RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511276.1

FAM53C-208, Transcript of family with sequence similarity 53 member C, human

TSL 4

Gene FAM53C, Length 571 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM53C-208	ENST00000511276	SDHD	O14521	159 aa		10.82	□□□□□ -0.68
FAM53C-208	ENST00000511276	FAM20B	O75063	409 aa		10.82	□□□□□ -0.68
FAM53C-208	ENST00000511276	IL6	P05231	212 aa		10.82	□□□□□ -0.68
FAM53C-208	ENST00000511276	EEF1B2	P24534	225 aa	Known RBP	10.82	□□□□□ -0.68
FAM53C-208	ENST00000511276	HTR5A	P47898	357 aa		10.82	□□□□□ -0.68
FAM53C-208	ENST00000511276	IDH3A	P50213	366 aa		10.82	□□□□□ -0.68
FAM53C-208	ENST00000511276	GUCA2A	Q02747	115 aa		10.82	□□□□□ -0.68
FAM53C-208	ENST00000511276	MAB21L1	Q13394	359 aa		10.82	□□□□□ -0.68
FAM53C-208	ENST00000511276	KCNJ8	Q15842	424 aa		10.82	□□□□□ -0.68
FAM53C-208	ENST00000511276	LY6E	Q16553	131 aa		10.82	□□□□□ -0.68
FAM53C-208	ENST00000511276	KLHL22	Q53GT1	634 aa		10.82	□□□□□ -0.68
FAM53C-208	ENST00000511276	CLEC12A	Q5QGZ9	265 aa		10.82	□□□□□ -0.68
FAM53C-208	ENST00000511276	FBXW12	Q6X9E4	464 aa		10.82	□□□□□ -0.68
FAM53C-208	ENST00000511276	KRT73	Q86Y46	540 aa		10.82	□□□□□ -0.68
FAM53C-208	ENST00000511276	SLC30A8	Q8IWU4	369 aa		10.82	□□□□□ -0.68
FAM53C-208	ENST00000511276	C10orf111	Q8N326	155 aa		10.82	□□□□□ -0.68
FAM53C-208	ENST00000511276	CLDN22	Q8N7P3	220 aa		10.82	□□□□□ -0.68
FAM53C-208	ENST00000511276	PAPD5	Q8NDF8	572 aa	Known RBP	10.82	□□□□□ -0.68
FAM53C-208	ENST00000511276	BHLHE23	Q8NDY6	225 aa		10.82	□□□□□ -0.68
FAM53C-208	ENST00000511276	OR11L1	Q8NGX0	322 aa		10.82	□□□□□ -0.68
FAM53C-208	ENST00000511276		Q8TCH9	128 aa		10.82	□□□□□ -0.68
FAM53C-208	ENST00000511276	CCDC28B	Q9BUN5	200 aa		10.82	□□□□□ -0.68
FAM53C-208	ENST00000511276	TMEM120A	Q9BXJ8	343 aa		10.82	□□□□□ -0.68
FAM53C-208	ENST00000511276	RABEP2	Q9H5N1	569 aa		10.82	□□□□□ -0.68
FAM53C-208	ENST00000511276	SIRT7	Q9NRC8	400 aa		10.82	□□□□□ -0.68
FAM53C-208	ENST00000511276	INIP	Q9NRY2	104 aa		10.82	□□□□□ -0.68
FAM53C-208	ENST00000511276	GAR1	Q9NY12	217 aa	Known RBP	10.82	□□□□□ -0.68
FAM53C-208	ENST00000511276	PTTG3P	Q9NZH4	202 aa		10.82	□□□□□ -0.68
FAM53C-208	ENST00000511276	STX18	Q9P2W9	335 aa	Known RBP	10.82	□□□□□ -0.68
FAM53C-208	ENST00000511276	SLC13A4	Q9UKG4	626 aa		10.82	□□□□□ -0.68
FAM53C-208	ENST00000511276	ARL2BP	Q9Y2Y0	163 aa		10.82	□□□□□ -0.68
FAM53C-208	ENST00000511276	MAB21L2	Q9Y586	359 aa		10.82	□□□□□ -0.68
FAM53C-208	ENST00000511276		E9PQ18	207 aa		10.81	□□□□□ -0.68
FAM53C-208	ENST00000511276		M0R3H8	397 aa		10.81	□□□□□ -0.68
FAM53C-208	ENST00000511276	CLIC1	O00299	241 aa		10.81	□□□□□ -0.68
FAM53C-208	ENST00000511276	DOK2	O60496	412 aa		10.81	□□□□□ -0.68
FAM53C-208	ENST00000511276	LYPD3	O95274	346 aa		10.81	□□□□□ -0.68
FAM53C-208	ENST00000511276	ECD	O95905	644 aa	Predicted RBP	10.81	□□□□□ -0.68
FAM53C-208	ENST00000511276	THY1	P04216	161 aa		10.81	□□□□□ -0.68
FAM53C-208	ENST00000511276	HLA-DPB1	P04440	258 aa		10.81	□□□□□ -0.68
FAM53C-208	ENST00000511276	GUCA1A	P43080	201 aa	Predicted RBP	10.81	□□□□□ -0.68
FAM53C-208	ENST00000511276	DLX1	P56177	255 aa		10.81	□□□□□ -0.68
FAM53C-208	ENST00000511276	FADD	Q13158	208 aa		10.81	□□□□□ -0.68
FAM53C-208	ENST00000511276	REEP3	Q6NUK4	255 aa		10.81	□□□□□ -0.68
FAM53C-208	ENST00000511276	FOXL2NB	Q6ZUU3	175 aa		10.81	□□□□□ -0.68
FAM53C-208	ENST00000511276	SYT9	Q86SS6	491 aa		10.81	□□□□□ -0.68
FAM53C-208	ENST00000511276	PNKD	Q8N490	385 aa		10.81	□□□□□ -0.68
FAM53C-208	ENST00000511276	BOLL	Q8N9W6	283 aa	Known RBP	10.81	□□□□□ -0.68
FAM53C-208	ENST00000511276	CCDC197	Q8NCU1	140 aa		10.81	□□□□□ -0.68
FAM53C-208	ENST00000511276	SLC7A6	Q92536	515 aa		10.81	□□□□□ -0.68
FAM53C-208	ENST00000511276	ERGIC1	Q969X5	290 aa		10.81	□□□□□ -0.68
FAM53C-208	ENST00000511276	ITCH	Q96J02	903 aa		10.81	□□□□□ -0.68
FAM53C-208	ENST00000511276	RAD21L1	Q9H4I0	556 aa		10.81	□□□□□ -0.68
FAM53C-208	ENST00000511276	UFSP2	Q9NUQ7	469 aa		10.81	□□□□□ -0.68
FAM53C-208	ENST00000511276	ONECUT1	Q9UBC0	465 aa		10.81	□□□□□ -0.68
FAM53C-208	ENST00000511276	RPUSD1	Q9UJJ7	312 aa	Known RBP	10.81	□□□□□ -0.68
FAM53C-208	ENST00000511276	ANGPT4	Q9Y264	503 aa		10.81	□□□□□ -0.68
FAM53C-208	ENST00000511276		A0A1W2PPL8	197 aa		10.8	□□□□□ -0.68
FAM53C-208	ENST00000511276	MEIOC	A2RUB1	952 aa		10.8	□□□□□ -0.68
FAM53C-208	ENST00000511276	PRORSD1P	A6NEY8	169 aa		10.8	□□□□□ -0.68
FAM53C-208	ENST00000511276	CPSF4L	A6NMK7	179 aa	Known RBP	10.8	□□□□□ -0.68
FAM53C-208	ENST00000511276	C12orf71	A8MTZ7	269 aa		10.8	□□□□□ -0.68
FAM53C-208	ENST00000511276	IQCF6	A8MYZ5	107 aa		10.8	□□□□□ -0.68
FAM53C-208	ENST00000511276	LGALS8	O00214	317 aa		10.8	□□□□□ -0.68
FAM53C-208	ENST00000511276	DVL1	O14640	695 aa		10.8	□□□□□ -0.68
FAM53C-208	ENST00000511276	SCG5	P05408	212 aa		10.8	□□□□□ -0.68
FAM53C-208	ENST00000511276	NHLRC4	P0CG21	123 aa	Predicted RBP	10.8	□□□□□ -0.68
FAM53C-208	ENST00000511276	NR2C1	P13056	603 aa		10.8	□□□□□ -0.68
FAM53C-208	ENST00000511276	MSR1	P21757	451 aa		10.8	□□□□□ -0.68
FAM53C-208	ENST00000511276	FPR3	P25089	353 aa		10.8	□□□□□ -0.68
FAM53C-208	ENST00000511276	SAA4	P35542	130 aa		10.8	□□□□□ -0.68
FAM53C-208	ENST00000511276	RPL4	P36578	427 aa	Known RBP	10.8	□□□□□ -0.68
FAM53C-208	ENST00000511276	AQP2	P41181	271 aa		10.8	□□□□□ -0.68
FAM53C-208	ENST00000511276	CDK6	Q00534	326 aa		10.8	□□□□□ -0.68
FAM53C-208	ENST00000511276	KLRD1	Q13241	179 aa		10.8	□□□□□ -0.68
FAM53C-208	ENST00000511276	OR8B8	Q15620	311 aa		10.8	□□□□□ -0.68
FAM53C-208	ENST00000511276	MPPED2	Q15777	294 aa		10.8	□□□□□ -0.68
FAM53C-208	ENST00000511276	C11orf91	Q3C1V1	193 aa		10.8	□□□□□ -0.68
FAM53C-208	ENST00000511276	ENTPD8	Q5MY95	495 aa		10.8	□□□□□ -0.68
FAM53C-208	ENST00000511276	C6orf10	Q5SRN2	563 aa		10.8	□□□□□ -0.68
FAM53C-208	ENST00000511276	CASC10	Q5T4H9	136 aa		10.8	□□□□□ -0.68
FAM53C-208	ENST00000511276	PRAMEF6	Q5VXH4	476 aa		10.8	□□□□□ -0.68
FAM53C-208	ENST00000511276	METTL21C	Q5VZV1	264 aa		10.8	□□□□□ -0.68
FAM53C-208	ENST00000511276	CRIP3	Q6Q6R5	217 aa		10.8	□□□□□ -0.68
FAM53C-208	ENST00000511276	CELF2-AS1	Q8N7Q2	184 aa		10.8	□□□□□ -0.68
FAM53C-208	ENST00000511276	SSX3	Q99909	188 aa		10.8	□□□□□ -0.68
FAM53C-208	ENST00000511276	EBF4	Q9BQW3	602 aa		10.8	□□□□□ -0.68
FAM53C-208	ENST00000511276	RMND5A	Q9H871	391 aa		10.8	□□□□□ -0.68
FAM53C-208	ENST00000511276	MEPE	Q9NQ76	525 aa	Predicted RBP	10.8	□□□□□ -0.68
FAM53C-208	ENST00000511276	SERTAD4	Q9NUC0	356 aa		10.8	□□□□□ -0.68
FAM53C-208	ENST00000511276	TMEM100	Q9NV29	134 aa		10.8	□□□□□ -0.68
FAM53C-208	ENST00000511276	MRGBP	Q9NV56	204 aa		10.8	□□□□□ -0.68
FAM53C-208	ENST00000511276	ZKSCAN7	Q9P0L1	754 aa	Predicted RBP	10.8	□□□□□ -0.68
FAM53C-208	ENST00000511276	DNAJB11	Q9UBS4	358 aa		10.8	□□□□□ -0.68
FAM53C-208	ENST00000511276	SLC7A7	Q9UM01	511 aa		10.8	□□□□□ -0.68
FAM53C-208	ENST00000511276	SACS	Q9NZJ4	4579 aa		10.8	□□□□□ -0.68
FAM53C-208	ENST00000511276		A0A1B0GWJ7	208 aa		10.79	□□□□□ -0.68
FAM53C-208	ENST00000511276	MEGF11	A6BM72	1044 aa		10.79	□□□□□ -0.68
FAM53C-208	ENST00000511276	SGCE	O43556	437 aa		10.79	□□□□□ -0.68
FAM53C-208	ENST00000511276	NDUFA2	O43678	99 aa		10.79	□□□□□ -0.68

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