RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258243.6

URB2-201, Transcript of URB2 ribosome biogenesis 2 homolog (S. cerevisiae), humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene URB2, Length 5,613 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
URB2-201ENST00000258243 FXYD1O00168 92 aa9.89□□□□□ -0.83
URB2-201ENST00000258243 TNFSF11O14788 317 aa9.89□□□□□ -0.83
URB2-201ENST00000258243 CST2P09228 141 aa9.89□□□□□ -0.83
URB2-201ENST00000258243 OR8G3PP0DMU2 310 aa9.89□□□□□ -0.83
URB2-201ENST00000258243 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP9.89□□□□□ -0.83
URB2-201ENST00000258243 CCR6P51684 374 aa9.89□□□□□ -0.83
URB2-201ENST00000258243 SLC14A1Q13336 389 aa9.89□□□□□ -0.83
URB2-201ENST00000258243 TCTN1Q2MV58 587 aa9.89□□□□□ -0.83
URB2-201ENST00000258243 TMEM211Q6ICI0 200 aa9.89□□□□□ -0.83
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URB2-201ENST00000258243 M0R082 166 aa9.89□□□□□ -0.83
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URB2-201ENST00000258243 CT45A5P0DMU8 189 aa9.88□□□□□ -0.83
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URB2-201ENST00000258243 CT45A8P0DMV1 189 aa9.88□□□□□ -0.83
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URB2-201ENST00000258243 HIST1H3AP68431 136 aa9.88□□□□□ -0.83
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URB2-201ENST00000258243 ARV1Q9H2C2 271 aa9.88□□□□□ -0.83
URB2-201ENST00000258243 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
URB2-201ENST00000258243 GNG12Q9UBI6 72 aa9.88□□□□□ -0.83
URB2-201ENST00000258243 A6NDN8 102 aa9.88□□□□□ -0.83
URB2-201ENST00000258243 M0R1X1 148 aa9.88□□□□□ -0.83
URB2-201ENST00000258243 BMPR1BO00238 502 aa9.88□□□□□ -0.83
URB2-201ENST00000258243 XRCC3O43542 346 aa9.88□□□□□ -0.83
URB2-201ENST00000258243 OR7C1O76099 320 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
URB2-201ENST00000258243 GRPP07492 148 aa9.88□□□□□ -0.83
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URB2-201ENST00000258243 SPNP16150 400 aa9.88□□□□□ -0.83
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URB2-201ENST00000258243 JMJD6Q6NYC1 403 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
URB2-201ENST00000258243 OR4M1Q8NGD0 313 aa9.88□□□□□ -0.83
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URB2-201ENST00000258243 TRDV1A0A1B0GX56 115 aa9.88□□□□□ -0.83
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URB2-201ENST00000258243 CTF1Q16619 201 aa9.88□□□□□ -0.83
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URB2-201ENST00000258243 OLIG1Q8TAK6 271 aa9.88□□□□□ -0.83
URB2-201ENST00000258243 C12orf10Q9HB07 376 aa9.88□□□□□ -0.83
URB2-201ENST00000258243 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa9.88□□□□□ -0.83
URB2-201ENST00000258243 GPRIN2O60269 458 aa9.88□□□□□ -0.83
URB2-201ENST00000258243 RAB40ALP0C0E4 278 aa9.88□□□□□ -0.83
URB2-201ENST00000258243 OR10J4P0C629 311 aa9.88□□□□□ -0.83
URB2-201ENST00000258243 SFTPCP11686 197 aa9.88□□□□□ -0.83
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