RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000334414.10

PTPRB-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 12,316 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-202ENST00000334414 MICAL3Q7RTP6 2002 aa5.04□□□□□ -1.6
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PTPRB-202ENST00000334414 EN2P19622 333 aaPredicted RBP5.03□□□□□ -1.6
PTPRB-202ENST00000334414 PTGFRP43088 359 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRB-202ENST00000334414 RPL29P47914 159 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
PTPRB-202ENST00000334414 VASPP50552 380 aaPredicted RBP5.03□□□□□ -1.6
PTPRB-202ENST00000334414 SMIM21Q3B7S5 101 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRB-202ENST00000334414 NSUN5P2Q63ZY6 315 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRB-202ENST00000334414 FAM71E1Q6IPT2 247 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRB-202ENST00000334414 MFSD12Q6NUT3 480 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRB-202ENST00000334414 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRB-202ENST00000334414 H1FNTQ75WM6 255 aaPredicted RBP5.03□□□□□ -1.6
PTPRB-202ENST00000334414 IGSF8Q969P0 613 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRB-202ENST00000334414 TP53RKQ96S44 253 aa5.03□□□□□ -1.6
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