RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428064.5

LIMS1-208, Transcript of LIM zinc finger domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene LIMS1, Length 637 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS1-208ENST00000428064 OR2T2Q6IF00 324 aa17.62■□□□□ 0.41
LIMS1-208ENST00000428064 LEG1Q6P5S2 330 aa17.62■□□□□ 0.41
LIMS1-208ENST00000428064 JAZF1Q86VZ6 243 aa17.62■□□□□ 0.41
LIMS1-208ENST00000428064 OR5AS1Q8N127 324 aa17.62■□□□□ 0.41
LIMS1-208ENST00000428064 OR6V1Q8N148 313 aa17.62■□□□□ 0.41
LIMS1-208ENST00000428064 C3orf56Q8N813 242 aa17.62■□□□□ 0.41
LIMS1-208ENST00000428064 OR10AD1Q8NGE0 317 aa17.62■□□□□ 0.41
LIMS1-208ENST00000428064 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP17.62■□□□□ 0.41
LIMS1-208ENST00000428064 MRI1Q9BV20 369 aa17.62■□□□□ 0.41
LIMS1-208ENST00000428064 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP17.62■□□□□ 0.41
LIMS1-208ENST00000428064 MLNRO43193 412 aa17.61■□□□□ 0.41
LIMS1-208ENST00000428064 IDH3BO43837 385 aa17.61■□□□□ 0.41
LIMS1-208ENST00000428064 PPIAL4GP0DN37 164 aa17.61■□□□□ 0.41
LIMS1-208ENST00000428064 SPIBQ01892 262 aa17.61■□□□□ 0.41
LIMS1-208ENST00000428064 ECH1Q13011 328 aa17.61■□□□□ 0.41
LIMS1-208ENST00000428064 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP17.61■□□□□ 0.41
LIMS1-208ENST00000428064 SLC36A3Q495N2 470 aa17.61■□□□□ 0.41
LIMS1-208ENST00000428064 KLF17Q5JT82 389 aaPredicted RBP17.61■□□□□ 0.41
LIMS1-208ENST00000428064 SLC18B1Q6NT16 456 aa17.61■□□□□ 0.41
LIMS1-208ENST00000428064 DOK3Q7L591 496 aa17.61■□□□□ 0.41
LIMS1-208ENST00000428064 RNF148Q8N7C7 305 aa17.61■□□□□ 0.41
LIMS1-208ENST00000428064 NMNAT3Q96T66 252 aa17.61■□□□□ 0.41
LIMS1-208ENST00000428064 DDX28Q9NUL7 540 aaKnown RBP17.61■□□□□ 0.41
LIMS1-208ENST00000428064 OR5V1Q9UGF6 321 aa17.61■□□□□ 0.41
LIMS1-208ENST00000428064 WNT2P09544 360 aa17.6■□□□□ 0.41
LIMS1-208ENST00000428064 HIST1H1CP16403 213 aaKnown RBP17.6■□□□□ 0.41
LIMS1-208ENST00000428064 RBMXP38159 391 aaKnown RBP17.6■□□□□ 0.41
LIMS1-208ENST00000428064 IFNGR2P38484 337 aa17.6■□□□□ 0.41
LIMS1-208ENST00000428064 GATA4P43694 442 aa17.6■□□□□ 0.41
LIMS1-208ENST00000428064 PAX2Q02962 417 aa17.6■□□□□ 0.41
LIMS1-208ENST00000428064 CORO6Q6QEF8 472 aa17.6■□□□□ 0.41
LIMS1-208ENST00000428064 RBMS3Q6XE24 437 aaKnown RBP17.6■□□□□ 0.41
LIMS1-208ENST00000428064 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa17.6■□□□□ 0.41
LIMS1-208ENST00000428064 SGMS2Q8NHU3 365 aa17.6■□□□□ 0.41
LIMS1-208ENST00000428064 C22orf15Q8WYQ4 148 aa17.6■□□□□ 0.41
LIMS1-208ENST00000428064 HCAR1Q9BXC0 346 aa17.6■□□□□ 0.41
LIMS1-208ENST00000428064 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP17.6■□□□□ 0.41
LIMS1-208ENST00000428064 CYB5R1Q9UHQ9 305 aa17.6■□□□□ 0.41
LIMS1-208ENST00000428064 LRRC30A6NM36 301 aa17.59■□□□□ 0.41
LIMS1-208ENST00000428064 OR10H3O60404 316 aa17.59■□□□□ 0.41
LIMS1-208ENST00000428064 ACSM4P0C7M7 580 aa17.59■□□□□ 0.41
LIMS1-208ENST00000428064 GSSP48637 474 aa17.59■□□□□ 0.41
LIMS1-208ENST00000428064 CENPAP49450 140 aa17.59■□□□□ 0.41
LIMS1-208ENST00000428064 PAX8Q06710 450 aa17.59■□□□□ 0.41
LIMS1-208ENST00000428064 AWAT1Q58HT5 328 aa17.59■□□□□ 0.41
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF620Q6ZNG0 422 aa17.59■□□□□ 0.41
LIMS1-208ENST00000428064 CFAP77Q6ZQR2 320 aa17.59■□□□□ 0.41
LIMS1-208ENST00000428064 C1orf87Q8N0U7 546 aa17.59■□□□□ 0.41
LIMS1-208ENST00000428064 PGAM4Q8N0Y7 254 aa17.59■□□□□ 0.41
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF420Q8TAQ5 688 aaPredicted RBP17.59■□□□□ 0.41
LIMS1-208ENST00000428064 ERGIC1Q969X5 290 aa17.59■□□□□ 0.41
LIMS1-208ENST00000428064 MCUR1Q96AQ8 359 aa17.59■□□□□ 0.41
LIMS1-208ENST00000428064 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP17.59■□□□□ 0.41
LIMS1-208ENST00000428064 ATF6BQ99941 703 aa17.59■□□□□ 0.41
LIMS1-208ENST00000428064 SSBP3Q9BWW4 388 aaPredicted RBP17.59■□□□□ 0.41
LIMS1-208ENST00000428064 TMEM165Q9HC07 324 aa17.59■□□□□ 0.41
LIMS1-208ENST00000428064 IL1RAPQ9NPH3 570 aa17.59■□□□□ 0.41
LIMS1-208ENST00000428064 PNRC2Q9NPJ4 139 aaKnown RBP17.59■□□□□ 0.41
LIMS1-208ENST00000428064 RPRD1BQ9NQG5 326 aaKnown RBP17.59■□□□□ 0.41
LIMS1-208ENST00000428064 MIOXQ9UGB7 285 aa17.59■□□□□ 0.41
LIMS1-208ENST00000428064 CD300AQ9UGN4 299 aa17.59■□□□□ 0.41
LIMS1-208ENST00000428064 KCNG2Q9UJ96 466 aa17.59■□□□□ 0.41
LIMS1-208ENST00000428064 SNX3O60493 162 aa17.58■□□□□ 0.4
LIMS1-208ENST00000428064 FABP3P05413 133 aa17.58■□□□□ 0.4
LIMS1-208ENST00000428064 RPS2P15880 293 aaKnown RBP17.58■□□□□ 0.4
LIMS1-208ENST00000428064 NOS3P29474 1203 aa17.58■□□□□ 0.4
LIMS1-208ENST00000428064 GGT2P36268 569 aa17.58■□□□□ 0.4
LIMS1-208ENST00000428064 TSPAN31Q12999 210 aa17.58■□□□□ 0.4
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF404Q494X3 552 aa17.58■□□□□ 0.4
LIMS1-208ENST00000428064 SAMD4BQ5PRF9 694 aaKnown RBP17.58■□□□□ 0.4
LIMS1-208ENST00000428064 ZSCAN2Q7Z7L9 614 aaPredicted RBP17.58■□□□□ 0.4
LIMS1-208ENST00000428064 KLBQ86Z14 1044 aa17.58■□□□□ 0.4
LIMS1-208ENST00000428064 SIGLECL1Q8N7X8 197 aa17.58■□□□□ 0.4
LIMS1-208ENST00000428064 OR4K13Q8NH42 304 aa17.58■□□□□ 0.4
LIMS1-208ENST00000428064 Q8TCH9 128 aa17.58■□□□□ 0.4
LIMS1-208ENST00000428064 IFT27Q9BW83 186 aa17.58■□□□□ 0.4
LIMS1-208ENST00000428064 TMEM100Q9NV29 134 aa17.58■□□□□ 0.4
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF69Q9UC07 566 aa17.58■□□□□ 0.4
LIMS1-208ENST00000428064 PPIAL4AQ9Y536 164 aa17.58■□□□□ 0.4
LIMS1-208ENST00000428064 V9GYQ6 96 aa17.58■□□□□ 0.4
LIMS1-208ENST00000428064 OR6C68A6NDL8 312 aa17.57■□□□□ 0.4
LIMS1-208ENST00000428064 H0YL77 283 aa17.57■□□□□ 0.4
LIMS1-208ENST00000428064 CYB5R3P00387 301 aaPredicted RBP17.57■□□□□ 0.4
LIMS1-208ENST00000428064 HKR1P10072 659 aa17.57■□□□□ 0.4
LIMS1-208ENST00000428064 PRTN3P24158 256 aa17.57■□□□□ 0.4
LIMS1-208ENST00000428064 RRM2P31350 389 aa17.57■□□□□ 0.4
LIMS1-208ENST00000428064 TRAP1Q12931 704 aaKnown RBP17.57■□□□□ 0.4
LIMS1-208ENST00000428064 GK2Q14410 553 aaPredicted RBP17.57■□□□□ 0.4
LIMS1-208ENST00000428064 SPATS1Q496A3 300 aa17.57■□□□□ 0.4
LIMS1-208ENST00000428064 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa17.57■□□□□ 0.4
LIMS1-208ENST00000428064 BTNL3Q6UXE8 466 aa17.57■□□□□ 0.4
LIMS1-208ENST00000428064 LRRN1Q6UXK5 716 aa17.57■□□□□ 0.4
LIMS1-208ENST00000428064 C9orf139Q6ZV77 190 aa17.57■□□□□ 0.4
LIMS1-208ENST00000428064 LINC00346Q8IVM7 164 aa17.57■□□□□ 0.4
LIMS1-208ENST00000428064 BHLHE23Q8NDY6 225 aa17.57■□□□□ 0.4
LIMS1-208ENST00000428064 SDR9C7Q8NEX9 313 aa17.57■□□□□ 0.4
LIMS1-208ENST00000428064 OR2AJ1Q8NGZ0 328 aa17.57■□□□□ 0.4
LIMS1-208ENST00000428064 GNPDA2Q8TDQ7 276 aa17.57■□□□□ 0.4
LIMS1-208ENST00000428064 PLEKHA8Q96JA3 519 aa17.57■□□□□ 0.4
LIMS1-208ENST00000428064 NSMCE2Q96MF7 247 aa17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.5 ms