RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000518483.5

EXO1-208, Transcript of exonuclease 1, human

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene EXO1, Length 2,899 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EXO1-208	ENST00000518483	SLC35E2	P0CK97	266 aa		4.36	□□□□□ -1.71
EXO1-208	ENST00000518483	KCNE1	P15382	129 aa		4.36	□□□□□ -1.71
EXO1-208	ENST00000518483	ME2	P23368	584 aa		4.36	□□□□□ -1.71
EXO1-208	ENST00000518483	SAA4	P35542	130 aa		4.36	□□□□□ -1.71
EXO1-208	ENST00000518483	GTF2H2	Q13888	395 aa		4.36	□□□□□ -1.71
EXO1-208	ENST00000518483	GPR18	Q14330	331 aa		4.36	□□□□□ -1.71
EXO1-208	ENST00000518483	MESD	Q14696	234 aa		4.36	□□□□□ -1.71
EXO1-208	ENST00000518483	MTF1	Q14872	753 aa		4.36	□□□□□ -1.71
EXO1-208	ENST00000518483	NIPAL1	Q6NVV3	410 aa		4.36	□□□□□ -1.71
EXO1-208	ENST00000518483	GTF2H2C	Q6P1K8	395 aa		4.36	□□□□□ -1.71
EXO1-208	ENST00000518483	GDPD4	Q6W3E5	623 aa		4.36	□□□□□ -1.71
EXO1-208	ENST00000518483	C17orf64	Q86WR6	236 aa		4.36	□□□□□ -1.71
EXO1-208	ENST00000518483	OR6N2	Q8NGY6	317 aa		4.36	□□□□□ -1.71
EXO1-208	ENST00000518483	OR10J5	Q8NHC4	309 aa		4.36	□□□□□ -1.71
EXO1-208	ENST00000518483	ZNF564	Q8TBZ8	553 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
EXO1-208	ENST00000518483	TMEM163	Q8TC26	289 aa		4.36	□□□□□ -1.71
EXO1-208	ENST00000518483	ELSPBP1	Q96BH3	223 aa		4.36	□□□□□ -1.71
EXO1-208	ENST00000518483	RTP4	Q96DX8	246 aa		4.36	□□□□□ -1.71
EXO1-208	ENST00000518483	ZNF670	Q9BS34	389 aa		4.36	□□□□□ -1.71
EXO1-208	ENST00000518483	SSBP3	Q9BWW4	388 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
EXO1-208	ENST00000518483	ING2	Q9H160	280 aa		4.36	□□□□□ -1.71
EXO1-208	ENST00000518483	ZNF334	Q9HCZ1	680 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
EXO1-208	ENST00000518483	ZNHIT2	Q9UHR6	403 aa		4.36	□□□□□ -1.71
EXO1-208	ENST00000518483	GUCA1B	Q9UMX6	200 aa		4.36	□□□□□ -1.71
EXO1-208	ENST00000518483		V9GYQ6	96 aa		4.36	□□□□□ -1.71
EXO1-208	ENST00000518483	RALGAPA1	Q6GYQ0	2036 aa		4.36	□□□□□ -1.71
EXO1-208	ENST00000518483	EPG5	Q9HCE0	2579 aa		4.36	□□□□□ -1.71
EXO1-208	ENST00000518483	DOCK8	Q8NF50	2099 aa		4.36	□□□□□ -1.71
EXO1-208	ENST00000518483		A0A0A6YYD4	124 aa		4.36	□□□□□ -1.71
EXO1-208	ENST00000518483	SAGE2P	A6NJ88	616 aa		4.36	□□□□□ -1.71
EXO1-208	ENST00000518483	TM9SF1	O15321	606 aa		4.36	□□□□□ -1.71
EXO1-208	ENST00000518483	INPP4B	O15327	924 aa		4.36	□□□□□ -1.71
EXO1-208	ENST00000518483	GSC2	O15499	205 aa		4.36	□□□□□ -1.71
EXO1-208	ENST00000518483	XPNPEP2	O43895	674 aa		4.36	□□□□□ -1.71
EXO1-208	ENST00000518483	LYPD3	O95274	346 aa		4.36	□□□□□ -1.71
EXO1-208	ENST00000518483	FGF2	P09038	288 aa		4.36	□□□□□ -1.71
EXO1-208	ENST00000518483	FAM106CP	P0CH98	169 aa		4.36	□□□□□ -1.71
EXO1-208	ENST00000518483	BCKDHA	P12694	445 aa		4.36	□□□□□ -1.71
EXO1-208	ENST00000518483	TDGF1	P13385	188 aa		4.36	□□□□□ -1.71
EXO1-208	ENST00000518483	PROZ	P22891	400 aa		4.36	□□□□□ -1.71
EXO1-208	ENST00000518483	FAS	P25445	335 aa		4.36	□□□□□ -1.71
EXO1-208	ENST00000518483	RFC3	P40938	356 aa		4.36	□□□□□ -1.71
EXO1-208	ENST00000518483	RPS9	P46781	194 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
EXO1-208	ENST00000518483	RPL31	P62899	125 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
EXO1-208	ENST00000518483	ZNF85	Q03923	595 aa		4.36	□□□□□ -1.71
EXO1-208	ENST00000518483	TWF1	Q12792	350 aa		4.36	□□□□□ -1.71
EXO1-208	ENST00000518483	TPRG1L	Q5T0D9	272 aa		4.36	□□□□□ -1.71
EXO1-208	ENST00000518483	SAXO2	Q658L1	398 aa		4.36	□□□□□ -1.71
EXO1-208	ENST00000518483	DUPD1	Q68J44	220 aa		4.36	□□□□□ -1.71
EXO1-208	ENST00000518483	ZNF787	Q6DD87	383 aa		4.36	□□□□□ -1.71
EXO1-208	ENST00000518483	DRAM2	Q6UX65	266 aa		4.36	□□□□□ -1.71
EXO1-208	ENST00000518483	SARAF	Q96BY9	339 aa		4.36	□□□□□ -1.71
EXO1-208	ENST00000518483	SCMH1	Q96GD3	660 aa		4.36	□□□□□ -1.71
EXO1-208	ENST00000518483	PGLYRP2	Q96PD5	576 aa		4.36	□□□□□ -1.71
EXO1-208	ENST00000518483	UGT1A8	Q9HAW9	530 aa		4.36	□□□□□ -1.71
EXO1-208	ENST00000518483	ARID2	Q68CP9	1835 aa		4.36	□□□□□ -1.71
EXO1-208	ENST00000518483	TMEM272	A0A1B0GTI8	110 aa		4.35	□□□□□ -1.71
EXO1-208	ENST00000518483	hCG_38984	A0A1B0GV85	526 aa		4.35	□□□□□ -1.71
EXO1-208	ENST00000518483	OR2AT4	A6NND4	320 aa		4.35	□□□□□ -1.71
EXO1-208	ENST00000518483		E5RI56	91 aa		4.35	□□□□□ -1.71
EXO1-208	ENST00000518483	KCNK1	O00180	336 aa		4.35	□□□□□ -1.71
EXO1-208	ENST00000518483	RAD1	O60671	282 aa		4.35	□□□□□ -1.71
EXO1-208	ENST00000518483	CCNE1	P24864	410 aa		4.35	□□□□□ -1.71
EXO1-208	ENST00000518483	MSN	P26038	577 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
EXO1-208	ENST00000518483	MPI	P34949	423 aa		4.35	□□□□□ -1.71
EXO1-208	ENST00000518483	PMEL	P40967	661 aa		4.35	□□□□□ -1.71
EXO1-208	ENST00000518483	FGF8	P55075	233 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
EXO1-208	ENST00000518483	LAGE3	Q14657	143 aa		4.35	□□□□□ -1.71
EXO1-208	ENST00000518483	TEAD2	Q15562	447 aa		4.35	□□□□□ -1.71
EXO1-208	ENST00000518483	ZNF549	Q6P9A3	640 aa		4.35	□□□□□ -1.71
EXO1-208	ENST00000518483	LFNG	Q8NES3	379 aa		4.35	□□□□□ -1.71
EXO1-208	ENST00000518483	ATP6V1C2	Q8NEY4	427 aa		4.35	□□□□□ -1.71
EXO1-208	ENST00000518483	AEN	Q8WTP8	325 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
EXO1-208	ENST00000518483	SGTB	Q96EQ0	304 aa		4.35	□□□□□ -1.71
EXO1-208	ENST00000518483	FOXC2	Q99958	501 aa		4.35	□□□□□ -1.71
EXO1-208	ENST00000518483	OSBPL11	Q9BXB4	747 aa		4.35	□□□□□ -1.71
EXO1-208	ENST00000518483	BATF3	Q9NR55	127 aa		4.35	□□□□□ -1.71
EXO1-208	ENST00000518483	HRASLS2	Q9NWW9	162 aa		4.35	□□□□□ -1.71
EXO1-208	ENST00000518483	TFR2	Q9UP52	801 aa		4.35	□□□□□ -1.71
EXO1-208	ENST00000518483	PAM16	Q9Y3D7	125 aa		4.35	□□□□□ -1.71
EXO1-208	ENST00000518483	STYXL1	Q9Y6J8	313 aa		4.35	□□□□□ -1.71
EXO1-208	ENST00000518483	C2orf16	Q68DN1	1984 aa		4.35	□□□□□ -1.71
EXO1-208	ENST00000518483	MEIOC	A2RUB1	952 aa		4.35	□□□□□ -1.71
EXO1-208	ENST00000518483	ETV2	O00321	342 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
EXO1-208	ENST00000518483	GABRP	O00591	440 aa		4.35	□□□□□ -1.71
EXO1-208	ENST00000518483	BUB3	O43684	328 aa		4.35	□□□□□ -1.71
EXO1-208	ENST00000518483	SRP72	O76094	671 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
EXO1-208	ENST00000518483	HBQ1	P09105	142 aa		4.35	□□□□□ -1.71
EXO1-208	ENST00000518483	COMT	P21964	271 aa		4.35	□□□□□ -1.71
EXO1-208	ENST00000518483	S100A7	P31151	101 aa		4.35	□□□□□ -1.71
EXO1-208	ENST00000518483	TNFSF9	P41273	254 aa		4.35	□□□□□ -1.71
EXO1-208	ENST00000518483	ZP1	P60852	638 aa		4.35	□□□□□ -1.71
EXO1-208	ENST00000518483	CCNJ	Q5T5M9	372 aa		4.35	□□□□□ -1.71
EXO1-208	ENST00000518483	OR52E8	Q6IFG1	317 aa		4.35	□□□□□ -1.71
EXO1-208	ENST00000518483	TCEAL6	Q6IPX3	200 aa		4.35	□□□□□ -1.71
EXO1-208	ENST00000518483	XKRX	Q6PP77	449 aa		4.35	□□□□□ -1.71
EXO1-208	ENST00000518483		Q6ZT83	130 aa		4.35	□□□□□ -1.71
EXO1-208	ENST00000518483	TMEM161B	Q8NDZ6	487 aa		4.35	□□□□□ -1.71
EXO1-208	ENST00000518483	OR11L1	Q8NGX0	322 aa		4.35	□□□□□ -1.71
EXO1-208	ENST00000518483	OR4C3	Q8NH37	302 aa		4.35	□□□□□ -1.71

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