RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411083.1

RNU6-1135P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1135, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1135P, Length 103 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1135P-201ENST00000411083 PNOCQ13519 176 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-1135P-201ENST00000411083 NCF4Q15080 339 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-1135P-201ENST00000411083 DPYSL2Q16555 572 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-1135P-201ENST00000411083 LGALS9CQ6DKI2 356 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-1135P-201ENST00000411083 CCDC80Q76M96 950 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-1135P-201ENST00000411083 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-1135P-201ENST00000411083 BBS7Q8IWZ6 715 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-1135P-201ENST00000411083 MSANTD4Q8NCY6 345 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-1135P-201ENST00000411083 GPR26Q8NDV2 337 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-1135P-201ENST00000411083 LMX1AQ8TE12 382 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-1135P-201ENST00000411083 C4orf36Q96KX1 117 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-1135P-201ENST00000411083 MS4A8Q9BY19 250 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-1135P-201ENST00000411083 OR2S2Q9NQN1 319 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-1135P-201ENST00000411083 BFARQ9NZS9 450 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-1135P-201ENST00000411083 SPASTQ9UBP0 616 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-1135P-201ENST00000411083 SLC7A8Q9UHI5 535 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-1135P-201ENST00000411083 ANGPT4Q9Y264 503 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-1135P-201ENST00000411083 DENND4AQ7Z401 1863 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-1135P-201ENST00000411083 LAMA4Q16363 1823 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-1135P-201ENST00000411083 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-1135P-201ENST00000411083 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-1135P-201ENST00000411083 GATBO75879 557 aaKnown RBP-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-1135P-201ENST00000411083 FARS2O95363 451 aaKnown RBP-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-1135P-201ENST00000411083 C1orf105O95561 183 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-1135P-201ENST00000411083 MT-ATP6P00846 226 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-1135P-201ENST00000411083 TGFAP01135 160 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-1135P-201ENST00000411083 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-1135P-201ENST00000411083 PABPC4LP0CB38 370 aaKnown RBP-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-1135P-201ENST00000411083 CCR1P32246 355 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-1135P-201ENST00000411083 INPP1P49441 399 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-1135P-201ENST00000411083 PRR3P79522 188 aaKnown RBP-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-1135P-201ENST00000411083 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-1135P-201ENST00000411083 TWF1Q12792 350 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-1135P-201ENST00000411083 FILIP1LQ4L180 1135 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-1135P-201ENST00000411083 FAM104BQ5XKR9 115 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-1135P-201ENST00000411083 ANKRD26P1Q6NSI1 321 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-1135P-201ENST00000411083 CCDC50Q8IVM0 306 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-1135P-201ENST00000411083 C10orf126Q8N4M7 172 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-1135P-201ENST00000411083 OR1L1Q8NH94 360 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-1135P-201ENST00000411083 OSTF1Q92882 214 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-1135P-201ENST00000411083 YIPF5Q969M3 257 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-1135P-201ENST00000411083 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-1135P-201ENST00000411083 DNAJC30Q96LL9 226 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-1135P-201ENST00000411083 OR8B2Q96RD0 313 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-1135P-201ENST00000411083 LRRN3Q9H3W5 708 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-1135P-201ENST00000411083 TMEM27Q9HBJ8 222 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-1135P-201ENST00000411083 MTFP1Q9UDX5 166 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-1135P-201ENST00000411083 SLC7A11Q9UPY5 501 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-1135P-201ENST00000411083 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1135P-201ENST00000411083 INTS1Q8N201 2190 aaKnown RBP-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1135P-201ENST00000411083 IGKV1D-42A0A075B6H8 117 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1135P-201ENST00000411083 IGHV1-69DA0A0B4J2H0 117 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1135P-201ENST00000411083 A0A1W2PQL4 384 aaPredicted RBP-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1135P-201ENST00000411083 A8MWL6 223 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1135P-201ENST00000411083 TNFRSF11BO00300 401 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1135P-201ENST00000411083 CHADO15335 359 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1135P-201ENST00000411083 TIMM44O43615 452 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1135P-201ENST00000411083 SURF6O75683 361 aaKnown RBP-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1135P-201ENST00000411083 MT-ND4P03905 459 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1135P-201ENST00000411083 IL9P15248 144 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1135P-201ENST00000411083 F2RP25116 425 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1135P-201ENST00000411083 BLVRBP30043 206 aaPredicted RBP-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1135P-201ENST00000411083 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1135P-201ENST00000411083 BMI1P35226 326 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1135P-201ENST00000411083 PRPHP41219 470 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1135P-201ENST00000411083 RBM34P42696 430 aaKnown RBP-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1135P-201ENST00000411083 DHRS2Q13268 280 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1135P-201ENST00000411083 TMEM176BQ3YBM2 270 aaPredicted RBP-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1135P-201ENST00000411083 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1135P-201ENST00000411083 ELMOD2Q8IZ81 293 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1135P-201ENST00000411083 OR5C1Q8NGR4 320 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1135P-201ENST00000411083 OR2V1Q8NHB1 315 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1135P-201ENST00000411083 TRMT10AQ8TBZ6 339 aaKnown RBP-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1135P-201ENST00000411083 OR52B2Q96RD2 323 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1135P-201ENST00000411083 ZNF251Q9BRH9 671 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1135P-201ENST00000411083 CYSTM1Q9H1C7 97 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1135P-201ENST00000411083 C2orf40Q9H1Z8 148 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1135P-201ENST00000411083 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1135P-201ENST00000411083 A0A0G2JQZ4 141 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-1135P-201ENST00000411083 SSX5O60225 188 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-1135P-201ENST00000411083 SMPD2O60906 423 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-1135P-201ENST00000411083 CDH16O75309 829 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-1135P-201ENST00000411083 ETHE1O95571 254 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-1135P-201ENST00000411083 ERGP11308 486 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-1135P-201ENST00000411083 ETS1P14921 441 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-1135P-201ENST00000411083 LAP3P28838 519 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-1135P-201ENST00000411083 ATP5DP30049 168 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-1135P-201ENST00000411083 MPIP34949 423 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-1135P-201ENST00000411083 YAP1P46937 504 aaKnown RBP-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-1135P-201ENST00000411083 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-1135P-201ENST00000411083 CHIT1Q13231 466 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-1135P-201ENST00000411083 SLC25A25Q6KCM7 469 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-1135P-201ENST00000411083 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-1135P-201ENST00000411083 TMEM123Q8N131 208 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-1135P-201ENST00000411083 ORMDL3Q8N138 153 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-1135P-201ENST00000411083 MAGEE2Q8TD90 523 aaPredicted RBP-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-1135P-201ENST00000411083 CABS1Q96KC9 395 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-1135P-201ENST00000411083 SAMD8Q96LT4 415 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-1135P-201ENST00000411083 PITX2Q99697 317 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-1135P-201ENST00000411083 SH3GL1Q99961 368 aa-0.89□□□□□ -2.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.4 ms