RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000295645.8

PDCL2-201, Transcript of phosducin like 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDCL2, Length 861 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL2-201ENST00000295645 UBE2J2Q8N2K1 259 aa1.3□□□□□ -2.2
PDCL2-201ENST00000295645 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa1.3□□□□□ -2.2
PDCL2-201ENST00000295645 OR4M1Q8NGD0 313 aa1.3□□□□□ -2.2
PDCL2-201ENST00000295645 OR13C2Q8NGS9 318 aa1.3□□□□□ -2.2
PDCL2-201ENST00000295645 KIFAP3Q92845 792 aa1.3□□□□□ -2.2
PDCL2-201ENST00000295645 FBXO32Q969P5 355 aa1.3□□□□□ -2.2
PDCL2-201ENST00000295645 SLC29A1Q99808 456 aa1.3□□□□□ -2.2
PDCL2-201ENST00000295645 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP1.3□□□□□ -2.2
PDCL2-201ENST00000295645 NUP50Q9UKX7 468 aa1.3□□□□□ -2.2
PDCL2-201ENST00000295645 R4GN34 69 aa1.3□□□□□ -2.2
PDCL2-201ENST00000295645 KANK1Q14678 1352 aa1.3□□□□□ -2.2
PDCL2-201ENST00000295645 FAM240BA0A1B0GVZ2 78 aa1.29□□□□□ -2.2
PDCL2-201ENST00000295645 C3orf84H3BNL1 204 aa1.29□□□□□ -2.2
PDCL2-201ENST00000295645 RAB29O14966 203 aa1.29□□□□□ -2.2
PDCL2-201ENST00000295645 OR7C2O60412 319 aa1.29□□□□□ -2.2
PDCL2-201ENST00000295645 PRB1P04280 392 aa1.29□□□□□ -2.2
PDCL2-201ENST00000295645 SERPINA5P05154 406 aa1.29□□□□□ -2.2
PDCL2-201ENST00000295645 EIF4EP06730 217 aaKnown RBP1.29□□□□□ -2.2
PDCL2-201ENST00000295645 ACSM4P0C7M7 580 aa1.29□□□□□ -2.2
PDCL2-201ENST00000295645 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa1.29□□□□□ -2.2
PDCL2-201ENST00000295645 MCF2P10911 925 aa1.29□□□□□ -2.2
PDCL2-201ENST00000295645 OR7A5Q15622 319 aa1.29□□□□□ -2.2
PDCL2-201ENST00000295645 KLHL12Q53G59 568 aa1.29□□□□□ -2.2
PDCL2-201ENST00000295645 TBPL2Q6SJ96 375 aa1.29□□□□□ -2.2
PDCL2-201ENST00000295645 TMEM107Q6UX40 140 aa1.29□□□□□ -2.2
PDCL2-201ENST00000295645 RUFY3Q7L099 469 aa1.29□□□□□ -2.2
PDCL2-201ENST00000295645 ERO1BQ86YB8 467 aa1.29□□□□□ -2.2
PDCL2-201ENST00000295645 NKAIN4Q8IVV8 208 aa1.29□□□□□ -2.2
PDCL2-201ENST00000295645 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa1.29□□□□□ -2.2
PDCL2-201ENST00000295645 LRRC75AQ8NAA5 344 aa1.29□□□□□ -2.2
PDCL2-201ENST00000295645 OR10AD1Q8NGE0 317 aa1.29□□□□□ -2.2
PDCL2-201ENST00000295645 OR9K2Q8NGE7 335 aa1.29□□□□□ -2.2
PDCL2-201ENST00000295645 KCNG3Q8TAE7 436 aa1.29□□□□□ -2.2
PDCL2-201ENST00000295645 LRRC29Q8WV35 223 aa1.29□□□□□ -2.2
PDCL2-201ENST00000295645 CCDC126Q96EE4 140 aa1.29□□□□□ -2.2
PDCL2-201ENST00000295645 NT5C3AQ9H0P0 336 aa1.29□□□□□ -2.2
PDCL2-201ENST00000295645 ASF1BQ9NVP2 202 aa1.29□□□□□ -2.2
PDCL2-201ENST00000295645 NLE1Q9NVX2 485 aaPredicted RBP1.29□□□□□ -2.2
PDCL2-201ENST00000295645 CACNA1DQ01668 2161 aa1.28□□□□□ -2.2
PDCL2-201ENST00000295645 PRR14LQ5THK1 2151 aa1.28□□□□□ -2.2
PDCL2-201ENST00000295645 SMCO2A6NFE2 343 aa1.28□□□□□ -2.2
PDCL2-201ENST00000295645 GABRR3A8MPY1 467 aa1.28□□□□□ -2.2
PDCL2-201ENST00000295645 OVOL1O14753 267 aa1.28□□□□□ -2.2
PDCL2-201ENST00000295645 NUPL2O15504 423 aaKnown RBP1.28□□□□□ -2.2
PDCL2-201ENST00000295645 RDH16O75452 317 aa1.28□□□□□ -2.2
PDCL2-201ENST00000295645 CRYGBP07316 175 aa1.28□□□□□ -2.2
PDCL2-201ENST00000295645 SLC2A3P11169 496 aa1.28□□□□□ -2.2
PDCL2-201ENST00000295645 TNNI1P19237 187 aa1.28□□□□□ -2.2
PDCL2-201ENST00000295645 GGT1P19440 569 aa1.28□□□□□ -2.2
PDCL2-201ENST00000295645 HLA-DMAP28067 261 aa1.28□□□□□ -2.2
PDCL2-201ENST00000295645 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP1.28□□□□□ -2.2
PDCL2-201ENST00000295645 TMED10P49755 219 aaKnown RBP1.28□□□□□ -2.2
PDCL2-201ENST00000295645 ACLYP53396 1101 aa1.28□□□□□ -2.2
PDCL2-201ENST00000295645 ACTR3P61158 418 aa1.28□□□□□ -2.2
PDCL2-201ENST00000295645 PRR3P79522 188 aaKnown RBP1.28□□□□□ -2.2
PDCL2-201ENST00000295645 ZNF726P1Q15940 193 aa1.28□□□□□ -2.2
PDCL2-201ENST00000295645 VPS26BQ4G0F5 336 aa1.28□□□□□ -2.2
PDCL2-201ENST00000295645 PPM1LQ5SGD2 360 aa1.28□□□□□ -2.2
PDCL2-201ENST00000295645 FAM228AQ86W67 206 aa1.28□□□□□ -2.2
PDCL2-201ENST00000295645 PRELID2Q8N945 189 aa1.28□□□□□ -2.2
PDCL2-201ENST00000295645 LY6G5BQ8NDX9 201 aa1.28□□□□□ -2.2
PDCL2-201ENST00000295645 SPATA4Q8NEY3 305 aa1.28□□□□□ -2.2
PDCL2-201ENST00000295645 SLC26A10Q8NG04 563 aa1.28□□□□□ -2.2
PDCL2-201ENST00000295645 OR51M1Q9H341 326 aa1.28□□□□□ -2.2
PDCL2-201ENST00000295645 LINC00574Q9H8X3 128 aa1.28□□□□□ -2.2
PDCL2-201ENST00000295645 SLC2A8Q9NY64 477 aa1.28□□□□□ -2.2
PDCL2-201ENST00000295645 PDP1Q9P0J1 537 aaPredicted RBP1.28□□□□□ -2.2
PDCL2-201ENST00000295645 ZNF492Q9P255 531 aa1.28□□□□□ -2.2
PDCL2-201ENST00000295645 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP1.27□□□□□ -2.21
PDCL2-201ENST00000295645 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP1.27□□□□□ -2.21
PDCL2-201ENST00000295645 K7EMT4 169 aa1.27□□□□□ -2.21
PDCL2-201ENST00000295645 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP1.27□□□□□ -2.21
PDCL2-201ENST00000295645 NVLO15381 856 aaKnown RBP1.27□□□□□ -2.21
PDCL2-201ENST00000295645 FSTL3O95633 263 aa1.27□□□□□ -2.21
PDCL2-201ENST00000295645 IGKV1-16P04430 117 aa1.27□□□□□ -2.21
PDCL2-201ENST00000295645 CD37P11049 281 aa1.27□□□□□ -2.21
PDCL2-201ENST00000295645 FOXN2P32314 431 aa1.27□□□□□ -2.21
PDCL2-201ENST00000295645 RBM34P42696 430 aaKnown RBP1.27□□□□□ -2.21
PDCL2-201ENST00000295645 SIGLEC14Q08ET2 396 aa1.27□□□□□ -2.21
PDCL2-201ENST00000295645 DMC1Q14565 340 aa1.27□□□□□ -2.21
PDCL2-201ENST00000295645 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP1.27□□□□□ -2.21
PDCL2-201ENST00000295645 CPTPQ5TA50 214 aa1.27□□□□□ -2.21
PDCL2-201ENST00000295645 DEGS2Q6QHC5 323 aa1.27□□□□□ -2.21
PDCL2-201ENST00000295645 MBOAT1Q6ZNC8 495 aa1.27□□□□□ -2.21
PDCL2-201ENST00000295645 SLC22A9Q8IVM8 553 aa1.27□□□□□ -2.21
PDCL2-201ENST00000295645 STK40Q8N2I9 435 aa1.27□□□□□ -2.21
PDCL2-201ENST00000295645 NECAB1Q8N987 351 aa1.27□□□□□ -2.21
PDCL2-201ENST00000295645 AKR7LQ8NHP1 331 aa1.27□□□□□ -2.21
PDCL2-201ENST00000295645 GPR151Q8TDV0 419 aa1.27□□□□□ -2.21
PDCL2-201ENST00000295645 GPR82Q96P67 336 aa1.27□□□□□ -2.21
PDCL2-201ENST00000295645 MICU1Q9BPX6 476 aa1.27□□□□□ -2.21
PDCL2-201ENST00000295645 SAMD10Q9BYL1 202 aa1.27□□□□□ -2.21
PDCL2-201ENST00000295645 DUSP21Q9H596 190 aa1.27□□□□□ -2.21
PDCL2-201ENST00000295645 TRIM45Q9H8W5 580 aaPredicted RBP1.27□□□□□ -2.21
PDCL2-201ENST00000295645 ANKRA2Q9H9E1 313 aa1.27□□□□□ -2.21
PDCL2-201ENST00000295645 TMEM9BQ9NQ34 198 aa1.27□□□□□ -2.21
PDCL2-201ENST00000295645 EXTL2Q9UBQ6 330 aa1.27□□□□□ -2.21
PDCL2-201ENST00000295645 HMGXB4Q9UGU5 601 aa1.27□□□□□ -2.21
PDCL2-201ENST00000295645 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa1.26□□□□□ -2.21
PDCL2-201ENST00000295645 OR2AG2A6NM03 316 aa1.26□□□□□ -2.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.1 ms