RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368202.4

PTPRK-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRK, Length 526 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-201ENST00000368202 GFOD2Q3B7J2 385 aa10.6□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 XKRXQ6PP77 449 aa10.6□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 PRSS35Q8N3Z0 413 aa10.6□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 OR8B12Q8NGG6 310 aa10.6□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 OR52H1Q8NGJ2 320 aa10.6□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 OR13C3Q8NGS6 347 aa10.6□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 LILRB4Q8NHJ6 448 aa10.6□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 GPR148Q8TDV2 347 aa10.6□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 PGLYRP3Q96LB9 341 aa10.6□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 C1QTNF6Q9BXI9 259 aa10.6□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 NOX3Q9HBY0 568 aa10.6□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 NUFIP1Q9UHK0 495 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 HHLA2Q9UM44 414 aa10.6□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 SF3B6Q9Y3B4 125 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 KALRNO60229 2985 aa10.6□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 TRDV1A0A1B0GX56 115 aa10.59□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 OR4C45A6NMZ5 311 aa10.59□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP10.59□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 M0R1B8 84 aa10.59□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 P2RY10O00398 339 aa10.59□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 SLC22A1O15245 554 aa10.59□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 XRCC2O43543 280 aa10.59□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 MTRF1O75570 445 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 GATBO75879 557 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 ARL6IP5O75915 188 aa10.59□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 ATE1O95260 518 aa10.59□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 CD2P06729 351 aa10.59□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 OCM2P0CE71 109 aa10.59□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 ZNF14P17017 642 aaPredicted RBP10.59□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 ACHEP22303 614 aa10.59□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 MYL9P24844 172 aa10.59□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 OTX1P32242 354 aaPredicted RBP10.59□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 FABP5Q01469 135 aa10.59□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 MALLQ13021 153 aa10.59□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 ACSM3Q53FZ2 586 aa10.59□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 CEACAM19Q7Z692 300 aa10.59□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 NAA40Q86UY6 237 aa10.59□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 ELMOD2Q8IZ81 293 aa10.59□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 IL17RDQ8NFM7 739 aa10.59□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 KBTBD8Q8NFY9 601 aa10.59□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 OR5L1Q8NGL2 311 aa10.59□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 ABHD4Q8TB40 342 aa10.59□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 RPS4Y2Q8TD47 263 aa10.59□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP10.59□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 RNASE6Q93091 150 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 C12orf43Q96C57 262 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 POM121L2Q96KW2 1035 aa10.59□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 SLITRK2Q9H156 845 aa10.59□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 NGBQ9NPG2 151 aa10.59□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 G6PC2Q9NQR9 355 aa10.59□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 NDRG3Q9UGV2 375 aa10.59□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 DHDHQ9UQ10 334 aa10.59□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 SLC25A15Q9Y619 301 aa10.59□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 FREM1Q5H8C1 2179 aa10.59□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa10.59□□□□□ -0.71
PTPRK-201ENST00000368202 CFAP46Q8IYW2 2715 aa10.58□□□□□ -0.72
PTPRK-201ENST00000368202 LOC107986453A0A1B0GWG9 222 aa10.58□□□□□ -0.72
PTPRK-201ENST00000368202 NKX2-6A6NCS4 301 aa10.58□□□□□ -0.72
PTPRK-201ENST00000368202 ZNF879B4DU55 563 aa10.58□□□□□ -0.72
PTPRK-201ENST00000368202 H3BSH0 61 aa10.58□□□□□ -0.72
PTPRK-201ENST00000368202 SYT7O43581 403 aa10.58□□□□□ -0.72
PTPRK-201ENST00000368202 IGKV3-15P01624 115 aa10.58□□□□□ -0.72
PTPRK-201ENST00000368202 TTRP02766 147 aa10.58□□□□□ -0.72
PTPRK-201ENST00000368202 ISG15P05161 165 aa10.58□□□□□ -0.72
PTPRK-201ENST00000368202 CCL2P13500 99 aa10.58□□□□□ -0.72
PTPRK-201ENST00000368202 CFL1P23528 166 aaKnown RBP10.58□□□□□ -0.72
PTPRK-201ENST00000368202 CRYBB2P43320 205 aa10.58□□□□□ -0.72
PTPRK-201ENST00000368202 SOX2P48431 317 aa10.58□□□□□ -0.72
PTPRK-201ENST00000368202 ZNF83P51522 516 aa10.58□□□□□ -0.72
PTPRK-201ENST00000368202 VBP1P61758 197 aa10.58□□□□□ -0.72
PTPRK-201ENST00000368202 C3orf36Q3SXR2 165 aa10.58□□□□□ -0.72
PTPRK-201ENST00000368202 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa10.58□□□□□ -0.72
PTPRK-201ENST00000368202 Q499Y3 187 aa10.58□□□□□ -0.72
PTPRK-201ENST00000368202 SOWAHCQ53LP3 525 aaPredicted RBP10.58□□□□□ -0.72
PTPRK-201ENST00000368202 C22orf42Q6IC83 251 aa10.58□□□□□ -0.72
PTPRK-201ENST00000368202 DOK3Q7L591 496 aa10.58□□□□□ -0.72
PTPRK-201ENST00000368202 FAM169BQ8N8A8 192 aa10.58□□□□□ -0.72
PTPRK-201ENST00000368202 CCDC54Q8NEL0 328 aa10.58□□□□□ -0.72
PTPRK-201ENST00000368202 OR51E1Q8TCB6 317 aa10.58□□□□□ -0.72
PTPRK-201ENST00000368202 PHYHIPQ92561 330 aa10.58□□□□□ -0.72
PTPRK-201ENST00000368202 PPP1R14AQ96A00 147 aa10.58□□□□□ -0.72
PTPRK-201ENST00000368202 APOBEC3DQ96AK3 386 aaPredicted RBP10.58□□□□□ -0.72
PTPRK-201ENST00000368202 ZC3HAV1LQ96H79 300 aaKnown RBP10.58□□□□□ -0.72
PTPRK-201ENST00000368202 MS4A3Q96HJ5 214 aa10.58□□□□□ -0.72
PTPRK-201ENST00000368202 FAM71F1Q96KD3 344 aaPredicted RBP10.58□□□□□ -0.72
PTPRK-201ENST00000368202 KCTD7Q96MP8 289 aa10.58□□□□□ -0.72
PTPRK-201ENST00000368202 MED18Q9BUE0 208 aa10.58□□□□□ -0.72
PTPRK-201ENST00000368202 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP10.58□□□□□ -0.72
PTPRK-201ENST00000368202 PLEKHA1Q9HB21 404 aa10.58□□□□□ -0.72
PTPRK-201ENST00000368202 TXNL4BQ9NX01 149 aaKnown RBP10.58□□□□□ -0.72
PTPRK-201ENST00000368202 ZNF391Q9UJN7 358 aa10.58□□□□□ -0.72
PTPRK-201ENST00000368202 SPEF1Q9Y4P9 236 aa10.58□□□□□ -0.72
PTPRK-201ENST00000368202 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa10.57□□□□□ -0.72
PTPRK-201ENST00000368202 SVILO95425 2214 aa10.57□□□□□ -0.72
PTPRK-201ENST00000368202 LOC100509620A0A075B734 347 aa10.57□□□□□ -0.72
PTPRK-201ENST00000368202 A0A0U1RQV5 110 aa10.57□□□□□ -0.72
PTPRK-201ENST00000368202 H3BMQ9 156 aa10.57□□□□□ -0.72
PTPRK-201ENST00000368202 GPX5O75715 221 aa10.57□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.3 ms