RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481114.1

SDCCAG3-210, Transcript of Serologically defined colon cancer antigen 3, humanhuman

TSL 2

Gene SDCCAG3, Length 340 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDCCAG3-210ENST00000481114 GRHPRQ9UBQ7 328 aa11.12□□□□□ -0.63
SDCCAG3-210ENST00000481114 PIN1P1O15428 100 aa11.11□□□□□ -0.63
SDCCAG3-210ENST00000481114 FAM20BO75063 409 aa11.11□□□□□ -0.63
SDCCAG3-210ENST00000481114 RPL4P36578 427 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
SDCCAG3-210ENST00000481114 GATA4P43694 442 aa11.11□□□□□ -0.63
SDCCAG3-210ENST00000481114 GZMMP51124 257 aa11.11□□□□□ -0.63
SDCCAG3-210ENST00000481114 KCNJ8Q15842 424 aa11.11□□□□□ -0.63
SDCCAG3-210ENST00000481114 BEAN1Q3B7T3 259 aa11.11□□□□□ -0.63
SDCCAG3-210ENST00000481114 DHRS7BQ6IAN0 325 aaPredicted RBP11.11□□□□□ -0.63
SDCCAG3-210ENST00000481114 OAFQ86UD1 273 aa11.11□□□□□ -0.63
SDCCAG3-210ENST00000481114 LDLRAD3Q86YD5 345 aa11.11□□□□□ -0.63
SDCCAG3-210ENST00000481114 Q8TCH9 128 aa11.11□□□□□ -0.63
SDCCAG3-210ENST00000481114 LRRC8CQ8TDW0 803 aa11.11□□□□□ -0.63
SDCCAG3-210ENST00000481114 LRTOMTQ8WZ04 291 aa11.11□□□□□ -0.63
SDCCAG3-210ENST00000481114 ERGIC1Q969X5 290 aa11.11□□□□□ -0.63
SDCCAG3-210ENST00000481114 HCAR1Q9BXC0 346 aa11.11□□□□□ -0.63
SDCCAG3-210ENST00000481114 RERGLQ9H628 205 aa11.11□□□□□ -0.63
SDCCAG3-210ENST00000481114 C16orf95Q9H693 158 aa11.11□□□□□ -0.63
SDCCAG3-210ENST00000481114 WDR76Q9H967 626 aa11.11□□□□□ -0.63
SDCCAG3-210ENST00000481114 UFSP2Q9NUQ7 469 aa11.11□□□□□ -0.63
SDCCAG3-210ENST00000481114 CTSZQ9UBR2 303 aa11.11□□□□□ -0.63
SDCCAG3-210ENST00000481114 FAM96BQ9Y3D0 163 aa11.11□□□□□ -0.63
SDCCAG3-210ENST00000481114 TEX13CA0A0J9YWL9 993 aa11.1□□□□□ -0.63
SDCCAG3-210ENST00000481114 ELOVL7A1L3X0 281 aa11.1□□□□□ -0.63
SDCCAG3-210ENST00000481114 EFCAB9A8MZ26 197 aa11.1□□□□□ -0.63
SDCCAG3-210ENST00000481114 RER1O15258 196 aa11.1□□□□□ -0.63
SDCCAG3-210ENST00000481114 IFNA14P01570 189 aa11.1□□□□□ -0.63
SDCCAG3-210ENST00000481114 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP11.1□□□□□ -0.63
SDCCAG3-210ENST00000481114 CTLA4P16410 223 aa11.1□□□□□ -0.63
SDCCAG3-210ENST00000481114 IFNA8P32881 189 aa11.1□□□□□ -0.63
SDCCAG3-210ENST00000481114 LSM6P62312 80 aaKnown RBP11.1□□□□□ -0.63
SDCCAG3-210ENST00000481114 ARF6P62330 175 aa11.1□□□□□ -0.63
SDCCAG3-210ENST00000481114 MAB21L1Q13394 359 aa11.1□□□□□ -0.63
SDCCAG3-210ENST00000481114 FAM189A2Q15884 450 aa11.1□□□□□ -0.63
SDCCAG3-210ENST00000481114 ANKDD1AQ495B1 522 aa11.1□□□□□ -0.63
SDCCAG3-210ENST00000481114 PRAMEF6Q5VXH4 476 aa11.1□□□□□ -0.63
SDCCAG3-210ENST00000481114 SFRP4Q6FHJ7 346 aaPredicted RBP11.1□□□□□ -0.63
SDCCAG3-210ENST00000481114 NRMQ8IXM6 262 aa11.1□□□□□ -0.63
SDCCAG3-210ENST00000481114 PDZD9Q8IXQ8 264 aa11.1□□□□□ -0.63
SDCCAG3-210ENST00000481114 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa11.1□□□□□ -0.63
SDCCAG3-210ENST00000481114 BOLLQ8N9W6 283 aaKnown RBP11.1□□□□□ -0.63
SDCCAG3-210ENST00000481114 OR13C2Q8NGS9 318 aa11.1□□□□□ -0.63
SDCCAG3-210ENST00000481114 Q96M85 177 aa11.1□□□□□ -0.63
SDCCAG3-210ENST00000481114 SIRPDQ9H106 197 aa11.1□□□□□ -0.63
SDCCAG3-210ENST00000481114 ATPIF1Q9UII2 106 aa11.1□□□□□ -0.63
SDCCAG3-210ENST00000481114 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP11.1□□□□□ -0.63
SDCCAG3-210ENST00000481114 POLR1DQ9Y2S0 133 aa11.1□□□□□ -0.63
SDCCAG3-210ENST00000481114 ADAM18Q9Y3Q7 739 aa11.1□□□□□ -0.63
SDCCAG3-210ENST00000481114 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa11.09□□□□□ -0.63
SDCCAG3-210ENST00000481114 PRSS37A4D1T9 235 aa11.09□□□□□ -0.63
SDCCAG3-210ENST00000481114 BTBD17A6NE02 478 aa11.09□□□□□ -0.63
SDCCAG3-210ENST00000481114 ADAM20O43506 726 aa11.09□□□□□ -0.63
SDCCAG3-210ENST00000481114 AHCYL1O43865 530 aa11.09□□□□□ -0.63
SDCCAG3-210ENST00000481114 SLC16A7O60669 478 aa11.09□□□□□ -0.63
SDCCAG3-210ENST00000481114 KHDRBS3O75525 346 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
SDCCAG3-210ENST00000481114 CD200P41217 278 aa11.09□□□□□ -0.63
SDCCAG3-210ENST00000481114 PRSS12P56730 875 aa11.09□□□□□ -0.63
SDCCAG3-210ENST00000481114 EGR3Q06889 387 aa11.09□□□□□ -0.63
SDCCAG3-210ENST00000481114 FHL1Q13642 323 aa11.09□□□□□ -0.63
SDCCAG3-210ENST00000481114 OR8B8Q15620 311 aa11.09□□□□□ -0.63
SDCCAG3-210ENST00000481114 MPPED2Q15777 294 aa11.09□□□□□ -0.63
SDCCAG3-210ENST00000481114 MESTQ5EB52 335 aa11.09□□□□□ -0.63
SDCCAG3-210ENST00000481114 CLEC12AQ5QGZ9 265 aa11.09□□□□□ -0.63
SDCCAG3-210ENST00000481114 Q6ZPA2 131 aa11.09□□□□□ -0.63
SDCCAG3-210ENST00000481114 GLB1L2Q8IW92 636 aa11.09□□□□□ -0.63
SDCCAG3-210ENST00000481114 PRRC1Q96M27 445 aa11.09□□□□□ -0.63
SDCCAG3-210ENST00000481114 ZNF570Q96NI8 536 aa11.09□□□□□ -0.63
SDCCAG3-210ENST00000481114 ECSITQ9BQ95 431 aa11.09□□□□□ -0.63
SDCCAG3-210ENST00000481114 RASSF4Q9H2L5 321 aa11.09□□□□□ -0.63
SDCCAG3-210ENST00000481114 RNF7Q9UBF6 113 aa11.09□□□□□ -0.63
SDCCAG3-210ENST00000481114 A4GNTQ9UNA3 340 aa11.09□□□□□ -0.63
SDCCAG3-210ENST00000481114 LGALS8O00214 317 aa11.08□□□□□ -0.64
SDCCAG3-210ENST00000481114 TSPAN9O75954 239 aa11.08□□□□□ -0.64
SDCCAG3-210ENST00000481114 CD14P08571 375 aa11.08□□□□□ -0.64
SDCCAG3-210ENST00000481114 SLC9A3P48764 834 aa11.08□□□□□ -0.64
SDCCAG3-210ENST00000481114 RAD23AP54725 363 aa11.08□□□□□ -0.64
SDCCAG3-210ENST00000481114 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP11.08□□□□□ -0.64
SDCCAG3-210ENST00000481114 PRKCDQ05655 676 aa11.08□□□□□ -0.64
SDCCAG3-210ENST00000481114 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP11.08□□□□□ -0.64
SDCCAG3-210ENST00000481114 REC114Q7Z4M0 266 aa11.08□□□□□ -0.64
SDCCAG3-210ENST00000481114 GJC3Q8NFK1 279 aa11.08□□□□□ -0.64
SDCCAG3-210ENST00000481114 TPD52L3Q96J77 140 aa11.08□□□□□ -0.64
SDCCAG3-210ENST00000481114 ZNF583Q96ND8 569 aa11.08□□□□□ -0.64
SDCCAG3-210ENST00000481114 COQ7Q99807 217 aa11.08□□□□□ -0.64
SDCCAG3-210ENST00000481114 FNDC11Q9BVV2 318 aa11.08□□□□□ -0.64
SDCCAG3-210ENST00000481114 NDEL1Q9GZM8 345 aa11.08□□□□□ -0.64
SDCCAG3-210ENST00000481114 SYT4Q9H2B2 425 aa11.08□□□□□ -0.64
SDCCAG3-210ENST00000481114 FN3KRPQ9HA64 309 aa11.08□□□□□ -0.64
SDCCAG3-210ENST00000481114 SMURF1Q9HCE7 757 aa11.08□□□□□ -0.64
SDCCAG3-210ENST00000481114 CAB39Q9Y376 341 aaPredicted RBP11.08□□□□□ -0.64
SDCCAG3-210ENST00000481114 TRAV38-1A0A0B4J264 116 aa11.07□□□□□ -0.64
SDCCAG3-210ENST00000481114 A0A1B0GWJ7 208 aa11.07□□□□□ -0.64
SDCCAG3-210ENST00000481114 NDUFA2O43678 99 aa11.07□□□□□ -0.64
SDCCAG3-210ENST00000481114 OPN1MWP04001 364 aa11.07□□□□□ -0.64
SDCCAG3-210ENST00000481114 OPN1MW2P0DN77 364 aa11.07□□□□□ -0.64
SDCCAG3-210ENST00000481114 OPN1MW3P0DN78 364 aa11.07□□□□□ -0.64
SDCCAG3-210ENST00000481114 FUT4P22083 530 aa11.07□□□□□ -0.64
SDCCAG3-210ENST00000481114 TGFBR2P37173 567 aa11.07□□□□□ -0.64
SDCCAG3-210ENST00000481114 YAP1P46937 504 aaKnown RBP11.07□□□□□ -0.64
SDCCAG3-210ENST00000481114 CENPAP49450 140 aa11.07□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.7 ms