RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471880.5

SSR4-208, Transcript of signal sequence receptor subunit 4, human

TSL 5

Gene SSR4, Length 785 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SSR4-208	ENST00000471880	TMEM33	P57088	247 aa		12.6	□□□□□ -0.39
SSR4-208	ENST00000471880	ECH1	Q13011	328 aa		12.6	□□□□□ -0.39
SSR4-208	ENST00000471880	MALL	Q13021	153 aa		12.6	□□□□□ -0.39
SSR4-208	ENST00000471880	GINS1	Q14691	196 aa		12.6	□□□□□ -0.39
SSR4-208	ENST00000471880	FAM209A	Q5JX71	171 aa		12.6	□□□□□ -0.39
SSR4-208	ENST00000471880	OR2T2	Q6IF00	324 aa		12.6	□□□□□ -0.39
SSR4-208	ENST00000471880	SLC27A4	Q6P1M0	643 aa		12.6	□□□□□ -0.39
SSR4-208	ENST00000471880	DCXR	Q7Z4W1	244 aa		12.6	□□□□□ -0.39
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF511	Q8NB15	262 aa		12.6	□□□□□ -0.39
SSR4-208	ENST00000471880	CLDND2	Q8NHS1	167 aa		12.6	□□□□□ -0.39
SSR4-208	ENST00000471880	ZNRF4	Q8WWF5	429 aa		12.6	□□□□□ -0.39
SSR4-208	ENST00000471880	PTP4A1	Q93096	173 aa		12.6	□□□□□ -0.39
SSR4-208	ENST00000471880	SPTSSA	Q969W0	71 aa		12.6	□□□□□ -0.39
SSR4-208	ENST00000471880	APOBEC3D	Q96AK3	386 aa	Predicted RBP	12.6	□□□□□ -0.39
SSR4-208	ENST00000471880	COPS4	Q9BT78	406 aa		12.6	□□□□□ -0.39
SSR4-208	ENST00000471880	SOX7	Q9BT81	388 aa		12.6	□□□□□ -0.39
SSR4-208	ENST00000471880	HCAR1	Q9BXC0	346 aa		12.6	□□□□□ -0.39
SSR4-208	ENST00000471880	OR51V1	Q9H2C8	321 aa		12.6	□□□□□ -0.39
SSR4-208	ENST00000471880	NKIRAS2	Q9NYR9	191 aa		12.6	□□□□□ -0.39
SSR4-208	ENST00000471880	CYB5R1	Q9UHQ9	305 aa		12.6	□□□□□ -0.39
SSR4-208	ENST00000471880	KCNG2	Q9UJ96	466 aa		12.6	□□□□□ -0.39
SSR4-208	ENST00000471880	ZDHHC8	Q9ULC8	765 aa		12.6	□□□□□ -0.39
SSR4-208	ENST00000471880	COMMD3-BMI1	R4GMX3	469 aa		12.6	□□□□□ -0.39
SSR4-208	ENST00000471880	ARRDC5	A6NEK1	342 aa		12.59	□□□□□ -0.39
SSR4-208	ENST00000471880	ICMT	O60725	284 aa		12.59	□□□□□ -0.39
SSR4-208	ENST00000471880	DEAF1	O75398	565 aa	Predicted RBP	12.59	□□□□□ -0.39
SSR4-208	ENST00000471880	TACSTD2	P09758	323 aa		12.59	□□□□□ -0.39
SSR4-208	ENST00000471880	TUBG1	P23258	451 aa		12.59	□□□□□ -0.39
SSR4-208	ENST00000471880	GRK5	P34947	590 aa		12.59	□□□□□ -0.39
SSR4-208	ENST00000471880	GGT2	P36268	569 aa		12.59	□□□□□ -0.39
SSR4-208	ENST00000471880	CRYBB2	P43320	205 aa		12.59	□□□□□ -0.39
SSR4-208	ENST00000471880	ENTPD1	P49961	510 aa		12.59	□□□□□ -0.39
SSR4-208	ENST00000471880	HIST1H3A	P68431	136 aa		12.59	□□□□□ -0.39
SSR4-208	ENST00000471880	KLHL12	Q53G59	568 aa		12.59	□□□□□ -0.39
SSR4-208	ENST00000471880	HIST2H3PS2	Q5TEC6	136 aa		12.59	□□□□□ -0.39
SSR4-208	ENST00000471880	HIST2H3A	Q71DI3	136 aa		12.59	□□□□□ -0.39
SSR4-208	ENST00000471880	PEG10	Q86TG7	708 aa	Known RBP	12.59	□□□□□ -0.39
SSR4-208	ENST00000471880	ERI1	Q8IV48	349 aa	Known RBP	12.59	□□□□□ -0.39
SSR4-208	ENST00000471880	LINC01356	Q8N9X3	169 aa		12.59	□□□□□ -0.39
SSR4-208	ENST00000471880	OR6N2	Q8NGY6	317 aa		12.59	□□□□□ -0.39
SSR4-208	ENST00000471880	RAB1C	Q92928	201 aa		12.59	□□□□□ -0.39
SSR4-208	ENST00000471880	MAP6	Q96JE9	813 aa		12.59	□□□□□ -0.39
SSR4-208	ENST00000471880	DIRC2	Q96SL1	478 aa		12.59	□□□□□ -0.39
SSR4-208	ENST00000471880	RBM4	Q9BWF3	364 aa	Known RBP	12.59	□□□□□ -0.39
SSR4-208	ENST00000471880	TEX12	Q9BXU0	123 aa		12.59	□□□□□ -0.39
SSR4-208	ENST00000471880	TUBG2	Q9NRH3	451 aa		12.59	□□□□□ -0.39
SSR4-208	ENST00000471880	CMC2	Q9NRP2	79 aa		12.59	□□□□□ -0.39
SSR4-208	ENST00000471880	ATPIF1	Q9UII2	106 aa		12.59	□□□□□ -0.39
SSR4-208	ENST00000471880	CDC42EP3	Q9UKI2	254 aa		12.59	□□□□□ -0.39
SSR4-208	ENST00000471880	ATR	Q13535	2644 aa		12.58	□□□□□ -0.39
SSR4-208	ENST00000471880	PRR23D1	E9PI22	279 aa	Predicted RBP	12.58	□□□□□ -0.4
SSR4-208	ENST00000471880		M0R135	149 aa		12.58	□□□□□ -0.4
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF593	O00488	134 aa	Predicted RBP	12.58	□□□□□ -0.4
SSR4-208	ENST00000471880	WNT9B	O14905	357 aa		12.58	□□□□□ -0.4
SSR4-208	ENST00000471880	RP2	O75695	350 aa		12.58	□□□□□ -0.4
SSR4-208	ENST00000471880	PRR23D2	P0DMB1	279 aa	Predicted RBP	12.58	□□□□□ -0.4
SSR4-208	ENST00000471880	OSM	P13725	252 aa		12.58	□□□□□ -0.4
SSR4-208	ENST00000471880	ANXA8	P13928	327 aa		12.58	□□□□□ -0.4
SSR4-208	ENST00000471880	HNF1A	P20823	631 aa		12.58	□□□□□ -0.4
SSR4-208	ENST00000471880	PRKX	P51817	358 aa		12.58	□□□□□ -0.4
SSR4-208	ENST00000471880	SLC25A1	P53007	311 aa		12.58	□□□□□ -0.4
SSR4-208	ENST00000471880	CDH15	P55291	814 aa		12.58	□□□□□ -0.4
SSR4-208	ENST00000471880	RPS7	P62081	194 aa	Known RBP	12.58	□□□□□ -0.4
SSR4-208	ENST00000471880	MRPS11	P82912	194 aa	Known RBP	12.58	□□□□□ -0.4
SSR4-208	ENST00000471880	EIF2B1	Q14232	305 aa	Known RBP	12.58	□□□□□ -0.4
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF362	Q5T0B9	420 aa	Predicted RBP	12.58	□□□□□ -0.4
SSR4-208	ENST00000471880	MRPL21	Q7Z2W9	205 aa	Known RBP	12.58	□□□□□ -0.4
SSR4-208	ENST00000471880	NAA40	Q86UY6	237 aa		12.58	□□□□□ -0.4
SSR4-208	ENST00000471880	HIPK1	Q86Z02	1210 aa		12.58	□□□□□ -0.4
SSR4-208	ENST00000471880	OR10AD1	Q8NGE0	317 aa		12.58	□□□□□ -0.4
SSR4-208	ENST00000471880	HPS1	Q92902	700 aa		12.58	□□□□□ -0.4
SSR4-208	ENST00000471880	SLCO4A1	Q96BD0	722 aa		12.58	□□□□□ -0.4
SSR4-208	ENST00000471880	HAVCR1	Q96D42	359 aa		12.58	□□□□□ -0.4
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF799	Q96GE5	643 aa		12.58	□□□□□ -0.4
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF582	Q96NG8	517 aa	Predicted RBP	12.58	□□□□□ -0.4
SSR4-208	ENST00000471880	UBAP1	Q9NZ09	502 aa		12.58	□□□□□ -0.4
SSR4-208	ENST00000471880	IGHV3-64D	A0A0J9YX35	117 aa		12.57	□□□□□ -0.4
SSR4-208	ENST00000471880	SURF4	O15260	269 aa		12.57	□□□□□ -0.4
SSR4-208	ENST00000471880	ACSM4	P0C7M7	580 aa		12.57	□□□□□ -0.4
SSR4-208	ENST00000471880	RAC2	P15153	192 aa		12.57	□□□□□ -0.4
SSR4-208	ENST00000471880	TNFRSF1A	P19438	455 aa		12.57	□□□□□ -0.4
SSR4-208	ENST00000471880	KITLG	P21583	273 aa		12.57	□□□□□ -0.4
SSR4-208	ENST00000471880	IGFBP5	P24593	272 aa		12.57	□□□□□ -0.4
SSR4-208	ENST00000471880	HSD11B1	P28845	292 aa		12.57	□□□□□ -0.4
SSR4-208	ENST00000471880	GSTT1	P30711	240 aa		12.57	□□□□□ -0.4
SSR4-208	ENST00000471880	BLVRA	P53004	296 aa		12.57	□□□□□ -0.4
SSR4-208	ENST00000471880	SLC3A1	Q07837	685 aa		12.57	□□□□□ -0.4
SSR4-208	ENST00000471880	HNRNPA0	Q13151	305 aa	Known RBP	12.57	□□□□□ -0.4
SSR4-208	ENST00000471880	TMEM236	Q5W0B7	351 aa		12.57	□□□□□ -0.4
SSR4-208	ENST00000471880	ACSM5	Q6NUN0	579 aa		12.57	□□□□□ -0.4
SSR4-208	ENST00000471880	PLBD1	Q6P4A8	553 aa		12.57	□□□□□ -0.4
SSR4-208	ENST00000471880	SHQ1	Q6PI26	577 aa	Known RBP	12.57	□□□□□ -0.4
SSR4-208	ENST00000471880	CD300LD	Q6UXZ3	194 aa		12.57	□□□□□ -0.4
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF283	Q8N7M2	679 aa		12.57	□□□□□ -0.4
SSR4-208	ENST00000471880	SPRYD4	Q8WW59	207 aa	Predicted RBP	12.57	□□□□□ -0.4
SSR4-208	ENST00000471880	ITLN1	Q8WWA0	313 aa		12.57	□□□□□ -0.4
SSR4-208	ENST00000471880	SLAMF6	Q96DU3	332 aa		12.57	□□□□□ -0.4
SSR4-208	ENST00000471880	ZMYND19	Q96E35	227 aa	Predicted RBP	12.57	□□□□□ -0.4
SSR4-208	ENST00000471880	INTS14	Q96SY0	518 aa		12.57	□□□□□ -0.4
SSR4-208	ENST00000471880	DDO	Q99489	341 aa		12.57	□□□□□ -0.4

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