RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326294.3

PTPRCAP-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRCAP, Length 1,292 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR51V1Q9H2C8 321 aa16.56■□□□□ 0.24
PTPRCAP-201ENST00000326294 TREM2Q9NZC2 230 aa16.56■□□□□ 0.24
PTPRCAP-201ENST00000326294 WIPI2Q9Y4P8 454 aa16.56■□□□□ 0.24
PTPRCAP-201ENST00000326294 AP4S1Q9Y587 144 aa16.56■□□□□ 0.24
PTPRCAP-201ENST00000326294 DYSFO75923 2080 aa16.56■□□□□ 0.24
PTPRCAP-201ENST00000326294 C5orf63A6NC05 138 aa16.55■□□□□ 0.24
PTPRCAP-201ENST00000326294 FAM157AC9JC47 383 aa16.55■□□□□ 0.24
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF878C9JN71 531 aa16.55■□□□□ 0.24
PTPRCAP-201ENST00000326294 PRR23D1E9PI22 279 aaPredicted RBP16.55■□□□□ 0.24
PTPRCAP-201ENST00000326294 HMGN1P05114 100 aa16.55■□□□□ 0.24
PTPRCAP-201ENST00000326294 PRR23D2P0DMB1 279 aaPredicted RBP16.55■□□□□ 0.24
PTPRCAP-201ENST00000326294 FASP25445 335 aa16.55■□□□□ 0.24
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLC6A9P48067 706 aa16.55■□□□□ 0.24
PTPRCAP-201ENST00000326294 CRISP1P54107 249 aa16.55■□□□□ 0.24
PTPRCAP-201ENST00000326294 LMO4P61968 165 aa16.55■□□□□ 0.24
PTPRCAP-201ENST00000326294 SNAI3Q3KNW1 292 aa16.55■□□□□ 0.24
PTPRCAP-201ENST00000326294 DPY19L4Q7Z388 723 aa16.55■□□□□ 0.24
PTPRCAP-201ENST00000326294 TIGD4Q8IY51 512 aa16.55■□□□□ 0.24
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR8G5Q8NG78 346 aa16.55■□□□□ 0.24
PTPRCAP-201ENST00000326294 ITLN1Q8WWA0 313 aa16.55■□□□□ 0.24
PTPRCAP-201ENST00000326294 CCL17Q92583 94 aa16.55■□□□□ 0.24
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZMYND19Q96E35 227 aaPredicted RBP16.55■□□□□ 0.24
PTPRCAP-201ENST00000326294 GABARAPL1Q9H0R8 117 aa16.55■□□□□ 0.24
PTPRCAP-201ENST00000326294 DCAF16Q9NXF7 216 aa16.55■□□□□ 0.24
PTPRCAP-201ENST00000326294 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa16.55■□□□□ 0.24
PTPRCAP-201ENST00000326294 SVEP1Q4LDE5 3571 aa16.54■□□□□ 0.24
PTPRCAP-201ENST00000326294 PRODHO43272 600 aa16.54■□□□□ 0.24
PTPRCAP-201ENST00000326294 CIB2O75838 187 aa16.54■□□□□ 0.24
PTPRCAP-201ENST00000326294 TNFSF4P23510 183 aa16.54■□□□□ 0.24
PTPRCAP-201ENST00000326294 PRKXP51817 358 aa16.54■□□□□ 0.24
PTPRCAP-201ENST00000326294 EIF2B1Q14232 305 aaKnown RBP16.54■□□□□ 0.24
PTPRCAP-201ENST00000326294 DRAM2Q6UX65 266 aa16.54■□□□□ 0.24
PTPRCAP-201ENST00000326294 SPATC1Q76KD6 591 aa16.54■□□□□ 0.24
PTPRCAP-201ENST00000326294 CPOQ8IVL8 374 aa16.54■□□□□ 0.24
PTPRCAP-201ENST00000326294 BHLHE23Q8NDY6 225 aa16.54■□□□□ 0.24
PTPRCAP-201ENST00000326294 BBS1Q8NFJ9 593 aa16.54■□□□□ 0.24
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR10AD1Q8NGE0 317 aa16.54■□□□□ 0.24
PTPRCAP-201ENST00000326294 LRTOMTQ8WZ04 291 aa16.54■□□□□ 0.24
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF582Q96NG8 517 aaPredicted RBP16.54■□□□□ 0.24
PTPRCAP-201ENST00000326294 AMELYQ99218 206 aa16.54■□□□□ 0.24
PTPRCAP-201ENST00000326294 KCNJ15Q99712 375 aa16.54■□□□□ 0.24
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLC30A2Q9BRI3 323 aa16.54■□□□□ 0.24
PTPRCAP-201ENST00000326294 CENPMQ9NSP4 180 aa16.54■□□□□ 0.24
PTPRCAP-201ENST00000326294 IL19Q9UHD0 177 aa16.54■□□□□ 0.24
PTPRCAP-201ENST00000326294 A0A1B0GWJ7 208 aa16.53■□□□□ 0.24
PTPRCAP-201ENST00000326294 KIAA1324LA8MWY0 1029 aaPredicted RBP16.53■□□□□ 0.24
PTPRCAP-201ENST00000326294 G3V2T6 193 aa16.53■□□□□ 0.24
PTPRCAP-201ENST00000326294 MLNRO43193 412 aa16.53■□□□□ 0.24
PTPRCAP-201ENST00000326294 SELENOFO60613 162 aa16.53■□□□□ 0.24
PTPRCAP-201ENST00000326294 MITFO75030 526 aaPredicted RBP16.53■□□□□ 0.24
PTPRCAP-201ENST00000326294 FCGR1AP12314 374 aa16.53■□□□□ 0.24
PTPRCAP-201ENST00000326294 SELEP16581 610 aa16.53■□□□□ 0.24
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLC2A5P22732 501 aa16.53■□□□□ 0.24
PTPRCAP-201ENST00000326294 RBMXP38159 391 aaKnown RBP16.53■□□□□ 0.24
PTPRCAP-201ENST00000326294 MALLQ13021 153 aa16.53■□□□□ 0.24
PTPRCAP-201ENST00000326294 AMIGO2Q86SJ2 522 aa16.53■□□□□ 0.24
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF283Q8N7M2 679 aa16.53■□□□□ 0.24
PTPRCAP-201ENST00000326294 RNF133Q8WVZ7 376 aa16.53■□□□□ 0.24
PTPRCAP-201ENST00000326294 RAB1CQ92928 201 aa16.53■□□□□ 0.24
PTPRCAP-201ENST00000326294 TIMD4Q96H15 378 aa16.53■□□□□ 0.24
PTPRCAP-201ENST00000326294 PLEKHA8Q96JA3 519 aa16.53■□□□□ 0.24
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR2V2Q96R30 315 aa16.53■□□□□ 0.24
PTPRCAP-201ENST00000326294 ABHD6Q9BV23 337 aa16.53■□□□□ 0.24
PTPRCAP-201ENST00000326294 TMEM106BQ9NUM4 274 aa16.53■□□□□ 0.24
PTPRCAP-201ENST00000326294 LPAR3Q9UBY5 353 aa16.53■□□□□ 0.24
PTPRCAP-201ENST00000326294 ATRQ13535 2644 aa16.53■□□□□ 0.24
PTPRCAP-201ENST00000326294 H0YL77 283 aa16.52■□□□□ 0.24
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLC2A1P11166 492 aa16.52■□□□□ 0.24
PTPRCAP-201ENST00000326294 TNFRSF1AP19438 455 aa16.52■□□□□ 0.24
PTPRCAP-201ENST00000326294 ESRRGP62508 458 aa16.52■□□□□ 0.24
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLC3A1Q07837 685 aa16.52■□□□□ 0.24
PTPRCAP-201ENST00000326294 TAF13Q15543 124 aa16.52■□□□□ 0.24
PTPRCAP-201ENST00000326294 KLHL12Q53G59 568 aa16.52■□□□□ 0.24
PTPRCAP-201ENST00000326294 GLYATL3Q5SZD4 288 aa16.52■□□□□ 0.24
PTPRCAP-201ENST00000326294 FAM120AOSQ5T036 256 aa16.52■□□□□ 0.24
PTPRCAP-201ENST00000326294 CCDC121Q6ZUS5 278 aa16.52■□□□□ 0.24
PTPRCAP-201ENST00000326294 IL17RELQ6ZVW7 336 aa16.52■□□□□ 0.24
PTPRCAP-201ENST00000326294 PGAP1Q75T13 922 aa16.52■□□□□ 0.24
PTPRCAP-201ENST00000326294 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP16.52■□□□□ 0.24
PTPRCAP-201ENST00000326294 MRPL21Q7Z2W9 205 aaKnown RBP16.52■□□□□ 0.24
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR13G1Q8NGZ3 307 aa16.52■□□□□ 0.24
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR2AE1Q8NHA4 323 aa16.52■□□□□ 0.24
PTPRCAP-201ENST00000326294 TEX12Q9BXU0 123 aa16.52■□□□□ 0.24
PTPRCAP-201ENST00000326294 BEX2Q9BXY8 128 aa16.52■□□□□ 0.24
PTPRCAP-201ENST00000326294 SHARPINQ9H0F6 387 aa16.52■□□□□ 0.24
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF665Q9H7R5 613 aa16.52■□□□□ 0.24
PTPRCAP-201ENST00000326294 KRT84Q9NSB2 600 aa16.52■□□□□ 0.24
PTPRCAP-201ENST00000326294 TVP23BQ9NYZ1 205 aa16.52■□□□□ 0.24
PTPRCAP-201ENST00000326294 CUBNO60494 3623 aa16.52■□□□□ 0.23
PTPRCAP-201ENST00000326294 B4DSR2 109 aa16.51■□□□□ 0.23
PTPRCAP-201ENST00000326294 IGHV2-5P01817 119 aa16.51■□□□□ 0.23
PTPRCAP-201ENST00000326294 FAM157CP0CG43 387 aa16.51■□□□□ 0.23
PTPRCAP-201ENST00000326294 MMP16P51512 607 aa16.51■□□□□ 0.23
PTPRCAP-201ENST00000326294 DVL1P1P54792 670 aaPredicted RBP16.51■□□□□ 0.23
PTPRCAP-201ENST00000326294 GRB2P62993 217 aaKnown RBP16.51■□□□□ 0.23
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF92Q03936 586 aa16.51■□□□□ 0.23
PTPRCAP-201ENST00000326294 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP16.51■□□□□ 0.23
PTPRCAP-201ENST00000326294 SNAPC1Q16533 368 aa16.51■□□□□ 0.23
PTPRCAP-201ENST00000326294 CR1LQ2VPA4 569 aa16.51■□□□□ 0.23
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLC35D3Q5M8T2 416 aa16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.9 ms