RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000435535.1

RPS3AP54-201, Transcript of ribosomal protein S3a pseudogene 54, humanhuman

BASIC

Gene RPS3AP54, Length 734 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP54-201ENST00000435535 CHP2O43745 196 aa3.8□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 GPRIN2O60269 458 aa3.8□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 NPIPB7O75200 414 aa3.8□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 MFN2O95140 757 aa3.8□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 OR2C1O95371 312 aa3.8□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 HLA-HP01893 362 aa3.8□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 BGLAPP02818 100 aa3.8□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 THY1P04216 161 aa3.8□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 PATE4P0C8F1 98 aa3.8□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 ADORA3P0DMS8 318 aa3.8□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 CD79AP11912 226 aa3.8□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 ETS2P15036 469 aa3.8□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 FUT1P19526 365 aa3.8□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 AHCYP23526 432 aa3.8□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 CHATP28329 748 aa3.8□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 CALCRP30988 508 aa3.8□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 OR1E2P47887 323 aa3.8□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 MRPL19P49406 292 aaKnown RBP3.8□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 CLK1P49759 484 aaKnown RBP3.8□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 CRYBA2P53672 197 aa3.8□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 UGT2B15P54855 530 aa3.8□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 BIDP55957 195 aa3.8□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 TAS2R41P59536 307 aa3.8□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 PRPS1P60891 318 aa3.8□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 SNRPD2P62316 118 aaKnown RBP3.8□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 MYBPC1Q00872 1141 aa3.8□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 GLO1Q04760 184 aa3.8□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 PUDPQ08623 228 aa3.8□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 PMS2P3Q13401 168 aa3.8□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 SNTB2Q13425 540 aaKnown RBP3.8□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 GGTLC2Q14390 218 aa3.8□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 NRF1Q16656 503 aa3.8□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 DUSP7Q16829 419 aa3.8□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 ALKBH6Q3KRA9 238 aa3.8□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 MMEL1Q495T6 779 aa3.8□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 AGAP6Q5VW22 663 aa3.8□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 OR7E24Q6IFN5 339 aa3.8□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 ULK3Q6PHR2 472 aa3.8□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 C6orf89Q6UWU4 347 aa3.8□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP3.8□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 NANOGNBQ7Z5D8 188 aa3.8□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 ABHD12BQ7Z5M8 362 aaPredicted RBP3.8□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 MDP1Q86V88 176 aa3.8□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 CARM1Q86X55 608 aa3.8□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 CDK20Q8IZL9 346 aa3.8□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 SVOPLQ8N434 492 aa3.8□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 C17orf78Q8N4C9 275 aa3.8□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 LRRC17Q8N6Y2 441 aa3.8□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 ICA1LQ8NDH6 482 aa3.8□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 RBM15BQ8NDT2 890 aaKnown RBP3.8□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 NOXO1Q8NFA2 376 aa3.8□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 OR6N1Q8NGY5 312 aa3.8□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 MFSD8Q8NHS3 518 aa3.8□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 RCN3Q96D15 328 aa3.8□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 SLC47A1Q96FL8 570 aa3.8□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 TPD52L3Q96J77 140 aa3.8□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZNF570Q96NI8 536 aa3.8□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 ARHGDIGQ99819 225 aa3.8□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 DHRS9Q9BPW9 319 aa3.8□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 FAM110AQ9BQ89 295 aa3.8□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 SF3B5Q9BWJ5 86 aaKnown RBP3.8□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 RABEP2Q9H5N1 569 aa3.8□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 NARFLQ9H6Q4 476 aa3.8□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 VIPAS39Q9H9C1 493 aa3.8□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 FKRPQ9H9S5 495 aa3.8□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 TMEM27Q9HBJ8 222 aa3.8□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 CRLF2Q9HC73 371 aa3.8□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 DYNLRB1Q9NP97 96 aa3.8□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 YAE1D1Q9NRH1 226 aa3.8□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 CBLN4Q9NTU7 201 aa3.8□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 OR6C3Q9NZP0 311 aa3.8□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 MGAT4BQ9UQ53 548 aa3.8□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 RASD1Q9Y272 281 aa3.8□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 B3GALT5Q9Y2C3 310 aa3.8□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 FKBP7Q9Y680 259 aa3.8□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 V9GYQ6 96 aa3.8□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 IGHV2OR16-5A0A0B4J2B6 119 aa3.79□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 LOC100653049A0A140TA62 436 aa3.79□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 TRAPPC13A5PLN9 417 aa3.79□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 OR6C65A6NJZ3 312 aa3.79□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 FAM220BPB1ANY3 271 aa3.79□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 H7C1C5 153 aa3.79□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 hCG_2039718K7EN88 272 aa3.79□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 RNF13O43567 381 aa3.79□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 SERPINB7O75635 380 aa3.79□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 KRT34O76011 436 aa3.79□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZNF432O94892 652 aa3.79□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 NDUFB4O95168 129 aa3.79□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 OR6A2O95222 327 aa3.79□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 RAB36O95755 333 aa3.79□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZNF682O95780 498 aa3.79□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 CH25HO95992 272 aa3.79□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 CRYAAP02489 173 aa3.79□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 OR4A8P0C604 315 aa3.79□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 GPX2P18283 190 aa3.79□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 FKBP2P26885 142 aaKnown RBP3.79□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 GPR4P46093 362 aa3.79□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 YAP1P46937 504 aaKnown RBP3.79□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 CSNK1A1P48729 337 aa3.79□□□□□ -1.8
RPS3AP54-201ENST00000435535 NUDT2P50583 147 aa3.79□□□□□ -1.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36 ms