RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549039.5

CTDSP2-205, Transcript of CTD small phosphatase 2, humanhuman

TSL 2

Gene CTDSP2, Length 797 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2-205ENST00000549039 HLA-DQA2P01906 255 aa10.15□□□□□ -0.78
CTDSP2-205ENST00000549039 H1F0P07305 194 aaKnown RBP10.15□□□□□ -0.78
CTDSP2-205ENST00000549039 NCK1P16333 377 aa10.15□□□□□ -0.78
CTDSP2-205ENST00000549039 MDKP21741 143 aaPredicted RBP10.15□□□□□ -0.78
CTDSP2-205ENST00000549039 FPR3P25089 353 aa10.15□□□□□ -0.78
CTDSP2-205ENST00000549039 CRABP1P29762 137 aa10.15□□□□□ -0.78
CTDSP2-205ENST00000549039 PITPNBP48739 271 aa10.15□□□□□ -0.78
CTDSP2-205ENST00000549039 KRT72Q14CN4 511 aa10.15□□□□□ -0.78
CTDSP2-205ENST00000549039 CGB2Q6NT52 195 aa10.15□□□□□ -0.78
CTDSP2-205ENST00000549039 PTCHD4Q6ZW05 846 aa10.15□□□□□ -0.78
CTDSP2-205ENST00000549039 C19orf18Q8NEA5 215 aa10.15□□□□□ -0.78
CTDSP2-205ENST00000549039 OR10S1Q8NGN2 331 aa10.15□□□□□ -0.78
CTDSP2-205ENST00000549039 OR52J3Q8NH60 311 aa10.15□□□□□ -0.78
CTDSP2-205ENST00000549039 RP9Q8TA86 221 aaKnown RBP10.15□□□□□ -0.78
CTDSP2-205ENST00000549039 TMIGD2Q96BF3 282 aa10.15□□□□□ -0.78
CTDSP2-205ENST00000549039 UPRTQ96BW1 309 aa10.15□□□□□ -0.78
CTDSP2-205ENST00000549039 RSRC1Q96IZ7 334 aaKnown RBP10.15□□□□□ -0.78
CTDSP2-205ENST00000549039 COQ7Q99807 217 aa10.15□□□□□ -0.78
CTDSP2-205ENST00000549039 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP10.15□□□□□ -0.78
CTDSP2-205ENST00000549039 SLC30A2Q9BRI3 323 aa10.15□□□□□ -0.78
CTDSP2-205ENST00000549039 NUDT16L1Q9BRJ7 211 aaKnown RBP10.15□□□□□ -0.78
CTDSP2-205ENST00000549039 CDADC1Q9BWV3 514 aa10.15□□□□□ -0.78
CTDSP2-205ENST00000549039 HDHD2Q9H0R4 259 aa10.15□□□□□ -0.78
CTDSP2-205ENST00000549039 ANKRD19PQ9H560 264 aa10.15□□□□□ -0.78
CTDSP2-205ENST00000549039 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP10.15□□□□□ -0.78
CTDSP2-205ENST00000549039 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP10.15□□□□□ -0.78
CTDSP2-205ENST00000549039 CLN8Q9UBY8 286 aa10.15□□□□□ -0.78
CTDSP2-205ENST00000549039 SIGLEC7Q9Y286 467 aa10.15□□□□□ -0.78
CTDSP2-205ENST00000549039 ENPP4Q9Y6X5 453 aa10.15□□□□□ -0.78
CTDSP2-205ENST00000549039 UNC119BA6NIH7 251 aa10.14□□□□□ -0.79
CTDSP2-205ENST00000549039 NME4O00746 187 aa10.14□□□□□ -0.79
CTDSP2-205ENST00000549039 PPP1R3DO95685 299 aa10.14□□□□□ -0.79
CTDSP2-205ENST00000549039 CRYBA1P05813 215 aa10.14□□□□□ -0.79
CTDSP2-205ENST00000549039 PPIAL4GP0DN37 164 aa10.14□□□□□ -0.79
CTDSP2-205ENST00000549039 CPT2P23786 658 aa10.14□□□□□ -0.79
CTDSP2-205ENST00000549039 CDKN2AP42771 156 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
CTDSP2-205ENST00000549039 OMPP47874 163 aa10.14□□□□□ -0.79
CTDSP2-205ENST00000549039 GSK3BP49841 420 aa10.14□□□□□ -0.79
CTDSP2-205ENST00000549039 RAD23AP54725 363 aa10.14□□□□□ -0.79
CTDSP2-205ENST00000549039 DEFA6Q01524 100 aa10.14□□□□□ -0.79
CTDSP2-205ENST00000549039 PAX2Q02962 417 aa10.14□□□□□ -0.79
CTDSP2-205ENST00000549039 MALLQ13021 153 aa10.14□□□□□ -0.79
CTDSP2-205ENST00000549039 TUSC1Q2TAM9 212 aa10.14□□□□□ -0.79
CTDSP2-205ENST00000549039 ZNF404Q494X3 552 aa10.14□□□□□ -0.79
CTDSP2-205ENST00000549039 PGM2L1Q6PCE3 622 aa10.14□□□□□ -0.79
CTDSP2-205ENST00000549039 C16orf87Q6PH81 154 aa10.14□□□□□ -0.79
CTDSP2-205ENST00000549039 SMARCD3Q6STE5 483 aa10.14□□□□□ -0.79
CTDSP2-205ENST00000549039 DPY19L2P2Q6ZN68 376 aa10.14□□□□□ -0.79
CTDSP2-205ENST00000549039 C9orf139Q6ZV77 190 aa10.14□□□□□ -0.79
CTDSP2-205ENST00000549039 OR11L1Q8NGX0 322 aa10.14□□□□□ -0.79
CTDSP2-205ENST00000549039 SPRYD4Q8WW59 207 aaPredicted RBP10.14□□□□□ -0.79
CTDSP2-205ENST00000549039 TECTBQ96PL2 329 aa10.14□□□□□ -0.79
CTDSP2-205ENST00000549039 ERMAPQ96PL5 475 aaPredicted RBP10.14□□□□□ -0.79
CTDSP2-205ENST00000549039 GPX7Q96SL4 187 aaPredicted RBP10.14□□□□□ -0.79
CTDSP2-205ENST00000549039 PITX2Q99697 317 aa10.14□□□□□ -0.79
CTDSP2-205ENST00000549039 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP10.14□□□□□ -0.79
CTDSP2-205ENST00000549039 PCGF1Q9BSM1 259 aa10.14□□□□□ -0.79
CTDSP2-205ENST00000549039 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
CTDSP2-205ENST00000549039 MMADHCQ9H3L0 296 aaPredicted RBP10.14□□□□□ -0.79
CTDSP2-205ENST00000549039 UFSP2Q9NUQ7 469 aa10.14□□□□□ -0.79
CTDSP2-205ENST00000549039 ATPIF1Q9UII2 106 aa10.14□□□□□ -0.79
CTDSP2-205ENST00000549039 MGAM2Q2M2H8 2515 aa10.13□□□□□ -0.79
CTDSP2-205ENST00000549039 TRBV4-1A0A0J9YWV2 114 aa10.13□□□□□ -0.79
CTDSP2-205ENST00000549039 KIR2DS1A0A191URI9 304 aa10.13□□□□□ -0.79
CTDSP2-205ENST00000549039 A0A1W2PRQ8 180 aa10.13□□□□□ -0.79
CTDSP2-205ENST00000549039 IQCF6A8MYZ5 107 aa10.13□□□□□ -0.79
CTDSP2-205ENST00000549039 SLC22A2O15244 555 aa10.13□□□□□ -0.79
CTDSP2-205ENST00000549039 DIRAS1O95057 198 aa10.13□□□□□ -0.79
CTDSP2-205ENST00000549039 PLATP00750 562 aa10.13□□□□□ -0.79
CTDSP2-205ENST00000549039 RENP00797 406 aa10.13□□□□□ -0.79
CTDSP2-205ENST00000549039 LCATP04180 440 aa10.13□□□□□ -0.79
CTDSP2-205ENST00000549039 COX4I1P13073 169 aa10.13□□□□□ -0.79
CTDSP2-205ENST00000549039 NOS3P29474 1203 aa10.13□□□□□ -0.79
CTDSP2-205ENST00000549039 MDH1P40925 334 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
CTDSP2-205ENST00000549039 NUDT2P50583 147 aa10.13□□□□□ -0.79
CTDSP2-205ENST00000549039 FGF12P61328 243 aa10.13□□□□□ -0.79
CTDSP2-205ENST00000549039 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP10.13□□□□□ -0.79
CTDSP2-205ENST00000549039 DGCR6Q14129 220 aa10.13□□□□□ -0.79
CTDSP2-205ENST00000549039 KCNMB1Q16558 191 aa10.13□□□□□ -0.79
CTDSP2-205ENST00000549039 DEFB112Q30KQ8 113 aa10.13□□□□□ -0.79
CTDSP2-205ENST00000549039 GPR157Q5UAW9 335 aa10.13□□□□□ -0.79
CTDSP2-205ENST00000549039 PRAMEF6Q5VXH4 476 aa10.13□□□□□ -0.79
CTDSP2-205ENST00000549039 LYPD2Q6UXB3 125 aa10.13□□□□□ -0.79
CTDSP2-205ENST00000549039 C17orf107Q6ZR85 190 aa10.13□□□□□ -0.79
CTDSP2-205ENST00000549039 LINC00346Q8IVM7 164 aa10.13□□□□□ -0.79
CTDSP2-205ENST00000549039 BOLLQ8N9W6 283 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
CTDSP2-205ENST00000549039 OR2AJ1Q8NGZ0 328 aa10.13□□□□□ -0.79
CTDSP2-205ENST00000549039 FANK1Q8TC84 345 aa10.13□□□□□ -0.79
CTDSP2-205ENST00000549039 SLCO4A1Q96BD0 722 aa10.13□□□□□ -0.79
CTDSP2-205ENST00000549039 NMNAT3Q96T66 252 aa10.13□□□□□ -0.79
CTDSP2-205ENST00000549039 EFCAB1Q9HAE3 211 aa10.13□□□□□ -0.79
CTDSP2-205ENST00000549039 KIF17Q9P2E2 1029 aa10.13□□□□□ -0.79
CTDSP2-205ENST00000549039 B9D1Q9UPM9 204 aa10.13□□□□□ -0.79
CTDSP2-205ENST00000549039 LHFPL6Q9Y693 200 aa10.13□□□□□ -0.79
CTDSP2-205ENST00000549039 FAM181BA6NEQ2 426 aa10.12□□□□□ -0.79
CTDSP2-205ENST00000549039 DCTN6O00399 190 aa10.12□□□□□ -0.79
CTDSP2-205ENST00000549039 GMNNO75496 209 aa10.12□□□□□ -0.79
CTDSP2-205ENST00000549039 SASH3O75995 380 aa10.12□□□□□ -0.79
CTDSP2-205ENST00000549039 KNG1P01042 644 aa10.12□□□□□ -0.79
CTDSP2-205ENST00000549039 RHCEP18577 417 aa10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.3 ms