RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546891.5

CS-205, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 911 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-205ENST00000546891 DNPH1O43598 174 aa8.7□□□□□ -1.02
CS-205ENST00000546891 RAD1O60671 282 aa8.7□□□□□ -1.02
CS-205ENST00000546891 ZNF354AO60765 605 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
CS-205ENST00000546891 B3GALNT1O75752 331 aa8.7□□□□□ -1.02
CS-205ENST00000546891 TIAF1O95411 115 aa8.7□□□□□ -1.02
CS-205ENST00000546891 CER1O95813 267 aa8.7□□□□□ -1.02
CS-205ENST00000546891 TTRP02766 147 aa8.7□□□□□ -1.02
CS-205ENST00000546891 AMY2AP04746 511 aa8.7□□□□□ -1.02
CS-205ENST00000546891 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
CS-205ENST00000546891 VSIG10L2P0DP72 767 aa8.7□□□□□ -1.02
CS-205ENST00000546891 PPP3CBP16298 524 aa8.7□□□□□ -1.02
CS-205ENST00000546891 ZNF17P17021 662 aa8.7□□□□□ -1.02
CS-205ENST00000546891 CCL1P22362 96 aa8.7□□□□□ -1.02
CS-205ENST00000546891 TAS2R31P59538 309 aa8.7□□□□□ -1.02
CS-205ENST00000546891 SEC61A1P61619 476 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
CS-205ENST00000546891 LSM6P62312 80 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
CS-205ENST00000546891 GABREP78334 506 aa8.7□□□□□ -1.02
CS-205ENST00000546891 PLA2G7Q13093 441 aa8.7□□□□□ -1.02
CS-205ENST00000546891 POU4F3Q15319 338 aa8.7□□□□□ -1.02
CS-205ENST00000546891 HLA-BQ31612 363 aa8.7□□□□□ -1.02
CS-205ENST00000546891 RNASE10Q5GAN6 216 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
CS-205ENST00000546891 LIN54Q6MZP7 749 aa8.7□□□□□ -1.02
CS-205ENST00000546891 ZNF529Q6P280 563 aa8.7□□□□□ -1.02
CS-205ENST00000546891 FAHD2BQ6P2I3 314 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
CS-205ENST00000546891 NHLRC1Q6VVB1 395 aa8.7□□□□□ -1.02
CS-205ENST00000546891 ZNF813Q6ZN06 617 aa8.7□□□□□ -1.02
CS-205ENST00000546891 C16orf47Q6ZP98 133 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
CS-205ENST00000546891 IDO2Q6ZQW0 420 aa8.7□□□□□ -1.02
CS-205ENST00000546891 DOK3Q7L591 496 aa8.7□□□□□ -1.02
CS-205ENST00000546891 CHMP1BQ7LBR1 199 aa8.7□□□□□ -1.02
CS-205ENST00000546891 TMPRSS9Q7Z410 1059 aa8.7□□□□□ -1.02
CS-205ENST00000546891 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
CS-205ENST00000546891 AGBL5Q8NDL9 886 aa8.7□□□□□ -1.02
CS-205ENST00000546891 OR51A2Q8NGJ7 313 aa8.7□□□□□ -1.02
CS-205ENST00000546891 M1APQ8TC57 530 aa8.7□□□□□ -1.02
CS-205ENST00000546891 IFI44Q8TCB0 444 aa8.7□□□□□ -1.02
CS-205ENST00000546891 FGGYQ96C11 551 aa8.7□□□□□ -1.02
CS-205ENST00000546891 INTS12Q96CB8 462 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
CS-205ENST00000546891 FAHD2AQ96GK7 314 aa8.7□□□□□ -1.02
CS-205ENST00000546891 OR5B2Q96R09 309 aa8.7□□□□□ -1.02
CS-205ENST00000546891 CITED4Q96RK1 184 aa8.7□□□□□ -1.02
CS-205ENST00000546891 EDEM2Q9BV94 578 aa8.7□□□□□ -1.02
CS-205ENST00000546891 GSX2Q9BZM3 304 aa8.7□□□□□ -1.02
CS-205ENST00000546891 ZNF700Q9H0M5 742 aa8.7□□□□□ -1.02
CS-205ENST00000546891 MED9Q9NWA0 146 aa8.7□□□□□ -1.02
CS-205ENST00000546891 GHRLQ9UBU3 117 aa8.7□□□□□ -1.02
CS-205ENST00000546891 SSUH2Q9Y2M2 353 aa8.7□□□□□ -1.02
CS-205ENST00000546891 IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 117 aa8.69□□□□□ -1.02
CS-205ENST00000546891 RPS10-NUDT3A0A1W2PQS6 291 aa8.69□□□□□ -1.02
CS-205ENST00000546891 C2orf72A6NCS6 295 aa8.69□□□□□ -1.02
CS-205ENST00000546891 MCRIP1C9JLW8 97 aa8.69□□□□□ -1.02
CS-205ENST00000546891 DLL1O00548 723 aa8.69□□□□□ -1.02
CS-205ENST00000546891 EIF1AYO14602 144 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
CS-205ENST00000546891 GOSR2O14653 212 aa8.69□□□□□ -1.02
CS-205ENST00000546891 SHOXO15266 292 aa8.69□□□□□ -1.02
CS-205ENST00000546891 TOXO94900 526 aa8.69□□□□□ -1.02
CS-205ENST00000546891 WISP1O95388 367 aa8.69□□□□□ -1.02
CS-205ENST00000546891 RPA2P15927 270 aa8.69□□□□□ -1.02
CS-205ENST00000546891 CTSSP25774 331 aa8.69□□□□□ -1.02
CS-205ENST00000546891 S100A11P31949 105 aa8.69□□□□□ -1.02
CS-205ENST00000546891 CBX5P45973 191 aa8.69□□□□□ -1.02
CS-205ENST00000546891 EIF1AXP47813 144 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
CS-205ENST00000546891 P2RY4P51582 365 aa8.69□□□□□ -1.02
CS-205ENST00000546891 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
CS-205ENST00000546891 DSCR4P56555 118 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
CS-205ENST00000546891 CLDN6P56747 220 aa8.69□□□□□ -1.02
CS-205ENST00000546891 UBE2MP61081 183 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
CS-205ENST00000546891 CSNK2A1P68400 391 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
CS-205ENST00000546891 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
CS-205ENST00000546891 GK2Q14410 553 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
CS-205ENST00000546891 ARL6IP1Q15041 203 aa8.69□□□□□ -1.02
CS-205ENST00000546891 PCOLCEQ15113 449 aa8.69□□□□□ -1.02
CS-205ENST00000546891 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa8.69□□□□□ -1.02
CS-205ENST00000546891 ZNF260Q3ZCT1 412 aa8.69□□□□□ -1.02
CS-205ENST00000546891 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
CS-205ENST00000546891 AWAT2Q6E213 333 aa8.69□□□□□ -1.02
CS-205ENST00000546891 RTL6Q6ICC9 239 aa8.69□□□□□ -1.02
CS-205ENST00000546891 TMPPEQ6ZT21 453 aa8.69□□□□□ -1.02
CS-205ENST00000546891 MUC20Q8N307 709 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
CS-205ENST00000546891 BPIFB2Q8N4F0 458 aa8.69□□□□□ -1.02
CS-205ENST00000546891 OR4D6Q8NGJ1 314 aa8.69□□□□□ -1.02
CS-205ENST00000546891 OR8S1Q8NH09 359 aa8.69□□□□□ -1.02
CS-205ENST00000546891 PPP1R14AQ96A00 147 aa8.69□□□□□ -1.02
CS-205ENST00000546891 C10orf35Q96D05 121 aa8.69□□□□□ -1.02
CS-205ENST00000546891 SCGB3A2Q96PL1 93 aa8.69□□□□□ -1.02
CS-205ENST00000546891 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
CS-205ENST00000546891 B3GNT4Q9C0J1 378 aa8.69□□□□□ -1.02
CS-205ENST00000546891 POFUT1Q9H488 388 aa8.69□□□□□ -1.02
CS-205ENST00000546891 CNTD2Q9H8S5 307 aa8.69□□□□□ -1.02
CS-205ENST00000546891 SEC61A2Q9H9S3 476 aa8.69□□□□□ -1.02
CS-205ENST00000546891 IFT46Q9NQC8 304 aa8.69□□□□□ -1.02
CS-205ENST00000546891 CA10Q9NS85 328 aa8.69□□□□□ -1.02
CS-205ENST00000546891 GLTPQ9NZD2 209 aa8.69□□□□□ -1.02
CS-205ENST00000546891 KCNN3Q9UGI6 736 aa8.69□□□□□ -1.02
CS-205ENST00000546891 RHBDD3Q9Y3P4 386 aa8.69□□□□□ -1.02
CS-205ENST00000546891 SESN1Q9Y6P5 492 aa8.69□□□□□ -1.02
CS-205ENST00000546891 XIRP2A4UGR9 3374 aa8.69□□□□□ -1.02
CS-205ENST00000546891 SPAG17Q6Q759 2223 aa8.69□□□□□ -1.02
CS-205ENST00000546891 ADAMTS9Q9P2N4 1935 aa8.68□□□□□ -1.02
CS-205ENST00000546891 IGHV1-45A0A0A0MS14 117 aa8.68□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.9 ms