RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449757.5

DDX39B-211, Transcript of DExD-box helicase 39B, humanhuman

TSL 3

Gene DDX39B, Length 591 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39B-211ENST00000449757 TBC1D15Q8TC07 691 aa8.57□□□□□ -1.04
DDX39B-211ENST00000449757 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
DDX39B-211ENST00000449757 FAM71F1Q96KD3 344 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
DDX39B-211ENST00000449757 HCAR1Q9BXC0 346 aa8.57□□□□□ -1.04
DDX39B-211ENST00000449757 SYT4Q9H2B2 425 aa8.57□□□□□ -1.04
DDX39B-211ENST00000449757 TMEM100Q9NV29 134 aa8.57□□□□□ -1.04
DDX39B-211ENST00000449757 A4GNTQ9UNA3 340 aa8.57□□□□□ -1.04
DDX39B-211ENST00000449757 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
DDX39B-211ENST00000449757 POMT1Q9Y6A1 747 aa8.57□□□□□ -1.04
DDX39B-211ENST00000449757 HTR3EA5X5Y0 456 aa8.56□□□□□ -1.04
DDX39B-211ENST00000449757 SLC22A31A6NKX4 558 aa8.56□□□□□ -1.04
DDX39B-211ENST00000449757 IQCF6A8MYZ5 107 aa8.56□□□□□ -1.04
DDX39B-211ENST00000449757 FAM220BPB1ANY3 271 aa8.56□□□□□ -1.04
DDX39B-211ENST00000449757 ZNF879B4DU55 563 aa8.56□□□□□ -1.04
DDX39B-211ENST00000449757 C3orf80F5H4A9 247 aa8.56□□□□□ -1.04
DDX39B-211ENST00000449757 J3QW42 95 aa8.56□□□□□ -1.04
DDX39B-211ENST00000449757 SOCS2O14508 198 aa8.56□□□□□ -1.04
DDX39B-211ENST00000449757 MRASO14807 208 aa8.56□□□□□ -1.04
DDX39B-211ENST00000449757 GPR137BO60478 399 aa8.56□□□□□ -1.04
DDX39B-211ENST00000449757 FAM20BO75063 409 aa8.56□□□□□ -1.04
DDX39B-211ENST00000449757 IFNW1P05000 195 aa8.56□□□□□ -1.04
DDX39B-211ENST00000449757 CD14P08571 375 aa8.56□□□□□ -1.04
DDX39B-211ENST00000449757 FUT4P22083 530 aa8.56□□□□□ -1.04
DDX39B-211ENST00000449757 PMELP40967 661 aa8.56□□□□□ -1.04
DDX39B-211ENST00000449757 RAD23AP54725 363 aa8.56□□□□□ -1.04
DDX39B-211ENST00000449757 BPIFB3P59826 476 aa8.56□□□□□ -1.04
DDX39B-211ENST00000449757 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
DDX39B-211ENST00000449757 PRKCDQ05655 676 aa8.56□□□□□ -1.04
DDX39B-211ENST00000449757 OR8B8Q15620 311 aa8.56□□□□□ -1.04
DDX39B-211ENST00000449757 MEP1BQ16820 701 aa8.56□□□□□ -1.04
DDX39B-211ENST00000449757 ZNF181Q2M3W8 571 aa8.56□□□□□ -1.04
DDX39B-211ENST00000449757 ANKDD1AQ495B1 522 aa8.56□□□□□ -1.04
DDX39B-211ENST00000449757 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
DDX39B-211ENST00000449757 SFRP4Q6FHJ7 346 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
DDX39B-211ENST00000449757 ASPHD2Q6ICH7 369 aa8.56□□□□□ -1.04
DDX39B-211ENST00000449757 RRM2BQ7LG56 351 aa8.56□□□□□ -1.04
DDX39B-211ENST00000449757 CALHM3Q86XJ0 350 aa8.56□□□□□ -1.04
DDX39B-211ENST00000449757 GLB1L2Q8IW92 636 aa8.56□□□□□ -1.04
DDX39B-211ENST00000449757 OFCC1Q8IZS5 231 aa8.56□□□□□ -1.04
DDX39B-211ENST00000449757 OR8J3Q8NGG0 315 aa8.56□□□□□ -1.04
DDX39B-211ENST00000449757 TSPEARQ8WU66 669 aa8.56□□□□□ -1.04
DDX39B-211ENST00000449757 LHX4Q969G2 390 aa8.56□□□□□ -1.04
DDX39B-211ENST00000449757 TBX15Q96SF7 602 aa8.56□□□□□ -1.04
DDX39B-211ENST00000449757 TRIM15Q9C019 465 aa8.56□□□□□ -1.04
DDX39B-211ENST00000449757 ERVK-18Q9QC07 812 aa8.56□□□□□ -1.04
DDX39B-211ENST00000449757 RPS6KA6Q9UK32 745 aa8.56□□□□□ -1.04
DDX39B-211ENST00000449757 CDC42EP2O14613 210 aa8.55□□□□□ -1.04
DDX39B-211ENST00000449757 IMPA2O14732 288 aa8.55□□□□□ -1.04
DDX39B-211ENST00000449757 ADAM20O43506 726 aa8.55□□□□□ -1.04
DDX39B-211ENST00000449757 ZNF682O95780 498 aa8.55□□□□□ -1.04
DDX39B-211ENST00000449757 IGHV4-59P01825 116 aa8.55□□□□□ -1.04
DDX39B-211ENST00000449757 KDELR2P33947 212 aa8.55□□□□□ -1.04
DDX39B-211ENST00000449757 NPY4RP50391 375 aa8.55□□□□□ -1.04
DDX39B-211ENST00000449757 LSM6P62312 80 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
DDX39B-211ENST00000449757 FHL1Q13642 323 aa8.55□□□□□ -1.04
DDX39B-211ENST00000449757 OR8G1Q15617 311 aa8.55□□□□□ -1.04
DDX39B-211ENST00000449757 KCNJ8Q15842 424 aa8.55□□□□□ -1.04
DDX39B-211ENST00000449757 C2orf68Q2NKX9 166 aa8.55□□□□□ -1.04
DDX39B-211ENST00000449757 ZBED5Q49AG3 693 aa8.55□□□□□ -1.04
DDX39B-211ENST00000449757 CD276Q5ZPR3 534 aa8.55□□□□□ -1.04
DDX39B-211ENST00000449757 DHRS7BQ6IAN0 325 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
DDX39B-211ENST00000449757 CORO6Q6QEF8 472 aa8.55□□□□□ -1.04
DDX39B-211ENST00000449757 TBPL2Q6SJ96 375 aa8.55□□□□□ -1.04
DDX39B-211ENST00000449757 VTCN1Q7Z7D3 282 aa8.55□□□□□ -1.04
DDX39B-211ENST00000449757 PNLDC1Q8NA58 520 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
DDX39B-211ENST00000449757 OR2T12Q8NG77 320 aa8.55□□□□□ -1.04
DDX39B-211ENST00000449757 LINC01006Q8NI28 216 aa8.55□□□□□ -1.04
DDX39B-211ENST00000449757 C10orf82Q8WW14 230 aa8.55□□□□□ -1.04
DDX39B-211ENST00000449757 SPRYD4Q8WW59 207 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
DDX39B-211ENST00000449757 ACOT11Q8WXI4 607 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
DDX39B-211ENST00000449757 DYRK2Q92630 601 aa8.55□□□□□ -1.04
DDX39B-211ENST00000449757 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
DDX39B-211ENST00000449757 WDFY2Q96P53 400 aa8.55□□□□□ -1.04
DDX39B-211ENST00000449757 COQ7Q99807 217 aa8.55□□□□□ -1.04
DDX39B-211ENST00000449757 ADAT1Q9BUB4 502 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
DDX39B-211ENST00000449757 HDHD2Q9H0R4 259 aa8.55□□□□□ -1.04
DDX39B-211ENST00000449757 PRDM13Q9H4Q3 707 aa8.55□□□□□ -1.04
DDX39B-211ENST00000449757 ACOXLQ9NUZ1 547 aa8.55□□□□□ -1.04
DDX39B-211ENST00000449757 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
DDX39B-211ENST00000449757 ARMCX1Q9P291 453 aa8.55□□□□□ -1.04
DDX39B-211ENST00000449757 CTSZQ9UBR2 303 aa8.55□□□□□ -1.04
DDX39B-211ENST00000449757 ATPIF1Q9UII2 106 aa8.55□□□□□ -1.04
DDX39B-211ENST00000449757 IGHV1-69DA0A0B4J2H0 117 aa8.54□□□□□ -1.04
DDX39B-211ENST00000449757 A0A0U1RQK1 487 aa8.54□□□□□ -1.04
DDX39B-211ENST00000449757 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa8.54□□□□□ -1.04
DDX39B-211ENST00000449757 hCG_1807616A0A1W2PRN6 198 aa8.54□□□□□ -1.04
DDX39B-211ENST00000449757 BTBD17A6NE02 478 aa8.54□□□□□ -1.04
DDX39B-211ENST00000449757 F5H5K5 113 aa8.54□□□□□ -1.04
DDX39B-211ENST00000449757 FXYD1O00168 92 aa8.54□□□□□ -1.04
DDX39B-211ENST00000449757 TNFRSF13BO14836 293 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
DDX39B-211ENST00000449757 AHCYL1O43865 530 aa8.54□□□□□ -1.04
DDX39B-211ENST00000449757 NDUFB2O95178 105 aa8.54□□□□□ -1.04
DDX39B-211ENST00000449757 IGHV1-69P01742 117 aa8.54□□□□□ -1.04
DDX39B-211ENST00000449757 SDHAP31040 664 aa8.54□□□□□ -1.04
DDX39B-211ENST00000449757 RPL15P61313 204 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
DDX39B-211ENST00000449757 SELENOWP63302 87 aa8.54□□□□□ -1.04
DDX39B-211ENST00000449757 MALLQ13021 153 aa8.54□□□□□ -1.04
DDX39B-211ENST00000449757 DNM1P34Q6PK57 102 aa8.54□□□□□ -1.04
DDX39B-211ENST00000449757 ZNF841Q6ZN19 808 aa8.54□□□□□ -1.04
DDX39B-211ENST00000449757 GDPGP1Q6ZNW5 385 aa8.54□□□□□ -1.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.6 ms