RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000441222.7

USP46-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 46, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP46, Length 7,954 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46-201ENST00000441222 DHRS4L2Q6PKH6 230 aa6.09□□□□□ -1.43
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USP46-201ENST00000441222 OR2A1Q8NGT9 310 aa6.09□□□□□ -1.43
USP46-201ENST00000441222 OXGR1Q96P68 337 aa6.09□□□□□ -1.43
USP46-201ENST00000441222 LAT2Q9GZY6 243 aa6.09□□□□□ -1.43
USP46-201ENST00000441222 NTN4Q9HB63 628 aa6.09□□□□□ -1.43
USP46-201ENST00000441222 CMC2Q9NRP2 79 aa6.09□□□□□ -1.43
USP46-201ENST00000441222 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
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USP46-201ENST00000441222 HSBP1O75506 76 aa6.09□□□□□ -1.43
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USP46-201ENST00000441222 ZNF534Q76KX8 674 aa6.09□□□□□ -1.43
USP46-201ENST00000441222 Q96M85 177 aa6.09□□□□□ -1.43
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USP46-201ENST00000441222 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
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USP46-201ENST00000441222 ARRDC5A6NEK1 342 aa6.09□□□□□ -1.43
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USP46-201ENST00000441222 QDPRP09417 244 aa6.09□□□□□ -1.43
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USP46-201ENST00000441222 EXD3Q8N9H8 876 aa6.09□□□□□ -1.43
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USP46-201ENST00000441222 NRG4Q8WWG1 115 aa6.09□□□□□ -1.43
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USP46-201ENST00000441222 SMIM19Q96E16 107 aa6.09□□□□□ -1.43
USP46-201ENST00000441222 TEAD3Q99594 435 aa6.09□□□□□ -1.43
USP46-201ENST00000441222 ZNF2Q9BSG1 426 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
USP46-201ENST00000441222 VAMP8Q9BV40 100 aa6.09□□□□□ -1.43
USP46-201ENST00000441222 ZNF230Q9UIE0 474 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
USP46-201ENST00000441222 CLEC18AA5D8T8 446 aa6.09□□□□□ -1.44
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USP46-201ENST00000441222 WDR1O75083 606 aa6.09□□□□□ -1.44
USP46-201ENST00000441222 CRYABP02511 175 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.44
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USP46-201ENST00000441222 TMEM40Q8WWA1 233 aa6.09□□□□□ -1.44
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USP46-201ENST00000441222 ZDHHC11Q9H8X9 412 aa6.09□□□□□ -1.44
USP46-201ENST00000441222 PSENENQ9NZ42 101 aa6.09□□□□□ -1.44
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USP46-201ENST00000441222 MYOFQ9NZM1 2061 aa6.09□□□□□ -1.44
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USP46-201ENST00000441222 SELENOFO60613 162 aa6.08□□□□□ -1.44
USP46-201ENST00000441222 SIX6O95475 246 aa6.08□□□□□ -1.44
USP46-201ENST00000441222 OR5H8P0DN80 308 aa6.08□□□□□ -1.44
USP46-201ENST00000441222 G0S2P27469 103 aa6.08□□□□□ -1.44
USP46-201ENST00000441222 BCL6P41182 706 aa6.08□□□□□ -1.44
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USP46-201ENST00000441222 KMT5CQ86Y97 462 aa6.08□□□□□ -1.44
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USP46-201ENST00000441222 OR5AP2Q8NGF4 316 aa6.08□□□□□ -1.44
USP46-201ENST00000441222 DVL3Q92997 716 aaPredicted RBP6.08□□□□□ -1.44
USP46-201ENST00000441222 SLC35B4Q969S0 331 aa6.08□□□□□ -1.44
USP46-201ENST00000441222 SLC39A13Q96H72 371 aa6.08□□□□□ -1.44
USP46-201ENST00000441222 MRGPRX4Q96LA9 322 aa6.08□□□□□ -1.44
USP46-201ENST00000441222 KIF13BQ9NQT8 1826 aa6.08□□□□□ -1.44
USP46-201ENST00000441222 NACAE9PAV3 2078 aa6.08□□□□□ -1.44
USP46-201ENST00000441222 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa6.08□□□□□ -1.44
USP46-201ENST00000441222 A0A1B0GUH1 482 aa6.08□□□□□ -1.44
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