RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261169.10

LMO3-201, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LMO3, Length 3,810 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-201ENST00000261169 MAGT1Q9H0U3 335 aa4.97□□□□□ -1.61
LMO3-201ENST00000261169 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP4.97□□□□□ -1.61
LMO3-201ENST00000261169 GLTPQ9NZD2 209 aa4.97□□□□□ -1.61
LMO3-201ENST00000261169 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa4.97□□□□□ -1.61
LMO3-201ENST00000261169 CUL9Q8IWT3 2517 aa4.97□□□□□ -1.61
LMO3-201ENST00000261169 USF3Q68DE3 2245 aa4.97□□□□□ -1.61
LMO3-201ENST00000261169 TMEM221A6NGB7 291 aa4.97□□□□□ -1.61
LMO3-201ENST00000261169 XRCC2O43543 280 aa4.97□□□□□ -1.61
LMO3-201ENST00000261169 TNFSF15O95150 251 aa4.97□□□□□ -1.61
LMO3-201ENST00000261169 WNT1P04628 370 aa4.97□□□□□ -1.61
LMO3-201ENST00000261169 RPS16P62249 146 aaKnown RBP4.97□□□□□ -1.61
LMO3-201ENST00000261169 IFITM3Q01628 133 aa4.97□□□□□ -1.61
LMO3-201ENST00000261169 PRSS53Q2L4Q9 553 aa4.97□□□□□ -1.61
LMO3-201ENST00000261169 CLVS2Q5SYC1 327 aa4.97□□□□□ -1.61
LMO3-201ENST00000261169 PXDC1Q5TGL8 231 aa4.97□□□□□ -1.61
LMO3-201ENST00000261169 OR8G2PQ6IF36 304 aa4.97□□□□□ -1.61
LMO3-201ENST00000261169 OVCH1Q7RTY7 1134 aa4.97□□□□□ -1.61
LMO3-201ENST00000261169 SYS1Q8N2H4 156 aa4.97□□□□□ -1.61
LMO3-201ENST00000261169 ZNF808Q8N4W9 903 aaPredicted RBP4.97□□□□□ -1.61
LMO3-201ENST00000261169 OR5M9Q8NGP3 310 aa4.97□□□□□ -1.61
LMO3-201ENST00000261169 OR14K1Q8NGZ2 314 aa4.97□□□□□ -1.61
LMO3-201ENST00000261169 ST7LQ8TDW4 575 aa4.97□□□□□ -1.61
LMO3-201ENST00000261169 TCEAL3Q969E4 200 aa4.97□□□□□ -1.61
LMO3-201ENST00000261169 C19orf43Q9BQ61 176 aa4.97□□□□□ -1.61
LMO3-201ENST00000261169 ZNF2Q9BSG1 426 aaPredicted RBP4.97□□□□□ -1.61
LMO3-201ENST00000261169 PBDC1Q9BVG4 233 aa4.97□□□□□ -1.61
LMO3-201ENST00000261169 JAM3Q9BX67 310 aa4.97□□□□□ -1.61
LMO3-201ENST00000261169 PBOV1Q9GZY1 135 aa4.97□□□□□ -1.61
LMO3-201ENST00000261169 PLEKHA3Q9HB20 300 aa4.97□□□□□ -1.61
LMO3-201ENST00000261169 B3GALT5Q9Y2C3 310 aa4.97□□□□□ -1.61
LMO3-201ENST00000261169 LOXL2Q9Y4K0 774 aa4.97□□□□□ -1.61
LMO3-201ENST00000261169 LRP12Q9Y561 859 aa4.97□□□□□ -1.61
LMO3-201ENST00000261169 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa4.97□□□□□ -1.61
LMO3-201ENST00000261169 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP4.97□□□□□ -1.61
LMO3-201ENST00000261169 IGKV1-8A0A0C4DH67 115 aa4.97□□□□□ -1.61
LMO3-201ENST00000261169 GPR171O14626 319 aa4.97□□□□□ -1.61
LMO3-201ENST00000261169 MPPED1O15442 326 aa4.97□□□□□ -1.61
LMO3-201ENST00000261169 DHHO43323 396 aa4.97□□□□□ -1.61
LMO3-201ENST00000261169 CLDN1O95832 211 aa4.97□□□□□ -1.61
LMO3-201ENST00000261169 C1QBP02746 253 aa4.97□□□□□ -1.61
LMO3-201ENST00000261169 SERPINA7P05543 415 aa4.97□□□□□ -1.61
LMO3-201ENST00000261169 PPP3CBP16298 524 aa4.97□□□□□ -1.61
LMO3-201ENST00000261169 NAGAP17050 411 aa4.97□□□□□ -1.61
LMO3-201ENST00000261169 TGM1P22735 817 aa4.97□□□□□ -1.61
LMO3-201ENST00000261169 SERPINF1P36955 418 aa4.97□□□□□ -1.61
LMO3-201ENST00000261169 RBP2P50120 134 aa4.97□□□□□ -1.61
LMO3-201ENST00000261169 TAS2R46P59540 309 aa4.97□□□□□ -1.61
LMO3-201ENST00000261169 PLA2G7Q13093 441 aa4.97□□□□□ -1.61
LMO3-201ENST00000261169 PAN3Q58A45 887 aaKnown RBP4.97□□□□□ -1.61
LMO3-201ENST00000261169 LAIR1Q6GTX8 287 aa4.97□□□□□ -1.61
LMO3-201ENST00000261169 C5orf46Q6UWT4 87 aa4.97□□□□□ -1.61
LMO3-201ENST00000261169 SSX9Q7RTT3 188 aa4.97□□□□□ -1.61
LMO3-201ENST00000261169 NAXDQ8IW45 347 aa4.97□□□□□ -1.61
LMO3-201ENST00000261169 NT5CQ8TCD5 201 aa4.97□□□□□ -1.61
LMO3-201ENST00000261169 GPBAR1Q8TDU6 330 aa4.97□□□□□ -1.61
LMO3-201ENST00000261169 TRMT61AQ96FX7 289 aaKnown RBP4.97□□□□□ -1.61
LMO3-201ENST00000261169 SLC25A21Q9BQT8 299 aaPredicted RBP4.97□□□□□ -1.61
LMO3-201ENST00000261169 NMNAT2Q9BZQ4 307 aa4.97□□□□□ -1.61
LMO3-201ENST00000261169 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa4.97□□□□□ -1.61
LMO3-201ENST00000261169 DYNLRB1Q9NP97 96 aa4.97□□□□□ -1.61
LMO3-201ENST00000261169 BIN3Q9NQY0 253 aa4.97□□□□□ -1.61
LMO3-201ENST00000261169 ZNF230Q9UIE0 474 aaPredicted RBP4.97□□□□□ -1.61
LMO3-201ENST00000261169 RNF150Q9ULK6 438 aa4.97□□□□□ -1.61
LMO3-201ENST00000261169 MPDZO75970 2070 aa4.96□□□□□ -1.61
LMO3-201ENST00000261169 MYO18BQ8IUG5 2567 aa4.96□□□□□ -1.61
LMO3-201ENST00000261169 RPS10-NUDT3A0A1W2PQS6 291 aa4.96□□□□□ -1.61
LMO3-201ENST00000261169 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.61
LMO3-201ENST00000261169 C17orf51A8MQB3 221 aa4.96□□□□□ -1.61
LMO3-201ENST00000261169 C1orf196B1AJZ1 125 aa4.96□□□□□ -1.61
LMO3-201ENST00000261169 MSTNO14793 375 aa4.96□□□□□ -1.61
LMO3-201ENST00000261169 OIP5O43482 229 aa4.96□□□□□ -1.61
LMO3-201ENST00000261169 LPLP06858 475 aa4.96□□□□□ -1.61
LMO3-201ENST00000261169 ACHEP22303 614 aa4.96□□□□□ -1.61
LMO3-201ENST00000261169 PEBP1P30086 187 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.61
LMO3-201ENST00000261169 DDOSTP39656 456 aa4.96□□□□□ -1.61
LMO3-201ENST00000261169 RPS10P46783 165 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.61
LMO3-201ENST00000261169 RAB5BP61020 215 aa4.96□□□□□ -1.61
LMO3-201ENST00000261169 TLE1Q04724 770 aa4.96□□□□□ -1.61
LMO3-201ENST00000261169 CLEC12BQ2HXU8 276 aa4.96□□□□□ -1.61
LMO3-201ENST00000261169 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.61
LMO3-201ENST00000261169 CST9LP1Q5W188 147 aa4.96□□□□□ -1.61
LMO3-201ENST00000261169 CD276Q5ZPR3 534 aa4.96□□□□□ -1.61
LMO3-201ENST00000261169 C6orf15Q6UXA7 325 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.61
LMO3-201ENST00000261169 DGAT2L6Q6ZPD8 337 aa4.96□□□□□ -1.61
LMO3-201ENST00000261169 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.61
LMO3-201ENST00000261169 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa4.96□□□□□ -1.61
LMO3-201ENST00000261169 DMBX1Q8NFW5 382 aa4.96□□□□□ -1.61
LMO3-201ENST00000261169 PPP1R35Q8TAP8 253 aa4.96□□□□□ -1.61
LMO3-201ENST00000261169 ZFAND1Q8TCF1 268 aa4.96□□□□□ -1.61
LMO3-201ENST00000261169 SPACA9Q96E40 222 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.61
LMO3-201ENST00000261169 WDR34Q96EX3 536 aa4.96□□□□□ -1.61
LMO3-201ENST00000261169 MVB12AQ96EY5 273 aa4.96□□□□□ -1.61
LMO3-201ENST00000261169 TMPRSS13Q9BYE2 586 aa4.96□□□□□ -1.61
LMO3-201ENST00000261169 CYSLTR2Q9NS75 346 aa4.96□□□□□ -1.61
LMO3-201ENST00000261169 ETV7Q9Y603 341 aa4.96□□□□□ -1.61
LMO3-201ENST00000261169 FAM208BQ5VWN6 2430 aa4.96□□□□□ -1.62
LMO3-201ENST00000261169 FRG2CA6NGY1 282 aa4.96□□□□□ -1.62
LMO3-201ENST00000261169 OR5H14A6NHG9 310 aa4.96□□□□□ -1.62
LMO3-201ENST00000261169 B8ZZF3 427 aa4.96□□□□□ -1.62
LMO3-201ENST00000261169 MASP2O00187 686 aa4.96□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.5 ms