RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473406.5

RABGGTB-209, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 721 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-209ENST00000473406 OR10G9Q8NGN4 311 aa4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-209ENST00000473406 NEIL3Q8TAT5 605 aa4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-209ENST00000473406 SGTBQ96EQ0 304 aa4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-209ENST00000473406 ZFP3Q96NJ6 502 aa4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-209ENST00000473406 CIB1Q99828 191 aa4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-209ENST00000473406 PLEKHA1Q9HB21 404 aa4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-209ENST00000473406 MOKQ9UQ07 419 aa4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-209ENST00000473406 OR51B2Q9Y5P1 312 aa4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-209ENST00000473406 FADS3Q9Y5Q0 445 aa4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-209ENST00000473406 A0A0G2JN53 185 aa4.44□□□□□ -1.7
RABGGTB-209ENST00000473406 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa4.44□□□□□ -1.7
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RABGGTB-209ENST00000473406 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP4.44□□□□□ -1.7
RABGGTB-209ENST00000473406 CD40LGP29965 261 aa4.44□□□□□ -1.7
RABGGTB-209ENST00000473406 PFN2P35080 140 aa4.44□□□□□ -1.7
RABGGTB-209ENST00000473406 UBE2E1P51965 193 aa4.44□□□□□ -1.7
RABGGTB-209ENST00000473406 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP4.44□□□□□ -1.75e-12■■□□□ 13.8
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RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF266Q14584 549 aa4.44□□□□□ -1.7
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RABGGTB-209ENST00000473406 NPWQ8N729 165 aa4.44□□□□□ -1.7
RABGGTB-209ENST00000473406 OR10W1Q8NGF6 305 aa4.44□□□□□ -1.7
RABGGTB-209ENST00000473406 LRRC29Q8WV35 223 aa4.44□□□□□ -1.7
RABGGTB-209ENST00000473406 TNFRSF14Q92956 283 aa4.44□□□□□ -1.7
RABGGTB-209ENST00000473406 AURKBQ96GD4 344 aaPredicted RBP4.44□□□□□ -1.7
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP4.44□□□□□ -1.7
RABGGTB-209ENST00000473406 UBE2E2Q96LR5 201 aa4.44□□□□□ -1.7
RABGGTB-209ENST00000473406 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP4.44□□□□□ -1.7
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RABGGTB-209ENST00000473406 BEX2Q9BXY8 128 aa4.44□□□□□ -1.7
RABGGTB-209ENST00000473406 CLMPQ9H6B4 373 aa4.44□□□□□ -1.7
RABGGTB-209ENST00000473406 SDHAF2Q9NX18 166 aa4.44□□□□□ -1.7
RABGGTB-209ENST00000473406 MAT2BQ9NZL9 334 aa4.44□□□□□ -1.7
RABGGTB-209ENST00000473406 SCML1Q9UN30 329 aa4.44□□□□□ -1.7
RABGGTB-209ENST00000473406 KLF12Q9Y4X4 402 aa4.44□□□□□ -1.7
RABGGTB-209ENST00000473406 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP4.44□□□□□ -1.7
RABGGTB-209ENST00000473406 NOTCH4Q99466 2003 aa4.43□□□□□ -1.7
RABGGTB-209ENST00000473406 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP4.43□□□□□ -1.7
RABGGTB-209ENST00000473406 A0A0B4J2E0 115 aa4.43□□□□□ -1.7
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RABGGTB-209ENST00000473406 SYCE1LA8MT33 242 aa4.43□□□□□ -1.7
RABGGTB-209ENST00000473406 MKRN2OSH3BPM6 223 aa4.43□□□□□ -1.7
RABGGTB-209ENST00000473406 XKRYO14609 159 aa4.43□□□□□ -1.7
RABGGTB-209ENST00000473406 KMOO15229 486 aa4.43□□□□□ -1.7
RABGGTB-209ENST00000473406 RAD51BO15315 384 aa4.43□□□□□ -1.7
RABGGTB-209ENST00000473406 FAM189A1O60320 539 aa4.43□□□□□ -1.7
RABGGTB-209ENST00000473406 RAB3DO95716 219 aa4.43□□□□□ -1.7
RABGGTB-209ENST00000473406 THY1P04216 161 aa4.43□□□□□ -1.7
RABGGTB-209ENST00000473406 GIPP09681 153 aaPredicted RBP4.43□□□□□ -1.7
RABGGTB-209ENST00000473406 RAB3BP20337 219 aa4.43□□□□□ -1.7
RABGGTB-209ENST00000473406 GNRHRP30968 328 aa4.43□□□□□ -1.7
RABGGTB-209ENST00000473406 CEACAM3P40198 252 aa4.43□□□□□ -1.7
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RABGGTB-209ENST00000473406 UBE2IP63279 158 aaKnown RBP4.43□□□□□ -1.7
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RABGGTB-209ENST00000473406 C14orf177Q52M58 125 aa4.43□□□□□ -1.7
RABGGTB-209ENST00000473406 RNF165Q6ZSG1 346 aa4.43□□□□□ -1.7
RABGGTB-209ENST00000473406 H2AFVQ71UI9 128 aa4.43□□□□□ -1.7
RABGGTB-209ENST00000473406 ABHD13Q7L211 337 aa4.43□□□□□ -1.7
RABGGTB-209ENST00000473406 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP4.43□□□□□ -1.7
RABGGTB-209ENST00000473406 OR2L8Q8NGY9 312 aa4.43□□□□□ -1.7
RABGGTB-209ENST00000473406 OR2L2Q8NH16 312 aa4.43□□□□□ -1.7
RABGGTB-209ENST00000473406 ZFP90Q8TF47 636 aa4.43□□□□□ -1.7
RABGGTB-209ENST00000473406 TMEM234Q8WY98 164 aa4.43□□□□□ -1.7
RABGGTB-209ENST00000473406 MARC2Q969Z3 335 aa4.43□□□□□ -1.7
RABGGTB-209ENST00000473406 RNF145Q96MT1 663 aa4.43□□□□□ -1.7
RABGGTB-209ENST00000473406 ATOH8Q96SQ7 321 aa4.43□□□□□ -1.7
RABGGTB-209ENST00000473406 NRIP2Q9BQI9 281 aa4.43□□□□□ -1.7
RABGGTB-209ENST00000473406 OSBPL11Q9BXB4 747 aa4.43□□□□□ -1.7
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RABGGTB-209ENST00000473406 MDFICQ9P1T7 246 aa4.43□□□□□ -1.7
RABGGTB-209ENST00000473406 PRSS21Q9Y6M0 314 aa4.43□□□□□ -1.7
RABGGTB-209ENST00000473406 MYO3BQ8WXR4 1341 aa4.43□□□□□ -1.7
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RABGGTB-209ENST00000473406 SMLR1H3BR10 107 aa4.42□□□□□ -1.7
RABGGTB-209ENST00000473406 EMC8O43402 210 aa4.42□□□□□ -1.7
RABGGTB-209ENST00000473406 ENSAO43768 121 aaKnown RBP4.42□□□□□ -1.7
RABGGTB-209ENST00000473406 TNFSF13O75888 250 aa4.42□□□□□ -1.7
RABGGTB-209ENST00000473406 RETP07949 1114 aa4.42□□□□□ -1.7
RABGGTB-209ENST00000473406 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP4.42□□□□□ -1.7
RABGGTB-209ENST00000473406 SLC35E2BP0CK96 405 aa4.42□□□□□ -1.7
RABGGTB-209ENST00000473406 SMIM10L1P0DMW3 83 aa4.42□□□□□ -1.7
RABGGTB-209ENST00000473406 CNR1P21554 472 aa4.42□□□□□ -1.7
RABGGTB-209ENST00000473406 TEAD1P28347 426 aa4.42□□□□□ -1.7
RABGGTB-209ENST00000473406 RIPPLY3P57055 190 aa4.42□□□□□ -1.7
RABGGTB-209ENST00000473406 OR2B8PP59922 312 aa4.42□□□□□ -1.7
RABGGTB-209ENST00000473406 PRR3P79522 188 aaKnown RBP4.42□□□□□ -1.7
RABGGTB-209ENST00000473406 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP4.42□□□□□ -1.7
RABGGTB-209ENST00000473406 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP4.42□□□□□ -1.7
RABGGTB-209ENST00000473406 GUCA2BQ16661 112 aa4.42□□□□□ -1.7
RABGGTB-209ENST00000473406 RFX4Q33E94 735 aa4.42□□□□□ -1.7
RABGGTB-209ENST00000473406 THEM4Q5T1C6 240 aa4.42□□□□□ -1.7
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