RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544253.1

ANKRD49-208, Transcript of ankyrin repeat domain 49, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene ANKRD49, Length 3,002 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD49-208ENST00000544253 RCN3Q96D15 328 aa4.82□□□□□ -1.64
ANKRD49-208ENST00000544253 DNAJA3Q96EY1 480 aa4.82□□□□□ -1.64
ANKRD49-208ENST00000544253 PYURFQ96I23 114 aa4.82□□□□□ -1.64
ANKRD49-208ENST00000544253 FAM71F1Q96KD3 344 aaPredicted RBP4.82□□□□□ -1.64
ANKRD49-208ENST00000544253 UNKLQ9H9P5 680 aaKnown RBP4.82□□□□□ -1.64
ANKRD49-208ENST00000544253 IL1RAPQ9NPH3 570 aa4.82□□□□□ -1.64
ANKRD49-208ENST00000544253 IL20Q9NYY1 176 aa4.82□□□□□ -1.64
ANKRD49-208ENST00000544253 DUSP13Q9UII6 198 aa4.82□□□□□ -1.64
ANKRD49-208ENST00000544253 LHFPL6Q9Y693 200 aa4.82□□□□□ -1.64
ANKRD49-208ENST00000544253 CDC42EP2O14613 210 aa4.82□□□□□ -1.64
ANKRD49-208ENST00000544253 XRCC2O43543 280 aa4.82□□□□□ -1.64
ANKRD49-208ENST00000544253 TIMM8AO60220 97 aaPredicted RBP4.82□□□□□ -1.64
ANKRD49-208ENST00000544253 TMEM127O75204 238 aa4.82□□□□□ -1.64
ANKRD49-208ENST00000544253 RENP00797 406 aa4.82□□□□□ -1.64
ANKRD49-208ENST00000544253 LHBP01229 141 aa4.82□□□□□ -1.64
ANKRD49-208ENST00000544253 FAM157BP0CG42 384 aa4.82□□□□□ -1.64
ANKRD49-208ENST00000544253 CTLA4P16410 223 aa4.82□□□□□ -1.64
ANKRD49-208ENST00000544253 CBLP22681 906 aa4.82□□□□□ -1.64
ANKRD49-208ENST00000544253 GGT2P36268 569 aa4.82□□□□□ -1.64
ANKRD49-208ENST00000544253 HTR5AP47898 357 aa4.82□□□□□ -1.64
ANKRD49-208ENST00000544253 ACTG1P63261 375 aa4.82□□□□□ -1.64
ANKRD49-208ENST00000544253 FMODQ06828 376 aa4.82□□□□□ -1.64
ANKRD49-208ENST00000544253 LCN1P1Q5VSP4 162 aa4.82□□□□□ -1.64
ANKRD49-208ENST00000544253 ZNF770Q6IQ21 691 aaPredicted RBP4.82□□□□□ -1.64
ANKRD49-208ENST00000544253 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa4.82□□□□□ -1.64
ANKRD49-208ENST00000544253 IL17RELQ6ZVW7 336 aa4.82□□□□□ -1.64
ANKRD49-208ENST00000544253 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP4.82□□□□□ -1.64
ANKRD49-208ENST00000544253 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP4.82□□□□□ -1.64
ANKRD49-208ENST00000544253 C16orf95Q9H693 158 aa4.82□□□□□ -1.64
ANKRD49-208ENST00000544253 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa4.82□□□□□ -1.64
ANKRD49-208ENST00000544253 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP4.82□□□□□ -1.64
ANKRD49-208ENST00000544253 CDH10Q9Y6N8 788 aa4.82□□□□□ -1.64
ANKRD49-208ENST00000544253 DYSFO75923 2080 aa4.81□□□□□ -1.64
ANKRD49-208ENST00000544253 SRRM5B3KS81 715 aa4.81□□□□□ -1.64
ANKRD49-208ENST00000544253 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP4.81□□□□□ -1.64
ANKRD49-208ENST00000544253 WNT9BO14905 357 aa4.81□□□□□ -1.64
ANKRD49-208ENST00000544253 ENSAO43768 121 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
ANKRD49-208ENST00000544253 SERPINA1P01009 418 aa4.81□□□□□ -1.64
ANKRD49-208ENST00000544253 SCG5P05408 212 aa4.81□□□□□ -1.64
ANKRD49-208ENST00000544253 ACAA1P09110 424 aaPredicted RBP4.81□□□□□ -1.64
ANKRD49-208ENST00000544253 DCTDP32321 178 aa4.81□□□□□ -1.64
ANKRD49-208ENST00000544253 MNAT1P51948 309 aa4.81□□□□□ -1.64
ANKRD49-208ENST00000544253 ERVS71-1P61550 626 aa4.81□□□□□ -1.64
ANKRD49-208ENST00000544253 GRB2P62993 217 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
ANKRD49-208ENST00000544253 TRAP1Q12931 704 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
ANKRD49-208ENST00000544253 AWAT1Q58HT5 328 aa4.81□□□□□ -1.64
ANKRD49-208ENST00000544253 C16orf87Q6PH81 154 aa4.81□□□□□ -1.64
ANKRD49-208ENST00000544253 BTNL3Q6UXE8 466 aa4.81□□□□□ -1.64
ANKRD49-208ENST00000544253 LIAT1Q6ZQX7 453 aa4.81□□□□□ -1.64
ANKRD49-208ENST00000544253 NLRC3Q7RTR2 1065 aa4.81□□□□□ -1.64
ANKRD49-208ENST00000544253 LNX2Q8N448 690 aa4.81□□□□□ -1.64
ANKRD49-208ENST00000544253 BPIFB2Q8N4F0 458 aa4.81□□□□□ -1.64
ANKRD49-208ENST00000544253 CYB561A3Q8NBI2 242 aa4.81□□□□□ -1.64
ANKRD49-208ENST00000544253 LY6G5BQ8NDX9 201 aa4.81□□□□□ -1.64
ANKRD49-208ENST00000544253 OR11L1Q8NGX0 322 aa4.81□□□□□ -1.64
ANKRD49-208ENST00000544253 SSBP3Q9BWW4 388 aaPredicted RBP4.81□□□□□ -1.64
ANKRD49-208ENST00000544253 HCAR1Q9BXC0 346 aa4.81□□□□□ -1.64
ANKRD49-208ENST00000544253 RNPEPL1Q9HAU8 725 aa4.81□□□□□ -1.64
ANKRD49-208ENST00000544253 TREM2Q9NZC2 230 aa4.81□□□□□ -1.64
ANKRD49-208ENST00000544253 B9D1Q9UPM9 204 aa4.81□□□□□ -1.64
ANKRD49-208ENST00000544253 LRP12Q9Y561 859 aa4.81□□□□□ -1.64
ANKRD49-208ENST00000544253 TMEM210A6NLX4 147 aa4.81□□□□□ -1.64
ANKRD49-208ENST00000544253 BHLHE40O14503 412 aa4.81□□□□□ -1.64
ANKRD49-208ENST00000544253 CLPXO76031 633 aa4.81□□□□□ -1.64
ANKRD49-208ENST00000544253 ATP6V1B1P15313 513 aa4.81□□□□□ -1.64
ANKRD49-208ENST00000544253 PRTN3P24158 256 aa4.81□□□□□ -1.64
ANKRD49-208ENST00000544253 GRK5P34947 590 aa4.81□□□□□ -1.64
ANKRD49-208ENST00000544253 PSME3P61289 254 aa4.81□□□□□ -1.64
ANKRD49-208ENST00000544253 CCL8P80075 99 aa4.81□□□□□ -1.64
ANKRD49-208ENST00000544253 MALLQ13021 153 aa4.81□□□□□ -1.64
ANKRD49-208ENST00000544253 ZMYND11Q15326 602 aa4.81□□□□□ -1.64
ANKRD49-208ENST00000544253 SGCAQ16586 387 aa4.81□□□□□ -1.64
ANKRD49-208ENST00000544253 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP4.81□□□□□ -1.64
ANKRD49-208ENST00000544253 ESCO2Q56NI9 601 aa4.81□□□□□ -1.64
ANKRD49-208ENST00000544253 ARMCX4Q5H9R4 360 aa4.81□□□□□ -1.64
ANKRD49-208ENST00000544253 LCN8Q6JVE9 175 aa4.81□□□□□ -1.64
ANKRD49-208ENST00000544253 ZNF841Q6ZN19 808 aa4.81□□□□□ -1.64
ANKRD49-208ENST00000544253 ZDHHC21Q8IVQ6 265 aa4.81□□□□□ -1.64
ANKRD49-208ENST00000544253 C3orf56Q8N813 242 aa4.81□□□□□ -1.64
ANKRD49-208ENST00000544253 CCDC54Q8NEL0 328 aa4.81□□□□□ -1.64
ANKRD49-208ENST00000544253 FANK1Q8TC84 345 aa4.81□□□□□ -1.64
ANKRD49-208ENST00000544253 RAB40AQ8WXH6 277 aa4.81□□□□□ -1.64
ANKRD49-208ENST00000544253 GCDHQ92947 438 aaPredicted RBP4.81□□□□□ -1.64
ANKRD49-208ENST00000544253 SPTSSAQ969W0 71 aa4.81□□□□□ -1.64
ANKRD49-208ENST00000544253 ZNF582Q96NG8 517 aaPredicted RBP4.81□□□□□ -1.64
ANKRD49-208ENST00000544253 GAL3ST1Q99999 423 aa4.81□□□□□ -1.64
ANKRD49-208ENST00000544253 FN3KRPQ9HA64 309 aa4.81□□□□□ -1.64
ANKRD49-208ENST00000544253 FAM32AQ9Y421 112 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
ANKRD49-208ENST00000544253 SNX13Q9Y5W8 968 aa4.81□□□□□ -1.64
ANKRD49-208ENST00000544253 KPTNQ9Y664 436 aa4.81□□□□□ -1.64
ANKRD49-208ENST00000544253 AUP1Q9Y679 476 aa4.81□□□□□ -1.64
ANKRD49-208ENST00000544253 A0A1W2PPL8 197 aa4.8□□□□□ -1.64
ANKRD49-208ENST00000544253 GSTA4O15217 222 aa4.8□□□□□ -1.64
ANKRD49-208ENST00000544253 CDAP32320 146 aa4.8□□□□□ -1.64
ANKRD49-208ENST00000544253 TPTEP56180 551 aa4.8□□□□□ -1.64
ANKRD49-208ENST00000544253 CCNIQ14094 377 aa4.8□□□□□ -1.64
ANKRD49-208ENST00000544253 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
ANKRD49-208ENST00000544253 KLF17Q5JT82 389 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
ANKRD49-208ENST00000544253 C16orf89Q6UX73 402 aa4.8□□□□□ -1.64
ANKRD49-208ENST00000544253 FAM90A1Q86YD7 464 aa4.8□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 82.5 ms