RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551592.5

SENP1-208, Transcript of SUMO specific peptidase 1, human

TSL 3

Gene SENP1, Length 866 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SENP1-208	ENST00000551592	DYNLL2	Q96FJ2	89 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SENP1-208	ENST00000551592	ZNF681	Q96N22	645 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SENP1-208	ENST00000551592	RHOXF2	Q9BQY4	288 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SENP1-208	ENST00000551592	HDHD3	Q9BSH5	251 aa	Predicted RBP	3.37	□□□□□ -1.87
SENP1-208	ENST00000551592	CHID1	Q9BWS9	393 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SENP1-208	ENST00000551592	TM6SF2	Q9BZW4	377 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SENP1-208	ENST00000551592	SLC39A1	Q9NY26	324 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SENP1-208	ENST00000551592	IFNK	Q9P0W0	207 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SENP1-208	ENST00000551592	UVRAG	Q9P2Y5	699 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SENP1-208	ENST00000551592	RPS6KB2	Q9UBS0	482 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SENP1-208	ENST00000551592	MTFP1	Q9UDX5	166 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SENP1-208	ENST00000551592	STK38L	Q9Y2H1	464 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SENP1-208	ENST00000551592	MN1	Q10571	1320 aa	Predicted RBP	3.37	□□□□□ -1.87
SENP1-208	ENST00000551592	MAP3K15	Q6ZN16	1313 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SENP1-208	ENST00000551592	CENPX	A8MT69	81 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SENP1-208	ENST00000551592	POLR1C	O15160	346 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
SENP1-208	ENST00000551592	RNF113A	O15541	343 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
SENP1-208	ENST00000551592	NEMF	O60524	1076 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SENP1-208	ENST00000551592	SLC19A2	O60779	497 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SENP1-208	ENST00000551592	CAT	P04040	527 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
SENP1-208	ENST00000551592	CTSL	P07711	333 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SENP1-208	ENST00000551592	ERG	P11308	486 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SENP1-208	ENST00000551592	HOXB8	P17481	243 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
SENP1-208	ENST00000551592	RAB3A	P20336	220 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SENP1-208	ENST00000551592	RAB5A	P20339	215 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SENP1-208	ENST00000551592	IL32	P24001	234 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SENP1-208	ENST00000551592	IVD	P26440	423 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SENP1-208	ENST00000551592	PFN2	P35080	140 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SENP1-208	ENST00000551592	PPP1CB	P62140	327 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SENP1-208	ENST00000551592	SLA	Q13239	276 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SENP1-208	ENST00000551592	LCE3C	Q5T5A8	94 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SENP1-208	ENST00000551592	PRMT9	Q6P2P2	845 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SENP1-208	ENST00000551592	PLET1	Q6UQ28	207 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SENP1-208	ENST00000551592	ARHGAP18	Q8N392	663 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SENP1-208	ENST00000551592	CBR4	Q8N4T8	237 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SENP1-208	ENST00000551592	FAM86B1	Q8N7N1	296 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SENP1-208	ENST00000551592	SPERT	Q8NA61	448 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SENP1-208	ENST00000551592	TFG	Q92734	400 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
SENP1-208	ENST00000551592	TMIGD2	Q96BF3	282 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SENP1-208	ENST00000551592	BTN2A3P	Q96KV6	586 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SENP1-208	ENST00000551592	TAAR1	Q96RJ0	339 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SENP1-208	ENST00000551592	SAV1	Q9H4B6	383 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
SENP1-208	ENST00000551592	FLVCR2	Q9UPI3	526 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SENP1-208	ENST00000551592	MROH7	Q68CQ1	1323 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SENP1-208	ENST00000551592	ZNFX1	Q9P2E3	1918 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
SENP1-208	ENST00000551592	TMEM94	Q12767	1356 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SENP1-208	ENST00000551592	IGHV3-66	A0A0C4DH42	116 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SENP1-208	ENST00000551592	TRIM49D1	C9J1S8	452 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SENP1-208	ENST00000551592	ANKRD65	E5RJM6	399 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SENP1-208	ENST00000551592		M0QX08	132 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SENP1-208	ENST00000551592	PSMD11	O00231	422 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SENP1-208	ENST00000551592	RP2	O75695	350 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SENP1-208	ENST00000551592	CD3G	P09693	182 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SENP1-208	ENST00000551592	HOXA9	P31269	272 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SENP1-208	ENST00000551592	PSMC5	P62195	406 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SENP1-208	ENST00000551592	ART3	Q13508	389 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SENP1-208	ENST00000551592	TFDP2	Q14188	446 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SENP1-208	ENST00000551592	CAPRIN1	Q14444	709 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
SENP1-208	ENST00000551592	KIR2DS1	Q14954	304 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SENP1-208	ENST00000551592	METTL21C	Q5VZV1	264 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SENP1-208	ENST00000551592		Q8N976	141 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SENP1-208	ENST00000551592	DUSP18	Q8NEJ0	188 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SENP1-208	ENST00000551592	ZFP90	Q8TF47	636 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SENP1-208	ENST00000551592	CACNG8	Q8WXS5	425 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SENP1-208	ENST00000551592	OR8D1	Q8WZ84	308 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SENP1-208	ENST00000551592	RGP1	Q92546	391 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
SENP1-208	ENST00000551592	FAM104A	Q969W3	186 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SENP1-208	ENST00000551592	SGTB	Q96EQ0	304 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SENP1-208	ENST00000551592	MSANTD3	Q96H12	275 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SENP1-208	ENST00000551592	UQCC2	Q9BRT2	126 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SENP1-208	ENST00000551592	SLC40A1	Q9NP59	571 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SENP1-208	ENST00000551592	FAM49B	Q9NUQ9	324 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SENP1-208	ENST00000551592	RBAK	Q9NYW8	714 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
SENP1-208	ENST00000551592	ASTN1	O14525	1302 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SENP1-208	ENST00000551592	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SENP1-208	ENST00000551592	MTCL1	Q9Y4B5	1905 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
SENP1-208	ENST00000551592	CROCC	Q5TZA2	2017 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SENP1-208	ENST00000551592	IGHV3OR16-9	A0A0B4J2B5	98 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SENP1-208	ENST00000551592	LOC100506127	A0A0U1RQW1	187 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SENP1-208	ENST00000551592		A0A1B0GVY2	172 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SENP1-208	ENST00000551592	WI2-2373I1.2	A0A1W2PRP0	233 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SENP1-208	ENST00000551592	PINLYP	A6NC86	204 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SENP1-208	ENST00000551592	ERICH4	A6NGS2	130 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SENP1-208	ENST00000551592	ZNF879	B4DU55	563 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SENP1-208	ENST00000551592	CA11	O75493	328 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SENP1-208	ENST00000551592	SLC25A27	O95847	323 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SENP1-208	ENST00000551592	PAH	P00439	452 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SENP1-208	ENST00000551592	PRPS2	P11908	318 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SENP1-208	ENST00000551592	ADRB3	P13945	408 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SENP1-208	ENST00000551592	CSNK1A1	P48729	337 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SENP1-208	ENST00000551592	P2RX1	P51575	399 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SENP1-208	ENST00000551592	CCR6	P51684	374 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SENP1-208	ENST00000551592	RPS23	P62266	143 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
SENP1-208	ENST00000551592		Q3ZCU0	254 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SENP1-208	ENST00000551592	CEMP1	Q6PRD7	247 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.87
SENP1-208	ENST00000551592	PCP2	Q8IVA1	136 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SENP1-208	ENST00000551592	C15orf56	Q8N910	161 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SENP1-208	ENST00000551592	SNX31	Q8N9S9	440 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SENP1-208	ENST00000551592	ZNF596	Q8TC21	504 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SENP1-208	ENST00000551592	NTAN1	Q96AB6	310 aa		3.34	□□□□□ -1.87

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.5 ms