RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555015.5

SRP54-AS1-202, Transcript of SRP54 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 3

Gene SRP54-AS1, Length 561 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP54-AS1-202ENST00000555015 TMED1Q13445 227 aa11.06□□□□□ -0.64
SRP54-AS1-202ENST00000555015 LRRC36Q1X8D7 754 aa11.06□□□□□ -0.64
SRP54-AS1-202ENST00000555015 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP11.06□□□□□ -0.64
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ZNF718Q3SXZ3 478 aa11.06□□□□□ -0.64
SRP54-AS1-202ENST00000555015 SLC25A30Q5SVS4 291 aa11.06□□□□□ -0.64
SRP54-AS1-202ENST00000555015 SPATA46Q5T0L3 261 aa11.06□□□□□ -0.64
SRP54-AS1-202ENST00000555015 PRSS57Q6UWY2 283 aa11.06□□□□□ -0.64
SRP54-AS1-202ENST00000555015 COLCA1Q6ZS62 124 aa11.06□□□□□ -0.64
SRP54-AS1-202ENST00000555015 LRP11Q86VZ4 500 aa11.06□□□□□ -0.64
SRP54-AS1-202ENST00000555015 GALNT4Q8N4A0 578 aa11.06□□□□□ -0.64
SRP54-AS1-202ENST00000555015 OR5L1Q8NGL2 311 aa11.06□□□□□ -0.64
SRP54-AS1-202ENST00000555015 SLC25A40Q8TBP6 338 aa11.06□□□□□ -0.64
SRP54-AS1-202ENST00000555015 APOBEC3DQ96AK3 386 aaPredicted RBP11.06□□□□□ -0.64
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ZNF799Q96GE5 643 aa11.06□□□□□ -0.64
SRP54-AS1-202ENST00000555015 C1QTNF5Q9BXJ0 243 aa11.06□□□□□ -0.64
SRP54-AS1-202ENST00000555015 OR2J1Q9GZK6 312 aa11.06□□□□□ -0.64
SRP54-AS1-202ENST00000555015 BARX1Q9HBU1 254 aaPredicted RBP11.06□□□□□ -0.64
SRP54-AS1-202ENST00000555015 FAM118AQ9NWS6 357 aa11.06□□□□□ -0.64
SRP54-AS1-202ENST00000555015 SLCO1C1Q9NYB5 712 aa11.06□□□□□ -0.64
SRP54-AS1-202ENST00000555015 DUSP13Q9UII6 198 aa11.06□□□□□ -0.64
SRP54-AS1-202ENST00000555015 FZR1Q9UM11 496 aa11.06□□□□□ -0.64
SRP54-AS1-202ENST00000555015 LOC100130705A0A1B0GUX0 176 aa11.05□□□□□ -0.64
SRP54-AS1-202ENST00000555015 A0A1W2PPW3 197 aa11.05□□□□□ -0.64
SRP54-AS1-202ENST00000555015 M0R233 179 aa11.05□□□□□ -0.64
SRP54-AS1-202ENST00000555015 DLGAP1O14490 977 aa11.05□□□□□ -0.64
SRP54-AS1-202ENST00000555015 MPZL2O60487 215 aa11.05□□□□□ -0.64
SRP54-AS1-202ENST00000555015 IGHV3-13P01766 116 aa11.05□□□□□ -0.64
SRP54-AS1-202ENST00000555015 IGHV4-39P01824 125 aa11.05□□□□□ -0.64
SRP54-AS1-202ENST00000555015 MRPL3P09001 348 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
SRP54-AS1-202ENST00000555015 OPRL1P41146 370 aa11.05□□□□□ -0.64
SRP54-AS1-202ENST00000555015 POU4F2Q12837 409 aa11.05□□□□□ -0.64
SRP54-AS1-202ENST00000555015 TAF13Q15543 124 aa11.05□□□□□ -0.64
SRP54-AS1-202ENST00000555015 MOGQ16653 247 aa11.05□□□□□ -0.64
SRP54-AS1-202ENST00000555015 Q5PR19 223 aa11.05□□□□□ -0.64
SRP54-AS1-202ENST00000555015 MEDAGQ5VYS4 303 aa11.05□□□□□ -0.64
SRP54-AS1-202ENST00000555015 SHEQ5VZ18 495 aa11.05□□□□□ -0.64
SRP54-AS1-202ENST00000555015 DRAM2Q6UX65 266 aa11.05□□□□□ -0.64
SRP54-AS1-202ENST00000555015 SPNS3Q6ZMD2 512 aa11.05□□□□□ -0.64
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP11.05□□□□□ -0.64
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ZNF555Q8NEP9 628 aa11.05□□□□□ -0.64
SRP54-AS1-202ENST00000555015 KLF14Q8TD94 323 aaPredicted RBP11.05□□□□□ -0.64
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ZNF582Q96NG8 517 aaPredicted RBP11.05□□□□□ -0.64
SRP54-AS1-202ENST00000555015 MNTQ99583 582 aa11.05□□□□□ -0.64
SRP54-AS1-202ENST00000555015 KCNJ15Q99712 375 aa11.05□□□□□ -0.64
SRP54-AS1-202ENST00000555015 VCXQ9H320 206 aa11.05□□□□□ -0.64
SRP54-AS1-202ENST00000555015 RNPEPL1Q9HAU8 725 aa11.05□□□□□ -0.64
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ADGRL4Q9HBW9 690 aa11.05□□□□□ -0.64
SRP54-AS1-202ENST00000555015 DYNLRB1Q9NP97 96 aa11.05□□□□□ -0.64
SRP54-AS1-202ENST00000555015 CENPMQ9NSP4 180 aa11.05□□□□□ -0.64
SRP54-AS1-202ENST00000555015 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa11.05□□□□□ -0.64
SRP54-AS1-202ENST00000555015 MYEF2Q9P2K5 600 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
SRP54-AS1-202ENST00000555015 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP11.05□□□□□ -0.64
SRP54-AS1-202ENST00000555015 GPR160Q9UJ42 338 aa11.05□□□□□ -0.64
SRP54-AS1-202ENST00000555015 LAMP5Q9UJQ1 280 aa11.05□□□□□ -0.64
SRP54-AS1-202ENST00000555015 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP11.05□□□□□ -0.64
SRP54-AS1-202ENST00000555015 TMEM14AQ9Y6G1 99 aa11.05□□□□□ -0.64
SRP54-AS1-202ENST00000555015 CLPTM1O96005 669 aa11.04□□□□□ -0.64
SRP54-AS1-202ENST00000555015 APOC1P02654 83 aa11.04□□□□□ -0.64
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP11.04□□□□□ -0.64
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ALOX5APP20292 161 aa11.04□□□□□ -0.64
SRP54-AS1-202ENST00000555015 HSD11B1P28845 292 aa11.04□□□□□ -0.64
SRP54-AS1-202ENST00000555015 MPV17P39210 176 aa11.04□□□□□ -0.64
SRP54-AS1-202ENST00000555015 SLC6A9P48067 706 aa11.04□□□□□ -0.64
SRP54-AS1-202ENST00000555015 OCLNQ16625 522 aa11.04□□□□□ -0.64
SRP54-AS1-202ENST00000555015 NKPD1Q17RQ9 610 aa11.04□□□□□ -0.64
SRP54-AS1-202ENST00000555015 SPATC1Q76KD6 591 aa11.04□□□□□ -0.64
SRP54-AS1-202ENST00000555015 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa11.04□□□□□ -0.64
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ENTHD1Q8IYW4 607 aa11.04□□□□□ -0.64
SRP54-AS1-202ENST00000555015 THEM6Q8WUY1 208 aa11.04□□□□□ -0.64
SRP54-AS1-202ENST00000555015 SNX33Q8WV41 574 aa11.04□□□□□ -0.64
SRP54-AS1-202ENST00000555015 AMELYQ99218 206 aa11.04□□□□□ -0.64
SRP54-AS1-202ENST00000555015 APOL4Q9BPW4 351 aa11.04□□□□□ -0.64
SRP54-AS1-202ENST00000555015 RAB1BQ9H0U4 201 aa11.04□□□□□ -0.64
SRP54-AS1-202ENST00000555015 MS4A5Q9H3V2 200 aa11.04□□□□□ -0.64
SRP54-AS1-202ENST00000555015 POFUT1Q9H488 388 aa11.04□□□□□ -0.64
SRP54-AS1-202ENST00000555015 CGGBP1Q9UFW8 167 aaPredicted RBP11.04□□□□□ -0.64
SRP54-AS1-202ENST00000555015 KLHDC2Q9Y2U9 406 aa11.04□□□□□ -0.64
SRP54-AS1-202ENST00000555015 STARD10Q9Y365 291 aa11.04□□□□□ -0.64
SRP54-AS1-202ENST00000555015 SNTNA6NMZ2 147 aa11.03□□□□□ -0.64
SRP54-AS1-202ENST00000555015 PHYHO14832 338 aa11.03□□□□□ -0.64
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ENTPD6O75354 484 aa11.03□□□□□ -0.64
SRP54-AS1-202ENST00000555015 MT-ND5P03915 603 aa11.03□□□□□ -0.64
SRP54-AS1-202ENST00000555015 LCATP04180 440 aa11.03□□□□□ -0.64
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ADRA2AP08913 450 aa11.03□□□□□ -0.64
SRP54-AS1-202ENST00000555015 H2BFMP0C1H6 154 aa11.03□□□□□ -0.64
SRP54-AS1-202ENST00000555015 SBK2P0C263 348 aa11.03□□□□□ -0.64
SRP54-AS1-202ENST00000555015 GABRB1P18505 474 aa11.03□□□□□ -0.64
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ALDH3B1P43353 468 aa11.03□□□□□ -0.64
SRP54-AS1-202ENST00000555015 CX3CR1P49238 355 aa11.03□□□□□ -0.64
SRP54-AS1-202ENST00000555015 EFNA4P52798 201 aa11.03□□□□□ -0.64
SRP54-AS1-202ENST00000555015 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP11.03□□□□□ -0.64
SRP54-AS1-202ENST00000555015 TTC23Q5W5X9 447 aa11.03□□□□□ -0.64
SRP54-AS1-202ENST00000555015 KCTD18Q6PI47 426 aaPredicted RBP11.03□□□□□ -0.64
SRP54-AS1-202ENST00000555015 DEGS2Q6QHC5 323 aa11.03□□□□□ -0.64
SRP54-AS1-202ENST00000555015 FBXW12Q6X9E4 464 aa11.03□□□□□ -0.64
SRP54-AS1-202ENST00000555015 SLC35F2Q8IXU6 374 aa11.03□□□□□ -0.64
SRP54-AS1-202ENST00000555015 OR51G2Q8NGK0 314 aa11.03□□□□□ -0.64
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ASB17Q8WXJ9 295 aa11.03□□□□□ -0.64
SRP54-AS1-202ENST00000555015 UBE2FQ969M7 185 aa11.03□□□□□ -0.64
SRP54-AS1-202ENST00000555015 Q96MT0 163 aa11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 124.3 ms