RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417504.5

PTPA-211, Transcript of protein phosphatase 2 phosphatase activator, humanhuman

TSL 4

Gene PTPA, Length 567 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPA-211ENST00000417504 CDH20Q9HBT6 801 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPA-211ENST00000417504 TRIM36Q9NQ86 728 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPA-211ENST00000417504 C19orf73Q9NVV2 129 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPA-211ENST00000417504 ATPIF1Q9UII2 106 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPA-211ENST00000417504 CAB39Q9Y376 341 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
PTPA-211ENST00000417504 SF3B6Q9Y3B4 125 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
PTPA-211ENST00000417504 LRP12Q9Y561 859 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPA-211ENST00000417504 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
PTPA-211ENST00000417504 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
PTPA-211ENST00000417504 METTL15A6NJ78 407 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPA-211ENST00000417504 J3QLW9 94 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPA-211ENST00000417504 J3QRE1 110 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPA-211ENST00000417504 M0R1B8 84 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPA-211ENST00000417504 ZNF254O75437 659 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPA-211ENST00000417504 SULT1C4O75897 302 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPA-211ENST00000417504 RPP14O95059 124 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
PTPA-211ENST00000417504 ZNF205O95201 554 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPA-211ENST00000417504 CLPTM1O96005 669 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPA-211ENST00000417504 APOC1P02654 83 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPA-211ENST00000417504 ANXA2P07355 339 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
PTPA-211ENST00000417504 HTR1AP08908 422 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPA-211ENST00000417504 MMP7P09237 267 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
PTPA-211ENST00000417504 LIMS3P0CW19 117 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPA-211ENST00000417504 LIMS4P0CW20 117 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPA-211ENST00000417504 HSMCR30P0CW71 290 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPA-211ENST00000417504 ZNF19P17023 458 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPA-211ENST00000417504 CCNOP22674 350 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPA-211ENST00000417504 PAX7P23759 505 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPA-211ENST00000417504 PSMB9P28065 219 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPA-211ENST00000417504 MAP2K4P45985 399 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPA-211ENST00000417504 CX3CR1P49238 355 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPA-211ENST00000417504 GDI2P50395 445 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
PTPA-211ENST00000417504 TAS2R43P59537 309 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPA-211ENST00000417504 SORDQ00796 357 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPA-211ENST00000417504 PSG4Q00888 419 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPA-211ENST00000417504 GALK2Q01415 458 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPA-211ENST00000417504 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
PTPA-211ENST00000417504 RAB39AQ14964 217 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPA-211ENST00000417504 CDONQ4KMG0 1287 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPA-211ENST00000417504 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPA-211ENST00000417504 OR2G6Q5TZ20 316 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPA-211ENST00000417504 RNLSQ5VYX0 342 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPA-211ENST00000417504 SLC30A7Q8NEW0 376 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPA-211ENST00000417504 OR1J2Q8NGS2 313 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPA-211ENST00000417504 OR1F12Q8NHA8 337 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPA-211ENST00000417504 FGFBP3Q8TAT2 258 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPA-211ENST00000417504 SPRYD4Q8WW59 207 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
PTPA-211ENST00000417504 HSD17B8Q92506 261 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPA-211ENST00000417504 RORBQ92753 470 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPA-211ENST00000417504 RCC1LQ96I51 464 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
PTPA-211ENST00000417504 AMELYQ99218 206 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPA-211ENST00000417504 COQ7Q99807 217 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPA-211ENST00000417504 WNT5BQ9H1J7 359 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPA-211ENST00000417504 MOB1AQ9H8S9 216 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPA-211ENST00000417504 ELOVL3Q9HB03 270 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPA-211ENST00000417504 NGBQ9NPG2 151 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPA-211ENST00000417504 DDX28Q9NUL7 540 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
PTPA-211ENST00000417504 ACOXLQ9NUZ1 547 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPA-211ENST00000417504 SLCO1C1Q9NYB5 712 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPA-211ENST00000417504 ZNF224Q9NZL3 707 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPA-211ENST00000417504 NDRG3Q9UGV2 375 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPA-211ENST00000417504 CLEC2DQ9UHP7 191 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPA-211ENST00000417504 RTTNQ86VV8 2226 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPA-211ENST00000417504 CENPEQ02224 2701 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPA-211ENST00000417504 ITPR2Q14571 2701 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPA-211ENST00000417504 TMEM82A0PJX8 343 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPA-211ENST00000417504 C5orf49A4QMS7 147 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPA-211ENST00000417504 CLEC18AA5D8T8 446 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPA-211ENST00000417504 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPA-211ENST00000417504 F5H5K5 113 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPA-211ENST00000417504 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPA-211ENST00000417504 M0R135 149 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPA-211ENST00000417504 MAGEB4O15481 346 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
PTPA-211ENST00000417504 TBX1O43435 398 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPA-211ENST00000417504 SYNGR3O43761 229 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPA-211ENST00000417504 ABHD16AO95870 558 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPA-211ENST00000417504 SMIM18P0DKX4 95 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPA-211ENST00000417504 COX5BP10606 129 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPA-211ENST00000417504 CBR1P16152 277 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPA-211ENST00000417504 STOMP27105 288 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPA-211ENST00000417504 APEX1P27695 318 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
PTPA-211ENST00000417504 PEX19P40855 299 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPA-211ENST00000417504 OPRL1P41146 370 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPA-211ENST00000417504 ZNF83P51522 516 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPA-211ENST00000417504 PRKXP51817 358 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPA-211ENST00000417504 TPTEP56180 551 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPA-211ENST00000417504 OR12D2P58182 307 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPA-211ENST00000417504 HIST1H3AP68431 136 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPA-211ENST00000417504 ROM1Q03395 351 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPA-211ENST00000417504 IRF3Q14653 427 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPA-211ENST00000417504 SPHARQ15513 63 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPA-211ENST00000417504 TAB1Q15750 504 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPA-211ENST00000417504 CCDC92Q53HC0 331 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
PTPA-211ENST00000417504 BCL2L15Q5TBC7 163 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPA-211ENST00000417504 HIST2H3PS2Q5TEC6 136 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPA-211ENST00000417504 DEGS2Q6QHC5 323 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPA-211ENST00000417504 ARL9Q6T311 187 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPA-211ENST00000417504 CLEC18BQ6UXF7 455 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPA-211ENST00000417504 KCTD8Q6ZWB6 473 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPA-211ENST00000417504 HIST2H3AQ71DI3 136 aa7.04□□□□□ -1.28
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