RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000641787.1

TNNT3-218, Transcript of troponin T3, fast skeletal type, humanhuman

APPRIS ALT2 BASIC

Gene TNNT3, Length 924 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT3-218ENST00000641787 CGREF1Q99674 301 aa7.32□□□□□ -1.24
TNNT3-218ENST00000641787 POLR2J2Q9GZM3 115 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
TNNT3-218ENST00000641787 POLR2J3Q9H1A7 115 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
TNNT3-218ENST00000641787 SMURF1Q9HCE7 757 aa7.32□□□□□ -1.24
TNNT3-218ENST00000641787 NECAP2Q9NVZ3 263 aa7.32□□□□□ -1.24
TNNT3-218ENST00000641787 RNASEK-C17orf49H0YIS7 233 aa7.31□□□□□ -1.24
TNNT3-218ENST00000641787 FCN3O75636 299 aa7.31□□□□□ -1.24
TNNT3-218ENST00000641787 PTBP3O95758 552 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
TNNT3-218ENST00000641787 FBP1P09467 338 aa7.31□□□□□ -1.24
TNNT3-218ENST00000641787 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP7.31□□□□□ -1.24
TNNT3-218ENST00000641787 IRF2P14316 349 aa7.31□□□□□ -1.24
TNNT3-218ENST00000641787 CD200P41217 278 aa7.31□□□□□ -1.24
TNNT3-218ENST00000641787 GUCA1AP43080 201 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
TNNT3-218ENST00000641787 EFNB2P52799 333 aa7.31□□□□□ -1.24
TNNT3-218ENST00000641787 CRYBA2P53672 197 aa7.31□□□□□ -1.24
TNNT3-218ENST00000641787 MTPNP58546 118 aa7.31□□□□□ -1.24
TNNT3-218ENST00000641787 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
TNNT3-218ENST00000641787 AQP6Q13520 282 aa7.31□□□□□ -1.24
TNNT3-218ENST00000641787 CYLC2Q14093 348 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
TNNT3-218ENST00000641787 LAPTM4AQ15012 233 aa7.31□□□□□ -1.24
TNNT3-218ENST00000641787 METTL21CQ5VZV1 264 aa7.31□□□□□ -1.24
TNNT3-218ENST00000641787 C11orf88Q6PI97 169 aa7.31□□□□□ -1.24
TNNT3-218ENST00000641787 DLEU7Q6UYE1 221 aa7.31□□□□□ -1.24
TNNT3-218ENST00000641787 Q6ZTK2 550 aa7.31□□□□□ -1.24
TNNT3-218ENST00000641787 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
TNNT3-218ENST00000641787 DPP10Q8N608 796 aa7.31□□□□□ -1.24
TNNT3-218ENST00000641787 SCCPDHQ8NBX0 429 aa7.31□□□□□ -1.24
TNNT3-218ENST00000641787 NPRL2Q8WTW4 380 aa7.31□□□□□ -1.24
TNNT3-218ENST00000641787 TSPEARQ8WU66 669 aa7.31□□□□□ -1.24
TNNT3-218ENST00000641787 TMEM239Q8WW34 195 aa7.31□□□□□ -1.24
TNNT3-218ENST00000641787 RASSF5Q8WWW0 418 aa7.31□□□□□ -1.24
TNNT3-218ENST00000641787 SLC7A6Q92536 515 aa7.31□□□□□ -1.24
TNNT3-218ENST00000641787 TAMM41Q96BW9 452 aa7.31□□□□□ -1.24
TNNT3-218ENST00000641787 ZNF582Q96NG8 517 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
TNNT3-218ENST00000641787 TECTBQ96PL2 329 aa7.31□□□□□ -1.24
TNNT3-218ENST00000641787 SH3GL1Q99961 368 aa7.31□□□□□ -1.24
TNNT3-218ENST00000641787 EMC7Q9NPA0 242 aa7.31□□□□□ -1.24
TNNT3-218ENST00000641787 ERVK-18Q9QC07 812 aa7.31□□□□□ -1.24
TNNT3-218ENST00000641787 TMCC3Q9ULS5 477 aa7.31□□□□□ -1.24
TNNT3-218ENST00000641787 KPTNQ9Y664 436 aa7.31□□□□□ -1.24
TNNT3-218ENST00000641787 COL7A1Q02388 2944 aa7.3□□□□□ -1.24
TNNT3-218ENST00000641787 IGHV3-64DA0A0J9YX35 117 aa7.3□□□□□ -1.24
TNNT3-218ENST00000641787 A0A1B0GVI7 797 aa7.3□□□□□ -1.24
TNNT3-218ENST00000641787 A6NIZ1 184 aa7.3□□□□□ -1.24
TNNT3-218ENST00000641787 XPNPEP2O43895 674 aa7.3□□□□□ -1.24
TNNT3-218ENST00000641787 EDF1O60869 148 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
TNNT3-218ENST00000641787 FAM20BO75063 409 aa7.3□□□□□ -1.24
TNNT3-218ENST00000641787 OR5F1O95221 314 aa7.3□□□□□ -1.24
TNNT3-218ENST00000641787 IFNA14P01570 189 aa7.3□□□□□ -1.24
TNNT3-218ENST00000641787 RAP1BP61224 184 aa7.3□□□□□ -1.24
TNNT3-218ENST00000641787 RAP1AP62834 184 aa7.3□□□□□ -1.24
TNNT3-218ENST00000641787 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
TNNT3-218ENST00000641787 FHL1Q13642 323 aa7.3□□□□□ -1.24
TNNT3-218ENST00000641787 MAPRE2Q15555 327 aa7.3□□□□□ -1.24
TNNT3-218ENST00000641787 KCNJ8Q15842 424 aa7.3□□□□□ -1.24
TNNT3-218ENST00000641787 SLC35E4Q6ICL7 350 aa7.3□□□□□ -1.24
TNNT3-218ENST00000641787 COLCA1Q6ZS62 124 aa7.3□□□□□ -1.24
TNNT3-218ENST00000641787 FAM156AQ8NDB6 213 aa7.3□□□□□ -1.24
TNNT3-218ENST00000641787 C19orf18Q8NEA5 215 aa7.3□□□□□ -1.24
TNNT3-218ENST00000641787 OR5L1Q8NGL2 311 aa7.3□□□□□ -1.24
TNNT3-218ENST00000641787 APOBEC3DQ96AK3 386 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
TNNT3-218ENST00000641787 PHF21AQ96BD5 680 aa7.3□□□□□ -1.24
TNNT3-218ENST00000641787 DMRTB1Q96MA1 342 aa7.3□□□□□ -1.24
TNNT3-218ENST00000641787 ECSITQ9BQ95 431 aa7.3□□□□□ -1.24
TNNT3-218ENST00000641787 PTTG3PQ9NZH4 202 aa7.3□□□□□ -1.24
TNNT3-218ENST00000641787 CAB39Q9Y376 341 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
TNNT3-218ENST00000641787 TEX13CA0A0J9YWL9 993 aa7.29□□□□□ -1.24
TNNT3-218ENST00000641787 HTR3EA5X5Y0 456 aa7.29□□□□□ -1.24
TNNT3-218ENST00000641787 BTBD17A6NE02 478 aa7.29□□□□□ -1.24
TNNT3-218ENST00000641787 LGALS8O00214 317 aa7.29□□□□□ -1.24
TNNT3-218ENST00000641787 FBP2O00757 339 aa7.29□□□□□ -1.24
TNNT3-218ENST00000641787 NDUFA2O43678 99 aa7.29□□□□□ -1.24
TNNT3-218ENST00000641787 AHCYL1O43865 530 aa7.29□□□□□ -1.24
TNNT3-218ENST00000641787 ECDO95905 644 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
TNNT3-218ENST00000641787 HLA-DPB1P04440 258 aa7.29□□□□□ -1.24
TNNT3-218ENST00000641787 DBHP09172 617 aa7.29□□□□□ -1.24
TNNT3-218ENST00000641787 VSIG8P0DPA2 414 aa7.29□□□□□ -1.24
TNNT3-218ENST00000641787 FPR3P25089 353 aa7.29□□□□□ -1.24
TNNT3-218ENST00000641787 GABRA5P31644 462 aa7.29□□□□□ -1.24
TNNT3-218ENST00000641787 CTXN1P60606 82 aa7.29□□□□□ -1.24
TNNT3-218ENST00000641787 LSM6P62312 80 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
TNNT3-218ENST00000641787 HIST1H3AP68431 136 aa7.29□□□□□ -1.24
TNNT3-218ENST00000641787 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
TNNT3-218ENST00000641787 SELPLGQ14242 412 aa7.29□□□□□ -1.24
TNNT3-218ENST00000641787 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa7.29□□□□□ -1.24
TNNT3-218ENST00000641787 ANKDD1AQ495B1 522 aa7.29□□□□□ -1.24
TNNT3-218ENST00000641787 CDONQ4KMG0 1287 aa7.29□□□□□ -1.24
TNNT3-218ENST00000641787 CCDC92Q53HC0 331 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
TNNT3-218ENST00000641787 OXLD1Q5BKU9 147 aa7.29□□□□□ -1.24
TNNT3-218ENST00000641787 HIST2H3PS2Q5TEC6 136 aa7.29□□□□□ -1.24
TNNT3-218ENST00000641787 C1orf94Q6P1W5 598 aa7.29□□□□□ -1.24
TNNT3-218ENST00000641787 HIST2H3AQ71DI3 136 aa7.29□□□□□ -1.24
TNNT3-218ENST00000641787 CCDC80Q76M96 950 aa7.29□□□□□ -1.24
TNNT3-218ENST00000641787 VMO1Q7Z5L0 202 aa7.29□□□□□ -1.24
TNNT3-218ENST00000641787 BHLHE23Q8NDY6 225 aa7.29□□□□□ -1.24
TNNT3-218ENST00000641787 OR11L1Q8NGX0 322 aa7.29□□□□□ -1.24
TNNT3-218ENST00000641787 OR10A6Q8NH74 314 aa7.29□□□□□ -1.24
TNNT3-218ENST00000641787 OR5R1Q8NH85 324 aa7.29□□□□□ -1.24
TNNT3-218ENST00000641787 OR1F12Q8NHA8 337 aa7.29□□□□□ -1.24
TNNT3-218ENST00000641787 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa7.29□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29 ms