RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426282.6

NUP50-AS1-201, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NUP50-AS1, Length 2,076 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP50-AS1-201ENST00000426282 Q0VFX4 171 aa16.57■□□□□ 0.24
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ANGPT1Q15389 498 aa16.57■□□□□ 0.24
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TAF13Q15543 124 aa16.57■□□□□ 0.24
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GLDNQ6ZMI3 551 aaPredicted RBP16.57■□□□□ 0.24
NUP50-AS1-201ENST00000426282 Q6ZTK2 550 aa16.57■□□□□ 0.24
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TIPARPQ7Z3E1 657 aaKnown RBP16.57■□□□□ 0.24
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GPX8Q8TED1 209 aa16.57■□□□□ 0.24
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SGCZQ96LD1 299 aa16.57■□□□□ 0.24
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GLTPQ9NZD2 209 aa16.57■□□□□ 0.24
NUP50-AS1-201ENST00000426282 KIAA1549Q9HCM3 1950 aa16.56■□□□□ 0.24
NUP50-AS1-201ENST00000426282 IGHV3-15A0A0B4J1V0 119 aa16.56■□□□□ 0.24
NUP50-AS1-201ENST00000426282 A0A1B0GVI7 797 aa16.56■□□□□ 0.24
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MECP2P51608 486 aaKnown RBP16.56■□□□□ 0.24
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PRKXP51817 358 aa16.56■□□□□ 0.24
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SSBP1Q04837 148 aaKnown RBP16.56■□□□□ 0.24
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CHAF1BQ13112 559 aa16.56■□□□□ 0.24
NUP50-AS1-201ENST00000426282 OR10K2Q6IF99 312 aa16.56■□□□□ 0.24
NUP50-AS1-201ENST00000426282 C6orf15Q6UXA7 325 aaPredicted RBP16.56■□□□□ 0.24
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SEZ6L2Q6UXD5 910 aa16.56■□□□□ 0.24
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZNF767PQ75MW2 155 aa16.56■□□□□ 0.24
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZNF627Q7L945 461 aa16.56■□□□□ 0.24
NUP50-AS1-201ENST00000426282 OR1M1Q8NGA1 313 aa16.56■□□□□ 0.24
NUP50-AS1-201ENST00000426282 OR4D10Q8NGI6 311 aa16.56■□□□□ 0.24
NUP50-AS1-201ENST00000426282 OR51E1Q8TCB6 317 aa16.56■□□□□ 0.24
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CT55Q8WUE5 264 aa16.56■□□□□ 0.24
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PTX4Q96A99 478 aa16.56■□□□□ 0.24
NUP50-AS1-201ENST00000426282 UCN2Q96RP3 112 aa16.56■□□□□ 0.24
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GAL3ST1Q99999 423 aa16.56■□□□□ 0.24
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SDK2Q58EX2 2172 aa16.55■□□□□ 0.24
NUP50-AS1-201ENST00000426282 VAMP5O95183 116 aa16.55■□□□□ 0.24
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ICAM2P13598 275 aa16.55■□□□□ 0.24
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GTF2F2P13984 249 aa16.55■□□□□ 0.24
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ANXA7P20073 488 aaKnown RBP16.55■□□□□ 0.24
NUP50-AS1-201ENST00000426282 HTR2BP41595 481 aa16.55■□□□□ 0.24
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CSNK1A1P48729 337 aa16.55■□□□□ 0.24
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CSNK2A1P68400 391 aaPredicted RBP16.55■□□□□ 0.24
NUP50-AS1-201ENST00000426282 POU4F3Q15319 338 aa16.55■□□□□ 0.24
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RBMS2Q15434 407 aaKnown RBP16.55■□□□□ 0.24
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CCDC157Q569K6 752 aa16.55■□□□□ 0.24
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CLEC1AQ8NC01 280 aa16.55■□□□□ 0.24
NUP50-AS1-201ENST00000426282 OR52N4Q8NGI2 321 aa16.55■□□□□ 0.24
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZNF385AQ96PM9 386 aaKnown RBP16.55■□□□□ 0.24
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SEC22CQ9BRL7 303 aa16.55■□□□□ 0.24
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CNTD2Q9H8S5 307 aa16.55■□□□□ 0.24
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TMEM138Q9NPI0 162 aa16.55■□□□□ 0.24
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PTTG3PQ9NZH4 202 aa16.55■□□□□ 0.24
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MYEF2Q9P2K5 600 aaKnown RBP16.55■□□□□ 0.24
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NPTNQ9Y639 398 aa16.55■□□□□ 0.24
NUP50-AS1-201ENST00000426282 A0A0A6YYH2 397 aa16.55■□□□□ 0.24
NUP50-AS1-201ENST00000426282 A0A0G2JMM0 328 aa16.55■□□□□ 0.24
NUP50-AS1-201ENST00000426282 A0A1W2PPB8 328 aa16.55■□□□□ 0.24
NUP50-AS1-201ENST00000426282 A0A1W2PRS3 328 aa16.55■□□□□ 0.24
NUP50-AS1-201ENST00000426282 A6NJ64 397 aa16.55■□□□□ 0.24
NUP50-AS1-201ENST00000426282 KIR3DP1A8MWS1 328 aa16.55■□□□□ 0.24
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ERVH48-1M5A8F1 160 aa16.55■□□□□ 0.24
NUP50-AS1-201ENST00000426282 AKAIN1P0CW23 69 aa16.55■□□□□ 0.24
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SLC2A1P11166 492 aa16.55■□□□□ 0.24
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CAPZA1P52907 286 aa16.55■□□□□ 0.24
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZNF121P58317 390 aaPredicted RBP16.55■□□□□ 0.24
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ACTBP60709 375 aa16.55■□□□□ 0.24
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RAC1P63000 192 aa16.55■□□□□ 0.24
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ACTG1P63261 375 aa16.55■□□□□ 0.24
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZNF529Q6P280 563 aa16.55■□□□□ 0.24
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZNF782Q6ZMW2 699 aaPredicted RBP16.55■□□□□ 0.24
NUP50-AS1-201ENST00000426282 OR6N1Q8NGY5 312 aa16.55■□□□□ 0.24
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SNAPC3Q92966 411 aa16.55■□□□□ 0.24
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SEH1LQ96EE3 360 aa16.55■□□□□ 0.24
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MED30Q96HR3 178 aa16.55■□□□□ 0.24
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PIGQQ9BRB3 760 aa16.55■□□□□ 0.24
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NAA11Q9BSU3 229 aaPredicted RBP16.55■□□□□ 0.24
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP16.55■□□□□ 0.24
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DLL4Q9NR61 685 aa16.55■□□□□ 0.24
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MGAT4AQ9UM21 535 aa16.55■□□□□ 0.24
NUP50-AS1-201ENST00000426282 A0A0J9YW62 118 aa16.54■□□□□ 0.24
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LNP1A1A4G5 178 aa16.54■□□□□ 0.24
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NPIPA2E9PIF3 369 aa16.54■□□□□ 0.24
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NPIPA3F8WFD2 350 aa16.54■□□□□ 0.24
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SULT1C2O00338 296 aa16.54■□□□□ 0.24
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LPLP06858 475 aa16.54■□□□□ 0.24
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SP9P0CG40 484 aa16.54■□□□□ 0.24
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MOGAT2Q3SYC2 334 aa16.54■□□□□ 0.24
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PHYHD1Q5SRE7 291 aa16.54■□□□□ 0.24
NUP50-AS1-201ENST00000426282 C10orf128Q5T292 105 aa16.54■□□□□ 0.24
NUP50-AS1-201ENST00000426282 B3GNTL1Q67FW5 361 aaPredicted RBP16.54■□□□□ 0.24
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RAB11FIP2Q7L804 512 aa16.54■□□□□ 0.24
NUP50-AS1-201ENST00000426282 OR11H4Q8NGC9 324 aa16.54■□□□□ 0.24
NUP50-AS1-201ENST00000426282 OR9K2Q8NGE7 335 aa16.54■□□□□ 0.24
NUP50-AS1-201ENST00000426282 OR8B12Q8NGG6 310 aa16.54■□□□□ 0.24
NUP50-AS1-201ENST00000426282 OR5D14Q8NGL3 314 aa16.54■□□□□ 0.24
NUP50-AS1-201ENST00000426282 OR13C9Q8NGT0 318 aa16.54■□□□□ 0.24
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP16.54■□□□□ 0.24
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TMEM54Q969K7 222 aa16.54■□□□□ 0.24
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GPR137Q96N19 417 aa16.54■□□□□ 0.24
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZNF416Q9BWM5 594 aa16.54■□□□□ 0.24
NUP50-AS1-201ENST00000426282 STRADBQ9C0K7 418 aa16.54■□□□□ 0.24
NUP50-AS1-201ENST00000426282 METTL17Q9H7H0 456 aaPredicted RBP16.54■□□□□ 0.24
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PYCARD-AS1I3L0S3 204 aa16.54■□□□□ 0.24
NUP50-AS1-201ENST00000426282 M0R296 226 aa16.54■□□□□ 0.24
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TNFSF11O14788 317 aa16.54■□□□□ 0.24
NUP50-AS1-201ENST00000426282 WDPCPO95876 746 aa16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.7 ms