RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000445241.5

PTPA-222, Transcript of protein phosphatase 2 phosphatase activator, human

TSL 3

Gene PTPA, Length 949 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPA-222	ENST00000445241	SLC16A9	Q7RTY1	509 aa		12.53	□□□□□ -0.4
PTPA-222	ENST00000445241	DPY19L4	Q7Z388	723 aa		12.53	□□□□□ -0.4
PTPA-222	ENST00000445241	TCEANC	Q8N8B7	351 aa		12.53	□□□□□ -0.4
PTPA-222	ENST00000445241	BBS1	Q8NFJ9	593 aa		12.53	□□□□□ -0.4
PTPA-222	ENST00000445241	OR10S1	Q8NGN2	331 aa		12.53	□□□□□ -0.4
PTPA-222	ENST00000445241	RNF133	Q8WVZ7	376 aa		12.53	□□□□□ -0.4
PTPA-222	ENST00000445241	SLAMF6	Q96DU3	332 aa		12.53	□□□□□ -0.4
PTPA-222	ENST00000445241	ZMYND19	Q96E35	227 aa	Predicted RBP	12.53	□□□□□ -0.4
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF799	Q96GE5	643 aa		12.53	□□□□□ -0.4
PTPA-222	ENST00000445241		Q96MF0	132 aa		12.53	□□□□□ -0.4
PTPA-222	ENST00000445241	SORCS2	Q96PQ0	1159 aa		12.53	□□□□□ -0.4
PTPA-222	ENST00000445241	VRK1	Q99986	396 aa	Predicted RBP	12.53	□□□□□ -0.4
PTPA-222	ENST00000445241	COPS4	Q9BT78	406 aa		12.53	□□□□□ -0.4
PTPA-222	ENST00000445241	OR51B6	Q9H340	312 aa		12.53	□□□□□ -0.4
PTPA-222	ENST00000445241	SP140L	Q9H930	580 aa		12.53	□□□□□ -0.4
PTPA-222	ENST00000445241	DLL4	Q9NR61	685 aa		12.53	□□□□□ -0.4
PTPA-222	ENST00000445241	TAAR3P	Q9P1P4	343 aa		12.53	□□□□□ -0.4
PTPA-222	ENST00000445241	TMEM14A	Q9Y6G1	99 aa		12.53	□□□□□ -0.4
PTPA-222	ENST00000445241	PLSCR5	A0PG75	271 aa		12.52	□□□□□ -0.41
PTPA-222	ENST00000445241	C17orf100	A8MU93	164 aa		12.52	□□□□□ -0.41
PTPA-222	ENST00000445241	NDUFS7	O75251	213 aa		12.52	□□□□□ -0.41
PTPA-222	ENST00000445241	BAG2	O95816	211 aa		12.52	□□□□□ -0.41
PTPA-222	ENST00000445241	ADH4	P08319	380 aa		12.52	□□□□□ -0.41
PTPA-222	ENST00000445241	DBH	P09172	617 aa		12.52	□□□□□ -0.41
PTPA-222	ENST00000445241	CD99	P14209	185 aa		12.52	□□□□□ -0.41
PTPA-222	ENST00000445241	DBP	Q10586	325 aa	Predicted RBP	12.52	□□□□□ -0.41
PTPA-222	ENST00000445241	POU4F2	Q12837	409 aa		12.52	□□□□□ -0.41
PTPA-222	ENST00000445241	TAF13	Q15543	124 aa		12.52	□□□□□ -0.41
PTPA-222	ENST00000445241	DEGS2	Q6QHC5	323 aa		12.52	□□□□□ -0.41
PTPA-222	ENST00000445241	LRP11	Q86VZ4	500 aa		12.52	□□□□□ -0.41
PTPA-222	ENST00000445241	PACRGL	Q8N7B6	248 aa		12.52	□□□□□ -0.41
PTPA-222	ENST00000445241	SLC7A6	Q92536	515 aa		12.52	□□□□□ -0.41
PTPA-222	ENST00000445241	RFK	Q969G6	155 aa		12.52	□□□□□ -0.41
PTPA-222	ENST00000445241	HAVCR1	Q96D42	359 aa		12.52	□□□□□ -0.41
PTPA-222	ENST00000445241	DIRC2	Q96SL1	478 aa		12.52	□□□□□ -0.41
PTPA-222	ENST00000445241	KCNJ15	Q99712	375 aa		12.52	□□□□□ -0.41
PTPA-222	ENST00000445241	RHNO1	Q9BSD3	238 aa		12.52	□□□□□ -0.41
PTPA-222	ENST00000445241	ABHD6	Q9BV23	337 aa		12.52	□□□□□ -0.41
PTPA-222	ENST00000445241	OPA3	Q9H6K4	179 aa		12.52	□□□□□ -0.41
PTPA-222	ENST00000445241	NIPAL2	Q9H841	368 aa		12.52	□□□□□ -0.41
PTPA-222	ENST00000445241	MYEF2	Q9P2K5	600 aa	Known RBP	12.52	□□□□□ -0.41
PTPA-222	ENST00000445241	AKAP9	Q99996	3911 aa		12.52	□□□□□ -0.41
PTPA-222	ENST00000445241	LOC390937	A0A1W2PQ73	354 aa		12.51	□□□□□ -0.41
PTPA-222	ENST00000445241	CCDC182	A6NF36	153 aa		12.51	□□□□□ -0.41
PTPA-222	ENST00000445241		F5H5K5	113 aa		12.51	□□□□□ -0.41
PTPA-222	ENST00000445241	PHYH	O14832	338 aa		12.51	□□□□□ -0.41
PTPA-222	ENST00000445241	SSX4	O60224	188 aa		12.51	□□□□□ -0.41
PTPA-222	ENST00000445241	CLPTM1	O96005	669 aa		12.51	□□□□□ -0.41
PTPA-222	ENST00000445241	LYN	P07948	512 aa		12.51	□□□□□ -0.41
PTPA-222	ENST00000445241	PSKH1	P11801	424 aa		12.51	□□□□□ -0.41
PTPA-222	ENST00000445241	ANPEP	P15144	967 aa		12.51	□□□□□ -0.41
PTPA-222	ENST00000445241	SLC25A16	P16260	332 aa		12.51	□□□□□ -0.41
PTPA-222	ENST00000445241	SELE	P16581	610 aa		12.51	□□□□□ -0.41
PTPA-222	ENST00000445241	POLR2I	P36954	125 aa	Known RBP	12.51	□□□□□ -0.41
PTPA-222	ENST00000445241	OPRL1	P41146	370 aa		12.51	□□□□□ -0.41
PTPA-222	ENST00000445241	RPS27	P42677	84 aa	Known RBP	12.51	□□□□□ -0.41
PTPA-222	ENST00000445241	ALDH3B1	P43353	468 aa		12.51	□□□□□ -0.41
PTPA-222	ENST00000445241	PDLIM4	P50479	330 aa		12.51	□□□□□ -0.41
PTPA-222	ENST00000445241	MMP15	P51511	669 aa		12.51	□□□□□ -0.41
PTPA-222	ENST00000445241	MALL	Q13021	153 aa		12.51	□□□□□ -0.41
PTPA-222	ENST00000445241	PSG7	Q13046	419 aa		12.51	□□□□□ -0.41
PTPA-222	ENST00000445241	TMEM154	Q6P9G4	183 aa		12.51	□□□□□ -0.41
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF540	Q8NDQ6	660 aa		12.51	□□□□□ -0.41
PTPA-222	ENST00000445241	ASB17	Q8WXJ9	295 aa		12.51	□□□□□ -0.41
PTPA-222	ENST00000445241	ITFG2	Q969R8	447 aa		12.51	□□□□□ -0.41
PTPA-222	ENST00000445241	DCLRE1B	Q9H816	532 aa		12.51	□□□□□ -0.41
PTPA-222	ENST00000445241	IMPAD1	Q9NX62	359 aa		12.51	□□□□□ -0.41
PTPA-222	ENST00000445241	WARS2	Q9UGM6	360 aa	Known RBP	12.51	□□□□□ -0.41
PTPA-222	ENST00000445241	ZDHHC8	Q9ULC8	765 aa		12.51	□□□□□ -0.41
PTPA-222	ENST00000445241	FZR1	Q9UM11	496 aa		12.51	□□□□□ -0.41
PTPA-222	ENST00000445241	STARD10	Q9Y365	291 aa		12.51	□□□□□ -0.41
PTPA-222	ENST00000445241	SNTN	A6NMZ2	147 aa		12.5	□□□□□ -0.41
PTPA-222	ENST00000445241	MPZL2	O60487	215 aa		12.5	□□□□□ -0.41
PTPA-222	ENST00000445241	SELENOF	O60613	162 aa		12.5	□□□□□ -0.41
PTPA-222	ENST00000445241	ALOX5AP	P20292	161 aa		12.5	□□□□□ -0.41
PTPA-222	ENST00000445241	HTR1F	P30939	366 aa		12.5	□□□□□ -0.41
PTPA-222	ENST00000445241	MPV17	P39210	176 aa		12.5	□□□□□ -0.41
PTPA-222	ENST00000445241	SNRPG	P62308	76 aa	Known RBP	12.5	□□□□□ -0.41
PTPA-222	ENST00000445241	RCN1	Q15293	331 aa		12.5	□□□□□ -0.41
PTPA-222	ENST00000445241	SPATA46	Q5T0L3	261 aa		12.5	□□□□□ -0.41
PTPA-222	ENST00000445241	MEDAG	Q5VYS4	303 aa		12.5	□□□□□ -0.41
PTPA-222	ENST00000445241	KCTD18	Q6PI47	426 aa	Predicted RBP	12.5	□□□□□ -0.41
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF786	Q8N393	782 aa		12.5	□□□□□ -0.41
PTPA-222	ENST00000445241	FAM168A	Q92567	244 aa		12.5	□□□□□ -0.41
PTPA-222	ENST00000445241	CMBL	Q96DG6	245 aa		12.5	□□□□□ -0.41
PTPA-222	ENST00000445241	C18orf12	Q96KH6	178 aa		12.5	□□□□□ -0.41
PTPA-222	ENST00000445241	COX4I2	Q96KJ9	171 aa		12.5	□□□□□ -0.41
PTPA-222	ENST00000445241	IL4I1	Q96RQ9	567 aa		12.5	□□□□□ -0.41
PTPA-222	ENST00000445241	CNN2	Q99439	309 aa	Known RBP	12.5	□□□□□ -0.41
PTPA-222	ENST00000445241	SLC29A1	Q99808	456 aa		12.5	□□□□□ -0.41
PTPA-222	ENST00000445241	CENPM	Q9NSP4	180 aa		12.5	□□□□□ -0.41
PTPA-222	ENST00000445241	LAMP5	Q9UJQ1	280 aa		12.5	□□□□□ -0.41
PTPA-222	ENST00000445241	PURG	Q9UJV8	347 aa	Known RBP	12.5	□□□□□ -0.41
PTPA-222	ENST00000445241	CASQ2	O14958	399 aa	Predicted RBP	12.49	□□□□□ -0.41
PTPA-222	ENST00000445241	SLC16A6	O15403	523 aa		12.49	□□□□□ -0.41
PTPA-222	ENST00000445241	XRCC2	O43543	280 aa		12.49	□□□□□ -0.41
PTPA-222	ENST00000445241	TIMM8A	O60220	97 aa	Predicted RBP	12.49	□□□□□ -0.41
PTPA-222	ENST00000445241	LCAT	P04180	440 aa		12.49	□□□□□ -0.41
PTPA-222	ENST00000445241	CD55	P08174	381 aa		12.49	□□□□□ -0.41
PTPA-222	ENST00000445241	GIF	P27352	417 aa		12.49	□□□□□ -0.41

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