RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480301.1

ACTB-211, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ACTB, Length 657 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-211ENST00000480301 TVP23BQ9NYZ1 205 aa17.85■□□□□ 0.45
ACTB-211ENST00000480301 PURGQ9UJV8 347 aaKnown RBP17.85■□□□□ 0.45
ACTB-211ENST00000480301 ZANQ9Y493 2812 aa17.85■□□□□ 0.45
ACTB-211ENST00000480301 ZSCAN5BA6NJL1 495 aa17.84■□□□□ 0.45
ACTB-211ENST00000480301 H3BNX3 289 aa17.84■□□□□ 0.45
ACTB-211ENST00000480301 IGHV1-46P01743 117 aa17.84■□□□□ 0.45
ACTB-211ENST00000480301 MT-ND5P03915 603 aa17.84■□□□□ 0.45
ACTB-211ENST00000480301 GSTT1P30711 240 aa17.84■□□□□ 0.45
ACTB-211ENST00000480301 LIPAP38571 399 aa17.84■□□□□ 0.45
ACTB-211ENST00000480301 GGTLC2Q14390 218 aa17.84■□□□□ 0.45
ACTB-211ENST00000480301 BBS1Q8NFJ9 593 aa17.84■□□□□ 0.45
ACTB-211ENST00000480301 ST7LQ8TDW4 575 aa17.84■□□□□ 0.45
ACTB-211ENST00000480301 TEX12Q9BXU0 123 aa17.84■□□□□ 0.45
ACTB-211ENST00000480301 CYSLTR2Q9NS75 346 aa17.84■□□□□ 0.45
ACTB-211ENST00000480301 PTTG3PQ9NZH4 202 aa17.84■□□□□ 0.45
ACTB-211ENST00000480301 TMEFF2Q9UIK5 374 aaPredicted RBP17.84■□□□□ 0.45
ACTB-211ENST00000480301 OAZ3Q9UMX2 235 aa17.84■□□□□ 0.45
ACTB-211ENST00000480301 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa17.83■□□□□ 0.44
ACTB-211ENST00000480301 PLSCR5A0PG75 271 aa17.83■□□□□ 0.44
ACTB-211ENST00000480301 SPRY3O43610 288 aa17.83■□□□□ 0.44
ACTB-211ENST00000480301 TIMM8AO60220 97 aaPredicted RBP17.83■□□□□ 0.44
ACTB-211ENST00000480301 ADH4P08319 380 aa17.83■□□□□ 0.44
ACTB-211ENST00000480301 RAC2P15153 192 aa17.83■□□□□ 0.44
ACTB-211ENST00000480301 EPHA2P29317 976 aa17.83■□□□□ 0.44
ACTB-211ENST00000480301 OTX1P32242 354 aaPredicted RBP17.83■□□□□ 0.44
ACTB-211ENST00000480301 TPTEP56180 551 aa17.83■□□□□ 0.44
ACTB-211ENST00000480301 MRPS11P82912 194 aaKnown RBP17.83■□□□□ 0.44
ACTB-211ENST00000480301 HLXQ14774 488 aaPredicted RBP17.83■□□□□ 0.44
ACTB-211ENST00000480301 SNAPC1Q16533 368 aa17.83■□□□□ 0.44
ACTB-211ENST00000480301 TSTQ16762 297 aaKnown RBP17.83■□□□□ 0.44
ACTB-211ENST00000480301 TMEM249Q2WGJ8 235 aa17.83■□□□□ 0.44
ACTB-211ENST00000480301 FBXW12Q6X9E4 464 aa17.83■□□□□ 0.44
ACTB-211ENST00000480301 DPY19L4Q7Z388 723 aa17.83■□□□□ 0.44
ACTB-211ENST00000480301 ERI1Q8IV48 349 aaKnown RBP17.83■□□□□ 0.44
ACTB-211ENST00000480301 TIGD4Q8IY51 512 aa17.83■□□□□ 0.44
ACTB-211ENST00000480301 OR5L1Q8NGL2 311 aa17.83■□□□□ 0.44
ACTB-211ENST00000480301 SLAMF6Q96DU3 332 aa17.83■□□□□ 0.44
ACTB-211ENST00000480301 ZMYND19Q96E35 227 aaPredicted RBP17.83■□□□□ 0.44
ACTB-211ENST00000480301 PLEKHA8Q96JA3 519 aa17.83■□□□□ 0.44
ACTB-211ENST00000480301 INTS14Q96SY0 518 aa17.83■□□□□ 0.44
ACTB-211ENST00000480301 PKP2Q99959 881 aa17.83■□□□□ 0.44
ACTB-211ENST00000480301 CHODLQ9H9P2 273 aa17.83■□□□□ 0.44
ACTB-211ENST00000480301 MSL2Q9HCI7 577 aa17.83■□□□□ 0.44
ACTB-211ENST00000480301 CGGBP1Q9UFW8 167 aaPredicted RBP17.83■□□□□ 0.44
ACTB-211ENST00000480301 C2CD3Q4AC94 2353 aa17.83■□□□□ 0.44
ACTB-211ENST00000480301 HIVEP2P31629 2446 aa17.82■□□□□ 0.44
ACTB-211ENST00000480301 FN1P02751 2386 aaKnown RBP17.82■□□□□ 0.44
ACTB-211ENST00000480301 M0R135 149 aa17.82■□□□□ 0.44
ACTB-211ENST00000480301 PRODHO43272 600 aa17.82■□□□□ 0.44
ACTB-211ENST00000480301 RP2O75695 350 aa17.82■□□□□ 0.44
ACTB-211ENST00000480301 ACHEP22303 614 aa17.82■□□□□ 0.44
ACTB-211ENST00000480301 SLC2A5P22732 501 aa17.82■□□□□ 0.44
ACTB-211ENST00000480301 RIPPLY3P57055 190 aa17.82■□□□□ 0.44
ACTB-211ENST00000480301 KLHL12Q53G59 568 aa17.82■□□□□ 0.44
ACTB-211ENST00000480301 FAM209AQ5JX71 171 aa17.82■□□□□ 0.44
ACTB-211ENST00000480301 Q6ZR03 302 aa17.82■□□□□ 0.44
ACTB-211ENST00000480301 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP17.82■□□□□ 0.44
ACTB-211ENST00000480301 OR6N2Q8NGY6 317 aa17.82■□□□□ 0.44
ACTB-211ENST00000480301 SPTSSAQ969W0 71 aa17.82■□□□□ 0.44
ACTB-211ENST00000480301 ZNF799Q96GE5 643 aa17.82■□□□□ 0.44
ACTB-211ENST00000480301 ZNF275Q9NSD4 429 aaPredicted RBP17.82■□□□□ 0.44
ACTB-211ENST00000480301 SAC3D1A6NKF1 404 aa17.81■□□□□ 0.44
ACTB-211ENST00000480301 ZAR1LA6NP61 321 aa17.81■□□□□ 0.44
ACTB-211ENST00000480301 CD5LO43866 347 aa17.81■□□□□ 0.44
ACTB-211ENST00000480301 LCATP04180 440 aa17.81■□□□□ 0.44
ACTB-211ENST00000480301 ANOS1P23352 680 aa17.81■□□□□ 0.44
ACTB-211ENST00000480301 CRYBB2P43320 205 aa17.81■□□□□ 0.44
ACTB-211ENST00000480301 PPP2R2BQ00005 443 aa17.81■□□□□ 0.44
ACTB-211ENST00000480301 CDK5R2Q13319 367 aa17.81■□□□□ 0.44
ACTB-211ENST00000480301 EIF2B1Q14232 305 aaKnown RBP17.81■□□□□ 0.44
ACTB-211ENST00000480301 SLC35D3Q5M8T2 416 aa17.81■□□□□ 0.44
ACTB-211ENST00000480301 SLX4IPQ5VYV7 408 aa17.81■□□□□ 0.44
ACTB-211ENST00000480301 ZFP1Q6P2D0 407 aa17.81■□□□□ 0.44
ACTB-211ENST00000480301 CIB1Q99828 191 aa17.81■□□□□ 0.44
ACTB-211ENST00000480301 COPS4Q9BT78 406 aa17.81■□□□□ 0.44
ACTB-211ENST00000480301 ABHD6Q9BV23 337 aa17.81■□□□□ 0.44
ACTB-211ENST00000480301 CENPMQ9NSP4 180 aa17.81■□□□□ 0.44
ACTB-211ENST00000480301 DECR2Q9NUI1 292 aa17.81■□□□□ 0.44
ACTB-211ENST00000480301 PRKYO43930 277 aa17.8■□□□□ 0.44
ACTB-211ENST00000480301 SELENOFO60613 162 aa17.8■□□□□ 0.44
ACTB-211ENST00000480301 CDC14BO60729 498 aa17.8■□□□□ 0.44
ACTB-211ENST00000480301 LILRA1O75019 489 aa17.8■□□□□ 0.44
ACTB-211ENST00000480301 CD55P08174 381 aa17.8■□□□□ 0.44
ACTB-211ENST00000480301 TACSTD2P09758 323 aa17.8■□□□□ 0.44
ACTB-211ENST00000480301 IGFBP5P24593 272 aa17.8■□□□□ 0.44
ACTB-211ENST00000480301 TMEM33P57088 247 aa17.8■□□□□ 0.44
ACTB-211ENST00000480301 EFNB1P98172 346 aa17.8■□□□□ 0.44
ACTB-211ENST00000480301 TRIP10Q15642 601 aa17.8■□□□□ 0.44
ACTB-211ENST00000480301 SPRNQ5BIV9 151 aa17.8■□□□□ 0.44
ACTB-211ENST00000480301 OR2T2Q6IF00 324 aa17.8■□□□□ 0.44
ACTB-211ENST00000480301 SPATC1Q76KD6 591 aa17.8■□□□□ 0.44
ACTB-211ENST00000480301 SHFQ7M4L6 423 aa17.8■□□□□ 0.44
ACTB-211ENST00000480301 DIRC2Q96SL1 478 aa17.8■□□□□ 0.44
ACTB-211ENST00000480301 AMELYQ99218 206 aa17.8■□□□□ 0.44
ACTB-211ENST00000480301 KCNJ15Q99712 375 aa17.8■□□□□ 0.44
ACTB-211ENST00000480301 OSBPL10Q9BXB5 764 aa17.8■□□□□ 0.44
ACTB-211ENST00000480301 SAP30LQ9HAJ7 183 aa17.8■□□□□ 0.44
ACTB-211ENST00000480301 ZDHHC8Q9ULC8 765 aa17.8■□□□□ 0.44
ACTB-211ENST00000480301 YLPM1P49750 1951 aaKnown RBP17.79■□□□□ 0.44
ACTB-211ENST00000480301 ZNF878C9JN71 531 aa17.79■□□□□ 0.44
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