RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293845.7

CCDC42-201, Transcript of coiled-coil domain containing 42, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CCDC42, Length 1,374 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC42-201ENST00000293845 SOD3P08294 240 aa11.37□□□□□ -0.59
CCDC42-201ENST00000293845 OR4A8P0C604 315 aa11.37□□□□□ -0.59
CCDC42-201ENST00000293845 CCDC159P0C7I6 412 aa11.37□□□□□ -0.59
CCDC42-201ENST00000293845 SERPINF1P36955 418 aa11.37□□□□□ -0.59
CCDC42-201ENST00000293845 EVX1P49640 407 aa11.37□□□□□ -0.59
CCDC42-201ENST00000293845 ZNF121P58317 390 aaPredicted RBP11.37□□□□□ -0.59
CCDC42-201ENST00000293845 ZNF718Q3SXZ3 478 aa11.37□□□□□ -0.59
CCDC42-201ENST00000293845 AGAP6Q5VW22 663 aa11.37□□□□□ -0.59
CCDC42-201ENST00000293845 MBNL2Q5VZF2 373 aaKnown RBP11.37□□□□□ -0.59
CCDC42-201ENST00000293845 C11orf71Q6IPW1 123 aa11.37□□□□□ -0.59
CCDC42-201ENST00000293845 PLEKHG7Q6ZR37 379 aa11.37□□□□□ -0.59
CCDC42-201ENST00000293845 BPIFB6Q8NFQ5 453 aa11.37□□□□□ -0.59
CCDC42-201ENST00000293845 OR52H1Q8NGJ2 320 aa11.37□□□□□ -0.59
CCDC42-201ENST00000293845 OR5L1Q8NGL2 311 aa11.37□□□□□ -0.59
CCDC42-201ENST00000293845 KLF14Q8TD94 323 aaPredicted RBP11.37□□□□□ -0.59
CCDC42-201ENST00000293845 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP11.37□□□□□ -0.59
CCDC42-201ENST00000293845 TRAF4Q9BUZ4 470 aaPredicted RBP11.37□□□□□ -0.59
CCDC42-201ENST00000293845 MRPL37Q9BZE1 423 aaKnown RBP11.37□□□□□ -0.59
CCDC42-201ENST00000293845 OR2J1Q9GZK6 312 aa11.37□□□□□ -0.59
CCDC42-201ENST00000293845 PLK3Q9H4B4 646 aa11.37□□□□□ -0.59
CCDC42-201ENST00000293845 SP140LQ9H930 580 aa11.37□□□□□ -0.59
CCDC42-201ENST00000293845 CBLN4Q9NTU7 201 aa11.37□□□□□ -0.59
CCDC42-201ENST00000293845 ERVK13-1Q9NX77 482 aa11.37□□□□□ -0.59
CCDC42-201ENST00000293845 DIMT1Q9UNQ2 313 aaKnown RBP11.37□□□□□ -0.59
CCDC42-201ENST00000293845 STARD10Q9Y365 291 aa11.37□□□□□ -0.59
CCDC42-201ENST00000293845 ARID1AO14497 2285 aa11.37□□□□□ -0.59
CCDC42-201ENST00000293845 LRBAP50851 2863 aa11.36□□□□□ -0.59
CCDC42-201ENST00000293845 TMEM129A0AVI4 362 aa11.36□□□□□ -0.59
CCDC42-201ENST00000293845 METTL15A6NJ78 407 aa11.36□□□□□ -0.59
CCDC42-201ENST00000293845 ACOD1A6NK06 481 aa11.36□□□□□ -0.59
CCDC42-201ENST00000293845 B9A039 149 aa11.36□□□□□ -0.59
CCDC42-201ENST00000293845 MAGEB4O15481 346 aaPredicted RBP11.36□□□□□ -0.59
CCDC42-201ENST00000293845 SRSF10O75494 262 aaKnown RBP11.36□□□□□ -0.59
CCDC42-201ENST00000293845 CD8AP01732 235 aa11.36□□□□□ -0.59
CCDC42-201ENST00000293845 ADRA2AP08913 450 aa11.36□□□□□ -0.59
CCDC42-201ENST00000293845 LIMS3P0CW19 117 aa11.36□□□□□ -0.59
CCDC42-201ENST00000293845 LIMS4P0CW20 117 aa11.36□□□□□ -0.59
CCDC42-201ENST00000293845 SLC2A1P11166 492 aa11.36□□□□□ -0.59
CCDC42-201ENST00000293845 ANOS1P23352 680 aa11.36□□□□□ -0.59
CCDC42-201ENST00000293845 MMP16P51512 607 aa11.36□□□□□ -0.59
CCDC42-201ENST00000293845 ACTA2P62736 377 aa11.36□□□□□ -0.59
CCDC42-201ENST00000293845 ACTG2P63267 376 aa11.36□□□□□ -0.59
CCDC42-201ENST00000293845 GALEQ14376 348 aa11.36□□□□□ -0.59
CCDC42-201ENST00000293845 SWI5Q1ZZU3 235 aa11.36□□□□□ -0.59
CCDC42-201ENST00000293845 MST1LQ2TV78 715 aa11.36□□□□□ -0.59
CCDC42-201ENST00000293845 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP11.36□□□□□ -0.59
CCDC42-201ENST00000293845 SNAI3Q3KNW1 292 aa11.36□□□□□ -0.59
CCDC42-201ENST00000293845 FBXW12Q6X9E4 464 aa11.36□□□□□ -0.59
CCDC42-201ENST00000293845 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa11.36□□□□□ -0.59
CCDC42-201ENST00000293845 SYS1Q8N2H4 156 aa11.36□□□□□ -0.59
CCDC42-201ENST00000293845 SYNPRQ8TBG9 265 aa11.36□□□□□ -0.59
CCDC42-201ENST00000293845 SNX33Q8WV41 574 aa11.36□□□□□ -0.59
CCDC42-201ENST00000293845 NRGNQ92686 78 aa11.36□□□□□ -0.59
CCDC42-201ENST00000293845 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP11.36□□□□□ -0.59
CCDC42-201ENST00000293845 TMEM80Q96HE8 168 aa11.36□□□□□ -0.59
CCDC42-201ENST00000293845 ALG8Q9BVK2 526 aa11.36□□□□□ -0.59
CCDC42-201ENST00000293845 LIME1Q9H400 295 aa11.36□□□□□ -0.59
CCDC42-201ENST00000293845 POFUT1Q9H488 388 aa11.36□□□□□ -0.59
CCDC42-201ENST00000293845 FAM206AQ9NX38 181 aa11.36□□□□□ -0.59
CCDC42-201ENST00000293845 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa11.36□□□□□ -0.59
CCDC42-201ENST00000293845 EDARQ9UNE0 448 aa11.36□□□□□ -0.59
CCDC42-201ENST00000293845 TMEM269A0A1B0GVZ9 245 aa11.35□□□□□ -0.59
CCDC42-201ENST00000293845 XRCC2O43543 280 aa11.35□□□□□ -0.59
CCDC42-201ENST00000293845 ATE1O95260 518 aa11.35□□□□□ -0.59
CCDC42-201ENST00000293845 TACC2O95359 2948 aa11.35□□□□□ -0.59
CCDC42-201ENST00000293845 IGHV3-13P01766 116 aa11.35□□□□□ -0.59
CCDC42-201ENST00000293845 RAF1P04049 648 aa11.35□□□□□ -0.59
CCDC42-201ENST00000293845 ANXA2P07355 339 aaKnown RBP11.35□□□□□ -0.59
CCDC42-201ENST00000293845 RAC2P15153 192 aa11.35□□□□□ -0.59
CCDC42-201ENST00000293845 GCH1P30793 250 aa11.35□□□□□ -0.59
CCDC42-201ENST00000293845 KLF3P57682 345 aaPredicted RBP11.35□□□□□ -0.59
CCDC42-201ENST00000293845 SLC35A2P78381 396 aa11.35□□□□□ -0.59
CCDC42-201ENST00000293845 ST3GAL4Q11206 333 aa11.35□□□□□ -0.59
CCDC42-201ENST00000293845 SPATA46Q5T0L3 261 aa11.35□□□□□ -0.59
CCDC42-201ENST00000293845 LIPNQ5VXI9 398 aa11.35□□□□□ -0.59
CCDC42-201ENST00000293845 AHSA2Q719I0 299 aa11.35□□□□□ -0.59
CCDC42-201ENST00000293845 FAM57BQ71RH2 274 aa11.35□□□□□ -0.59
CCDC42-201ENST00000293845 FAM220AQ7Z4H9 259 aa11.35□□□□□ -0.59
CCDC42-201ENST00000293845 LHFPL3Q86UP9 236 aa11.35□□□□□ -0.59
CCDC42-201ENST00000293845 NAV2Q8IVL1 2488 aa11.35□□□□□ -0.59
CCDC42-201ENST00000293845 YIPF7Q8N8F6 280 aa11.35□□□□□ -0.59
CCDC42-201ENST00000293845 ZNF540Q8NDQ6 660 aa11.35□□□□□ -0.59
CCDC42-201ENST00000293845 NINJ1Q92982 152 aa11.35□□□□□ -0.59
CCDC42-201ENST00000293845 SPSB4Q96A44 273 aa11.35□□□□□ -0.59
CCDC42-201ENST00000293845 CCL19Q99731 98 aa11.35□□□□□ -0.59
CCDC42-201ENST00000293845 MOB1AQ9H8S9 216 aa11.35□□□□□ -0.59
CCDC42-201ENST00000293845 SCN3BQ9NY72 215 aa11.35□□□□□ -0.59
CCDC42-201ENST00000293845 UBAP1Q9NZ09 502 aa11.35□□□□□ -0.59
CCDC42-201ENST00000293845 PTTG3PQ9NZH4 202 aa11.35□□□□□ -0.59
CCDC42-201ENST00000293845 FBXO9Q9UK97 447 aaPredicted RBP11.35□□□□□ -0.59
CCDC42-201ENST00000293845 LAMP3Q9UQV4 416 aa11.35□□□□□ -0.59
CCDC42-201ENST00000293845 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP11.35□□□□□ -0.59
CCDC42-201ENST00000293845 TPRKBQ9Y3C4 175 aa11.35□□□□□ -0.59
CCDC42-201ENST00000293845 PCDHGB5Q9Y5G0 923 aa11.35□□□□□ -0.59
CCDC42-201ENST00000293845 R4GMQ9 66 aa11.35□□□□□ -0.59
CCDC42-201ENST00000293845 C5orf63A6NC05 138 aa11.34□□□□□ -0.59
CCDC42-201ENST00000293845 PNPP00491 289 aa11.34□□□□□ -0.59
CCDC42-201ENST00000293845 TACSTD2P09758 323 aa11.34□□□□□ -0.59
CCDC42-201ENST00000293845 MYL12AP19105 171 aa11.34□□□□□ -0.59
CCDC42-201ENST00000293845 CD53P19397 219 aa11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.2 ms