RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550358.5

PTPRB-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRB, Length 6,583 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-208ENST00000550358 YRDCQ86U90 279 aaKnown RBP7.7□□□□□ -1.18
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PTPRB-208ENST00000550358 SLC25A32Q9H2D1 315 aa7.7□□□□□ -1.18
PTPRB-208ENST00000550358 ACKR4Q9NPB9 350 aa7.7□□□□□ -1.18
PTPRB-208ENST00000550358 TAS2R4Q9NYW5 299 aa7.7□□□□□ -1.18
PTPRB-208ENST00000550358 DUSP13Q9UII6 198 aa7.7□□□□□ -1.18
PTPRB-208ENST00000550358 B9D1Q9UPM9 204 aa7.7□□□□□ -1.18
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PTPRB-208ENST00000550358 ESRP2Q9H6T0 727 aaKnown RBP7.69□□□□□ -1.18
PTPRB-208ENST00000550358 METTL17Q9H7H0 456 aaPredicted RBP7.69□□□□□ -1.18
PTPRB-208ENST00000550358 HINT3Q9NQE9 182 aaKnown RBP7.69□□□□□ -1.18
PTPRB-208ENST00000550358 ACOXLQ9NUZ1 547 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRB-208ENST00000550358 LPAR3Q9UBY5 353 aa7.69□□□□□ -1.18
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