RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578334.5

TSPOAP1-AS1-202, TSPOAP1, SUPT4H1 and RNF43 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TSPOAP1-AS1, Length 956 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 GADD45GO95257 159 aa23.69■■□□□ 1.38
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 CYB5R3P00387 301 aaPredicted RBP23.69■■□□□ 1.38
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 RENP00797 406 aa23.69■■□□□ 1.38
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 SLC6A6P31641 620 aa23.69■■□□□ 1.38
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 SMIM11AP58511 58 aa23.69■■□□□ 1.38
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 AWAT1Q58HT5 328 aa23.69■■□□□ 1.38
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 KLF17Q5JT82 389 aaPredicted RBP23.69■■□□□ 1.38
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 OR6V1Q8N148 313 aa23.69■■□□□ 1.38
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 MYLK2Q9H1R3 596 aa23.69■■□□□ 1.38
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 OR52D1Q9H346 318 aa23.69■■□□□ 1.38
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 LRCH1Q9Y2L9 728 aa23.69■■□□□ 1.38
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 SPRY1O43609 319 aaPredicted RBP23.68■■□□□ 1.38
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 RPS2P15880 293 aaKnown RBP23.68■■□□□ 1.38
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP23.68■■□□□ 1.38
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 COX10Q12887 443 aa23.68■■□□□ 1.38
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 RFX4Q33E94 735 aa23.68■■□□□ 1.38
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 LINC00346Q8IVM7 164 aa23.68■■□□□ 1.38
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 OR4K13Q8NH42 304 aa23.68■■□□□ 1.38
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 PYURFQ96I23 114 aa23.68■■□□□ 1.38
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 SLC30A2Q9BRI3 323 aa23.68■■□□□ 1.38
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 IFT27Q9BW83 186 aa23.68■■□□□ 1.38
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 HCAR1Q9BXC0 346 aa23.68■■□□□ 1.38
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 GORASP2Q9H8Y8 452 aa23.68■■□□□ 1.38
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 IQCF6A8MYZ5 107 aa23.67■■□□□ 1.38
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 F5H5P2 479 aa23.67■■□□□ 1.38
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 MLNRO43193 412 aa23.67■■□□□ 1.38
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 WNT2P09544 360 aa23.67■■□□□ 1.38
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 HIST1H1CP16403 213 aaKnown RBP23.67■■□□□ 1.38
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 PRDX6P30041 224 aa23.67■■□□□ 1.38
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 DOK3Q7L591 496 aa23.67■■□□□ 1.38
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 MOGAT3Q86VF5 341 aa23.67■■□□□ 1.38
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 SLC26A10Q8NG04 563 aa23.67■■□□□ 1.38
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 DUX5Q96PT3 197 aa23.67■■□□□ 1.38
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 PITX2Q99697 317 aa23.67■■□□□ 1.38
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 SSBP3Q9BWW4 388 aaPredicted RBP23.67■■□□□ 1.38
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 RPRD1BQ9NQG5 326 aaKnown RBP23.67■■□□□ 1.38
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 ARPC3O15145 178 aa23.66■■□□□ 1.38
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 OR10H3O60404 316 aa23.66■■□□□ 1.38
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 NOS3P29474 1203 aa23.66■■□□□ 1.38
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 CFAP77Q6ZQR2 320 aa23.66■■□□□ 1.38
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP23.66■■□□□ 1.38
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 SGMS2Q8NHU3 365 aa23.66■■□□□ 1.38
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 CDADC1Q9BWV3 514 aa23.66■■□□□ 1.38
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 TMEM165Q9HC07 324 aa23.66■■□□□ 1.38
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 TMEM100Q9NV29 134 aa23.66■■□□□ 1.38
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 LRRC30A6NM36 301 aa23.65■■□□□ 1.38
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 F5H5K5 113 aa23.65■■□□□ 1.38
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 HLA-DQA2P01906 255 aa23.65■■□□□ 1.38
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 SEMG1P04279 462 aa23.65■■□□□ 1.38
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 SELEP16581 610 aa23.65■■□□□ 1.38
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 EGR1P18146 543 aa23.65■■□□□ 1.38
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 FPR3P25089 353 aa23.65■■□□□ 1.38
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 PRSS12P56730 875 aa23.65■■□□□ 1.38
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 GNB2P62879 340 aa23.65■■□□□ 1.38
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP23.65■■□□□ 1.38
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 SLC36A3Q495N2 470 aa23.65■■□□□ 1.38
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 SLC18B1Q6NT16 456 aa23.65■■□□□ 1.38
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 KLBQ86Z14 1044 aa23.65■■□□□ 1.38
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 OR2AJ1Q8NGZ0 328 aa23.65■■□□□ 1.38
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 MCUR1Q96AQ8 359 aa23.65■■□□□ 1.38
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 C1QTNF5Q9BXJ0 243 aa23.65■■□□□ 1.38
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 FAM107BQ9H098 131 aa23.65■■□□□ 1.38
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 FN3KQ9H479 309 aa23.65■■□□□ 1.38
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 MAGEL2Q9UJ55 1249 aa23.65■■□□□ 1.38
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa23.64■■□□□ 1.37
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 HLA-DPB1P04440 258 aa23.64■■□□□ 1.37
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 ACSM4P0C7M7 580 aa23.64■■□□□ 1.37
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 PRTN3P24158 256 aa23.64■■□□□ 1.37
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 CD80P33681 288 aa23.64■■□□□ 1.37
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 BTNL3Q6UXE8 466 aa23.64■■□□□ 1.37
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 COLCA1Q6ZS62 124 aa23.64■■□□□ 1.37
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 C1orf87Q8N0U7 546 aa23.64■■□□□ 1.37
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 SDR9C7Q8NEX9 313 aa23.64■■□□□ 1.37
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 ATF6BQ99941 703 aa23.64■■□□□ 1.37
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP23.64■■□□□ 1.37
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 MIOXQ9UGB7 285 aa23.64■■□□□ 1.37
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 DOCK11Q5JSL3 2073 aa23.64■■□□□ 1.37
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 CPT2P23786 658 aa23.63■■□□□ 1.37
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 IFNGR2P38484 337 aa23.63■■□□□ 1.37
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 PAX8Q06710 450 aa23.63■■□□□ 1.37
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 FOXL1Q12952 345 aa23.63■■□□□ 1.37
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 ECH1Q13011 328 aa23.63■■□□□ 1.37
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 BAMBIQ13145 260 aa23.63■■□□□ 1.37
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 TUSC1Q2TAM9 212 aa23.63■■□□□ 1.37
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa23.63■■□□□ 1.37
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 ZBTB46Q86UZ6 589 aa23.63■■□□□ 1.37
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 OR52E2Q8NGJ4 325 aa23.63■■□□□ 1.37
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP23.63■■□□□ 1.37
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 PLEKHA8Q96JA3 519 aa23.63■■□□□ 1.37
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 TMEM246Q9BRR3 403 aa23.63■■□□□ 1.37
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 TMCC3Q9ULS5 477 aa23.63■■□□□ 1.37
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 MGAM2Q2M2H8 2515 aa23.62■■□□□ 1.37
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 LCATP04180 440 aa23.62■■□□□ 1.37
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 FABP3P05413 133 aa23.62■■□□□ 1.37
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 HKR1P10072 659 aa23.62■■□□□ 1.37
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 IRF2P14316 349 aa23.62■■□□□ 1.37
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 RRM2P31350 389 aa23.62■■□□□ 1.37
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP23.62■■□□□ 1.37
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 TRAP1Q12931 704 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 MALLQ13021 153 aa23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.4 ms