RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356384.4

RXRA-201, Transcript of retinoid X receptor alpha, humanhuman

TSL 5

Gene RXRA, Length 5,770 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RXRA-201ENST00000356384 MENTQ9BUN1 341 aa14.61□□□□□ -0.07
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RXRA-201ENST00000356384 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
RXRA-201ENST00000356384 PRSS44E7EML9 344 aa14.6□□□□□ -0.07
RXRA-201ENST00000356384 VAMP5O95183 116 aa14.6□□□□□ -0.07
RXRA-201ENST00000356384 FKBP2P26885 142 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
RXRA-201ENST00000356384 CST5P28325 142 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
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RXRA-201ENST00000356384 OR10AD1Q8NGE0 317 aa14.6□□□□□ -0.07
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RXRA-201ENST00000356384 YTHDF2Q9Y5A9 579 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
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RXRA-201ENST00000356384 TRAPPC2BP0DI82 140 aa14.6□□□□□ -0.07
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RXRA-201ENST00000356384 TRMT61AQ96FX7 289 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
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RXRA-201ENST00000356384 CD3DP04234 171 aa14.58□□□□□ -0.08
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