RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492996.6

HERC4-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC4, Length 3,385 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC4-211ENST00000492996 ANXA2P07355 339 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 TMIGD3P0DMS9 266 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 S100PP25815 95 aa6.26□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 BTCP35070 178 aa6.26□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 EIF1P41567 113 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 POU3F4P49335 361 aa6.26□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 PLA2G7Q13093 441 aa6.26□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 FAAP20Q6NZ36 180 aa6.26□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 TFAP2EQ6VUC0 442 aa6.26□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 LINC00346Q8IVM7 164 aa6.26□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 PRSS35Q8N3Z0 413 aa6.26□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 OR5T2Q8NGG2 359 aa6.26□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 SYNPRQ8TBG9 265 aa6.26□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 MBD6Q96DN6 1003 aa6.26□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 ZC3HAV1LQ96H79 300 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 BOD1Q96IK1 185 aa6.26□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 SSX3Q99909 188 aa6.26□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 ZNF251Q9BRH9 671 aa6.26□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 KLK11Q9UBX7 282 aa6.26□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 KCNMB2Q9Y691 235 aa6.26□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 A0A1W2PQD3 144 aa6.25□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 M0R233 179 aa6.25□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 AIPO00170 330 aa6.25□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 PDCD5O14737 125 aa6.25□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 TXNL1O43396 289 aa6.25□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 OR2J2O76002 312 aa6.25□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 TOXO94900 526 aa6.25□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 PNPP00491 289 aa6.25□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 EDN3P14138 238 aa6.25□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 IFNGR1P15260 489 aa6.25□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 GDNFP39905 211 aa6.25□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 EIF1AXP47813 144 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 DCDP81605 110 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 POU3F1Q03052 451 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 SNTB2Q13425 540 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 LPAL2Q16609 132 aa6.25□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 PLA1AQ53H76 456 aa6.25□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 EMC4Q5J8M3 183 aa6.25□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 WDR38Q5JTN6 314 aa6.25□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 C6orf15Q6UXA7 325 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 OR52I2Q8NH67 350 aa6.25□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 OTOSQ8NHW6 89 aa6.25□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 SLC25A38Q96DW6 304 aa6.25□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 LURAP1Q96LR2 239 aa6.25□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 COMMD4Q9H0A8 199 aa6.25□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 SLITRK2Q9H156 845 aa6.25□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 MRPL22Q9NWU5 206 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 OR5V1Q9UGF6 321 aa6.25□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 RCE1Q9Y256 329 aa6.25□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 FAM74A7A6NL05 159 aa6.25□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 PLPP3O14495 311 aa6.25□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 SIGLEC5O15389 551 aa6.25□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 NPIPB7O75200 414 aa6.25□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 HPP00738 406 aa6.25□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 TCRBP04435 133 aa6.25□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 KIR3DL2P43630 455 aa6.25□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 RPP30P78346 268 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 FOXF1Q12946 379 aa6.25□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 EIF2B1Q14232 305 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 FCN2Q15485 313 aa6.25□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 FAM74A3Q4VXF1 159 aa6.25□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 CCDC157Q569K6 752 aa6.25□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 HAGHLQ6PII5 290 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 ATRAIDQ6UW56 229 aa6.25□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 DHRS13Q6UX07 377 aa6.25□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 LIX1LQ8IVB5 337 aa6.25□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 GLB1L2Q8IW92 636 aa6.25□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 WDFY1Q8IWB7 410 aa6.25□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 OR10G3Q8NGC4 313 aa6.25□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 TMEM68Q96MH6 324 aa6.25□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 SEMA4CQ9C0C4 833 aa6.25□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 DPAGT1Q9H3H5 408 aa6.25□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 TXNIPQ9H3M7 391 aa6.25□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 CENPMQ9NSP4 180 aa6.25□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 MYEF2Q9P2K5 600 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 FBXL2Q9UKC9 423 aa6.25□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 CAMK2AQ9UQM7 478 aa6.25□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 EML6Q6ZMW3 1958 aa6.25□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 MASP2O00187 686 aa6.24□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP6.24□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 MT-ATP6P00846 226 aa6.24□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 TPOP07202 933 aa6.24□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 CELA2AP08217 269 aa6.24□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 LIFP15018 202 aa6.24□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 DPP4P27487 766 aa6.24□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 KCNJ3P48549 501 aa6.24□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 TDGF1P3P51864 188 aa6.24□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 RRADP55042 308 aa6.24□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 DLX5P56178 289 aa6.24□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 SLC26A5P58743 744 aa6.24□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 PITPNAQ00169 270 aa6.24□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 UBE2NLQ5JXB2 153 aa6.24□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 PRAMEF20Q5VT98 475 aa6.24□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 DPPA2Q7Z7J5 298 aa6.24□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 PPP1R3BQ86XI6 285 aa6.24□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 STPG2Q8N412 459 aa6.24□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 NFAM1Q8NET5 270 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
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