RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563200.5

PPP4C-205, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, human

TSL 5

Gene PPP4C, Length 1,447 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP4C-205	ENST00000563200	RAP2A	P10114	183 aa		18.4	■□□□□ 0.54
PPP4C-205	ENST00000563200	ECH1	Q13011	328 aa		18.4	■□□□□ 0.54
PPP4C-205	ENST00000563200	KRTAP24-1	Q3LI83	254 aa		18.4	■□□□□ 0.54
PPP4C-205	ENST00000563200	OR4Q3	Q8NH05	313 aa		18.4	■□□□□ 0.54
PPP4C-205	ENST00000563200	RAB39B	Q96DA2	213 aa		18.4	■□□□□ 0.54
PPP4C-205	ENST00000563200	PITX2	Q99697	317 aa		18.4	■□□□□ 0.54
PPP4C-205	ENST00000563200	CDADC1	Q9BWV3	514 aa		18.4	■□□□□ 0.54
PPP4C-205	ENST00000563200	G6PC2	Q9NQR9	355 aa		18.4	■□□□□ 0.54
PPP4C-205	ENST00000563200	IL19	Q9UHD0	177 aa		18.4	■□□□□ 0.54
PPP4C-205	ENST00000563200	KCNG2	Q9UJ96	466 aa		18.4	■□□□□ 0.54
PPP4C-205	ENST00000563200	PLPP2	O43688	288 aa		18.39	■□□□□ 0.53
PPP4C-205	ENST00000563200	HLA-DQA2	P01906	255 aa		18.39	■□□□□ 0.53
PPP4C-205	ENST00000563200	ANPEP	P15144	967 aa		18.39	■□□□□ 0.53
PPP4C-205	ENST00000563200	PYCR1	P32322	319 aa		18.39	■□□□□ 0.53
PPP4C-205	ENST00000563200	RBMX	P38159	391 aa	Known RBP	18.39	■□□□□ 0.53
PPP4C-205	ENST00000563200	OR2T2	Q6IF00	324 aa		18.39	■□□□□ 0.53
PPP4C-205	ENST00000563200	ADGRG5	Q8IZF4	528 aa		18.39	■□□□□ 0.53
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF283	Q8N7M2	679 aa		18.39	■□□□□ 0.53
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC37A3	Q8NCC5	494 aa		18.39	■□□□□ 0.53
PPP4C-205	ENST00000563200	OR10S1	Q8NGN2	331 aa		18.39	■□□□□ 0.53
PPP4C-205	ENST00000563200	OR2AJ1	Q8NGZ0	328 aa		18.39	■□□□□ 0.53
PPP4C-205	ENST00000563200	OR2T4	Q8NH00	348 aa		18.39	■□□□□ 0.53
PPP4C-205	ENST00000563200	ATF6B	Q99941	703 aa		18.39	■□□□□ 0.53
PPP4C-205	ENST00000563200	TSSK6	Q9BXA6	273 aa		18.39	■□□□□ 0.53
PPP4C-205	ENST00000563200	NMNAT2	Q9BZQ4	307 aa		18.39	■□□□□ 0.53
PPP4C-205	ENST00000563200	TMEM106B	Q9NUM4	274 aa		18.39	■□□□□ 0.53
PPP4C-205	ENST00000563200		A0A1B0GWJ7	208 aa		18.38	■□□□□ 0.53
PPP4C-205	ENST00000563200	PSKH1	P11801	424 aa		18.38	■□□□□ 0.53
PPP4C-205	ENST00000563200	TNFRSF1A	P19438	455 aa		18.38	■□□□□ 0.53
PPP4C-205	ENST00000563200	TNFSF4	P23510	183 aa		18.38	■□□□□ 0.53
PPP4C-205	ENST00000563200	TRAP1	Q12931	704 aa	Known RBP	18.38	■□□□□ 0.53
PPP4C-205	ENST00000563200	CD300LD	Q6UXZ3	194 aa		18.38	■□□□□ 0.53
PPP4C-205	ENST00000563200	TRPM8	Q7Z2W7	1104 aa		18.38	■□□□□ 0.53
PPP4C-205	ENST00000563200	OR5AS1	Q8N127	324 aa		18.38	■□□□□ 0.53
PPP4C-205	ENST00000563200	PROKR2	Q8NFJ6	384 aa		18.38	■□□□□ 0.53
PPP4C-205	ENST00000563200	OR8G5	Q8NG78	346 aa		18.38	■□□□□ 0.53
PPP4C-205	ENST00000563200	ITLN1	Q8WWA0	313 aa		18.38	■□□□□ 0.53
PPP4C-205	ENST00000563200	SIGLEC11	Q96RL6	698 aa		18.38	■□□□□ 0.53
PPP4C-205	ENST00000563200	THTPA	Q9BU02	230 aa		18.38	■□□□□ 0.53
PPP4C-205	ENST00000563200	CHID1	Q9BWS9	393 aa		18.38	■□□□□ 0.53
PPP4C-205	ENST00000563200	TBC1D23	Q9NUY8	699 aa		18.38	■□□□□ 0.53
PPP4C-205	ENST00000563200	BAIAP2	Q9UQB8	552 aa		18.38	■□□□□ 0.53
PPP4C-205	ENST00000563200	NPTN	Q9Y639	398 aa		18.38	■□□□□ 0.53
PPP4C-205	ENST00000563200	IQCF6	A8MYZ5	107 aa		18.37	■□□□□ 0.53
PPP4C-205	ENST00000563200		F5H5K5	113 aa		18.37	■□□□□ 0.53
PPP4C-205	ENST00000563200	SOX14	O95416	240 aa		18.37	■□□□□ 0.53
PPP4C-205	ENST00000563200	IGHV2-70	P01814	119 aa		18.37	■□□□□ 0.53
PPP4C-205	ENST00000563200	SRP14	P37108	136 aa	Known RBP	18.37	■□□□□ 0.53
PPP4C-205	ENST00000563200	SRSF2	Q01130	221 aa	Known RBP	18.37	■□□□□ 0.53
PPP4C-205	ENST00000563200	CRMP1	Q14194	572 aa		18.37	■□□□□ 0.53
PPP4C-205	ENST00000563200	GK3P	Q14409	553 aa		18.37	■□□□□ 0.53
PPP4C-205	ENST00000563200	PCK2	Q16822	640 aa		18.37	■□□□□ 0.53
PPP4C-205	ENST00000563200	LYPD4	Q6UWN0	246 aa		18.37	■□□□□ 0.53
PPP4C-205	ENST00000563200	C1orf229	Q6ZS94	237 aa	Predicted RBP	18.37	■□□□□ 0.53
PPP4C-205	ENST00000563200	NAA40	Q86UY6	237 aa		18.37	■□□□□ 0.53
PPP4C-205	ENST00000563200	OR2T33	Q8NG76	320 aa		18.37	■□□□□ 0.53
PPP4C-205	ENST00000563200	OR51L1	Q8NGJ5	315 aa		18.37	■□□□□ 0.53
PPP4C-205	ENST00000563200	LRGUK	Q96M69	825 aa		18.37	■□□□□ 0.53
PPP4C-205	ENST00000563200	OR2V2	Q96R30	315 aa		18.37	■□□□□ 0.53
PPP4C-205	ENST00000563200	GAL3ST1	Q99999	423 aa		18.37	■□□□□ 0.53
PPP4C-205	ENST00000563200	NIPSNAP1	Q9BPW8	284 aa		18.37	■□□□□ 0.53
PPP4C-205	ENST00000563200	WDR76	Q9H967	626 aa		18.37	■□□□□ 0.53
PPP4C-205	ENST00000563200	DDX28	Q9NUL7	540 aa	Known RBP	18.37	■□□□□ 0.53
PPP4C-205	ENST00000563200	ARMC1	Q9NVT9	282 aa		18.37	■□□□□ 0.53
PPP4C-205	ENST00000563200	TVP23A	A6NH52	213 aa		18.36	■□□□□ 0.53
PPP4C-205	ENST00000563200	AQP12B	A6NM10	295 aa		18.36	■□□□□ 0.53
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF823	P16415	610 aa		18.36	■□□□□ 0.53
PPP4C-205	ENST00000563200	RPS27	P42677	84 aa	Known RBP	18.36	■□□□□ 0.53
PPP4C-205	ENST00000563200	PEG10	Q86TG7	708 aa	Known RBP	18.36	■□□□□ 0.53
PPP4C-205	ENST00000563200	AQP12A	Q8IXF9	295 aa		18.36	■□□□□ 0.53
PPP4C-205	ENST00000563200	OR10G2	Q8NGC3	310 aa		18.36	■□□□□ 0.53
PPP4C-205	ENST00000563200	OR9Q1	Q8NGQ5	310 aa		18.36	■□□□□ 0.53
PPP4C-205	ENST00000563200	CANT1	Q8WVQ1	401 aa		18.36	■□□□□ 0.53
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC30A2	Q9BRI3	323 aa		18.36	■□□□□ 0.53
PPP4C-205	ENST00000563200	COMMD3-BMI1	R4GMX3	469 aa		18.36	■□□□□ 0.53
PPP4C-205	ENST00000563200	ARRDC5	A6NEK1	342 aa		18.35	■□□□□ 0.53
PPP4C-205	ENST00000563200	SURF4	O15260	269 aa		18.35	■□□□□ 0.53
PPP4C-205	ENST00000563200	MLNR	O43193	412 aa		18.35	■□□□□ 0.53
PPP4C-205	ENST00000563200	PNP	P00491	289 aa		18.35	■□□□□ 0.53
PPP4C-205	ENST00000563200	AVP	P01185	164 aa		18.35	■□□□□ 0.53
PPP4C-205	ENST00000563200	OTX1	P32242	354 aa	Predicted RBP	18.35	■□□□□ 0.53
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC25A1	P53007	311 aa		18.35	■□□□□ 0.53
PPP4C-205	ENST00000563200	GK2	Q14410	553 aa	Predicted RBP	18.35	■□□□□ 0.53
PPP4C-205	ENST00000563200	FAHD2B	Q6P2I3	314 aa	Predicted RBP	18.35	■□□□□ 0.53
PPP4C-205	ENST00000563200	RFLNB	Q8N5W9	214 aa		18.35	■□□□□ 0.53
PPP4C-205	ENST00000563200	OR10AD1	Q8NGE0	317 aa		18.35	■□□□□ 0.53
PPP4C-205	ENST00000563200	OR13G1	Q8NGZ3	307 aa		18.35	■□□□□ 0.53
PPP4C-205	ENST00000563200	FAHD2A	Q96GK7	314 aa		18.35	■□□□□ 0.53
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF582	Q96NG8	517 aa	Predicted RBP	18.35	■□□□□ 0.53
PPP4C-205	ENST00000563200	FEV	Q99581	238 aa		18.35	■□□□□ 0.53
PPP4C-205	ENST00000563200	GCM1	Q9NP62	436 aa		18.35	■□□□□ 0.53
PPP4C-205	ENST00000563200	PPP1R3C	Q9UQK1	317 aa		18.35	■□□□□ 0.53
PPP4C-205	ENST00000563200	ISPD	A4D126	451 aa		18.34	■□□□□ 0.53
PPP4C-205	ENST00000563200	CST1	P01037	141 aa		18.34	■□□□□ 0.53
PPP4C-205	ENST00000563200	GYPB	P06028	91 aa		18.34	■□□□□ 0.53
PPP4C-205	ENST00000563200	SPI1	P17947	270 aa		18.34	■□□□□ 0.53
PPP4C-205	ENST00000563200	ANOS1	P23352	680 aa		18.34	■□□□□ 0.53
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC27A4	Q6P1M0	643 aa		18.34	■□□□□ 0.53
PPP4C-205	ENST00000563200	TMEM179B	Q7Z7N9	219 aa		18.34	■□□□□ 0.53
PPP4C-205	ENST00000563200	LRRC28	Q86X40	367 aa	Predicted RBP	18.34	■□□□□ 0.53

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