RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496549.5

CRNKL1-205, Transcript of crooked neck pre-mRNA splicing factor 1, human

TSL 1 (best)

Gene CRNKL1, Length 4,093 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CRNKL1-205	ENST00000496549	SIRT4	Q9Y6E7	314 aa	Predicted RBP	7.43	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549		A0A087WUJ7	227 aa		7.43	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	TLCD2	A6NGC4	264 aa		7.43	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	TMEM238	C9JI98	176 aa		7.43	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	CYR61	O00622	381 aa		7.43	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	FRS3	O43559	492 aa		7.43	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	WDR1	O75083	606 aa		7.43	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	ACRV1	P26436	265 aa		7.43	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	CD1C	P29017	333 aa		7.43	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	ARRB1	P49407	418 aa	Predicted RBP	7.43	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	DOC2B	Q14184	412 aa		7.43	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	C1orf194	Q5T5A4	169 aa		7.43	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	PET117	Q6UWS5	81 aa		7.43	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	TSEN54	Q7Z6J9	526 aa	Known RBP	7.43	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	LRP11	Q86VZ4	500 aa		7.43	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	ZNF101	Q8IZC7	436 aa		7.43	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	OR5H2	Q8NGV7	314 aa		7.43	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	SEH1L	Q96EE3	360 aa		7.43	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	DNAJA3	Q96EY1	480 aa		7.43	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	RAB18	Q9NP72	206 aa		7.43	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	ZNF701	Q9NV72	531 aa	Predicted RBP	7.43	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	LHX6	Q9UPM6	363 aa		7.43	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	DHDH	Q9UQ10	334 aa		7.43	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	COLEC10	Q9Y6Z7	277 aa		7.43	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549		A0A087WWC5	75 aa		7.42	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549		A0A0G2JK05	382 aa		7.42	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	LOC107983988	A0A1B0GUW6	1196 aa	Predicted RBP	7.42	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	FAM166B	A8MTA8	275 aa		7.42	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	SNAI1	O95863	264 aa	Predicted RBP	7.42	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	WNT11	O96014	354 aa		7.42	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	CSTB	P04080	98 aa	Known RBP	7.42	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	FGF5	P12034	268 aa		7.42	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	GRPR	P30550	384 aa		7.42	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	OPRD1	P41143	372 aa		7.42	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	FHIT	P49789	147 aa		7.42	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	CRMP1	Q14194	572 aa		7.42	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	DEFB115	Q30KQ5	88 aa		7.42	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	RTL6	Q6ICC9	239 aa		7.42	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	ZNF343	Q6P1L6	599 aa		7.42	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	NPAS4	Q8IUM7	802 aa		7.42	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	CFAP52	Q8N1V2	620 aa		7.42	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	OR2G3	Q8NGZ4	309 aa		7.42	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	OR4K13	Q8NH42	304 aa		7.42	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549		Q8WTZ3	238 aa		7.42	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	REEP6	Q96HR9	211 aa		7.42	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	ANGPTL4	Q9BY76	406 aa		7.42	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	LANCL2	Q9NS86	450 aa		7.42	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	FBXL17	Q9UF56	701 aa		7.42	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	AK3	Q9UIJ7	227 aa		7.42	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	ZNF346	Q9UL40	294 aa	Known RBP	7.42	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	CCDC88C	Q9P219	2028 aa		7.42	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	TMEM272	A0A1B0GTI8	110 aa		7.42	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549		H0YIV9	168 aa		7.42	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	CDC14B	O60729	498 aa		7.42	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	F13B	P05160	661 aa		7.42	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	SERPINA4	P29622	427 aa		7.42	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	GPR3	P46089	330 aa		7.42	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	FAM3A	P98173	230 aa		7.42	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	GPR157	Q5UAW9	335 aa		7.42	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	NTNG2	Q96CW9	530 aa		7.42	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	MUCL1	Q96DR8	90 aa		7.42	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	SDSL	Q96GA7	329 aa		7.42	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	PGAM5	Q96HS1	289 aa		7.42	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	DIRC2	Q96SL1	478 aa		7.42	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	CXorf36	Q9H7Y0	433 aa		7.42	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	FBRS	Q9HAH7	460 aa		7.42	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	RYDEN	Q9NUL5	291 aa	Known RBP	7.42	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	RAB22A	Q9UL26	194 aa		7.42	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	SLC7A7	Q9UM01	511 aa		7.42	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	GOLGA4	Q13439	2230 aa	Known RBP	7.42	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	EFS	O43281	561 aa		7.42	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	KCNAB3	O43448	404 aa		7.42	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	GPR137B	O60478	399 aa		7.42	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	KNG1	P01042	644 aa		7.42	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	IFNA5	P01569	189 aa		7.42	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	GSTP1	P09211	210 aa	Known RBP	7.42	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	AMY2B	P19961	511 aa		7.42	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	TACR2	P21452	398 aa		7.42	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	TEAD1	P28347	426 aa		7.42	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	PPIC	P45877	212 aa		7.42	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	HSF1	Q00613	529 aa		7.42	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	RAB32	Q13637	225 aa		7.42	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	TMEM128	Q5BJH2	165 aa		7.42	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	OR8G2P	Q6IF36	304 aa		7.42	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	SLC25A42	Q86VD7	318 aa		7.42	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	BAGE3	Q86Y29	109 aa		7.42	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	BAGE2	Q86Y30	109 aa		7.42	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	TCTEX1D1	Q8N7M0	179 aa		7.42	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	SCAMP5	Q8TAC9	235 aa		7.42	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	CMC2	Q9NRP2	79 aa		7.42	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	IL36A	Q9UHA7	158 aa		7.42	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	GPR34	Q9UPC5	381 aa		7.42	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	HDGFL3	Q9Y3E1	203 aa		7.42	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	DOK2	O60496	412 aa		7.42	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	MT-CO2	P00403	227 aa		7.42	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	C1QC	P02747	245 aa		7.42	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	GAPDH	P04406	335 aa	Known RBP	7.42	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	FCGR3A	P08637	254 aa		7.42	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	SEC11B	P0C7V7	166 aa		7.42	□□□□□ -1.22
CRNKL1-205	ENST00000496549	IRF2	P14316	349 aa		7.42	□□□□□ -1.22

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.8 ms