RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470953.1

VARS-222, Transcript of valyl-tRNA synthetase, human

TSL 3

Gene VARS, Length 392 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
VARS-222	ENST00000470953	FFAR1	O14842	300 aa		4.92	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	SYNGR3	O43761	229 aa		4.92	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	MGRN1	O60291	552 aa		4.92	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	DOK2	O60496	412 aa		4.92	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	REN	P00797	406 aa		4.92	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	IGHM	P01871	453 aa		4.92	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	SERPINA5	P05154	406 aa		4.92	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	CD14	P08571	375 aa		4.92	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	IGHV4-38-2	P0DP08	117 aa		4.92	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	CCL2	P13500	99 aa		4.92	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	ZNF14	P17017	642 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	NR4A1	P22736	598 aa		4.92	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	SDHA	P31040	664 aa		4.92	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	RRM2	P31350	389 aa		4.92	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	SLC6A6	P31641	620 aa		4.92	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	CDA	P32320	146 aa		4.92	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	MSX2	P35548	267 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	ALDH3B1	P43353	468 aa		4.92	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	ARHGDIA	P52565	204 aa		4.92	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	TMEM33	P57088	247 aa		4.92	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	KLF3	P57682	345 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	MRPS34	P82930	218 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	GLO1	Q04760	184 aa		4.92	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	SCRN3	Q0VDG4	424 aa		4.92	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	HNRNPA0	Q13151	305 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	LAPTM4A	Q15012	233 aa		4.92	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	ALKBH6	Q3KRA9	238 aa		4.92	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	SPATS1	Q496A3	300 aa		4.92	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	FAM98B	Q52LJ0	330 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	ARMCX4	Q5H9R4	360 aa		4.92	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	PABPC1L2A	Q5JQF8	200 aa		4.92	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	C10orf128	Q5T292	105 aa		4.92	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	ARMC4	Q5T2S8	1044 aa		4.92	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	GPR139	Q6DWJ6	353 aa		4.92	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	TMEM154	Q6P9G4	183 aa		4.92	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	LRFN4	Q6PJG9	635 aa		4.92	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	TBPL2	Q6SJ96	375 aa		4.92	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	ARL9	Q6T311	187 aa		4.92	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	ZNF627	Q7L945	461 aa		4.92	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	ADCK1	Q86TW2	530 aa		4.92	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	DHFR2	Q86XF0	187 aa		4.92	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	ALDH16A1	Q8IZ83	802 aa		4.92	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	ARHGAP24	Q8N264	748 aa		4.92	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	FAM86B1	Q8N7N1	296 aa		4.92	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	AKR7L	Q8NHP1	331 aa		4.92	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	SUN5	Q8TC36	379 aa		4.92	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	SLC7A13	Q8TCU3	470 aa		4.92	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	LIPH	Q8WWY8	451 aa		4.92	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	C11orf40	Q8WZ69	217 aa		4.92	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	HDAC2	Q92769	488 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	DACT3	Q96B18	629 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	RASD2	Q96D21	266 aa		4.92	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	NSL1	Q96IY1	281 aa		4.92	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	MAP6	Q96JE9	813 aa		4.92	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	IFT27	Q9BW83	186 aa		4.92	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	SYT4	Q9H2B2	425 aa		4.92	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	MUC13	Q9H3R2	512 aa		4.92	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	GORASP2	Q9H8Y8	452 aa		4.92	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	REEP1	Q9H902	201 aa		4.92	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	MARCH7	Q9H992	704 aa		4.92	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	SIAE	Q9HAT2	523 aa		4.92	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	TMEM165	Q9HC07	324 aa		4.92	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	MAN2C1	Q9NTJ4	1040 aa		4.92	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	TBC1D23	Q9NUY8	699 aa		4.92	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	UBAP1	Q9NZ09	502 aa		4.92	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	REV1	Q9UBZ9	1251 aa		4.92	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	IL20RA	Q9UHF4	553 aa		4.92	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	NDRG4	Q9ULP0	352 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	ADAM18	Q9Y3Q7	739 aa		4.92	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	DMBT1	Q9UGM3	2413 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	TRBV4-1	A0A0J9YWV2	114 aa		4.91	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	PRSS37	A4D1T9	235 aa		4.91	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	TRAPPC2L	H3BP13	241 aa		4.91	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	TNFRSF11B	O00300	401 aa		4.91	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	EBAG9	O00559	213 aa		4.91	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	GNGT2	O14610	69 aa		4.91	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	CDC42EP2	O14613	210 aa		4.91	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	SLC16A7	O60669	478 aa		4.91	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	CDC14B	O60729	498 aa		4.91	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	KHDRBS3	O75525	346 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	CCNB2	O95067	398 aa		4.91	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	ABHD16A	O95870	558 aa		4.91	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	HLA-DQA2	P01906	255 aa		4.91	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	CRYBA1	P05813	215 aa		4.91	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	ZNF32	P17041	273 aa		4.91	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	GSTM3	P21266	225 aa		4.91	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	ATP6V1B2	P21281	511 aa		4.91	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	GATA3	P23771	443 aa		4.91	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	STOM	P27105	288 aa		4.91	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	LAP3	P28838	519 aa		4.91	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	GLRX	P35754	106 aa		4.91	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	RAD52	P43351	418 aa		4.91	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	HTR5A	P47898	357 aa		4.91	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	KRTAP10-11	P60412	298 aa		4.91	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	CDK5R2	Q13319	367 aa		4.91	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	MAD2L1BP	Q15013	274 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	MOG	Q16653	247 aa		4.91	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	DEFB112	Q30KQ8	113 aa		4.91	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	DNAL1	Q4LDG9	190 aa		4.91	□□□□□ -1.62
VARS-222	ENST00000470953	MEST	Q5EB52	335 aa		4.91	□□□□□ -1.62

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