RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460731.5

PTPN12-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 12, human

TSL 2

Gene PTPN12, Length 582 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPN12-209	ENST00000460731	OR6C6	A6NF89	314 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	C12orf71	A8MTZ7	269 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	DEFB108A	A8MXU0	73 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	PYCARD-AS1	I3L0S3	204 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	C19orf84	I3L1E1	186 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	SYNGR3	O43761	229 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	ENTPD6	O75354	484 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	LYZL6	O75951	148 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	KRT33A	O76009	404 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	MPZL1	O95297	269 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	SBK2	P0C263	348 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	CCDC159	P0C7I6	412 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	PIP	P12273	146 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	ZNF35	P13682	527 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	B4GALT1	P15291	398 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	ZNF14	P17017	642 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	CRYGS	P22914	178 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	CDA	P32320	146 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	DCTD	P32321	178 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	PYCR1	P32322	319 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	ARR3	P36575	388 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	PCBD1	P61457	104 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	PSG4	Q00888	419 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	AQP6	Q13520	282 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	HIKESHI	Q53FT3	197 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	C6orf141	Q5SZD1	244 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	C6orf52	Q5T4I8	152 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	SLC18B1	Q6NT16	456 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	DEGS2	Q6QHC5	323 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	UGT2A3	Q6UWM9	527 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	ZNF813	Q6ZN06	617 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	COLCA1	Q6ZS62	124 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	SLC16A9	Q7RTY1	509 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	BCDIN3D	Q7Z5W3	292 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	CDC20B	Q86Y33	519 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	ZNF584	Q8IVC4	421 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	C8orf59	Q8N0T1	100 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	UBE2J2	Q8N2K1	259 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	CPEB3	Q8NE35	698 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	IL17RD	Q8NFM7	739 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	OR10S1	Q8NGN2	331 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	OR9Q1	Q8NGQ5	310 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	OTOS	Q8NHW6	89 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	FAM81A	Q8TBF8	368 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	CYGB	Q8WWM9	190 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	IPCEF1	Q8WWN9	437 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	RFK	Q969G6	155 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	PLEKHA8	Q96JA3	519 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	YTHDF1	Q9BYJ9	559 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	ACTR6	Q9GZN1	396 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	DUSP21	Q9H596	190 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	MED20	Q9H944	212 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	WDR76	Q9H967	626 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	ADGRL4	Q9HBW9	690 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	FGF20	Q9NP95	211 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	DDX28	Q9NUL7	540 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	KCNN3	Q9UGI6	736 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	NDRG3	Q9UGV2	375 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	FBXL3	Q9UKT7	428 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	TIMM10B	Q9Y5J6	103 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	COMMD3-BMI1	R4GMX3	469 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	LRBA	P50851	2863 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	CIB4	A0PJX0	185 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	DPRX	A6NFQ7	191 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	TUBAL3	A6NHL2	446 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	SNTN	A6NMZ2	147 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	FAM90A27P	A6NNH2	459 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731		M0R129	80 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	ZNF593	O00488	134 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	RAD51D	O75771	328 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	UBL3	O95164	117 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	FARS2	O95363	451 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	CLIC3	O95833	236 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	GPANK1	O95872	356 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	HLA-H	P01893	362 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	GYPB	P06028	91 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	OR2T7	P0C7T2	308 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	DBT	P11182	482 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	PSKH1	P11801	424 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	IL32	P24001	234 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	PTAFR	P25105	342 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	PCSK6	P29122	969 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	OPRL1	P41146	370 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	GUCA1A	P43080	201 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	MTNR1A	P48039	350 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	ENTPD1	P49961	510 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	NUDT6	P53370	316 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	KRTAP10-9	P60411	292 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	RAB1A	P62820	205 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	IL13RA1	P78552	427 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	RAB40B	Q12829	278 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	ECH1	Q13011	328 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	APOF	Q13790	326 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	PPA1	Q15181	289 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	TSC22D1	Q15714	1073 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	SGCA	Q16586	387 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	SLC36A2	Q495M3	483 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	CCDC92	Q53HC0	331 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	NCMAP	Q5T1S8	102 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	ADAM5	Q6NVV9	412 aa		4.87	□□□□□ -1.63

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