RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551441.5

CS-227, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 636 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-227ENST00000551441 FBXW12Q6X9E4 464 aa13.35□□□□□ -0.27
CS-227ENST00000551441 DCDC5Q6ZRR9 648 aa13.35□□□□□ -0.27
CS-227ENST00000551441 C1orf87Q8N0U7 546 aa13.35□□□□□ -0.27
CS-227ENST00000551441 TBC1D15Q8TC07 691 aa13.35□□□□□ -0.27
CS-227ENST00000551441 SSMEM1Q8WWF3 244 aa13.35□□□□□ -0.27
CS-227ENST00000551441 GATAD2BQ8WXI9 593 aa13.35□□□□□ -0.27
CS-227ENST00000551441 COG8Q96MW5 612 aa13.35□□□□□ -0.27
CS-227ENST00000551441 ECSITQ9BQ95 431 aa13.35□□□□□ -0.27
CS-227ENST00000551441 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa13.35□□□□□ -0.27
CS-227ENST00000551441 RABEP2Q9H5N1 569 aa13.35□□□□□ -0.27
CS-227ENST00000551441 TUBG2Q9NRH3 451 aa13.35□□□□□ -0.27
CS-227ENST00000551441 ACOXLQ9NUZ1 547 aa13.35□□□□□ -0.27
CS-227ENST00000551441 TMEM100Q9NV29 134 aa13.35□□□□□ -0.27
CS-227ENST00000551441 TEX13CA0A0J9YWL9 993 aa13.34□□□□□ -0.27
CS-227ENST00000551441 C3orf80F5H4A9 247 aa13.34□□□□□ -0.27
CS-227ENST00000551441 P2RY10O00398 339 aa13.34□□□□□ -0.27
CS-227ENST00000551441 XKRYO14609 159 aa13.34□□□□□ -0.27
CS-227ENST00000551441 CDC42EP2O14613 210 aa13.34□□□□□ -0.27
CS-227ENST00000551441 PHYHO14832 338 aa13.34□□□□□ -0.27
CS-227ENST00000551441 CLPXO76031 633 aa13.34□□□□□ -0.27
CS-227ENST00000551441 MMP9P14780 707 aa13.34□□□□□ -0.27
CS-227ENST00000551441 ARF6P62330 175 aa13.34□□□□□ -0.27
CS-227ENST00000551441 PRKCDQ05655 676 aa13.34□□□□□ -0.27
CS-227ENST00000551441 PDCD1Q15116 288 aa13.34□□□□□ -0.27
CS-227ENST00000551441 Q6ZSV7 163 aa13.34□□□□□ -0.27
CS-227ENST00000551441 CALHM3Q86XJ0 350 aa13.34□□□□□ -0.27
CS-227ENST00000551441 TMEM86BQ8N661 226 aa13.34□□□□□ -0.27
CS-227ENST00000551441 PCYOX1LQ8NBM8 494 aa13.34□□□□□ -0.27
CS-227ENST00000551441 SCCPDHQ8NBX0 429 aa13.34□□□□□ -0.27
CS-227ENST00000551441 OR5L1Q8NGL2 311 aa13.34□□□□□ -0.27
CS-227ENST00000551441 DYRK2Q92630 601 aa13.34□□□□□ -0.27
CS-227ENST00000551441 PRRC1Q96M27 445 aa13.34□□□□□ -0.27
CS-227ENST00000551441 ZNF570Q96NI8 536 aa13.34□□□□□ -0.27
CS-227ENST00000551441 WDFY2Q96P53 400 aa13.34□□□□□ -0.27
CS-227ENST00000551441 POLR2J2Q9GZM3 115 aaKnown RBP13.34□□□□□ -0.27
CS-227ENST00000551441 POLR2J3Q9H1A7 115 aaKnown RBP13.34□□□□□ -0.27
CS-227ENST00000551441 SYT4Q9H2B2 425 aa13.34□□□□□ -0.27
CS-227ENST00000551441 SMURF1Q9HCE7 757 aa13.34□□□□□ -0.27
CS-227ENST00000551441 POLR1DQ9Y2S0 133 aa13.34□□□□□ -0.27
CS-227ENST00000551441 PRSS37A4D1T9 235 aa13.33□□□□□ -0.28
CS-227ENST00000551441 IQCF6A8MYZ5 107 aa13.33□□□□□ -0.28
CS-227ENST00000551441 CPT2P23786 658 aa13.33□□□□□ -0.28
CS-227ENST00000551441 CLEC12AQ5QGZ9 265 aa13.33□□□□□ -0.28
CS-227ENST00000551441 NAA40Q86UY6 237 aa13.33□□□□□ -0.28
CS-227ENST00000551441 FGFRL1Q8N441 504 aa13.33□□□□□ -0.28
CS-227ENST00000551441 OR11L1Q8NGX0 322 aa13.33□□□□□ -0.28
CS-227ENST00000551441 KIF17Q9P2E2 1029 aa13.33□□□□□ -0.28
CS-227ENST00000551441 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP13.33□□□□□ -0.28
CS-227ENST00000551441 ERVK-18Q9QC07 812 aa13.33□□□□□ -0.28
CS-227ENST00000551441 DNAJB11Q9UBS4 358 aa13.33□□□□□ -0.28
CS-227ENST00000551441 RPS6KA6Q9UK32 745 aa13.33□□□□□ -0.28
CS-227ENST00000551441 POMT1Q9Y6A1 747 aa13.33□□□□□ -0.28
CS-227ENST00000551441 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa13.33□□□□□ -0.28
CS-227ENST00000551441 IGHV1-69DA0A0B4J2H0 117 aa13.32□□□□□ -0.28
CS-227ENST00000551441 A0A1W2PRD5 423 aa13.32□□□□□ -0.28
CS-227ENST00000551441 A0A1W2PRF3 423 aa13.32□□□□□ -0.28
CS-227ENST00000551441 A0A1W2PRM7 423 aa13.32□□□□□ -0.28
CS-227ENST00000551441 ELOVL7A1L3X0 281 aa13.32□□□□□ -0.28
CS-227ENST00000551441 SOCS2O14508 198 aa13.32□□□□□ -0.28
CS-227ENST00000551441 ADAM20O43506 726 aa13.32□□□□□ -0.28
CS-227ENST00000551441 KHDRBS3O75525 346 aaKnown RBP13.32□□□□□ -0.28
CS-227ENST00000551441 ALX3O95076 343 aa13.32□□□□□ -0.28
CS-227ENST00000551441 IGHV1-69P01742 117 aa13.32□□□□□ -0.28
CS-227ENST00000551441 CD14P08571 375 aa13.32□□□□□ -0.28
CS-227ENST00000551441 PSMB10P40306 273 aa13.32□□□□□ -0.28
CS-227ENST00000551441 IER3P46695 156 aa13.32□□□□□ -0.28
CS-227ENST00000551441 BPIFB3P59826 476 aa13.32□□□□□ -0.28
CS-227ENST00000551441 OR8B8Q15620 311 aa13.32□□□□□ -0.28
CS-227ENST00000551441 ZNF181Q2M3W8 571 aa13.32□□□□□ -0.28
CS-227ENST00000551441 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP13.32□□□□□ -0.28
CS-227ENST00000551441 METTL11BQ5VVY1 283 aa13.32□□□□□ -0.28
CS-227ENST00000551441 VTCN1Q7Z7D3 282 aa13.32□□□□□ -0.28
CS-227ENST00000551441 DYDC1Q8WWB3 177 aa13.32□□□□□ -0.28
CS-227ENST00000551441 APOBEC3DQ96AK3 386 aaPredicted RBP13.32□□□□□ -0.28
CS-227ENST00000551441 ZNF583Q96ND8 569 aa13.32□□□□□ -0.28
CS-227ENST00000551441 TSSK2Q96PF2 358 aa13.32□□□□□ -0.28
CS-227ENST00000551441 WACQ9BTA9 647 aa13.32□□□□□ -0.28
CS-227ENST00000551441 FNDC11Q9BVV2 318 aa13.32□□□□□ -0.28
CS-227ENST00000551441 SIRPDQ9H106 197 aa13.32□□□□□ -0.28
CS-227ENST00000551441 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP13.32□□□□□ -0.28
CS-227ENST00000551441 A0A087WUU8 490 aa13.31□□□□□ -0.28
CS-227ENST00000551441 FXYD1O00168 92 aa13.31□□□□□ -0.28
CS-227ENST00000551441 FFAR1O14842 300 aa13.31□□□□□ -0.28
CS-227ENST00000551441 FCN3O75636 299 aa13.31□□□□□ -0.28
CS-227ENST00000551441 GYPAP02724 150 aa13.31□□□□□ -0.28
CS-227ENST00000551441 KDELR2P33947 212 aa13.31□□□□□ -0.28
CS-227ENST00000551441 RGS6P49758 472 aa13.31□□□□□ -0.28
CS-227ENST00000551441 DLX1P56177 255 aa13.31□□□□□ -0.28
CS-227ENST00000551441 ELF3P78545 371 aaPredicted RBP13.31□□□□□ -0.28
CS-227ENST00000551441 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP13.31□□□□□ -0.28
CS-227ENST00000551441 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP13.31□□□□□ -0.28
CS-227ENST00000551441 CYLC2Q14093 348 aaPredicted RBP13.31□□□□□ -0.28
CS-227ENST00000551441 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP13.31□□□□□ -0.28
CS-227ENST00000551441 ZNF730Q6ZMV8 503 aa13.31□□□□□ -0.28
CS-227ENST00000551441 PTCHD4Q6ZW05 846 aa13.31□□□□□ -0.28
CS-227ENST00000551441 FAM122BQ7Z309 247 aa13.31□□□□□ -0.28
CS-227ENST00000551441 LINC00346Q8IVM7 164 aa13.31□□□□□ -0.28
CS-227ENST00000551441 GLB1L2Q8IW92 636 aa13.31□□□□□ -0.28
CS-227ENST00000551441 SLCO4A1Q96BD0 722 aa13.31□□□□□ -0.28
CS-227ENST00000551441 HCAR1Q9BXC0 346 aa13.31□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.8 ms