RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362832.1

RNU6-170P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 170, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-170P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-170P-201ENST00000362832 CHST4Q8NCG5 386 aa-0.53□□□□□ -2.49
RNU6-170P-201ENST00000362832 OR52B4Q8NGK2 314 aa-0.53□□□□□ -2.49
RNU6-170P-201ENST00000362832 OR10G6Q8NH81 332 aa-0.53□□□□□ -2.49
RNU6-170P-201ENST00000362832 LRRC29Q8WV35 223 aa-0.53□□□□□ -2.49
RNU6-170P-201ENST00000362832 SPRYD4Q8WW59 207 aaPredicted RBP-0.53□□□□□ -2.49
RNU6-170P-201ENST00000362832 MAIP1Q8WWC4 291 aa-0.53□□□□□ -2.49
RNU6-170P-201ENST00000362832 CXorf40BQ96DE9 158 aa-0.53□□□□□ -2.49
RNU6-170P-201ENST00000362832 SERPINB12Q96P63 405 aa-0.53□□□□□ -2.49
RNU6-170P-201ENST00000362832 OR52B2Q96RD2 323 aa-0.53□□□□□ -2.49
RNU6-170P-201ENST00000362832 SH3GL1Q99961 368 aa-0.53□□□□□ -2.49
RNU6-170P-201ENST00000362832 NABP2Q9BQ15 211 aa-0.53□□□□□ -2.49
RNU6-170P-201ENST00000362832 TMEM243Q9BU79 118 aa-0.53□□□□□ -2.49
RNU6-170P-201ENST00000362832 MS4A8Q9BY19 250 aa-0.53□□□□□ -2.49
RNU6-170P-201ENST00000362832 MRPL13Q9BYD1 178 aaKnown RBP-0.53□□□□□ -2.49
RNU6-170P-201ENST00000362832 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP-0.53□□□□□ -2.49
RNU6-170P-201ENST00000362832 PLEKHF2Q9H8W4 249 aa-0.53□□□□□ -2.49
RNU6-170P-201ENST00000362832 SYTL2Q9HCH5 934 aa-0.53□□□□□ -2.49
RNU6-170P-201ENST00000362832 FAM60AQ9NP50 221 aa-0.53□□□□□ -2.49
RNU6-170P-201ENST00000362832 CLN8Q9UBY8 286 aa-0.53□□□□□ -2.49
RNU6-170P-201ENST00000362832 PCSK1NQ9UHG2 260 aa-0.53□□□□□ -2.49
RNU6-170P-201ENST00000362832 SLC7A8Q9UHI5 535 aa-0.53□□□□□ -2.49
RNU6-170P-201ENST00000362832 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa-0.53□□□□□ -2.49
RNU6-170P-201ENST00000362832 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP-0.53□□□□□ -2.49
RNU6-170P-201ENST00000362832 TIMM10BQ9Y5J6 103 aa-0.53□□□□□ -2.49
RNU6-170P-201ENST00000362832 NPTNQ9Y639 398 aa-0.53□□□□□ -2.49
RNU6-170P-201ENST00000362832 IGKV1D-42A0A075B6H8 117 aa-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-170P-201ENST00000362832 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-170P-201ENST00000362832 SMIM26A0A096LP01 95 aa-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-170P-201ENST00000362832 IGHV1-69DA0A0B4J2H0 117 aa-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-170P-201ENST00000362832 A0A0G2JQZ4 141 aa-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-170P-201ENST00000362832 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-170P-201ENST00000362832 SLC9B1P1A6NJY1 282 aa-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-170P-201ENST00000362832 FNDC10F2Z333 226 aa-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-170P-201ENST00000362832 FCMRO60667 390 aa-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-170P-201ENST00000362832 SCO1O75880 301 aa-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-170P-201ENST00000362832 MAS1P04201 325 aa-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-170P-201ENST00000362832 C2P06681 752 aa-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-170P-201ENST00000362832 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-170P-201ENST00000362832 ZNF705DP0CH99 300 aaPredicted RBP-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-170P-201ENST00000362832 ZNF705BP0CI00 300 aaPredicted RBP-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-170P-201ENST00000362832 FUT1P19526 365 aa-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-170P-201ENST00000362832 POLR2IP36954 125 aaKnown RBP-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-170P-201ENST00000362832 CFHR2P36980 270 aa-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-170P-201ENST00000362832 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-170P-201ENST00000362832 RBM34P42696 430 aaKnown RBP-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-170P-201ENST00000362832 VSX2P58304 361 aaPredicted RBP-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-170P-201ENST00000362832 PLP1P60201 277 aa-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-170P-201ENST00000362832 ARF5P84085 180 aa-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-170P-201ENST00000362832 TWF1Q12792 350 aa-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-170P-201ENST00000362832 CHIT1Q13231 466 aa-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-170P-201ENST00000362832 QPRTQ15274 297 aa-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-170P-201ENST00000362832 DPYSL2Q16555 572 aa-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-170P-201ENST00000362832 TPRXLQ17RH7 258 aa-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-170P-201ENST00000362832 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-170P-201ENST00000362832 FILIP1LQ4L180 1135 aa-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-170P-201ENST00000362832 MRPL2Q5T653 305 aaKnown RBP-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-170P-201ENST00000362832 ETFRF1Q6IPR1 90 aa-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-170P-201ENST00000362832 CCDC80Q76M96 950 aa-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-170P-201ENST00000362832 COA5Q86WW8 74 aa-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-170P-201ENST00000362832 CPNE9Q8IYJ1 553 aa-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-170P-201ENST00000362832 C10orf126Q8N4M7 172 aa-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-170P-201ENST00000362832 SLC25A29Q8N8R3 303 aa-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-170P-201ENST00000362832 OR51F2Q8NH61 342 aa-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-170P-201ENST00000362832 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-170P-201ENST00000362832 TMEM186Q96B77 213 aa-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-170P-201ENST00000362832 KCNS1Q96KK3 526 aa-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-170P-201ENST00000362832 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-170P-201ENST00000362832 TTC25Q96NG3 672 aa-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-170P-201ENST00000362832 B9D2Q9BPU9 175 aa-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-170P-201ENST00000362832 ADPGKQ9BRR6 497 aa-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-170P-201ENST00000362832 MFFQ9GZY8 342 aa-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-170P-201ENST00000362832 TMEM27Q9HBJ8 222 aa-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-170P-201ENST00000362832 VAT1LQ9HCJ6 419 aa-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-170P-201ENST00000362832 SMOXQ9NWM0 555 aa-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-170P-201ENST00000362832 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-170P-201ENST00000362832 BFARQ9NZS9 450 aa-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-170P-201ENST00000362832 MGAT4BQ9UQ53 548 aa-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-170P-201ENST00000362832 ACOT9Q9Y305 439 aa-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-170P-201ENST00000362832 ICOSQ9Y6W8 199 aa-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-170P-201ENST00000362832 HSPE1-MOB4S4R3N1 261 aa-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-170P-201ENST00000362832 OTOFQ9HC10 1997 aa-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-170P-201ENST00000362832 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-170P-201ENST00000362832 POLEQ07864 2286 aa-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-170P-201ENST00000362832 NCOR2Q9Y618 2525 aa-0.55□□□□□ -2.5
RNU6-170P-201ENST00000362832 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa-0.55□□□□□ -2.5
RNU6-170P-201ENST00000362832 A0A0B4J2C4 111 aa-0.55□□□□□ -2.5
RNU6-170P-201ENST00000362832 C17orf98A8MV24 154 aa-0.55□□□□□ -2.5
RNU6-170P-201ENST00000362832 ODF3BA8MYP8 253 aa-0.55□□□□□ -2.5
RNU6-170P-201ENST00000362832 PLPP1O14494 284 aa-0.55□□□□□ -2.5
RNU6-170P-201ENST00000362832 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP-0.55□□□□□ -2.5
RNU6-170P-201ENST00000362832 CLDN3O15551 220 aa-0.55□□□□□ -2.5
RNU6-170P-201ENST00000362832 SSX5O60225 188 aa-0.55□□□□□ -2.5
RNU6-170P-201ENST00000362832 KINO60870 393 aaKnown RBP-0.55□□□□□ -2.5
RNU6-170P-201ENST00000362832 ERLIN2O94905 339 aa-0.55□□□□□ -2.5
RNU6-170P-201ENST00000362832 C1orf105O95561 183 aa-0.55□□□□□ -2.5
RNU6-170P-201ENST00000362832 EIF4EP06730 217 aaKnown RBP-0.55□□□□□ -2.5
RNU6-170P-201ENST00000362832 IL9P15248 144 aa-0.55□□□□□ -2.5
RNU6-170P-201ENST00000362832 RPA2P15927 270 aa-0.55□□□□□ -2.5
RNU6-170P-201ENST00000362832 LAP3P28838 519 aa-0.55□□□□□ -2.5
RNU6-170P-201ENST00000362832 CCR1P32246 355 aa-0.55□□□□□ -2.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.6 ms