RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459159.1

SNORD54-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 54, humanhuman

BASIC

Gene SNORD54, Length 67 nt, Biotype snoRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD54-201ENST00000459159 ALKBH3Q96Q83 286 aaPredicted RBP-2.48□□□□□ -2.81
SNORD54-201ENST00000459159 RPS6KC1Q96S38 1066 aa-2.48□□□□□ -2.81
SNORD54-201ENST00000459159 SLC9A7Q96T83 725 aa-2.48□□□□□ -2.81
SNORD54-201ENST00000459159 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP-2.48□□□□□ -2.81
SNORD54-201ENST00000459159 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP-2.48□□□□□ -2.81
SNORD54-201ENST00000459159 MAGEB5Q9BZ81 275 aa-2.48□□□□□ -2.81
SNORD54-201ENST00000459159 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP-2.48□□□□□ -2.81
SNORD54-201ENST00000459159 GPR88Q9GZN0 384 aa-2.48□□□□□ -2.81
SNORD54-201ENST00000459159 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP-2.48□□□□□ -2.81
SNORD54-201ENST00000459159 DPAGT1Q9H3H5 408 aa-2.48□□□□□ -2.81
SNORD54-201ENST00000459159 HAUS4Q9H6D7 363 aa-2.48□□□□□ -2.81
SNORD54-201ENST00000459159 DNAJC18Q9H819 358 aa-2.48□□□□□ -2.81
SNORD54-201ENST00000459159 BRF2Q9HAW0 419 aa-2.48□□□□□ -2.81
SNORD54-201ENST00000459159 MAGEF1Q9HAY2 307 aa-2.48□□□□□ -2.81
SNORD54-201ENST00000459159 EPB41L5Q9HCM4 733 aa-2.48□□□□□ -2.81
SNORD54-201ENST00000459159 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP-2.48□□□□□ -2.81
SNORD54-201ENST00000459159 C14orf105Q9NVL8 296 aa-2.48□□□□□ -2.81
SNORD54-201ENST00000459159 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP-2.48□□□□□ -2.81
SNORD54-201ENST00000459159 TAS2R16Q9NYV7 291 aa-2.48□□□□□ -2.81
SNORD54-201ENST00000459159 STX18Q9P2W9 335 aaKnown RBP-2.48□□□□□ -2.81
SNORD54-201ENST00000459159 STK39Q9UEW8 545 aa-2.48□□□□□ -2.81
SNORD54-201ENST00000459159 KCNE5Q9UJ90 142 aa-2.48□□□□□ -2.81
SNORD54-201ENST00000459159 ASF1AQ9Y294 204 aa-2.48□□□□□ -2.81
SNORD54-201ENST00000459159 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP-2.48□□□□□ -2.81
SNORD54-201ENST00000459159 AP4B1Q9Y6B7 739 aa-2.48□□□□□ -2.81
SNORD54-201ENST00000459159 UGGT2Q9NYU1 1516 aa-2.48□□□□□ -2.81
SNORD54-201ENST00000459159 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa-2.49□□□□□ -2.81
SNORD54-201ENST00000459159 ABCA9Q8IUA7 1624 aa-2.49□□□□□ -2.81
SNORD54-201ENST00000459159 NPATQ14207 1427 aa-2.49□□□□□ -2.81
SNORD54-201ENST00000459159 FANCAO15360 1455 aa-2.49□□□□□ -2.81
SNORD54-201ENST00000459159 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa-2.49□□□□□ -2.81
SNORD54-201ENST00000459159 ISPDA4D126 451 aa-2.49□□□□□ -2.81
SNORD54-201ENST00000459159 LRRD1A4D1F6 860 aa-2.49□□□□□ -2.81
SNORD54-201ENST00000459159 TRIM43BA6NCK2 446 aa-2.49□□□□□ -2.81
SNORD54-201ENST00000459159 URADA6NGE7 173 aa-2.49□□□□□ -2.81
SNORD54-201ENST00000459159 SPDYE5A6NIY4 337 aa-2.49□□□□□ -2.81
SNORD54-201ENST00000459159 ANKRD30BLA7E2S9 258 aa-2.49□□□□□ -2.81
SNORD54-201ENST00000459159 PPP5D1E7EU14 171 aa-2.49□□□□□ -2.81
SNORD54-201ENST00000459159 M0QY20 66 aa-2.49□□□□□ -2.81
SNORD54-201ENST00000459159 ZNF593O00488 134 aaPredicted RBP-2.49□□□□□ -2.81
SNORD54-201ENST00000459159 AQP7O14520 342 aa-2.49□□□□□ -2.81
SNORD54-201ENST00000459159 OR7A17O14581 309 aa-2.49□□□□□ -2.81
SNORD54-201ENST00000459159 XKRYO14609 159 aa-2.49□□□□□ -2.81
SNORD54-201ENST00000459159 ACOT8O14734 319 aa-2.49□□□□□ -2.81
SNORD54-201ENST00000459159 ST8SIA3O43173 380 aa-2.49□□□□□ -2.81
SNORD54-201ENST00000459159 SEPT4O43236 478 aa-2.49□□□□□ -2.81
SNORD54-201ENST00000459159 OR2T1O43869 369 aa-2.49□□□□□ -2.81
SNORD54-201ENST00000459159 GMFGO60234 142 aa-2.49□□□□□ -2.81
SNORD54-201ENST00000459159 BCE1O60756 84 aa-2.49□□□□□ -2.81
SNORD54-201ENST00000459159 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP-2.49□□□□□ -2.81
SNORD54-201ENST00000459159 RPS6KA5O75582 802 aa-2.49□□□□□ -2.81
SNORD54-201ENST00000459159 B3GALNT1O75752 331 aa-2.49□□□□□ -2.81
SNORD54-201ENST00000459159 DHRS3O75911 302 aa-2.49□□□□□ -2.81
SNORD54-201ENST00000459159 TNFSF15O95150 251 aa-2.49□□□□□ -2.81
SNORD54-201ENST00000459159 OR5F1O95221 314 aa-2.49□□□□□ -2.81
SNORD54-201ENST00000459159 LRATO95237 230 aa-2.49□□□□□ -2.81
SNORD54-201ENST00000459159 TXNDC12O95881 172 aa-2.49□□□□□ -2.81
SNORD54-201ENST00000459159 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP-2.49□□□□□ -2.81
SNORD54-201ENST00000459159 UGT2B7P16662 529 aa-2.49□□□□□ -2.81
SNORD54-201ENST00000459159 TMEM11P17152 192 aa-2.49□□□□□ -2.81
SNORD54-201ENST00000459159 COMTP21964 271 aa-2.49□□□□□ -2.81
SNORD54-201ENST00000459159 HTR2AP28223 471 aa-2.49□□□□□ -2.81
SNORD54-201ENST00000459159 OXTRP30559 389 aa-2.49□□□□□ -2.81
SNORD54-201ENST00000459159 GNRHRP30968 328 aa-2.49□□□□□ -2.81
SNORD54-201ENST00000459159 PGM1P36871 562 aa-2.49□□□□□ -2.81
SNORD54-201ENST00000459159 MMP13P45452 471 aa-2.49□□□□□ -2.81
SNORD54-201ENST00000459159 APOC4P55056 127 aa-2.49□□□□□ -2.81
SNORD54-201ENST00000459159 CLDN12P56749 244 aa-2.49□□□□□ -2.81
SNORD54-201ENST00000459159 CLDN18P56856 261 aa-2.49□□□□□ -2.81
SNORD54-201ENST00000459159 OSTNP61366 133 aa-2.49□□□□□ -2.81
SNORD54-201ENST00000459159 RPL23AP62750 156 aaKnown RBP-2.49□□□□□ -2.81
SNORD54-201ENST00000459159 CCT2P78371 535 aaKnown RBP-2.49□□□□□ -2.81
SNORD54-201ENST00000459159 DCDP81605 110 aaKnown RBP-2.49□□□□□ -2.81
SNORD54-201ENST00000459159 PPP3CAQ08209 521 aa-2.49□□□□□ -2.81
SNORD54-201ENST00000459159 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa-2.49□□□□□ -2.81
SNORD54-201ENST00000459159 MPPED2Q15777 294 aa-2.49□□□□□ -2.81
SNORD54-201ENST00000459159 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP-2.49□□□□□ -2.81
SNORD54-201ENST00000459159 ANKDD1AQ495B1 522 aa-2.49□□□□□ -2.81
SNORD54-201ENST00000459159 ZNF876PQ49A33 203 aa-2.49□□□□□ -2.81
SNORD54-201ENST00000459159 ABCA11PQ4W5N1 156 aa-2.49□□□□□ -2.81
SNORD54-201ENST00000459159 C6orf183Q5T699 404 aa-2.49□□□□□ -2.81
SNORD54-201ENST00000459159 OR2A2Q6IF42 318 aa-2.49□□□□□ -2.81
SNORD54-201ENST00000459159 EBLN2Q6P2I7 272 aa-2.49□□□□□ -2.81
SNORD54-201ENST00000459159 EPGNQ6UW88 154 aa-2.49□□□□□ -2.81
SNORD54-201ENST00000459159 CYP2R1Q6VVX0 501 aa-2.49□□□□□ -2.81
SNORD54-201ENST00000459159 GADL1Q6ZQY3 521 aa-2.49□□□□□ -2.81
SNORD54-201ENST00000459159 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP-2.49□□□□□ -2.81
SNORD54-201ENST00000459159 GALNT7Q86SF2 657 aa-2.49□□□□□ -2.81
SNORD54-201ENST00000459159 LUZP2Q86TE4 346 aa-2.49□□□□□ -2.81
SNORD54-201ENST00000459159 TBC1D26Q86UD7 250 aa-2.49□□□□□ -2.81
SNORD54-201ENST00000459159 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP-2.49□□□□□ -2.81
SNORD54-201ENST00000459159 EXOC8Q8IYI6 725 aa-2.49□□□□□ -2.81
SNORD54-201ENST00000459159 TTC5Q8N0Z6 440 aa-2.49□□□□□ -2.81
SNORD54-201ENST00000459159 CA13Q8N1Q1 262 aa-2.49□□□□□ -2.81
SNORD54-201ENST00000459159 UBE2J2Q8N2K1 259 aa-2.49□□□□□ -2.81
SNORD54-201ENST00000459159 SLC43A2Q8N370 569 aa-2.49□□□□□ -2.81
SNORD54-201ENST00000459159 FAM89BQ8N5H3 189 aa-2.49□□□□□ -2.81
SNORD54-201ENST00000459159 KRTCAP2Q8N6L1 136 aa-2.49□□□□□ -2.81
SNORD54-201ENST00000459159 FITM2Q8N6M3 262 aa-2.49□□□□□ -2.81
SNORD54-201ENST00000459159 PACRGLQ8N7B6 248 aa-2.49□□□□□ -2.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.4 ms