RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000435991.2

TRAPPC13P1-201, Transcript of trafficking protein particle complex 13 pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene TRAPPC13P1, Length 1,062 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ASCL4Q6XD76 172 aa3.5□□□□□ -1.85
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 TGIF2LYQ8IUE0 185 aa3.5□□□□□ -1.85
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 CBLN2Q8IUK8 224 aa3.5□□□□□ -1.85
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 SUMF2Q8NBJ7 301 aa3.5□□□□□ -1.85
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 NOXO1Q8NFA2 376 aa3.5□□□□□ -1.85
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 OR10Z1Q8NGY1 313 aa3.5□□□□□ -1.85
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 FAM210BQ96KR6 192 aa3.5□□□□□ -1.85
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 PRR34Q9NV39 138 aa3.5□□□□□ -1.85
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa3.5□□□□□ -1.85
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 MRPS18BQ9Y676 258 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 GTF3C1Q12789 2109 aa3.49□□□□□ -1.85
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ADAMTS9Q9P2N4 1935 aa3.49□□□□□ -1.85
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 NKX2-6A6NCS4 301 aa3.49□□□□□ -1.85
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 FAM166BA8MTA8 275 aa3.49□□□□□ -1.85
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ANKRD65E5RJM6 399 aa3.49□□□□□ -1.85
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 K7EMT4 169 aa3.49□□□□□ -1.85
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 LAD1O00515 517 aa3.49□□□□□ -1.85
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 SMC2O95347 1197 aa3.49□□□□□ -1.85
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 INSP01308 110 aa3.49□□□□□ -1.85
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 CATP04040 527 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ZNF30P17039 623 aa3.49□□□□□ -1.85
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 PSMC3P17980 439 aa3.49□□□□□ -1.85
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 FUT3P21217 361 aa3.49□□□□□ -1.85
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 CNR1P21554 472 aa3.49□□□□□ -1.85
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 USF1P22415 310 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 MAS1LP35410 378 aa3.49□□□□□ -1.85
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 CDKN2BP42772 138 aa3.49□□□□□ -1.85
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 KCNJ3P48549 501 aa3.49□□□□□ -1.85
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 NMUP48645 174 aa3.49□□□□□ -1.85
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 RND2P52198 227 aa3.49□□□□□ -1.85
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 WNT4P56705 351 aa3.49□□□□□ -1.85
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 UBE2NP61088 152 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 SLC39A6Q13433 755 aa3.49□□□□□ -1.85
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 IL17AQ16552 155 aa3.49□□□□□ -1.85
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ERICH5Q6P6B1 374 aa3.49□□□□□ -1.85
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 C12orf54Q6X4T0 127 aa3.49□□□□□ -1.85
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ACP7Q6ZNF0 438 aa3.49□□□□□ -1.85
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 LINC00173Q6ZV60 143 aa3.49□□□□□ -1.85
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 SYS1Q8N2H4 156 aa3.49□□□□□ -1.85
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 NPWQ8N729 165 aa3.49□□□□□ -1.85
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 LINC01555Q8NAE3 123 aa3.49□□□□□ -1.85
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 UBAC2Q8NBM4 344 aa3.49□□□□□ -1.85
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 OR10G4Q8NGN3 311 aa3.49□□□□□ -1.85
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 OR6K2Q8NGY2 324 aa3.49□□□□□ -1.85
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 TMIGD2Q96BF3 282 aa3.49□□□□□ -1.85
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 CENPNQ96H22 339 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa3.49□□□□□ -1.85
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ULBP2Q9BZM5 246 aa3.49□□□□□ -1.85
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 SYT4Q9H2B2 425 aa3.49□□□□□ -1.85
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 OR52A5Q9H2C5 316 aa3.49□□□□□ -1.85
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 SLCO1B3Q9NPD5 702 aa3.49□□□□□ -1.85
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 MED4Q9NPJ6 270 aa3.49□□□□□ -1.85
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 GGA2Q9UJY4 613 aa3.49□□□□□ -1.85
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 CFL2Q9Y281 166 aa3.49□□□□□ -1.85
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 V9GYY9 64 aa3.49□□□□□ -1.85
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 SCN2AQ99250 2005 aa3.49□□□□□ -1.85
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 CARMIL3Q8ND23 1372 aa3.49□□□□□ -1.85
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 WDR62O43379 1518 aa3.49□□□□□ -1.85
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa3.48□□□□□ -1.85
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 CIB4A0PJX0 185 aa3.48□□□□□ -1.85
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 NCBP2LA6PVI3 153 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 CETN3O15182 167 aa3.48□□□□□ -1.85
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 GMDSO60547 372 aa3.48□□□□□ -1.85
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 RDH16O75452 317 aa3.48□□□□□ -1.85
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 PTHP01270 115 aa3.48□□□□□ -1.85
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 GNAO1P09471 354 aa3.48□□□□□ -1.85
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 KLK2P20151 261 aa3.48□□□□□ -1.85
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 HTR2CP28335 458 aa3.48□□□□□ -1.85
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ARL2P36404 184 aa3.48□□□□□ -1.85
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 NUDT1P36639 197 aa3.48□□□□□ -1.85
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 RBMXP38159 391 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 DNASE1L1P49184 302 aa3.48□□□□□ -1.85
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 RAB7AP51149 207 aa3.48□□□□□ -1.85
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 CAV2P51636 162 aa3.48□□□□□ -1.85
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 OR2B8PP59922 312 aa3.48□□□□□ -1.85
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 KRTAP10-8P60410 259 aa3.48□□□□□ -1.85
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 PPP1CBP62140 327 aa3.48□□□□□ -1.85
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ARG2P78540 354 aa3.48□□□□□ -1.85
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 C2orf54Q08AI8 447 aa3.48□□□□□ -1.85
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ST3GAL4Q11206 333 aa3.48□□□□□ -1.85
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 GPR176Q14439 515 aa3.48□□□□□ -1.85
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 KIR2DS1Q14954 304 aa3.48□□□□□ -1.85
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 HERPUD1Q15011 391 aa3.48□□□□□ -1.85
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 PSG3Q16557 428 aa3.48□□□□□ -1.85
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 TMEM183BQ1AE95 376 aa3.48□□□□□ -1.85
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 NDUFAF7Q7L592 441 aa3.48□□□□□ -1.85
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 COMTD1Q86VU5 262 aa3.48□□□□□ -1.85
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 TMEM183AQ8IXX5 376 aa3.48□□□□□ -1.85
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 BLOC1S5Q8TDH9 187 aa3.48□□□□□ -1.85
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 TFGQ92734 400 aaPredicted RBP3.48□□□□□ -1.85
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 SCGB3A2Q96PL1 93 aa3.48□□□□□ -1.85
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 PLEKHF1Q96S99 279 aa3.48□□□□□ -1.85
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 GOLPH3Q9H4A6 298 aa3.48□□□□□ -1.85
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa3.48□□□□□ -1.85
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 REEP1Q9H902 201 aa3.48□□□□□ -1.85
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ANKHQ9HCJ1 492 aa3.48□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 67 ms