RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464611.1

ACTB-208, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 5

Gene ACTB, Length 715 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-208ENST00000464611 UTS2BQ765I0 119 aa7.59□□□□□ -1.19
ACTB-208ENST00000464611 ZNF627Q7L945 461 aa7.59□□□□□ -1.19
ACTB-208ENST00000464611 SLC51BQ86UW2 128 aa7.59□□□□□ -1.19
ACTB-208ENST00000464611 LYPD6Q86Y78 171 aa7.59□□□□□ -1.19
ACTB-208ENST00000464611 OR1M1Q8NGA1 313 aa7.59□□□□□ -1.19
ACTB-208ENST00000464611 OR51A4Q8NGJ6 313 aa7.59□□□□□ -1.19
ACTB-208ENST00000464611 OR51S1Q8NGJ8 323 aa7.59□□□□□ -1.19
ACTB-208ENST00000464611 OR6K3Q8NGY3 331 aa7.59□□□□□ -1.19
ACTB-208ENST00000464611 OR10AC1Q8NH08 325 aa7.59□□□□□ -1.19
ACTB-208ENST00000464611 KCNG3Q8TAE7 436 aa7.59□□□□□ -1.19
ACTB-208ENST00000464611 SUN5Q8TC36 379 aa7.59□□□□□ -1.19
ACTB-208ENST00000464611 LRRC20Q8TCA0 184 aa7.59□□□□□ -1.19
ACTB-208ENST00000464611 SAP25Q8TEE9 199 aa7.59□□□□□ -1.19
ACTB-208ENST00000464611 AQP3Q92482 292 aa7.59□□□□□ -1.19
ACTB-208ENST00000464611 ZNF524Q96C55 264 aa7.59□□□□□ -1.19
ACTB-208ENST00000464611 ORAI1Q96D31 301 aa7.59□□□□□ -1.19
ACTB-208ENST00000464611 SLAMF6Q96DU3 332 aa7.59□□□□□ -1.19
ACTB-208ENST00000464611 SFXN2Q96NB2 322 aa7.59□□□□□ -1.19
ACTB-208ENST00000464611 AMELYQ99218 206 aa7.59□□□□□ -1.19
ACTB-208ENST00000464611 CDC6Q99741 560 aa7.59□□□□□ -1.19
ACTB-208ENST00000464611 SEC22CQ9BRL7 303 aa7.59□□□□□ -1.19
ACTB-208ENST00000464611 DNTTIP1Q9H147 329 aa7.59□□□□□ -1.19
ACTB-208ENST00000464611 SMOC1Q9H4F8 434 aa7.59□□□□□ -1.19
ACTB-208ENST00000464611 METTL7AQ9H8H3 244 aa7.59□□□□□ -1.19
ACTB-208ENST00000464611 FSCN3Q9NQT6 498 aa7.59□□□□□ -1.19
ACTB-208ENST00000464611 TAS2R4Q9NYW5 299 aa7.59□□□□□ -1.19
ACTB-208ENST00000464611 KLRF1Q9NZS2 232 aa7.59□□□□□ -1.19
ACTB-208ENST00000464611 COMMD9Q9P000 198 aa7.59□□□□□ -1.19
ACTB-208ENST00000464611 MYOTQ9UBF9 498 aa7.59□□□□□ -1.19
ACTB-208ENST00000464611 KCNN3Q9UGI6 736 aa7.59□□□□□ -1.19
ACTB-208ENST00000464611 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP7.59□□□□□ -1.19
ACTB-208ENST00000464611 GDF2Q9UK05 429 aaPredicted RBP7.59□□□□□ -1.19
ACTB-208ENST00000464611 WIF1Q9Y5W5 379 aa7.59□□□□□ -1.19
ACTB-208ENST00000464611 B3GALT1Q9Y5Z6 326 aa7.59□□□□□ -1.19
ACTB-208ENST00000464611 MPDZO75970 2070 aa7.58□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 RALGAPA1Q6GYQ0 2036 aa7.58□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 A0A0B4J2A0 478 aa7.58□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 TRBV11-1A0A0K0K1C0 115 aa7.58□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 A0A1B0GTH9 108 aa7.58□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 CA11O75493 328 aa7.58□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 OR2F2O95006 317 aa7.58□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 CD3DP04234 171 aa7.58□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 AMY2AP04746 511 aa7.58□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 OR4E1P0C645 316 aa7.58□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 FGF5P12034 268 aa7.58□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 SLC25A4P12235 298 aa7.58□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 ZNF20P17024 532 aa7.58□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 ANXA7P20073 488 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 GNALP38405 381 aa7.58□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 CD96P40200 585 aa7.58□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 MAGEB1P43366 347 aa7.58□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 POU3F1Q03052 451 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 OR2F1Q13607 317 aa7.58□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 ZNF345Q14585 488 aa7.58□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 SHBQ15464 509 aa7.58□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 TAF13Q15543 124 aa7.58□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 PLPPR5Q32ZL2 321 aa7.58□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 TMEM255AQ5JRV8 349 aa7.58□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 MTFR2Q6P444 385 aa7.58□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 C11orf88Q6PI97 169 aa7.58□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 SLC25A47Q6Q0C1 308 aa7.58□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 NHLRC1Q6VVB1 395 aa7.58□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa7.58□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 TMUB2Q71RG4 321 aa7.58□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 DOK3Q7L591 496 aa7.58□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 ASCL5Q7RTU5 278 aa7.58□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 SLC25A42Q86VD7 318 aa7.58□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 PPP1R3BQ86XI6 285 aa7.58□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 BPIFB2Q8N4F0 458 aa7.58□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 JAGN1Q8N5M9 183 aa7.58□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 EIF4E3Q8N5X7 224 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 PHYHIPLQ96FC7 376 aa7.58□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 ELMOD3Q96FG2 381 aa7.58□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 CPNE2Q96FN4 548 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 POM121Q96HA1 1249 aa7.58□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 DHRS9Q9BPW9 319 aa7.58□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 NAA11Q9BSU3 229 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 URM1Q9BTM9 101 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 DEFB126Q9BYW3 111 aa7.58□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 ULBP3Q9BZM4 244 aa7.58□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 OR11A1Q9GZK7 315 aa7.58□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 PBOV1Q9GZY1 135 aa7.58□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 SLC25A32Q9H2D1 315 aa7.58□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 PARD6AQ9NPB6 346 aa7.58□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 SLC22A11Q9NSA0 550 aa7.58□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 CENPMQ9NSP4 180 aa7.58□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 FAM206AQ9NX38 181 aa7.58□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 CTSFQ9UBX1 484 aa7.58□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 SHPKQ9UHJ6 478 aa7.58□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 PFDN2Q9UHV9 154 aa7.58□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 CACNA1EQ15878 2313 aa7.58□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 ADAMTS9Q9P2N4 1935 aa7.58□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 CACNA1HO95180 2353 aa7.57□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 MUC6Q6W4X9 2439 aa7.57□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 LOC102723996A0A087X1L8 192 aa7.57□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 RPS10-NUDT3A0A1W2PQS6 291 aa7.57□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 DCDC2BA2VCK2 349 aa7.57□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 GJE1A6NN92 205 aa7.57□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 C4orf47A7E2U8 309 aa7.57□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 G3V3Q6 166 aa7.57□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.8 ms