RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000344528.8

SH3BP4-201, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP4, Length 5,044 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-201ENST00000344528 HTD2P86397 168 aa14.73□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 RBMS3Q6XE24 437 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 PP6455Q8WZ26 134 aa14.73□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 DAZAP1Q96EP5 407 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 OR8B4Q96RC9 309 aa14.73□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 PLA2G12AQ9BZM1 189 aa14.73□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 ING1Q9UK53 422 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 COPS3Q9UNS2 423 aa14.73□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 TBPP20226 339 aa14.73□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 C21orf58P58505 322 aa14.73□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 BAXQ07812 192 aa14.73□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 ASAH1Q13510 395 aa14.73□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 RNPS1Q15287 305 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 Q7L0L9 218 aa14.73□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 RBMXL3Q8N7X1 1067 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 OTOSQ8NHW6 89 aa14.73□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 NANPQ8TBE9 248 aa14.73□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 FRZBQ92765 325 aa14.73□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 PLA2G3Q9NZ20 509 aa14.73□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 SSUH2Q9Y2M2 353 aa14.73□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 COL4A5P29400 1685 aa14.73□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 MEIKINA0A087WXM9 373 aa14.73□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 DFFBO76075 338 aa14.73□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 CD1EP15812 388 aa14.73□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 OR51H1Q8NH63 302 aa14.73□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 TECTBQ96PL2 329 aa14.73□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 SPACA5Q96QH8 159 aa14.73□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 SEC22CQ9BRL7 303 aa14.73□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 RIMS4Q9H426 269 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 A0A1B0GVG6 124 aa14.72□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 HSD17B6O14756 317 aa14.72□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 SNAPINO95295 136 aa14.72□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 AADACP22760 399 aa14.72□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 EBPQ15125 230 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 OR13C5Q8NGS8 318 aa14.72□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 OR2AE1Q8NHA4 323 aa14.72□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 FBXO8Q9NRD0 319 aa14.72□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 CEP290O15078 2479 aa14.72□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 TPPPO94811 219 aa14.72□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 DDOSTP39656 456 aa14.72□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 FABP6P51161 128 aa14.72□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 MRPS34P82930 218 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 DYRK1AQ13627 763 aa14.72□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 TAF9Q16594 264 aa14.72□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 PWWP2BQ6NUJ5 590 aa14.72□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 WDR74Q6RFH5 385 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 SLC51BQ86UW2 128 aa14.72□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 GABRG1Q8N1C3 465 aa14.72□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 BATF2Q8N1L9 274 aa14.72□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 OR51A4Q8NGJ6 313 aa14.72□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 DYNC2LI1Q8TCX1 351 aa14.72□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 HAS2Q92819 552 aa14.72□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 GNRHR2Q96P88 292 aa14.72□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 PFDN5Q99471 154 aa14.72□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 CLEC1BQ9P126 229 aa14.72□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 A0A1B0GTQ1 180 aa14.72□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 C2orf76Q3KRA6 126 aa14.72□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 CST9LP1Q5W188 147 aa14.72□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 DEFB108BQ8NET1 73 aa14.72□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 SIRT5Q9NXA8 310 aa14.72□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 CT45A6P0DMU7 189 aa14.72□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 CT45A5P0DMU8 189 aa14.72□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 CT45A7P0DMV0 189 aa14.72□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 CT45A8P0DMV1 189 aa14.72□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 CT45A9P0DMV2 189 aa14.72□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 MC2RQ01718 297 aa14.72□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 TCTN1Q2MV58 587 aa14.72□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 CT45A2Q5DJT8 189 aa14.72□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 CT45A1Q5HYN5 189 aa14.72□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 ALKAL2Q6UX46 152 aa14.72□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 SLC25A26Q70HW3 274 aa14.72□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 H2BFWTQ7Z2G1 175 aa14.72□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 OR2I1PQ8NGU4 316 aa14.72□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 CT45A3Q8NHU0 189 aa14.72□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 SHARPINQ9H0F6 387 aa14.72□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 SLC39A9Q9NUM3 307 aa14.72□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 ST8SIA3O43173 380 aa14.71□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 HES3Q5TGS1 186 aa14.71□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 POFUT1Q9H488 388 aa14.71□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 C12orf10Q9HB07 376 aa14.71□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 NEU3Q9UQ49 428 aa14.71□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 SRP9P49458 86 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 PPP1CAP62136 330 aa14.71□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 DGCR2P98153 550 aa14.71□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 CLINT1Q14677 625 aa14.71□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 GPR32P1Q8NGA4 272 aa14.71□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 NUBPLQ8TB37 319 aa14.71□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 FAM213BQ8TBF2 198 aa14.71□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 SIRPB1O00241 398 aa14.71□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 TRAPPC2P0DI81 140 aa14.71□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 TRAPPC2BP0DI82 140 aa14.71□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF141Q15928 474 aa14.71□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 TIGD3Q6B0B8 471 aa14.71□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 FAM117AQ9C073 453 aa14.71□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 FBXO4Q9UKT5 387 aa14.71□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa14.71□□□□□ -0.05
SH3BP4-201ENST00000344528 TGM6O95932 706 aa14.71□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.6 ms