RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429738.1

MRPL28-203, Transcript of mitochondrial ribosomal protein L28, human

TSL 2 BASIC

Gene MRPL28, Length 310 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MRPL28-203	ENST00000429738		H0YL77	283 aa		14.89	□□□□□ -0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	IFNL4	K9M1U5	179 aa		14.89	□□□□□ -0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	HLA-DQA2	P01906	255 aa		14.89	□□□□□ -0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	ADRA2C	P18825	462 aa		14.89	□□□□□ -0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	OTX1	P32242	354 aa	Predicted RBP	14.89	□□□□□ -0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	SLC6A9	P48067	706 aa		14.89	□□□□□ -0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	TRAP1	Q12931	704 aa	Known RBP	14.89	□□□□□ -0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	TRIM25	Q14258	630 aa	Known RBP	14.89	□□□□□ -0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	GK2	Q14410	553 aa	Predicted RBP	14.89	□□□□□ -0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	LNX2	Q8N448	690 aa		14.89	□□□□□ -0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	KLHL36	Q8N4N3	616 aa		14.89	□□□□□ -0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	CYB561A3	Q8NBI2	242 aa		14.89	□□□□□ -0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	OR2AJ1	Q8NGZ0	328 aa		14.89	□□□□□ -0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	NANP	Q8TBE9	248 aa		14.89	□□□□□ -0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF747	Q9BV97	191 aa		14.89	□□□□□ -0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	C7orf69	Q9H7B7	122 aa		14.89	□□□□□ -0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF696	Q9H7X3	374 aa		14.89	□□□□□ -0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	WDR76	Q9H967	626 aa		14.89	□□□□□ -0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	MMP26	Q9NRE1	261 aa		14.89	□□□□□ -0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	DDX28	Q9NUL7	540 aa	Known RBP	14.89	□□□□□ -0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	VNN3	Q9NY84	501 aa		14.89	□□□□□ -0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	CCNB2	O95067	398 aa		14.88	□□□□□ -0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	FSTL3	O95633	263 aa		14.88	□□□□□ -0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	T-ENOL	P0DO92	83 aa		14.88	□□□□□ -0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	SELE	P16581	610 aa		14.88	□□□□□ -0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	PYCR1	P32322	319 aa		14.88	□□□□□ -0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	MDH2	P40926	338 aa	Known RBP	14.88	□□□□□ -0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	GATA4	P43694	442 aa		14.88	□□□□□ -0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	SRP9	P49458	86 aa	Known RBP	14.88	□□□□□ -0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	SEC61A1	P61619	476 aa	Known RBP	14.88	□□□□□ -0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	MS4A2	Q01362	244 aa		14.88	□□□□□ -0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	PPP1R8	Q12972	351 aa	Known RBP	14.88	□□□□□ -0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF181	Q2M3W8	571 aa		14.88	□□□□□ -0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	TUSC1	Q2TAM9	212 aa		14.88	□□□□□ -0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	ZDHHC22	Q8N966	263 aa		14.88	□□□□□ -0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	AQP11	Q8NBQ7	271 aa		14.88	□□□□□ -0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	SLC37A3	Q8NCC5	494 aa		14.88	□□□□□ -0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	DEFB108B	Q8NET1	73 aa		14.88	□□□□□ -0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	OR2T4	Q8NH00	348 aa		14.88	□□□□□ -0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF420	Q8TAQ5	688 aa	Predicted RBP	14.88	□□□□□ -0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	HCAR1	Q9BXC0	346 aa		14.88	□□□□□ -0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	TRAPPC2L	H3BP13	241 aa		14.87	□□□□□ -0.03
MRPL28-203	ENST00000429738		M0R135	149 aa		14.87	□□□□□ -0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	TMPRSS2	O15393	492 aa		14.87	□□□□□ -0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	FAM107A	O95990	144 aa		14.87	□□□□□ -0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	PSKH1	P11801	424 aa		14.87	□□□□□ -0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF823	P16415	610 aa		14.87	□□□□□ -0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	CALB2	P22676	271 aa		14.87	□□□□□ -0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	RPS27	P42677	84 aa	Known RBP	14.87	□□□□□ -0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	PCK2	Q16822	640 aa		14.87	□□□□□ -0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	MICA	Q29983	383 aa		14.87	□□□□□ -0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	OR2T5	Q6IEZ7	315 aa		14.87	□□□□□ -0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	SHISA2	Q6UWI4	295 aa		14.87	□□□□□ -0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	LYPD4	Q6UWN0	246 aa		14.87	□□□□□ -0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	DHFR2	Q86XF0	187 aa		14.87	□□□□□ -0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	MUC20	Q8N307	709 aa	Predicted RBP	14.87	□□□□□ -0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	BHLHE23	Q8NDY6	225 aa		14.87	□□□□□ -0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	PROKR2	Q8NFJ6	384 aa		14.87	□□□□□ -0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	OR2T29	Q8NH02	315 aa		14.87	□□□□□ -0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF799	Q96GE5	643 aa		14.87	□□□□□ -0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	SLC6A7	Q99884	636 aa		14.87	□□□□□ -0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	DGCR6L	Q9BY27	220 aa		14.87	□□□□□ -0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	NMNAT2	Q9BZQ4	307 aa		14.87	□□□□□ -0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	ESM1	Q9NQ30	184 aa		14.87	□□□□□ -0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	TMEM100	Q9NV29	134 aa		14.87	□□□□□ -0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	PCDHGB1	Q9Y5G3	927 aa		14.87	□□□□□ -0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	COMMD3-BMI1	R4GMX3	469 aa		14.87	□□□□□ -0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	TVP23A	A6NH52	213 aa		14.86	□□□□□ -0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	CEACAM18	A8MTB9	384 aa		14.86	□□□□□ -0.03
MRPL28-203	ENST00000429738		F5H5P2	479 aa		14.86	□□□□□ -0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	LCAT	P04180	440 aa		14.86	□□□□□ -0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	WNT2	P09544	360 aa		14.86	□□□□□ -0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF12	P17014	697 aa		14.86	□□□□□ -0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	ANOS1	P23352	680 aa		14.86	□□□□□ -0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	CPT2	P23786	658 aa		14.86	□□□□□ -0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	PMEL	P40967	661 aa		14.86	□□□□□ -0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	TPTE	P56180	551 aa		14.86	□□□□□ -0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	MAB21L1	Q13394	359 aa		14.86	□□□□□ -0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	BPIFB2	Q8N4F0	458 aa		14.86	□□□□□ -0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	CELF2-AS1	Q8N7Q2	184 aa		14.86	□□□□□ -0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	OR4Q3	Q8NH05	313 aa		14.86	□□□□□ -0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	DVL3	Q92997	716 aa	Predicted RBP	14.86	□□□□□ -0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	POP5	Q969H6	163 aa	Known RBP	14.86	□□□□□ -0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	TSSK6	Q9BXA6	273 aa		14.86	□□□□□ -0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	TMEM165	Q9HC07	324 aa		14.86	□□□□□ -0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	TBC1D23	Q9NUY8	699 aa		14.86	□□□□□ -0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	PRPF19	Q9UMS4	504 aa	Known RBP	14.86	□□□□□ -0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	BAIAP2	Q9UQB8	552 aa		14.86	□□□□□ -0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	INSIG2	Q9Y5U4	225 aa		14.86	□□□□□ -0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	CYB5R3	P00387	301 aa	Predicted RBP	14.85	□□□□□ -0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	HLA-DPB1	P04440	258 aa		14.85	□□□□□ -0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	SLC25A1	P53007	311 aa		14.85	□□□□□ -0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	RAD23A	P54725	363 aa		14.85	□□□□□ -0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	PRSS12	P56730	875 aa		14.85	□□□□□ -0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	UBA52	P62987	128 aa	Known RBP	14.85	□□□□□ -0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	PAX2	Q02962	417 aa		14.85	□□□□□ -0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	FOXL1	Q12952	345 aa		14.85	□□□□□ -0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	MALL	Q13021	153 aa		14.85	□□□□□ -0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF154	Q13106	437 aa		14.85	□□□□□ -0.03
MRPL28-203	ENST00000429738	CRMP1	Q14194	572 aa		14.85	□□□□□ -0.03

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