RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511669.1

CXCL3-204, Transcript of C-X-C motif chemokine ligand 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CXCL3, Length 1,641 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3-204ENST00000511669 ROBO4Q8WZ75 1007 aa14.55□□□□□ -0.08
CXCL3-204ENST00000511669 HAS2Q92819 552 aa14.55□□□□□ -0.08
CXCL3-204ENST00000511669 PGAM5Q96HS1 289 aa14.55□□□□□ -0.08
CXCL3-204ENST00000511669 TMEM138Q9NPI0 162 aa14.55□□□□□ -0.08
CXCL3-204ENST00000511669 CUL9Q8IWT3 2517 aa14.55□□□□□ -0.08
CXCL3-204ENST00000511669 A0A0A6YYH2 397 aa14.55□□□□□ -0.08
CXCL3-204ENST00000511669 A6NJ64 397 aa14.55□□□□□ -0.08
CXCL3-204ENST00000511669 XRCC3O43542 346 aa14.55□□□□□ -0.08
CXCL3-204ENST00000511669 FARS2O95363 451 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
CXCL3-204ENST00000511669 ARSBP15848 533 aa14.55□□□□□ -0.08
CXCL3-204ENST00000511669 GPR176Q14439 515 aa14.55□□□□□ -0.08
CXCL3-204ENST00000511669 SLC10A1Q14973 349 aa14.55□□□□□ -0.08
CXCL3-204ENST00000511669 ANKRD16Q6P6B7 361 aa14.55□□□□□ -0.08
CXCL3-204ENST00000511669 ABHD12BQ7Z5M8 362 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
CXCL3-204ENST00000511669 CDH24Q86UP0 819 aa14.55□□□□□ -0.08
CXCL3-204ENST00000511669 CDH26Q8IXH8 852 aa14.55□□□□□ -0.08
CXCL3-204ENST00000511669 UBE2J2Q8N2K1 259 aa14.55□□□□□ -0.08
CXCL3-204ENST00000511669 FAM109AQ8N4B1 249 aa14.55□□□□□ -0.08
CXCL3-204ENST00000511669 JAGN1Q8N5M9 183 aa14.55□□□□□ -0.08
CXCL3-204ENST00000511669 TMEM251Q8N6I4 163 aa14.55□□□□□ -0.08
CXCL3-204ENST00000511669 DTX3Q8N9I9 347 aa14.55□□□□□ -0.08
CXCL3-204ENST00000511669 PRSS33Q8NF86 280 aa14.55□□□□□ -0.08
CXCL3-204ENST00000511669 PTX4Q96A99 478 aa14.55□□□□□ -0.08
CXCL3-204ENST00000511669 NABP1Q96AH0 204 aa14.55□□□□□ -0.08
CXCL3-204ENST00000511669 FGGYQ96C11 551 aa14.55□□□□□ -0.08
CXCL3-204ENST00000511669 UQCC2Q9BRT2 126 aa14.55□□□□□ -0.08
CXCL3-204ENST00000511669 PRRG4Q9BZD6 226 aa14.55□□□□□ -0.08
CXCL3-204ENST00000511669 MMP28Q9H239 520 aa14.55□□□□□ -0.08
CXCL3-204ENST00000511669 PNRC2Q9NPJ4 139 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
CXCL3-204ENST00000511669 ASCL3Q9NQ33 180 aa14.55□□□□□ -0.08
CXCL3-204ENST00000511669 NLKQ9UBE8 527 aa14.55□□□□□ -0.08
CXCL3-204ENST00000511669 NCKAP5O14513 1909 aa14.55□□□□□ -0.08
CXCL3-204ENST00000511669 IGKV3D-15A0A087WSY6 115 aa14.54□□□□□ -0.08
CXCL3-204ENST00000511669 FAM166BA8MTA8 275 aa14.54□□□□□ -0.08
CXCL3-204ENST00000511669 H0YC42 278 aa14.54□□□□□ -0.08
CXCL3-204ENST00000511669 SCGNO76038 276 aa14.54□□□□□ -0.08
CXCL3-204ENST00000511669 GLSO94925 669 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
CXCL3-204ENST00000511669 DHFRP00374 187 aa14.54□□□□□ -0.08
CXCL3-204ENST00000511669 CD37P11049 281 aa14.54□□□□□ -0.08
CXCL3-204ENST00000511669 CDK2P24941 298 aa14.54□□□□□ -0.08
CXCL3-204ENST00000511669 SLC6A1P30531 599 aa14.54□□□□□ -0.08
CXCL3-204ENST00000511669 FAUP35544 74 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
CXCL3-204ENST00000511669 DDOSTP39656 456 aa14.54□□□□□ -0.08
CXCL3-204ENST00000511669 MAGEA5P43359 124 aa14.54□□□□□ -0.08
CXCL3-204ENST00000511669 EIF2B2P49770 351 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
CXCL3-204ENST00000511669 LHX2P50458 406 aa14.54□□□□□ -0.08
CXCL3-204ENST00000511669 TPTEP56180 551 aa14.54□□□□□ -0.08
CXCL3-204ENST00000511669 TAS2R20P59543 309 aa14.54□□□□□ -0.08
CXCL3-204ENST00000511669 BTG1P62324 171 aa14.54□□□□□ -0.08
CXCL3-204ENST00000511669 PPIAP62937 165 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
CXCL3-204ENST00000511669 HIST1H3AP68431 136 aa14.54□□□□□ -0.08
CXCL3-204ENST00000511669 DGCR2P98153 550 aa14.54□□□□□ -0.08
CXCL3-204ENST00000511669 ENDOGQ14249 297 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
CXCL3-204ENST00000511669 RAB35Q15286 201 aa14.54□□□□□ -0.08
CXCL3-204ENST00000511669 FAM189A2Q15884 450 aa14.54□□□□□ -0.08
CXCL3-204ENST00000511669 NRN1LQ496H8 165 aa14.54□□□□□ -0.08
CXCL3-204ENST00000511669 HIST2H3PS2Q5TEC6 136 aa14.54□□□□□ -0.08
CXCL3-204ENST00000511669 HIST2H3AQ71DI3 136 aa14.54□□□□□ -0.08
CXCL3-204ENST00000511669 SLC22A24Q8N4F4 322 aa14.54□□□□□ -0.08
CXCL3-204ENST00000511669 PLPP7Q8NBV4 271 aa14.54□□□□□ -0.08
CXCL3-204ENST00000511669 OR1M1Q8NGA1 313 aa14.54□□□□□ -0.08
CXCL3-204ENST00000511669 OR51D1Q8NGF3 324 aa14.54□□□□□ -0.08
CXCL3-204ENST00000511669 RNF122Q9H9V4 155 aa14.54□□□□□ -0.08
CXCL3-204ENST00000511669 ACKR4Q9NPB9 350 aa14.54□□□□□ -0.08
CXCL3-204ENST00000511669 PLEK2Q9NYT0 353 aa14.54□□□□□ -0.08
CXCL3-204ENST00000511669 TAS2R8Q9NYW2 309 aa14.54□□□□□ -0.08
CXCL3-204ENST00000511669 NOSIPQ9Y314 301 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
CXCL3-204ENST00000511669 CACNA1CQ13936 2221 aa14.54□□□□□ -0.08
CXCL3-204ENST00000511669 MRPL33O75394 65 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
CXCL3-204ENST00000511669 MTRF1O75570 445 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
CXCL3-204ENST00000511669 CCNKO75909 580 aa14.53□□□□□ -0.08
CXCL3-204ENST00000511669 ITGA5P08648 1049 aa14.53□□□□□ -0.08
CXCL3-204ENST00000511669 CD3GP09693 182 aa14.53□□□□□ -0.08
CXCL3-204ENST00000511669 ZNF708P17019 499 aa14.53□□□□□ -0.08
CXCL3-204ENST00000511669 GDNFP39905 211 aa14.53□□□□□ -0.08
CXCL3-204ENST00000511669 SLC6A9P48067 706 aa14.53□□□□□ -0.08
CXCL3-204ENST00000511669 GALK2Q01415 458 aa14.53□□□□□ -0.08
CXCL3-204ENST00000511669 RNPS1Q15287 305 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
CXCL3-204ENST00000511669 C2orf76Q3KRA6 126 aa14.53□□□□□ -0.08
CXCL3-204ENST00000511669 ZNF766Q5HY98 468 aa14.53□□□□□ -0.08
CXCL3-204ENST00000511669 PHYHD1Q5SRE7 291 aa14.53□□□□□ -0.08
CXCL3-204ENST00000511669 C1orf100Q5SVJ3 147 aa14.53□□□□□ -0.08
CXCL3-204ENST00000511669 GLYATL3Q5SZD4 288 aa14.53□□□□□ -0.08
CXCL3-204ENST00000511669 FAM166AQ6J272 317 aa14.53□□□□□ -0.08
CXCL3-204ENST00000511669 FAM57BQ71RH2 274 aa14.53□□□□□ -0.08
CXCL3-204ENST00000511669 ADGRE4PQ86SQ3 457 aa14.53□□□□□ -0.08
CXCL3-204ENST00000511669 MCEMP1Q8IX19 187 aa14.53□□□□□ -0.08
CXCL3-204ENST00000511669 LRRC18Q8N456 261 aa14.53□□□□□ -0.08
CXCL3-204ENST00000511669 ZFP62Q8NB50 900 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
CXCL3-204ENST00000511669 OR8B12Q8NGG6 310 aa14.53□□□□□ -0.08
CXCL3-204ENST00000511669 OR51E1Q8TCB6 317 aa14.53□□□□□ -0.08
CXCL3-204ENST00000511669 MARVELD1Q9BSK0 173 aa14.53□□□□□ -0.08
CXCL3-204ENST00000511669 LINC00470Q9BZP3 86 aa14.53□□□□□ -0.08
CXCL3-204ENST00000511669 LDAHQ9H6V9 325 aa14.53□□□□□ -0.08
CXCL3-204ENST00000511669 EXO5Q9H790 373 aa14.53□□□□□ -0.08
CXCL3-204ENST00000511669 CRLF2Q9HC73 371 aa14.53□□□□□ -0.08
CXCL3-204ENST00000511669 NEK6Q9HC98 313 aa14.53□□□□□ -0.08
CXCL3-204ENST00000511669 TMEM38BQ9NVV0 291 aa14.53□□□□□ -0.08
CXCL3-204ENST00000511669 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa14.53□□□□□ -0.08
CXCL3-204ENST00000511669 A0A0U1RQV5 110 aa14.52□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.1 ms