RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000570380.5

CTDNEP1-202, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDNEP1, Length 506 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-202ENST00000570380 TSPAN19P0C672 248 aa8.51□□□□□ -1.05
CTDNEP1-202ENST00000570380 FUT1P19526 365 aa8.51□□□□□ -1.05
CTDNEP1-202ENST00000570380 BGNP21810 368 aa8.51□□□□□ -1.05
CTDNEP1-202ENST00000570380 FPR3P25089 353 aa8.51□□□□□ -1.05
CTDNEP1-202ENST00000570380 AQP1P29972 269 aa8.51□□□□□ -1.05
CTDNEP1-202ENST00000570380 SAA4P35542 130 aa8.51□□□□□ -1.05
CTDNEP1-202ENST00000570380 RPL4P36578 427 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
CTDNEP1-202ENST00000570380 GUCA1AP43080 201 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
CTDNEP1-202ENST00000570380 GUCA2AQ02747 115 aa8.51□□□□□ -1.05
CTDNEP1-202ENST00000570380 DOC2BQ14184 412 aa8.51□□□□□ -1.05
CTDNEP1-202ENST00000570380 LAPTM4AQ15012 233 aa8.51□□□□□ -1.05
CTDNEP1-202ENST00000570380 C11orf91Q3C1V1 193 aa8.51□□□□□ -1.05
CTDNEP1-202ENST00000570380 GCNT6Q5T4J0 391 aa8.51□□□□□ -1.05
CTDNEP1-202ENST00000570380 MSANTD1Q6ZTZ1 278 aa8.51□□□□□ -1.05
CTDNEP1-202ENST00000570380 RBM45Q8IUH3 476 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
CTDNEP1-202ENST00000570380 ARMC8Q8IUR7 673 aa8.51□□□□□ -1.05
CTDNEP1-202ENST00000570380 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa8.51□□□□□ -1.05
CTDNEP1-202ENST00000570380 SMYD1Q8NB12 490 aa8.51□□□□□ -1.05
CTDNEP1-202ENST00000570380 LY6G5BQ8NDX9 201 aa8.51□□□□□ -1.05
CTDNEP1-202ENST00000570380 BEND2Q8NDZ0 799 aa8.51□□□□□ -1.05
CTDNEP1-202ENST00000570380 OR4D11Q8NGI4 311 aa8.51□□□□□ -1.05
CTDNEP1-202ENST00000570380 OR6T1Q8NGN1 323 aa8.51□□□□□ -1.05
CTDNEP1-202ENST00000570380 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
CTDNEP1-202ENST00000570380 GTF2H4Q92759 462 aa8.51□□□□□ -1.05
CTDNEP1-202ENST00000570380 RASD2Q96D21 266 aa8.51□□□□□ -1.05
CTDNEP1-202ENST00000570380 RBP7Q96R05 134 aa8.51□□□□□ -1.05
CTDNEP1-202ENST00000570380 ECSITQ9BQ95 431 aa8.51□□□□□ -1.05
CTDNEP1-202ENST00000570380 PRSS27Q9BQR3 290 aa8.51□□□□□ -1.05
CTDNEP1-202ENST00000570380 TXNIPQ9H3M7 391 aa8.51□□□□□ -1.05
CTDNEP1-202ENST00000570380 WDR55Q9H6Y2 383 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
CTDNEP1-202ENST00000570380 EVA1AQ9H8M9 152 aa8.51□□□□□ -1.05
CTDNEP1-202ENST00000570380 POLE4Q9NR33 117 aa8.51□□□□□ -1.05
CTDNEP1-202ENST00000570380 C20orf141Q9NUB4 165 aa8.51□□□□□ -1.05
CTDNEP1-202ENST00000570380 SLC25A37Q9NYZ2 338 aa8.51□□□□□ -1.05
CTDNEP1-202ENST00000570380 ONECUT1Q9UBC0 465 aa8.51□□□□□ -1.05
CTDNEP1-202ENST00000570380 RNF7Q9UBF6 113 aa8.51□□□□□ -1.05
CTDNEP1-202ENST00000570380 HAO1Q9UJM8 370 aa8.51□□□□□ -1.05
CTDNEP1-202ENST00000570380 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
CTDNEP1-202ENST00000570380 CSMD3Q7Z407 3707 aa8.51□□□□□ -1.05
CTDNEP1-202ENST00000570380 NPIPB13A6NJU9 1138 aa8.5□□□□□ -1.05
CTDNEP1-202ENST00000570380 NPIPB4C9JG80 1138 aa8.5□□□□□ -1.05
CTDNEP1-202ENST00000570380 HDAC3O15379 428 aa8.5□□□□□ -1.05
CTDNEP1-202ENST00000570380 NDUFA2O43678 99 aa8.5□□□□□ -1.05
CTDNEP1-202ENST00000570380 SERPINB7O75635 380 aa8.5□□□□□ -1.05
CTDNEP1-202ENST00000570380 OR7A10O76100 309 aa8.5□□□□□ -1.05
CTDNEP1-202ENST00000570380 DBHP09172 617 aa8.5□□□□□ -1.05
CTDNEP1-202ENST00000570380 NR2C1P13056 603 aa8.5□□□□□ -1.05
CTDNEP1-202ENST00000570380 ZNF26P17031 533 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
CTDNEP1-202ENST00000570380 CD200P41217 278 aa8.5□□□□□ -1.05
CTDNEP1-202ENST00000570380 SLC1A6P48664 564 aa8.5□□□□□ -1.05
CTDNEP1-202ENST00000570380 PRSS12P56730 875 aa8.5□□□□□ -1.05
CTDNEP1-202ENST00000570380 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa8.5□□□□□ -1.05
CTDNEP1-202ENST00000570380 SCRN3Q0VDG4 424 aa8.5□□□□□ -1.05
CTDNEP1-202ENST00000570380 POU4F2Q12837 409 aa8.5□□□□□ -1.05
CTDNEP1-202ENST00000570380 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
CTDNEP1-202ENST00000570380 SCARB2Q14108 478 aa8.5□□□□□ -1.05
CTDNEP1-202ENST00000570380 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
CTDNEP1-202ENST00000570380 OR8B8Q15620 311 aa8.5□□□□□ -1.05
CTDNEP1-202ENST00000570380 DUSP7Q16829 419 aa8.5□□□□□ -1.05
CTDNEP1-202ENST00000570380 CASC10Q5T4H9 136 aa8.5□□□□□ -1.05
CTDNEP1-202ENST00000570380 SLC2A7Q6PXP3 512 aa8.5□□□□□ -1.05
CTDNEP1-202ENST00000570380 Q8N7P7 452 aa8.5□□□□□ -1.05
CTDNEP1-202ENST00000570380 MNS1Q8NEH6 495 aa8.5□□□□□ -1.05
CTDNEP1-202ENST00000570380 GPR32P1Q8NGA4 272 aa8.5□□□□□ -1.05
CTDNEP1-202ENST00000570380 OR9I1Q8NGQ6 314 aa8.5□□□□□ -1.05
CTDNEP1-202ENST00000570380 C17orf50Q8WW18 174 aa8.5□□□□□ -1.05
CTDNEP1-202ENST00000570380 ST8SIA4Q92187 359 aa8.5□□□□□ -1.05
CTDNEP1-202ENST00000570380 RORBQ92753 470 aa8.5□□□□□ -1.05
CTDNEP1-202ENST00000570380 TNFRSF14Q92956 283 aa8.5□□□□□ -1.05
CTDNEP1-202ENST00000570380 MPP4Q96JB8 637 aa8.5□□□□□ -1.05
CTDNEP1-202ENST00000570380 WACQ9BTA9 647 aa8.5□□□□□ -1.05
CTDNEP1-202ENST00000570380 WDR76Q9H967 626 aa8.5□□□□□ -1.05
CTDNEP1-202ENST00000570380 TRAV38-1A0A0B4J264 116 aa8.49□□□□□ -1.05
CTDNEP1-202ENST00000570380 A0A1B0GW55 424 aa8.49□□□□□ -1.05
CTDNEP1-202ENST00000570380 TRAPPC13A5PLN9 417 aa8.49□□□□□ -1.05
CTDNEP1-202ENST00000570380 OR6C6A6NF89 314 aa8.49□□□□□ -1.05
CTDNEP1-202ENST00000570380 OOEPA6NGQ2 149 aa8.49□□□□□ -1.05
CTDNEP1-202ENST00000570380 E9PQ18 207 aa8.49□□□□□ -1.05
CTDNEP1-202ENST00000570380 J3QW42 95 aa8.49□□□□□ -1.05
CTDNEP1-202ENST00000570380 FBP2O00757 339 aa8.49□□□□□ -1.05
CTDNEP1-202ENST00000570380 TYROBPO43914 113 aa8.49□□□□□ -1.05
CTDNEP1-202ENST00000570380 CHST1O43916 411 aa8.49□□□□□ -1.05
CTDNEP1-202ENST00000570380 MT-ND1P03886 318 aa8.49□□□□□ -1.05
CTDNEP1-202ENST00000570380 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
CTDNEP1-202ENST00000570380 DUX4L2P0CJ85 424 aa8.49□□□□□ -1.05
CTDNEP1-202ENST00000570380 DUX4L3P0CJ86 424 aa8.49□□□□□ -1.05
CTDNEP1-202ENST00000570380 DUX4L4P0CJ87 422 aa8.49□□□□□ -1.05
CTDNEP1-202ENST00000570380 DUX4L5P0CJ88 424 aa8.49□□□□□ -1.05
CTDNEP1-202ENST00000570380 DUX4L6P0CJ89 424 aa8.49□□□□□ -1.05
CTDNEP1-202ENST00000570380 DUX4L7P0CJ90 424 aa8.49□□□□□ -1.05
CTDNEP1-202ENST00000570380 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
CTDNEP1-202ENST00000570380 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
CTDNEP1-202ENST00000570380 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
CTDNEP1-202ENST00000570380 FAM90A1Q86YD7 464 aa8.49□□□□□ -1.05
CTDNEP1-202ENST00000570380 MSRB3Q8IXL7 192 aa8.49□□□□□ -1.05
CTDNEP1-202ENST00000570380 OR5L1Q8NGL2 311 aa8.49□□□□□ -1.05
CTDNEP1-202ENST00000570380 OR1F12Q8NHA8 337 aa8.49□□□□□ -1.05
CTDNEP1-202ENST00000570380 PFN4Q8NHR9 129 aa8.49□□□□□ -1.05
CTDNEP1-202ENST00000570380 FNDC8Q8TC99 324 aa8.49□□□□□ -1.05
CTDNEP1-202ENST00000570380 SLC7A13Q8TCU3 470 aa8.49□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 94.3 ms