RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449058.6

TOM1-210, Transcript of target of myb1 membrane trafficking protein, human

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene TOM1, Length 2,389 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TOM1-210	ENST00000449058	WIF1	Q9Y5W5	379 aa		15.06	■□□□□ 0
TOM1-210	ENST00000449058	CPED1	A4D0V7	1026 aa		15.05	■□□□□ 0
TOM1-210	ENST00000449058	ZSCAN5B	A6NJL1	495 aa		15.05	■□□□□ 0
TOM1-210	ENST00000449058		K7ESF4	209 aa		15.05	■□□□□ 0
TOM1-210	ENST00000449058	EIF1AX	P47813	144 aa	Known RBP	15.05	■□□□□ 0
TOM1-210	ENST00000449058	UNC119	Q13432	240 aa		15.05	■□□□□ 0
TOM1-210	ENST00000449058	NAXD	Q8IW45	347 aa		15.05	■□□□□ 0
TOM1-210	ENST00000449058	BPIFB2	Q8N4F0	458 aa		15.05	■□□□□ 0
TOM1-210	ENST00000449058	OR1M1	Q8NGA1	313 aa		15.05	■□□□□ 0
TOM1-210	ENST00000449058	OR10G3	Q8NGC4	313 aa		15.05	■□□□□ 0
TOM1-210	ENST00000449058	OR52N4	Q8NGI2	321 aa		15.05	■□□□□ 0
TOM1-210	ENST00000449058	OR1J2	Q8NGS2	313 aa		15.05	■□□□□ 0
TOM1-210	ENST00000449058	OR13C8	Q8NGS7	320 aa		15.05	■□□□□ 0
TOM1-210	ENST00000449058	SLC6A7	Q99884	636 aa		15.05	■□□□□ 0
TOM1-210	ENST00000449058	UQCC2	Q9BRT2	126 aa		15.05	■□□□□ 0
TOM1-210	ENST00000449058	B3GNT4	Q9C0J1	378 aa		15.05	■□□□□ 0
TOM1-210	ENST00000449058	SDHAF3	Q9NRP4	125 aa		15.05	■□□□□ 0
TOM1-210	ENST00000449058	SLC2A8	Q9NY64	477 aa		15.05	■□□□□ 0
TOM1-210	ENST00000449058	SYT7	O43581	403 aa		15.05	■□□□□ -0
TOM1-210	ENST00000449058	ZFAND5	O76080	213 aa		15.05	■□□□□ -0
TOM1-210	ENST00000449058	BPNT1	O95861	308 aa		15.05	■□□□□ -0
TOM1-210	ENST00000449058	PGA4	P0DJD7	388 aa		15.05	■□□□□ -0
TOM1-210	ENST00000449058	PGA3	P0DJD8	388 aa		15.05	■□□□□ -0
TOM1-210	ENST00000449058	ZNF28	P17035	718 aa		15.05	■□□□□ -0
TOM1-210	ENST00000449058	CLDN6	P56747	220 aa		15.05	■□□□□ -0
TOM1-210	ENST00000449058	GMFB	P60983	142 aa		15.05	■□□□□ -0
TOM1-210	ENST00000449058	MEF2D	Q14814	521 aa		15.05	■□□□□ -0
TOM1-210	ENST00000449058	GUSBP11	Q6P575	273 aa		15.05	■□□□□ -0
TOM1-210	ENST00000449058	C11orf88	Q6PI97	169 aa		15.05	■□□□□ -0
TOM1-210	ENST00000449058	CFAP77	Q6ZQR2	320 aa		15.05	■□□□□ -0
TOM1-210	ENST00000449058	TMED4	Q7Z7H5	227 aa		15.05	■□□□□ -0
TOM1-210	ENST00000449058	ZNF584	Q8IVC4	421 aa		15.05	■□□□□ -0
TOM1-210	ENST00000449058	UEVLD	Q8IX04	471 aa		15.05	■□□□□ -0
TOM1-210	ENST00000449058	SLC22A24	Q8N4F4	322 aa		15.05	■□□□□ -0
TOM1-210	ENST00000449058	RBPMS	Q93062	196 aa	Known RBP	15.05	■□□□□ -0
TOM1-210	ENST00000449058	SPSB2	Q99619	263 aa		15.05	■□□□□ -0
TOM1-210	ENST00000449058	REG4	Q9BYZ8	158 aa		15.05	■□□□□ -0
TOM1-210	ENST00000449058	ARL6	Q9H0F7	186 aa		15.05	■□□□□ -0
TOM1-210	ENST00000449058	MED9	Q9NWA0	146 aa		15.05	■□□□□ -0
TOM1-210	ENST00000449058	RARRES3	Q9UL19	164 aa		15.05	■□□□□ -0
TOM1-210	ENST00000449058	LHFPL6	Q9Y693	200 aa		15.05	■□□□□ -0
TOM1-210	ENST00000449058	SDK1	Q7Z5N4	2213 aa		15.04	■□□□□ -0
TOM1-210	ENST00000449058	ASCC3	Q8N3C0	2202 aa	Known RBP	15.04	■□□□□ -0
TOM1-210	ENST00000449058	LY6G6E	A0A0G2JKS1	128 aa		15.04	■□□□□ -0
TOM1-210	ENST00000449058		A0A1W2PQM1	296 aa		15.04	■□□□□ -0
TOM1-210	ENST00000449058	OR14I1	A6ND48	311 aa		15.04	■□□□□ -0
TOM1-210	ENST00000449058	RPA2	P15927	270 aa		15.04	■□□□□ -0
TOM1-210	ENST00000449058	MPZ	P25189	248 aa		15.04	■□□□□ -0
TOM1-210	ENST00000449058	GNAL	P38405	381 aa		15.04	■□□□□ -0
TOM1-210	ENST00000449058	FAM69B	Q5VUD6	431 aa		15.04	■□□□□ -0
TOM1-210	ENST00000449058	NOXO1	Q8NFA2	376 aa		15.04	■□□□□ -0
TOM1-210	ENST00000449058	FAM46B	Q96A09	425 aa		15.04	■□□□□ -0
TOM1-210	ENST00000449058	METTL7A	Q9H8H3	244 aa		15.04	■□□□□ -0
TOM1-210	ENST00000449058	RDH8	Q9NYR8	311 aa		15.04	■□□□□ -0
TOM1-210	ENST00000449058		U3KQA8	63 aa		15.04	■□□□□ -0
TOM1-210	ENST00000449058		A0A1B0GTI1	187 aa		15.04	■□□□□ -0
TOM1-210	ENST00000449058	hCG_1807616	A0A1W2PRN6	198 aa		15.04	■□□□□ -0
TOM1-210	ENST00000449058	TRAF3IP2	O43734	574 aa	Predicted RBP	15.04	■□□□□ -0
TOM1-210	ENST00000449058	OR2J2	O76002	312 aa		15.04	■□□□□ -0
TOM1-210	ENST00000449058	NMB	P08949	121 aa		15.04	■□□□□ -0
TOM1-210	ENST00000449058	CLVS2	Q5SYC1	327 aa		15.04	■□□□□ -0
TOM1-210	ENST00000449058	C3orf33	Q6P1S2	294 aa		15.04	■□□□□ -0
TOM1-210	ENST00000449058	FJX1	Q86VR8	437 aa		15.04	■□□□□ -0
TOM1-210	ENST00000449058	OR2M3	Q8NG83	312 aa		15.04	■□□□□ -0
TOM1-210	ENST00000449058	OR4S1	Q8NGB4	309 aa		15.04	■□□□□ -0
TOM1-210	ENST00000449058	SCARB1	Q8WTV0	552 aa		15.04	■□□□□ -0
TOM1-210	ENST00000449058	CLDN23	Q96B33	292 aa		15.04	■□□□□ -0
TOM1-210	ENST00000449058	PTGES2	Q9H7Z7	377 aa		15.04	■□□□□ -0
TOM1-210	ENST00000449058	FBLN5	Q9UBX5	448 aa		15.04	■□□□□ -0
TOM1-210	ENST00000449058	RFPL4A	A6NLU0	287 aa		15.03	■□□□□ -0
TOM1-210	ENST00000449058	RFPL4AL1	F8VTS6	287 aa		15.03	■□□□□ -0
TOM1-210	ENST00000449058	DKK1	O94907	266 aa		15.03	■□□□□ -0
TOM1-210	ENST00000449058	VSIG8	P0DPA2	414 aa		15.03	■□□□□ -0
TOM1-210	ENST00000449058	CLRN1	P58418	232 aa		15.03	■□□□□ -0
TOM1-210	ENST00000449058	SORD	Q00796	357 aa		15.03	■□□□□ -0
TOM1-210	ENST00000449058	SRSF4	Q08170	494 aa	Known RBP	15.03	■□□□□ -0
TOM1-210	ENST00000449058	RGS7BP	Q6MZT1	257 aa	Predicted RBP	15.03	■□□□□ -0
TOM1-210	ENST00000449058	GSG1L	Q6UXU4	331 aa		15.03	■□□□□ -0
TOM1-210	ENST00000449058	NKD1	Q969G9	470 aa		15.03	■□□□□ -0
TOM1-210	ENST00000449058	FARSA	Q9Y285	508 aa	Known RBP	15.03	■□□□□ -0
TOM1-210	ENST00000449058	TRAV14DV4	A0A0A6YYC5	116 aa		15.03	■□□□□ -0
TOM1-210	ENST00000449058	IGHV5-10-1	A0A0J9YXX1	117 aa		15.03	■□□□□ -0
TOM1-210	ENST00000449058	DISC1	C4P0D8	188 aa		15.03	■□□□□ -0
TOM1-210	ENST00000449058	IGHG1	P01857	330 aa		15.03	■□□□□ -0
TOM1-210	ENST00000449058	EPHA8	P29322	1005 aa	Predicted RBP	15.03	■□□□□ -0
TOM1-210	ENST00000449058	CCL7	P80098	99 aa		15.03	■□□□□ -0
TOM1-210	ENST00000449058	DHRS2	Q13268	280 aa		15.03	■□□□□ -0
TOM1-210	ENST00000449058	INPP5J	Q15735	1006 aa	Predicted RBP	15.03	■□□□□ -0
TOM1-210	ENST00000449058	LCN10	Q6JVE6	187 aa		15.03	■□□□□ -0
TOM1-210	ENST00000449058	RHOU	Q7L0Q8	258 aa		15.03	■□□□□ -0
TOM1-210	ENST00000449058	TRAPPC6B	Q86SZ2	158 aa		15.03	■□□□□ -0
TOM1-210	ENST00000449058	OR5D14	Q8NGL3	314 aa		15.03	■□□□□ -0
TOM1-210	ENST00000449058	CMBL	Q96DG6	245 aa		15.03	■□□□□ -0
TOM1-210	ENST00000449058	CRB3	Q9BUF7	120 aa		15.03	■□□□□ -0
TOM1-210	ENST00000449058	MOB1A	Q9H8S9	216 aa		15.03	■□□□□ -0
TOM1-210	ENST00000449058	ZNF224	Q9NZL3	707 aa		15.03	■□□□□ -0
TOM1-210	ENST00000449058	SLC5A6	Q9Y289	635 aa		15.03	■□□□□ -0
TOM1-210	ENST00000449058	CACNA1E	Q15878	2313 aa		15.02	■□□□□ -0
TOM1-210	ENST00000449058	MFSD2B	A6NFX1	497 aa		15.02	■□□□□ -0
TOM1-210	ENST00000449058		B8ZZF3	427 aa		15.02	■□□□□ -0

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