RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000446904.5

SH3BP4-206, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP4, Length 829 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-206ENST00000446904 SLC27A4Q6P1M0 643 aa8.64□□□□□ -1.03
SH3BP4-206ENST00000446904 LEG1Q6P5S2 330 aa8.64□□□□□ -1.03
SH3BP4-206ENST00000446904 DNM1P34Q6PK57 102 aa8.64□□□□□ -1.03
SH3BP4-206ENST00000446904 SMARCD3Q6STE5 483 aa8.64□□□□□ -1.03
SH3BP4-206ENST00000446904 HIST2H3AQ71DI3 136 aa8.64□□□□□ -1.03
SH3BP4-206ENST00000446904 DOK3Q7L591 496 aa8.64□□□□□ -1.03
SH3BP4-206ENST00000446904 MOGAT3Q86VF5 341 aa8.64□□□□□ -1.03
SH3BP4-206ENST00000446904 LINC00346Q8IVM7 164 aa8.64□□□□□ -1.03
SH3BP4-206ENST00000446904 MUC20Q8N307 709 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
SH3BP4-206ENST00000446904 RNF148Q8N7C7 305 aa8.64□□□□□ -1.03
SH3BP4-206ENST00000446904 GJC3Q8NFK1 279 aa8.64□□□□□ -1.03
SH3BP4-206ENST00000446904 FANK1Q8TC84 345 aa8.64□□□□□ -1.03
SH3BP4-206ENST00000446904 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
SH3BP4-206ENST00000446904 ERMAPQ96PL5 475 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
SH3BP4-206ENST00000446904 NMNAT3Q96T66 252 aa8.64□□□□□ -1.03
SH3BP4-206ENST00000446904 COQ7Q99807 217 aa8.64□□□□□ -1.03
SH3BP4-206ENST00000446904 FUZQ9BT04 418 aa8.64□□□□□ -1.03
SH3BP4-206ENST00000446904 HDHD2Q9H0R4 259 aa8.64□□□□□ -1.03
SH3BP4-206ENST00000446904 TMEM165Q9HC07 324 aa8.64□□□□□ -1.03
SH3BP4-206ENST00000446904 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
SH3BP4-206ENST00000446904 DCAF13Q9NV06 445 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
SH3BP4-206ENST00000446904 ABCD2Q9UBJ2 740 aa8.64□□□□□ -1.03
SH3BP4-206ENST00000446904 ATPIF1Q9UII2 106 aa8.64□□□□□ -1.03
SH3BP4-206ENST00000446904 B9D1Q9UPM9 204 aa8.64□□□□□ -1.03
SH3BP4-206ENST00000446904 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
SH3BP4-206ENST00000446904 LRRC30A6NM36 301 aa8.63□□□□□ -1.03
SH3BP4-206ENST00000446904 IQCF6A8MYZ5 107 aa8.63□□□□□ -1.03
SH3BP4-206ENST00000446904 IFNL4K9M1U5 179 aa8.63□□□□□ -1.03
SH3BP4-206ENST00000446904 MLNRO43193 412 aa8.63□□□□□ -1.03
SH3BP4-206ENST00000446904 GMNNO75496 209 aa8.63□□□□□ -1.03
SH3BP4-206ENST00000446904 HLA-DPB1P04440 258 aa8.63□□□□□ -1.03
SH3BP4-206ENST00000446904 WNT2P09544 360 aa8.63□□□□□ -1.03
SH3BP4-206ENST00000446904 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa8.63□□□□□ -1.03
SH3BP4-206ENST00000446904 HKR1P10072 659 aa8.63□□□□□ -1.03
SH3BP4-206ENST00000446904 PRTN3P24158 256 aa8.63□□□□□ -1.03
SH3BP4-206ENST00000446904 MDH1P40925 334 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
SH3BP4-206ENST00000446904 PMELP40967 661 aa8.63□□□□□ -1.03
SH3BP4-206ENST00000446904 COX10Q12887 443 aa8.63□□□□□ -1.03
SH3BP4-206ENST00000446904 FOXL1Q12952 345 aa8.63□□□□□ -1.03
SH3BP4-206ENST00000446904 KRT72Q14CN4 511 aa8.63□□□□□ -1.03
SH3BP4-206ENST00000446904 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
SH3BP4-206ENST00000446904 HSP90B2PQ58FF3 399 aa8.63□□□□□ -1.03
SH3BP4-206ENST00000446904 FAM201AQ5SY85 155 aa8.63□□□□□ -1.03
SH3BP4-206ENST00000446904 SLC18B1Q6NT16 456 aa8.63□□□□□ -1.03
SH3BP4-206ENST00000446904 CFAP77Q6ZQR2 320 aa8.63□□□□□ -1.03
SH3BP4-206ENST00000446904 JAZF1Q86VZ6 243 aa8.63□□□□□ -1.03
SH3BP4-206ENST00000446904 KLBQ86Z14 1044 aa8.63□□□□□ -1.03
SH3BP4-206ENST00000446904 OR6V1Q8N148 313 aa8.63□□□□□ -1.03
SH3BP4-206ENST00000446904 SLC26A10Q8NG04 563 aa8.63□□□□□ -1.03
SH3BP4-206ENST00000446904 OR4K13Q8NH42 304 aa8.63□□□□□ -1.03
SH3BP4-206ENST00000446904 DHRS1Q96LJ7 313 aa8.63□□□□□ -1.03
SH3BP4-206ENST00000446904 C1orf147Q96MC9 270 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
SH3BP4-206ENST00000446904 PITX2Q99697 317 aa8.63□□□□□ -1.03
SH3BP4-206ENST00000446904 SLC30A2Q9BRI3 323 aa8.63□□□□□ -1.03
SH3BP4-206ENST00000446904 IFT27Q9BW83 186 aa8.63□□□□□ -1.03
SH3BP4-206ENST00000446904 SSBP3Q9BWW4 388 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
SH3BP4-206ENST00000446904 HCAR1Q9BXC0 346 aa8.63□□□□□ -1.03
SH3BP4-206ENST00000446904 SPAG4Q9NPE6 437 aa8.63□□□□□ -1.03
SH3BP4-206ENST00000446904 KRCC1Q9NPI7 259 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
SH3BP4-206ENST00000446904 RPRD1BQ9NQG5 326 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
SH3BP4-206ENST00000446904 ADA2Q9NZK5 511 aa8.63□□□□□ -1.03
SH3BP4-206ENST00000446904 SAMD4AQ9UPU9 718 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
SH3BP4-206ENST00000446904 LRCH1Q9Y2L9 728 aa8.63□□□□□ -1.03
SH3BP4-206ENST00000446904 CMYA5Q8N3K9 4069 aa8.63□□□□□ -1.03
SH3BP4-206ENST00000446904 F5H5K5 113 aa8.62□□□□□ -1.03
SH3BP4-206ENST00000446904 WIPF1O43516 503 aa8.62□□□□□ -1.03
SH3BP4-206ENST00000446904 RENP00797 406 aa8.62□□□□□ -1.03
SH3BP4-206ENST00000446904 HIST1H1CP16403 213 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
SH3BP4-206ENST00000446904 SLC6A6P31641 620 aa8.62□□□□□ -1.03
SH3BP4-206ENST00000446904 SPIBQ01892 262 aa8.62□□□□□ -1.03
SH3BP4-206ENST00000446904 PAX2Q02962 417 aa8.62□□□□□ -1.03
SH3BP4-206ENST00000446904 GK2Q14410 553 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
SH3BP4-206ENST00000446904 RFX4Q33E94 735 aa8.62□□□□□ -1.03
SH3BP4-206ENST00000446904 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa8.62□□□□□ -1.03
SH3BP4-206ENST00000446904 PGM2L1Q6PCE3 622 aa8.62□□□□□ -1.03
SH3BP4-206ENST00000446904 BTNL3Q6UXE8 466 aa8.62□□□□□ -1.03
SH3BP4-206ENST00000446904 LRRN1Q6UXK5 716 aa8.62□□□□□ -1.03
SH3BP4-206ENST00000446904 PARP8Q8N3A8 854 aa8.62□□□□□ -1.03
SH3BP4-206ENST00000446904 OR52E2Q8NGJ4 325 aa8.62□□□□□ -1.03
SH3BP4-206ENST00000446904 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP8.62□□□□□ -1.034e-9■■■■■ 29.9
SH3BP4-206ENST00000446904 CMTM5Q96DZ9 223 aa8.62□□□□□ -1.03
SH3BP4-206ENST00000446904 TMEM246Q9BRR3 403 aa8.62□□□□□ -1.03
SH3BP4-206ENST00000446904 ZNF747Q9BV97 191 aa8.62□□□□□ -1.03
SH3BP4-206ENST00000446904 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
SH3BP4-206ENST00000446904 OR52D1Q9H346 318 aa8.62□□□□□ -1.03
SH3BP4-206ENST00000446904 FN3KQ9H479 309 aa8.62□□□□□ -1.03
SH3BP4-206ENST00000446904 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
SH3BP4-206ENST00000446904 TMEM100Q9NV29 134 aa8.62□□□□□ -1.03
SH3BP4-206ENST00000446904 MIOXQ9UGB7 285 aa8.62□□□□□ -1.03
SH3BP4-206ENST00000446904 IGHV2-70DA0A0C4DH43 119 aa8.61□□□□□ -1.03
SH3BP4-206ENST00000446904 OR6C68A6NDL8 312 aa8.61□□□□□ -1.03
SH3BP4-206ENST00000446904 ARPC3O15145 178 aa8.61□□□□□ -1.03
SH3BP4-206ENST00000446904 TMPRSS2O15393 492 aa8.61□□□□□ -1.03
SH3BP4-206ENST00000446904 OR10H3O60404 316 aa8.61□□□□□ -1.03
SH3BP4-206ENST00000446904 GADD45GO95257 159 aa8.61□□□□□ -1.03
SH3BP4-206ENST00000446904 LCATP04180 440 aa8.61□□□□□ -1.03
SH3BP4-206ENST00000446904 SEMG1P04279 462 aa8.61□□□□□ -1.03
SH3BP4-206ENST00000446904 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
SH3BP4-206ENST00000446904 ACSM4P0C7M7 580 aa8.61□□□□□ -1.03
SH3BP4-206ENST00000446904 FPR3P25089 353 aa8.61□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.7 ms