RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233025.11

SPCS1-201, Transcript of signal peptidase complex subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPCS1, Length 1,082 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS1-201ENST00000233025 CD276Q5ZPR3 534 aa13.46□□□□□ -0.25
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SPCS1-201ENST00000233025 KCNN2Q9H2S1 579 aa13.43□□□□□ -0.26
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SPCS1-201ENST00000233025 BAG5Q9UL15 447 aa13.43□□□□□ -0.26
SPCS1-201ENST00000233025 IGHV3-64DA0A0J9YX35 117 aa13.42□□□□□ -0.26
SPCS1-201ENST00000233025 MEGF11A6BM72 1044 aa13.42□□□□□ -0.26
SPCS1-201ENST00000233025 LRRC30A6NM36 301 aa13.42□□□□□ -0.26
SPCS1-201ENST00000233025 OR1E2P47887 323 aa13.42□□□□□ -0.26
SPCS1-201ENST00000233025 HDDC2Q7Z4H3 204 aa13.42□□□□□ -0.26
SPCS1-201ENST00000233025 VMO1Q7Z5L0 202 aa13.42□□□□□ -0.26
SPCS1-201ENST00000233025 C19orf18Q8NEA5 215 aa13.42□□□□□ -0.26
SPCS1-201ENST00000233025 CMBLQ96DG6 245 aa13.42□□□□□ -0.26
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