RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455321.1

PGGT1BP1-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene PGGT1BP1, Length 1,023 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP1-201ENST00000455321 V9GYQ6 96 aa7.29□□□□□ -1.24
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ABCA12Q86UK0 2595 aa7.29□□□□□ -1.24
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MPDZO75970 2070 aa7.28□□□□□ -1.24
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PKDREJQ9NTG1 2253 aa7.28□□□□□ -1.24
PGGT1BP1-201ENST00000455321 A0A1B0GWA3 101 aa7.28□□□□□ -1.24
PGGT1BP1-201ENST00000455321 A0A1W2PNV4 684 aa7.28□□□□□ -1.24
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PRORSD1PA6NEY8 169 aa7.28□□□□□ -1.24
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CYSRT1A8MQ03 144 aa7.28□□□□□ -1.24
PGGT1BP1-201ENST00000455321 EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 151 aa7.28□□□□□ -1.24
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CXCR6O00574 342 aa7.28□□□□□ -1.24
PGGT1BP1-201ENST00000455321 EEF1E1O43324 174 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RAMP1O60894 148 aa7.28□□□□□ -1.24
PGGT1BP1-201ENST00000455321 NOL3O60936 208 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SYNGR4O95473 234 aa7.28□□□□□ -1.24
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ZNF682O95780 498 aa7.28□□□□□ -1.24
PGGT1BP1-201ENST00000455321 LGI1O95970 557 aa7.28□□□□□ -1.24
PGGT1BP1-201ENST00000455321 NPPAP01160 153 aa7.28□□□□□ -1.24
PGGT1BP1-201ENST00000455321 LIPFP07098 398 aa7.28□□□□□ -1.24
PGGT1BP1-201ENST00000455321 T-ENOLP0DO92 83 aa7.28□□□□□ -1.24
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CBLP22681 906 aa7.28□□□□□ -1.24
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ELK4P28324 431 aa7.28□□□□□ -1.24
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CHRNB4P30926 498 aa7.28□□□□□ -1.24
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CEACAM8P31997 349 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MNDAP41218 407 aa7.28□□□□□ -1.24
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SLC1A3P43003 542 aa7.28□□□□□ -1.24
PGGT1BP1-201ENST00000455321 YAP1P46937 504 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
PGGT1BP1-201ENST00000455321 POLR2HP52434 150 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
PGGT1BP1-201ENST00000455321 OR2B6P58173 313 aa7.28□□□□□ -1.24
PGGT1BP1-201ENST00000455321 GMFBP60983 142 aa7.28□□□□□ -1.24
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ISL1P61371 349 aa7.28□□□□□ -1.24
PGGT1BP1-201ENST00000455321 COPZ1P61923 177 aa7.28□□□□□ -1.24
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MYBPHQ13203 477 aa7.28□□□□□ -1.24
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CYBRD1Q53TN4 286 aa7.28□□□□□ -1.24
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RIPPLY2Q5TAB7 128 aa7.28□□□□□ -1.24
PGGT1BP1-201ENST00000455321 EEF1A1P5Q5VTE0 462 aa7.28□□□□□ -1.24
PGGT1BP1-201ENST00000455321 WBP2NLQ6ICG8 309 aa7.28□□□□□ -1.24
PGGT1BP1-201ENST00000455321 C3orf33Q6P1S2 294 aa7.28□□□□□ -1.24
PGGT1BP1-201ENST00000455321 HACD2Q6Y1H2 254 aa7.28□□□□□ -1.24
PGGT1BP1-201ENST00000455321 VTCN1Q7Z7D3 282 aa7.28□□□□□ -1.24
PGGT1BP1-201ENST00000455321 LUZP2Q86TE4 346 aa7.28□□□□□ -1.24
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ZNF440Q8IYI8 595 aa7.28□□□□□ -1.24
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ELMOD2Q8IZ81 293 aa7.28□□□□□ -1.24
PGGT1BP1-201ENST00000455321 DEFB107AQ8IZN7 70 aa7.28□□□□□ -1.24
PGGT1BP1-201ENST00000455321 EID3Q8N140 333 aa7.28□□□□□ -1.24
PGGT1BP1-201ENST00000455321 LILRB4Q8NHJ6 448 aa7.28□□□□□ -1.24
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ABHD3Q8WU67 409 aa7.28□□□□□ -1.24
PGGT1BP1-201ENST00000455321 FAM216AQ8WUB2 273 aa7.28□□□□□ -1.24
PGGT1BP1-201ENST00000455321 NSL1Q96IY1 281 aa7.28□□□□□ -1.24
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ARHGDIGQ99819 225 aa7.28□□□□□ -1.24
PGGT1BP1-201ENST00000455321 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
PGGT1BP1-201ENST00000455321 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
PGGT1BP1-201ENST00000455321 OPN3Q9H1Y3 402 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ZNF701Q9NV72 531 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ZNF224Q9NZL3 707 aa7.28□□□□□ -1.24
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TMEM181Q9P2C4 612 aa7.28□□□□□ -1.24
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CHRNA9Q9UGM1 479 aa7.28□□□□□ -1.24
PGGT1BP1-201ENST00000455321 AURKCQ9UQB9 309 aa7.28□□□□□ -1.24
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SH3GLB1Q9Y371 365 aa7.28□□□□□ -1.24
PGGT1BP1-201ENST00000455321 OR2W1Q9Y3N9 320 aa7.28□□□□□ -1.24
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CSMD1Q96PZ7 3565 aa7.28□□□□□ -1.24
PGGT1BP1-201ENST00000455321 AKAP9Q99996 3911 aa7.28□□□□□ -1.24
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ITPR2Q14571 2701 aa7.28□□□□□ -1.24
PGGT1BP1-201ENST00000455321 FBN2P35556 2912 aa7.28□□□□□ -1.24
PGGT1BP1-201ENST00000455321 F8VVB4 439 aa7.27□□□□□ -1.25
PGGT1BP1-201ENST00000455321 F8VWA3 439 aa7.27□□□□□ -1.25
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SULT2B1O00204 365 aa7.27□□□□□ -1.25
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PDE5AO76074 875 aa7.27□□□□□ -1.25
PGGT1BP1-201ENST00000455321 KDM4BO94953 1096 aa7.27□□□□□ -1.25
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RCBTB2O95199 551 aa7.27□□□□□ -1.25
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SERPINA1P01009 418 aa7.27□□□□□ -1.25
PGGT1BP1-201ENST00000455321 THY1P04216 161 aa7.27□□□□□ -1.25
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TFAP2AP05549 437 aa7.27□□□□□ -1.25
PGGT1BP1-201ENST00000455321 HOXD4P09016 255 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
PGGT1BP1-201ENST00000455321 UQCRBP14927 111 aa7.27□□□□□ -1.25
PGGT1BP1-201ENST00000455321 AREGP15514 252 aa7.27□□□□□ -1.25
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ZNF23P17027 643 aa7.27□□□□□ -1.25
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CXCR1P25024 350 aa7.27□□□□□ -1.25
PGGT1BP1-201ENST00000455321 EDNRAP25101 427 aa7.27□□□□□ -1.25
PGGT1BP1-201ENST00000455321 KDELR2P33947 212 aa7.27□□□□□ -1.25
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TIMP3P35625 211 aa7.27□□□□□ -1.25
PGGT1BP1-201ENST00000455321 OR3A1P47881 315 aa7.27□□□□□ -1.25
PGGT1BP1-201ENST00000455321 NCALDP61601 193 aa7.27□□□□□ -1.25
PGGT1BP1-201ENST00000455321 OR1Q1Q15612 314 aa7.27□□□□□ -1.25
PGGT1BP1-201ENST00000455321 OR7A5Q15622 319 aa7.27□□□□□ -1.25
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ZNF239Q16600 458 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
PGGT1BP1-201ENST00000455321 NRF1Q16656 503 aa7.27□□□□□ -1.25
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ERICH5Q6P6B1 374 aa7.27□□□□□ -1.25
PGGT1BP1-201ENST00000455321 XKRXQ6PP77 449 aa7.27□□□□□ -1.25
PGGT1BP1-201ENST00000455321 WDR88Q6ZMY6 472 aa7.27□□□□□ -1.25
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CCDC80Q76M96 950 aa7.27□□□□□ -1.25
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ARPINQ7Z6K5 226 aa7.27□□□□□ -1.25
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CARM1Q86X55 608 aa7.27□□□□□ -1.25
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SLC30A8Q8IWU4 369 aa7.27□□□□□ -1.25
PGGT1BP1-201ENST00000455321 FAM86B1Q8N7N1 296 aa7.27□□□□□ -1.25
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PRR26Q8N8Z3 221 aa7.27□□□□□ -1.25
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ZNF300Q96RE9 604 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MCHR1Q99705 422 aa7.27□□□□□ -1.25
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ARMC7Q9H6L4 198 aa7.27□□□□□ -1.25
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RNF122Q9H9V4 155 aa7.27□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.1 ms