RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000447609.5

LMO3-209, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LMO3, Length 3,365 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-209ENST00000447609 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
LMO3-209ENST00000447609 IL13RA1P78552 427 aa4.93□□□□□ -1.62
LMO3-209ENST00000447609 PLA2G2CQ5R387 149 aa4.93□□□□□ -1.62
LMO3-209ENST00000447609 DMRTA1Q5VZB9 504 aa4.93□□□□□ -1.62
LMO3-209ENST00000447609 STAC2Q6ZMT1 411 aa4.93□□□□□ -1.62
LMO3-209ENST00000447609 KMT5CQ86Y97 462 aa4.93□□□□□ -1.62
LMO3-209ENST00000447609 LFNGQ8NES3 379 aa4.93□□□□□ -1.62
LMO3-209ENST00000447609 OR5T3Q8NGG3 340 aa4.93□□□□□ -1.62
LMO3-209ENST00000447609 OR8S1Q8NH09 359 aa4.93□□□□□ -1.62
LMO3-209ENST00000447609 GPR148Q8TDV2 347 aa4.93□□□□□ -1.62
LMO3-209ENST00000447609 TMEM255BQ8WV15 326 aa4.93□□□□□ -1.62
LMO3-209ENST00000447609 GCDHQ92947 438 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
LMO3-209ENST00000447609 RAB24Q969Q5 203 aa4.93□□□□□ -1.62
LMO3-209ENST00000447609 F2RL3Q96RI0 385 aa4.93□□□□□ -1.62
LMO3-209ENST00000447609 CLCC1Q96S66 551 aa4.93□□□□□ -1.62
LMO3-209ENST00000447609 ZNF587Q96SQ5 575 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
LMO3-209ENST00000447609 ZNF559Q9BR84 538 aa4.93□□□□□ -1.62
LMO3-209ENST00000447609 NMES1Q9C002 83 aa4.93□□□□□ -1.62
LMO3-209ENST00000447609 ZNF337Q9Y3M9 751 aa4.93□□□□□ -1.62
LMO3-209ENST00000447609 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
LMO3-209ENST00000447609 IGHV5-51A0A0C4DH38 117 aa4.92□□□□□ -1.62
LMO3-209ENST00000447609 STMND1H3BQB6 276 aa4.92□□□□□ -1.62
LMO3-209ENST00000447609 TCAPO15273 167 aa4.92□□□□□ -1.62
LMO3-209ENST00000447609 PLGP00747 810 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
LMO3-209ENST00000447609 HOXB5P09067 269 aa4.92□□□□□ -1.62
LMO3-209ENST00000447609 SPARCP09486 303 aa4.92□□□□□ -1.62
LMO3-209ENST00000447609 HOXA5P20719 270 aa4.92□□□□□ -1.62
LMO3-209ENST00000447609 NFYBP25208 207 aa4.92□□□□□ -1.62
LMO3-209ENST00000447609 BSGP35613 385 aa4.92□□□□□ -1.62
LMO3-209ENST00000447609 AQP2P41181 271 aa4.92□□□□□ -1.62
LMO3-209ENST00000447609 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa4.92□□□□□ -1.62
LMO3-209ENST00000447609 C2orf68Q2NKX9 166 aa4.92□□□□□ -1.62
LMO3-209ENST00000447609 SCGB2B2Q4G0G5 96 aa4.92□□□□□ -1.62
LMO3-209ENST00000447609 BEX5Q5H9J7 111 aa4.92□□□□□ -1.62
LMO3-209ENST00000447609 OR4C11Q6IEV9 310 aa4.92□□□□□ -1.62
LMO3-209ENST00000447609 ADAM5Q6NVV9 412 aa4.92□□□□□ -1.62
LMO3-209ENST00000447609 VRK2Q86Y07 508 aa4.92□□□□□ -1.62
LMO3-209ENST00000447609 ZNF676Q8N7Q3 588 aa4.92□□□□□ -1.62
LMO3-209ENST00000447609 ZNF383Q8NA42 475 aa4.92□□□□□ -1.62
LMO3-209ENST00000447609 NUP43Q8NFH3 380 aa4.92□□□□□ -1.62
LMO3-209ENST00000447609 NOL4LQ96MY1 436 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
LMO3-209ENST00000447609 C2orf88Q9BSF0 95 aa4.92□□□□□ -1.62
LMO3-209ENST00000447609 SMDT1Q9H4I9 107 aa4.92□□□□□ -1.62
LMO3-209ENST00000447609 KCNJ16Q9NPI9 418 aa4.92□□□□□ -1.62
LMO3-209ENST00000447609 PRTFDC1Q9NRG1 225 aa4.92□□□□□ -1.62
LMO3-209ENST00000447609 COPS7AQ9UBW8 275 aa4.92□□□□□ -1.62
LMO3-209ENST00000447609 IL20RAQ9UHF4 553 aa4.92□□□□□ -1.62
LMO3-209ENST00000447609 PCYT1BQ9Y5K3 369 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
LMO3-209ENST00000447609 TMEM14AQ9Y6G1 99 aa4.92□□□□□ -1.62
LMO3-209ENST00000447609 SPTA1P02549 2419 aa4.92□□□□□ -1.62
LMO3-209ENST00000447609 RP1P56715 2156 aa4.92□□□□□ -1.62
LMO3-209ENST00000447609 DOCK9Q9BZ29 2069 aa4.92□□□□□ -1.62
LMO3-209ENST00000447609 A0A087X0M5 115 aa4.92□□□□□ -1.62
LMO3-209ENST00000447609 A0A0B4J2A0 478 aa4.92□□□□□ -1.62
LMO3-209ENST00000447609 TMEM272A0A1B0GTI8 110 aa4.92□□□□□ -1.62
LMO3-209ENST00000447609 A0A1B0GX30 115 aa4.92□□□□□ -1.62
LMO3-209ENST00000447609 CDC14CA4D256 554 aa4.92□□□□□ -1.62
LMO3-209ENST00000447609 MEGF11A6BM72 1044 aa4.92□□□□□ -1.62
LMO3-209ENST00000447609 OR6C76A6NM76 312 aa4.92□□□□□ -1.62
LMO3-209ENST00000447609 TMEM212A6NML5 194 aa4.92□□□□□ -1.62
LMO3-209ENST00000447609 ZNF587BE7ETH6 402 aa4.92□□□□□ -1.62
LMO3-209ENST00000447609 CLEC3AO75596 197 aa4.92□□□□□ -1.62
LMO3-209ENST00000447609 STK17BO94768 372 aa4.92□□□□□ -1.62
LMO3-209ENST00000447609 NDUFB2O95178 105 aa4.92□□□□□ -1.62
LMO3-209ENST00000447609 PPP1R3DO95685 299 aa4.92□□□□□ -1.62
LMO3-209ENST00000447609 WNT11O96014 354 aa4.92□□□□□ -1.62
LMO3-209ENST00000447609 CD3DP04234 171 aa4.92□□□□□ -1.62
LMO3-209ENST00000447609 HKR1P10072 659 aa4.92□□□□□ -1.62
LMO3-209ENST00000447609 SELLP14151 372 aa4.92□□□□□ -1.62
LMO3-209ENST00000447609 PGAM2P15259 253 aa4.92□□□□□ -1.62
LMO3-209ENST00000447609 CD46P15529 392 aa4.92□□□□□ -1.62
LMO3-209ENST00000447609 MUC1P15941 1255 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
LMO3-209ENST00000447609 PNLIPP16233 465 aa4.92□□□□□ -1.62
LMO3-209ENST00000447609 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
LMO3-209ENST00000447609 TBXA2RP21731 343 aa4.92□□□□□ -1.62
LMO3-209ENST00000447609 SLC2A5P22732 501 aa4.92□□□□□ -1.62
LMO3-209ENST00000447609 ACP1P24666 158 aa4.92□□□□□ -1.62
LMO3-209ENST00000447609 CHATP28329 748 aa4.92□□□□□ -1.62
LMO3-209ENST00000447609 HTR2CP28335 458 aa4.92□□□□□ -1.62
LMO3-209ENST00000447609 CD1CP29017 333 aa4.92□□□□□ -1.62
LMO3-209ENST00000447609 DDTP30046 118 aa4.92□□□□□ -1.62
LMO3-209ENST00000447609 CD80P33681 288 aa4.92□□□□□ -1.62
LMO3-209ENST00000447609 DIO1P49895 249 aa4.92□□□□□ -1.62
LMO3-209ENST00000447609 ATP1B3P54709 279 aa4.92□□□□□ -1.62
LMO3-209ENST00000447609 PPP1CAP62136 330 aa4.92□□□□□ -1.62
LMO3-209ENST00000447609 ID2Q02363 134 aa4.92□□□□□ -1.62
LMO3-209ENST00000447609 RSU1Q15404 277 aa4.92□□□□□ -1.62
LMO3-209ENST00000447609 SGCAQ16586 387 aa4.92□□□□□ -1.62
LMO3-209ENST00000447609 LY6G6FQ5SQ64 297 aa4.92□□□□□ -1.62
LMO3-209ENST00000447609 LIPNQ5VXI9 398 aa4.92□□□□□ -1.62
LMO3-209ENST00000447609 SLC22A25Q6T423 547 aa4.92□□□□□ -1.62
LMO3-209ENST00000447609 DPPA2Q7Z7J5 298 aa4.92□□□□□ -1.62
LMO3-209ENST00000447609 SYT9Q86SS6 491 aa4.92□□□□□ -1.62
LMO3-209ENST00000447609 SLC25A42Q86VD7 318 aa4.92□□□□□ -1.62
LMO3-209ENST00000447609 MITD1Q8WV92 249 aa4.92□□□□□ -1.62
LMO3-209ENST00000447609 EDARADDQ8WWZ3 215 aa4.92□□□□□ -1.62
LMO3-209ENST00000447609 SMIM8Q96KF7 97 aa4.92□□□□□ -1.62
LMO3-209ENST00000447609 GAL3ST4Q96RP7 486 aa4.92□□□□□ -1.62
LMO3-209ENST00000447609 TMEM231Q9H6L2 316 aa4.92□□□□□ -1.62
LMO3-209ENST00000447609 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33 ms