RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532032.5

ATXN3-215, Transcript of ataxin 3, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene ATXN3, Length 1,191 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATXN3-215	ENST00000532032	OR5K2	Q8NHB8	316 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-215	ENST00000532032	TRMT10A	Q8TBZ6	339 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-215	ENST00000532032	SLC2A12	Q8TD20	617 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-215	ENST00000532032	TFG	Q92734	400 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-215	ENST00000532032	GIMAP5	Q96F15	307 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-215	ENST00000532032	CNRIP1	Q96F85	164 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-215	ENST00000532032	OTUB1	Q96FW1	271 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-215	ENST00000532032	SLC41A3	Q96GZ6	507 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-215	ENST00000532032	PGLYRP3	Q96LB9	341 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-215	ENST00000532032	SAMD8	Q96LT4	415 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-215	ENST00000532032	ZNF681	Q96N22	645 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-215	ENST00000532032	OR7D2	Q96RA2	312 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-215	ENST00000532032	BBS4	Q96RK4	519 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-215	ENST00000532032	PRSS27	Q9BQR3	290 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-215	ENST00000532032	UTP23	Q9BRU9	249 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-215	ENST00000532032	ACAT2	Q9BWD1	397 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-215	ENST00000532032	FAIM2	Q9BWQ8	316 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-215	ENST00000532032	HCAR1	Q9BXC0	346 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-215	ENST00000532032	REG4	Q9BYZ8	158 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-215	ENST00000532032	CXXC4	Q9H2H0	198 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-215	ENST00000532032	KCNN2	Q9H2S1	579 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-215	ENST00000532032	DPAGT1	Q9H3H5	408 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-215	ENST00000532032	FN3K	Q9H479	309 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-215	ENST00000532032	KLHL31	Q9H511	634 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-215	ENST00000532032	FAM60A	Q9NP50	221 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-215	ENST00000532032	NANS	Q9NR45	359 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-215	ENST00000532032	CTPS2	Q9NRF8	586 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-215	ENST00000532032	SLC22A11	Q9NSA0	550 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-215	ENST00000532032	NUDT15	Q9NV35	164 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-215	ENST00000532032	MED9	Q9NWA0	146 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-215	ENST00000532032	PIPOX	Q9P0Z9	390 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-215	ENST00000532032	COPZ2	Q9P299	210 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-215	ENST00000532032	DHCR7	Q9UBM7	475 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-215	ENST00000532032	TAC3	Q9UHF0	121 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-215	ENST00000532032	SCP2D1	Q9UJQ7	156 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-215	ENST00000532032	NXT1	Q9UKK6	140 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-215	ENST00000532032	FBXL3	Q9UKT7	428 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-215	ENST00000532032	GTF2A1L	Q9UNN4	478 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-215	ENST00000532032	ZNF835	Q9Y2P0	537 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-215	ENST00000532032	MEMO1	Q9Y316	297 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-215	ENST00000532032	ATG4B	Q9Y4P1	393 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-215	ENST00000532032	FKBP7	Q9Y680	259 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-215	ENST00000532032	SVIL	O95425	2214 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-215	ENST00000532032	MED13L	Q71F56	2210 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-215	ENST00000532032	DIDO1	Q9BTC0	2240 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-215	ENST00000532032	AKAP9	Q99996	3911 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-215	ENST00000532032	SPG11	Q96JI7	2443 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-215	ENST00000532032	TRAV6	A0A075B6T7	132 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-215	ENST00000532032	IFITM10	A6NMD0	228 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-215	ENST00000532032	CPSF4L	A6NMK7	179 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-215	ENST00000532032	OGG1	O15527	345 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-215	ENST00000532032	OR1F1	O43749	312 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-215	ENST00000532032	ALOX12B	O75342	701 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-215	ENST00000532032	PRKRA	O75569	313 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-215	ENST00000532032	SCO1	O75880	301 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-215	ENST00000532032	OR7A10	O76100	309 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-215	ENST00000532032	HP	P00738	406 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-215	ENST00000532032	CFD	P00746	253 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-215	ENST00000532032	IFNA7	P01567	189 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-215	ENST00000532032	RPN2	P04844	631 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-215	ENST00000532032	SERPINA7	P05543	415 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-215	ENST00000532032	SAG	P10523	405 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-215	ENST00000532032	ATF1	P18846	271 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-215	ENST00000532032	CSNK2A2	P19784	350 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-215	ENST00000532032	RPS4Y1	P22090	263 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-215	ENST00000532032	HIST1H1T	P22492	207 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-215	ENST00000532032	ATP5A1	P25705	553 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-215	ENST00000532032	GIF	P27352	417 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-215	ENST00000532032	PSMB5	P28074	263 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-215	ENST00000532032	CALCR	P30988	508 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-215	ENST00000532032	SSR2	P43308	183 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-215	ENST00000532032	CAPZA2	P47755	286 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-215	ENST00000532032	GABRA4	P48169	554 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-215	ENST00000532032	RGS8	P57771	180 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-215	ENST00000532032	TAS2R43	P59537	309 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-215	ENST00000532032	STXBP1	P61764	594 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-215	ENST00000532032	EEF1A1	P68104	462 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-215	ENST00000532032	ZNF85	Q03923	595 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-215	ENST00000532032	TGM3	Q08188	693 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-215	ENST00000532032	EXOSC2	Q13868	293 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-215	ENST00000532032	ELFN2	Q5R3F8	820 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-215	ENST00000532032	GARNL3	Q5VVW2	1013 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-215	ENST00000532032	MFSD12	Q6NUT3	480 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-215	ENST00000532032	SLC48A1	Q6P1K1	146 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-215	ENST00000532032	PLBD1	Q6P4A8	553 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-215	ENST00000532032	ARL9	Q6T311	187 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-215	ENST00000532032	UNQ9370/PRO34162	Q6UXP9	181 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-215	ENST00000532032	WDR88	Q6ZMY6	472 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-215	ENST00000532032	FRRS1	Q6ZNA5	592 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-215	ENST00000532032	PLEKHM3	Q6ZWE6	761 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-215	ENST00000532032	NDUFAF7	Q7L592	441 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-215	ENST00000532032	CEACAM19	Q7Z692	300 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-215	ENST00000532032	LUZP2	Q86TE4	346 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-215	ENST00000532032	GPAT4	Q86UL3	456 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-215	ENST00000532032	ACOT4	Q8N9L9	421 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-215	ENST00000532032	UXS1	Q8NBZ7	420 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-215	ENST00000532032	FAM71C	Q8NEG0	241 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-215	ENST00000532032	C17orf47	Q8NEP4	570 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-215	ENST00000532032	OR11G2	Q8NGC1	345 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-215	ENST00000532032	OR52E1	Q8NGJ3	308 aa		4.6	□□□□□ -1.67

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